Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00136030

Standard Name

DNA2 (DNA replication ATP-dependent helicase)

Aliases

PreTt24328 | 10.m00377 | 3698.m00096

Description

Homolog of Saccharomyces DNA2

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• DNA binding (IEA) | GO:0003677
• ATP binding (IEA) | GO:0005524
• ATP-dependent DNA helicase activity (IEA) | GO:0004003

Biological Process

• DNA replication (IEA) | GO:0006260

Domains

• ( PF00580 ) UvrD/REP helicase
• ( TIGR01612 ) rhoptry protein
• ( TIGR00229 ) PAS domain S-box
• ( TIGR01257 ) rim ABC transporter
• ( TIGR00376 ) DNA helicase, putative
• ( PF08696 ) DNA replication factor Dna2
• ( TIGR00372 ) CRISPR-associated protein Cas4
• ( TIGR00864 ) polycystin cation channel protein
• ( PF03413 ) Peptidase propeptide and YPEB domain
• ( TIGR00088 ) tRNA (guanine-N1)-methyltransferase
• ( TIGR01447 ) exodeoxyribonuclease V, alpha subunit
• ( PF04851 ) type III restriction enzyme, res
• ( PF00418 ) Tau and MAP protein, tubulin-binding

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.1%

TetraMine Data

TTHERM_00136030

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_05769.1	2.000043494209831e-96	hypothetical protein (288 aa)
Oxytricha	Contig16074.0.g107	3.000745802558524e-63	DNA replication factor Dna2
SGD	YHR164C	5.997098480211051e-62	DNA2 Tripartite DNA replicatio n factor with single-stranded DNA-dependent ATPase, ATP-depe ndent nuclease, and helicase a ctivities; required for Okazak i fragment processing; involve d in DNA repair; cell-cycle de pendent localization
DictyBase	DDB_G0274777	5.0020095550341075e-51	DDB_G0274777 on chromosome: 2 position 3809416 to 3815083
WormBase	WBGene00001016	2.9990874792167046e-33	locus:dna-2 status:Partially _confirmed UniProt:Q9U3F2 protein_id:CAB54253.1
Stentor Coeruleus	SteCoe_16720	0.000000000000004658886145103398

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00136030(coding)
ATGGATAATAATATGAACAGCTGGAAAAGATTAAACGAAAAAAATCAAGTAGATATAGAA
GATTATAATTAATTATAAAATATTTCAACTGTTCTTAGCAAAGAACCTAAAGCTAAAGTG
AAAGTTAGCTATAGTGAAAGCAGTAGCAGTGATGAAGATGATGATGAAAAATTTTTTATT
TAAAACTTTAGTCAAAAAATGTCTAATTCAACTTCTAAAAATTAAAATCAATCTGATCTT
TAGAAAAATAAGGCTGAATTAGAGACTAAAAAAATGATCAAAAGAGTAGAGAGTTTTTAA
GTTGAAAACTAGCAAACAAAAGATAATTAAGCTATGCATTAAAAAATGGAGTTAAGCTCT
TCTGATGATAGCGATGAAGATGTGGAGTTTATAACAAATCTTTAGAAAGCCTAGTAATAT
TAAAATTTGTTGAAGGAAATTAATGAGGAAAAGTATGTAAGCATAGTTATAACAGAAATT
ATAAAAAAAAATGAAATTCCTTAAGAATACTGGTAAGCCTTTAATCAAATTGCATGTGAT
GATCATGACTTAGCTGAAAAGGATATAAACAAAAATTATACATCAACATACTTAAGAGTA
AGTATTAAGAATAACAAATAACTTGAAGAAAAGTTAAAATTAGTAGAAATAGGTCTGTTG
TTAATAGGGAGTACTTATAATGATATAGAATATGATATAGATGATCAAGCTAACTTTTTG
GGAAAGTTTAATTATTAATTATTGAAGATGTAGAACTAAACAGATTAGCGCGATATACAT
CTTTTCTTCTCTATTTTACACTAGTTTTAGCTATGTGATAACAAGGAAAGAGTTATGAAG
GAGGTATTTTCAAGCTCAAACATCTTGATTATGGAGCCTGATCAGATGCTATATCCAACT
TTGATTGCTTAATCTACGTCTTGTTATAGGATACCTTTGATTAAAATGAAGTTTAAAGTT
ACTGAATCCACTAATTGGAATATGTTAAAGGGTGTTATATTGCATGACATATTCTAACAT
CTGATGACCTTGCATAGCTAAAATCAATAAATAAAAGAAATCATAAAAGAAAAATCAGAT
TCATTTTTAACAGACATAATCAAATAGCTTTACACTAAGTATTTAGAAGAGCTTTTTTTG
TTAGAAAAGTGCATTAACACTTTCGAAAAGGAAATCAAATATATAGCAAAAAATATGATG
GACTTTTTGTAAAATTATTTAATCGAAGGAAAACTTATAGAAACTAAGTATAGTAACAGA
AAAATTAAAATTAAAAAGCTAGTTGAAAATGAAATGGTTGTTAATAATGAGGCTCTAGGA
CTAAAAGGATAAATTGATTGTGTTTTCAAATGTGAAGTTGAAGAATAATTTTCTGATTAA
AAAGAAAAAAAATATGAATGTTTTCTTCCTTTTGAATTAAAAACAGGTGGAAAAAAAAAG
TAAATTTATGAAGATTAAAACCTGTTTTACTGTCTCTTATTAAATCAAAAATATGATCGT
AAATAAAATTTAGAGGGTTTTTTATACTATTTAAGTTTAAATGATCTCACTACATCATGT
CCCACTAAGTAATCTTCTGTGAATTTACTTACTAGAAGAAATAAACTTGCTAAATTTATA
AAGAATATGGAGACTCAAGGTAAAATGCCAGAAATAAATATTGAGAGACCTGATATTTGC
AAATTTTGCTATGAAAAAGAAGCATGCTATGCAAATCAATTAGTTGATGATTATGATAAT
ATTAAAGATATTGAAGATTTACCTGAAAAATATAAAATAGATAAATAATTTGAGTATTTT
CATTAATTTTATGATAGCTTAACGGAAGGATCGAAGCTTTATTTAAAAAAATGGATAGAT
CTAATTTAAATGGAATAATAATGTGATTCTGATATCAAAAAAGATAAAAAATAAAAGCTA
CTTAATGAGGCTGACAATCAGTTAATTTTTATGACTGAAAATTTCGATTAGTTTTTCTCT
TCTTAAGTTGAGTAGCTCTAAACAAGTGGCTATATCTAATCTTAGTAAAATCTTTCTTCT
AAAGATAGCTCTAGAGATAGTAATGCATCATAAAAAGAATATGAACATATTATTTATTTG
AGAAAAATATGTCCTTCGCTAAGTAAGCTTATTGCTTTAAGCGAATTTTACAAAGAAGGT
GAAAGCTTTGTGCTTTATTAGATGGACATAAAATGCAAATTCAAAGCTATTTTAGAAGAA
AAAACTCTTTAAGAGTAGAGTCACTCTATTATTTTAAAGCTTAAGAGCATACAAGCCCAG
GTTAACTTTGATAAAAAAAAGGTTGAAAAAGTTTTAAATAGTAAAATTGGTAACGGTCTA
TATTGGAGTTTAGAGAGCTATAACAAAGACTAATATCCAGATTAAAGATAGAATGTTTTA
AATTTGATTTTAAATAAACTTGTTATGCAAAGTGAAAGTCATTAGAAATTGAAAGAGGCT
TATAACTTAAAGTTGACCAATAAGGATTTTACATCTGTTATCATAGATAACTTTCCTCCT
AAATTTTAAAATAATGAATTTACTGATGAAAAGATAGAAGAAATTTTAAATAAATATCCA
AATCTTCTCAAAAATGTTGATTAAGCTGATTCTATTAAAAAAATTTTAAAAAGTGAATCA
CTCACATGCATCTTAGGTATGCCAGGAACTGGAAAGACATTTTTAATAGCTCATTTAATC
AAGATTTTAGCTGATTAAAAAAAGAAGGTCTTGGTCACAAGTTTTACTAATTCTGCACTT
GATAACATAATTGTTAAGTTATTAGAGATTTTCCCTGAGATAAAAAATATTTGCTTAAGA
AAAGGATCAAATAAAAATTTGATTCATTCAGTTGCTCAAGAAATTTTATATAATCCTTAC
TCCTTTGAGGAAGAAAGATAATTTTCTGACTACTTAAAAGAAAAATAGATATATTTTGCT
ACCATTATTGGCTCAAATAATAAATTATTTCACAGTGAAAAGATTAAATTTGACTATTGT
ATTATAGATGAAGCCTCCTAGTGTGTAGAGCCTCTTTGCTTAGGTCCTATGCTTATTTGT
GATAAATCTATTTTAATCGGAGATCATTTCTAGCTATAACCTCTAGTTAAAAATGAAGAA
GCTGGCAAATAAGGTCTTTCTATTAGTTTATTTGAAAGAATGTGTAATTAATATCCACTA
TGTTAAGTGAAGCTTAAAAGCCAATTCAGAATGAATAACAAAATTATGGAACTTTCAAAT
ATAATGGTGTATAATAATTAACTAAAGGCATTTGATGATAACATTGGTAATAGAAAAATT
AAAATTAATGAAGATGACTTAAAAAGGATAACAAACAAGAGTTTAAATCATTGTATGTAA
CCTAACAATGAGGTTGTTTTTATAGATACAAGCCTTTTGGAATAAAGCTTCAAAGTTGAA
GGAGCTGCTGAAGAAGATTTAGTTTAGAAATAATCAATTGAAGAAAATAGATTTTAGATT
AAGTTTATTTGTTTGCTGATTAAGAAATTTTAAGAAGTCAATATTTAAAATAAGAGCATG
GCTTTAATTACCCCTTACAACTTTTATAGAGTTCAATTCTTAAAAAATATGAACTAGCTT
CATATTGAATAAAATGACCTTGAACTCTTCACAGTTGACAAAAGTTAAGGAATAGATAAA
GATATTATAATTTTACATATATCTGATAAAATTGGAAATGATCACTTATTATCAAATTGG
AGAAGAACAAATGTTGCTATTACAAGATCAAAAATGAAATTAATCATCGTTGGAAATTAA
AATGTATTAAATCGCTATAAAACCATAGACACTTTAATGACTATACTCTAATAAAAGAAA
TATGTATACCAACTAACTCAACAAGAGATGCAAGAAATACAAGAAGAAGTTCTTTAATTA
TAAAATCCTGAAAATTGA

>TTHERM_00136030(protein)
MDNNMNSWKRLNEKNQVDIEDYNQLQNISTVLSKEPKAKVKVSYSESSSSDEDDDEKFFI
QNFSQKMSNSTSKNQNQSDLQKNKAELETKKMIKRVESFQVENQQTKDNQAMHQKMELSS
SDDSDEDVEFITNLQKAQQYQNLLKEINEEKYVSIVITEIIKKNEIPQEYWQAFNQIACD
DHDLAEKDINKNYTSTYLRVSIKNNKQLEEKLKLVEIGLLLIGSTYNDIEYDIDDQANFL
GKFNYQLLKMQNQTDQRDIHLFFSILHQFQLCDNKERVMKEVFSSSNILIMEPDQMLYPT
LIAQSTSCYRIPLIKMKFKVTESTNWNMLKGVILHDIFQHLMTLHSQNQQIKEIIKEKSD
SFLTDIIKQLYTKYLEELFLLEKCINTFEKEIKYIAKNMMDFLQNYLIEGKLIETKYSNR
KIKIKKLVENEMVVNNEALGLKGQIDCVFKCEVEEQFSDQKEKKYECFLPFELKTGGKKK
QIYEDQNLFYCLLLNQKYDRKQNLEGFLYYLSLNDLTTSCPTKQSSVNLLTRRNKLAKFI
KNMETQGKMPEINIERPDICKFCYEKEACYANQLVDDYDNIKDIEDLPEKYKIDKQFEYF
HQFYDSLTEGSKLYLKKWIDLIQMEQQCDSDIKKDKKQKLLNEADNQLIFMTENFDQFFS
SQVEQLQTSGYIQSQQNLSSKDSSRDSNASQKEYEHIIYLRKICPSLSKLIALSEFYKEG
ESFVLYQMDIKCKFKAILEEKTLQEQSHSIILKLKSIQAQVNFDKKKVEKVLNSKIGNGL
YWSLESYNKDQYPDQRQNVLNLILNKLVMQSESHQKLKEAYNLKLTNKDFTSVIIDNFPP
KFQNNEFTDEKIEEILNKYPNLLKNVDQADSIKKILKSESLTCILGMPGTGKTFLIAHLI
KILADQKKKVLVTSFTNSALDNIIVKLLEIFPEIKNICLRKGSNKNLIHSVAQEILYNPY
SFEEERQFSDYLKEKQIYFATIIGSNNKLFHSEKIKFDYCIIDEASQCVEPLCLGPMLIC
DKSILIGDHFQLQPLVKNEEAGKQGLSISLFERMCNQYPLCQVKLKSQFRMNNKIMELSN
IMVYNNQLKAFDDNIGNRKIKINEDDLKRITNKSLNHCMQPNNEVVFIDTSLLEQSFKVE
GAAEEDLVQKQSIEENRFQIKFICLLIKKFQEVNIQNKSMALITPYNFYRVQFLKNMNQL
HIEQNDLELFTVDKSQGIDKDIIILHISDKIGNDHLLSNWRRTNVAITRSKMKLIIVGNQ
NVLNRYKTIDTLMTILQQKKYVYQLTQQEMQEIQEEVLQLQNPEN

>TTHERM_00136030(gene)
ATGGATAATAATATGAACAGCTGGAAAAGATTAAACGAAAAAAATCAAGTAGATATAGAA
GATTATAATTAATTATAAAATATTTCAACTGTTCTTAGCAAAGAACCTAAAGCTAAAGTG
AAAGTTAGCTATAGTGAAAGCAGTAGCAGTGATGAAGATGATGATGAAAAATTTTTTATT
TAAAACTTTAGTCAAAAAATGTCTAATTCAACTTCTAAAAATTAAAATCAATCTGATCTT
TAGAAAAATAAGGCTGAATTAGAGACTAAAAAAATGATCAAAAGAGTAGAGAGTTTTTAA
GTTGAAAACTAGCAAACAAAAGATAATTAAGCTATGCATTAAAAAATGGAGTTAAGCTCT
TCTGATGATAGCGATGAAGATGTGGAGTTTATAACAAATCTTTAGAAAGCCTAGTAATAT
TAAAATTTGTTGAAGGAAATTAATGAGGAAAAGTATGTAAGCATAGTTATAACAGAAATT
ATAAAAAAAAATGAAATTCCTTAAGAATACTGGTAAGCCTTTAATCAAATTGCATGTGAT
GATCATGACTTAGCTGAAAAGGATATAAACAAAAATTATACATCAACATACTTAAGAGTA
AGTATTAAGAATAACAAATAACTTGAAGAAAAGTTAAAATTAGTAGAAATAGGTCTGTTG
TTAATAGGGAGTACTTATAATGATATAGAATATGATATAGATGATCAAGCTAACTTTTTG
GGAAAGTTTAATTATTAATTATTGAAGATGTAGAACTAAACAGATTAGCGCGATATACAT
CTTTTCTTCTCTATTTTACACTAGTTTTAGCTATGTGATAACAAGGAAAGAGTTATGAAG
GAGGTATTTTCAAGCTCAAACATCTTGATTATGGAGCCTGATCAGATGCTATATCCAACT
TTGATTGCTTAATCTAGTAATGTTTATTTTTACATTTATTTCTTTTTTTAAAGATGATAA
ATTAAATAGTTTTTTTATTTTAAATTTTAATTATAGCGTCTTGTTATAGGATACCTTTGA
TTAAAATGAAGTTTAAAGTTACTGAATCCACTAATTGGAATATGTTAAAGGGTGTTATAT
TGCATGACATATTCTAACATCTGATGACCTTGCATAGCTAAAATCAATAAATAAAAGAAA
TCATAAAAGAAAAATCAGATTCATTTTTAACAGACATAATCAAATAGCTTTACACTAAGT
ATTTAGAAGAGCTTTTTTTGTTAGAAAAGTGCATTAACACTTTCGAAAAGGAAATCAAAT
ATATAGCAAAAAATATGATGGACTTTTTGTAAAATTATTTAAGTAATTATTAATTGCATC
TCTCTGTTTTAAATTAAATATTTATTTTTTAAAGTCGAAGGAAAACTTATAGAAACTAAG
TATAGTAACAGAAAAATTAAAATTAAAAAGCTAGTTGAAAATGAAATGGTTGTTAATAAT
GAGGCTCTAGGACTAAAAGGATAAATTGATTGTGTTTTCAAATGTGAAGTTGAAGAATAA
TTTTCTGATTAAAAAGAAAAAAAATATGAATGTTTTCTTCCTTTTGAATTAAAAACAGGT
GGAAAAAAAAAGTAAATTTATGAAGATTAAAACCTGTTTTACTGTCTCTTATTAAATCAA
AAATATGATCGTAAATAAAATTTAGAGGGTTTTTTATACTATTTAAGTTTAAATGATCTC
ACTACATCATGTCCCACTAAGTAATCTTCTGTGAATTTACTTACTAGAAGAAATAAAGTA
CATTTATTTTTAATTTACTTAAACCATAAATAAATATTTACTTATTTATTTATTATTTAT
TTTTAATATTTACTGTAATTCCTCATTTATAAAAAAATCTTTTAACTTATTATACCAAAA
AATTGCTTTTTTTTAATAATTAAATTTTTGTTGAAAATTTCAAGACTAATTTGAACTAAT
TAAAAATAATTGTATTATGTATTTATTTCAGCGATATTTATATTTAAAAAAAGCTTGCTA
AATTTATAAAGAATATGGAGACTCAAGGTAAAATGCCAGAAATAAATATTGAGAGACCTG
ATATTTGCAAATTTTGCTATGAAAAAGAAGCATGCTATGCAAATCAATTAGTTGATGATT
ATGATAATATTAAAGATATTGAAGATTTACCTGAAAAATATAAAATAGATAAATAATTTG
AGTATTTTCATTAATTTTATGATAGCTTAACGGAAGGATCGAAGCTTTATTTAAAAAAAT
GGATAGATCTAATTTAAATGGAATAATAATGTGATTCTGATATCAAAAAAGATAAAAAAT
AAAAGCTACTTAATGAGGCTGACAATCAGTTAATTTTTATGACTGAAAATTTCGATTAGT
TTTTCTCTTCTTAAGTTGAGTAGCTCTAAACAAGTGGCTATATCTAATCTTAGTAAAATC
TTTCTTCTAAAGATAGCTCTAGAGATAGTAATGCATCATAAAAAGAATATGAACATATTA
TTTATTTGAGAAAAATATGTCCTTCGCTAAGTAAGCTTATTGCTTTAAGCGAATTTTACA
AAGAAGGTGAAAGCTTTGTGCTTTATTAGATGGACATAAAATGCAAATTCAAAGCTATTT
TAGAAGAAAAAACTCTTTAAGAGTAGAGTCACTCTATTATTTTAAAGCTTAAGAGCATAC
AAGCCCAGGTTAACTTTGATAAAAAAAAGGTTGAAAAAGTTTTAAATAGTAAAATTGGTA
ACGGTCTATATTGGAGTTTAGAGAGCTATAACAAAGACTAATATCCAGATTAAAGATAGA
ATGTTTTAAATTTGATTTTAAATAAACTTGTTATGCAAAGTGAAAGTCATTAGAAATTGA
AAGAGGCTTATAACTTAAAGTTGACCAATAAGGATTTTACATCTGTTATCATAGATAACT
TTCCTCCTAAATTTTAAGTAAATCTTTTGAGATTAAAAATAAATTTAATATTTTTTTAAA
AAAGAATAATGAATTTACTGATGAAAAGATAGAAGAAATTTTAAATAAATATCCAAATCT
TCTCAAAAATGTTGATTAAGCTGATTCTAGTATGGTTATTTATTTTATTTAGTAAAAACG
AATAATTTAACAATTGTTTAATCATTAATAATAAAAAGTTAAAAAAATTTTAAAAAGTGA
ATCACTCACATGCATCTTAGGTATGCCAGGAACTGGAAAGACATTTTTAATAGCTCATTT
AATCAAGATTTTAGCTGATTAAAAAAAGAAGGTCTTGGTCACAAGTTTTACTAATTCTGC
ACTTGATAACATAATTGTTAAGTTATTAGAGATTTTCCCTGAGATAAAAAATATTTGCTT
AAGAAAAGGATCAAATAAAAATTTGATTCATTCAGTTGCTCAAGAAATTTTATATAATCC
TTACTCCTTTGAGGAAGAAAGATAATTTTCTGACTACTTAAAAGAAAAATAGATATATTT
TGCTACCATTATTGGCTCAAATAATAAATTATTTCGTAAGTTTTCACATTAAAAATATAT
TTTTAAAATCTCATTATTTTATAGACAGTGAAAAGATTAAATTTGACTATTGTATTATAG
ATGAAGCCTCCTAGTGTGTAGAGCCTCTTTGCTTAGGTCCTATGCTTATTTGTGATAAAT
CTATTTTAATCGGAGATCATTTCTAGGTACTGAATAAAAATATAGTTAAATATAATATTC
AACTTATTAATATAAAAAGCTATAACCTCTAGTTAAAAATGAAGAAGCTGGCAAATAAGG
TCTTTCTATTAGTTTATTTGAAAGAATGTGTAATTAATATCCACTATGTTAAGTGAAGCT
TAAAAGCCAAGTAAATAAATAAATATTTTTTTAATTATGGTATTATGACATTATTGATTA
AATTAATAAATAGTTCAGAATGAATAACAAAATTATGGAACTTTCAAATATAATGGTGTA
TAATAATTAACTAAAGGCATTTGATGATAACATTGGTAATAGAAAAATTAAAATTAATGA
AGATGACTTAAAAAGGATAACAAACAAGAGTTTAAATCATTGTATGTAACCTAACAATGA
GGTTGTTTTTATAGATACAAGCCTTTTGGAATAAAGCTTCAAAGTTGAAGGAGCTGCTGA
AGAAGATTTAGTTTAGAAATAATCAATTGAAGAAAATAGATTTTAGATTAAGTTTATTTG
TTTGCTGATTAAGAAATTTTAAGAAGTCAATATTTAAAATAAGAGCATGGCTTTAATTAC
CCCTTACAACTTTTATAGAGTTCAATTCTTAAAAAATATGAACTAGCTTCATATTGAAGT
AAAACATAATTATTTCCATACAACTTTAATAGAATTTTAACTAAATAACATTAAAAGTAA
AATGACCTTGAACTCTTCACAGTTGACAAAAGTTAAGGAATAGATAAAGATATTATAATT
TTACATATATCTGATAAAATTGGAAATGATCACTTATTATCAGTAATATTTTTAAACAAA
AATTATATTCTAAATTTCATTTACCAATAGAATTGGAGAAGAACAAATGTTGCTATTACA
AGATCAAAAATGAAATTAATCATCGTTGGAAATTAAAATGTATTAAATCGCTATAAAACC
ATAGACACTTTAATGACTATACTCTAATAAAAGAAATATGTAATGAAATTTTAAGAATTT
GTTTATTAATAATTCCTTTGATTATTAAAACAGGTATACCAACTAACTCAACAAGAGATG
CAAGAAATACAAGAAGAAGTTCTTTAATTATAAAATCCTGAAAATTGA