Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00047440

Standard Name

DIS32 (Exosome complex exonuclease DIS3-2)

Aliases

PreTt11223 | 3.m01807 | 3824.m02982

Description

RNB-like protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• ribonuclease activity (IEA) | GO:0004540
• RNA binding (IEA) | GO:0003723

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.9%

TetraMine Data

TTHERM_00047440

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Stentor Coeruleus	SteCoe_21077	0
WormBase	WBGene00001001	9.997093137033517e-262	locus:dis-3 Probable exosome complex exonuclease RRP44 s tatus:Partially_confirmed Un iProt:Q17632 protein_id:CAA9 4677.2
Tetrahymena borealis	EI9_01706.1	9.997093137033517e-262	RNB-like protein (947 aa)
DictyBase	DDB_G0293614	9.997093137033517e-262	DDB_G0293614 on chromosome: 6 position 3144728 to 3147821
Oxytricha	Contig19321.0.g57	9.997093137033517e-262	RNB domain
SGD	YOL021C	9.997093137033517e-262	DIS3 Exosome core complex cata lytic subunit; possesses both endonuclease and 3-5 exonuclea se activity; involved in 3-5 R NA processing and degradation in both the nucleus and the cy toplasm; has similarity to E. coli RNase R and to human DIS3

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00047440(coding)
ATGAACACATCAATTAGCGTTCAATTTGAGAAGTATAGAAGAGGAGGTATCGGCAAAAAG
GTCACTGAATTGTATTTAAGAGATGATATCTCATGTGGTTTAGTGAATTGCCAAATATGC
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GAGATATTATTTATTACAAGCGATTACTAATCTCATAAAATTGCTTTGGAAAAAGGATTA
AACTCGACCACTATATTTGAGTTTGTTAAATCGATTAAAGGTGAATATCCTAATTTGATG
GATTTTTTGGGTATCTCAGAGTAGGCTATGGATATTGAATTTGAAGGATAATAGGTTCTA
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AATCTTGATTACTCTTCAAACAGGAATTTAGCAGATAGTTTGGATAAAGTAAACAGACCT
AATGATCATTTCTTTAATAAATTGGTTCGTATCATGACTACCAGATCCATGAATGAAGCC
ACATATTTTTGTACAGCTGATGCTGATTATCCTGAATTTTATCATTATGGTTTGGCTGCA
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CTCCTTGCTGCCGCTATTGATATTGAAGCTATTCCAGCATATATGTCAAACAAGCTTAAA
ATGGCTAAAATTTGCGAAAAAATGAATATGAGAAATCGTATGGCTCGTTTTGCATCACGC
TCCAGCTCAGATTATAACACTTATTTATTTTTTAAAGATAAACAAATTGAAGAAGTTGCT
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GGACAAATTAAATTTAGTGAAAAAGATTTAAAAGAAAACGAGAAATTGTTGCAAGAGCTC
AAACAAAATTAATCTTTAATAATTGATTTCGTTGTAAATGGAAACAGACATAAATTATTT
GATTACCTTAAAGTAAGAGTAAGTGTTGGCATGAAAAACTTTCATAAATAAATTACTTTA
GAATATTTAGGTCCTAACTGA

>TTHERM_00047440(protein)
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GINVCSIDPPGCKDIDDALHCISLPNGNFEVGVHIADVSYFVRPDTAIDKEAQNRCTTVY
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QFYQMYETNSLIEEFMLLGNVAVAEKIVSHFPSISILRQHSQPKPKQIKELSQILQKIGF
NLDYSSNRNLADSLDKVNRPNDHFFNKLVRIMTTRSMNEATYFCTADADYPEFYHYGLAA
PLYTHFTSPIRRYADVLVHRLLAAAIDIEAIPAYMSNKLKMAKICEKMNMRNRMARFASR
SSSDYNTYLFFKDKQIEEVAMVSSISKTGATVVVPRYGLEGQIKFSEKDLKENEKLLQEL
KQNQSLIIDFVVNGNRHKLFDYLKVRVSVGMKNFHKQITLEYLGPN

>TTHERM_00047440(gene)
ATGAACACATCAATTAGCGTTCAATTTGAGAAGTATAGAAGAGGAGGTATCGGCAAAAAG
GTCACTGAATTGTATTTAAGAGATGATATCTCATGTGGTTTAGTGAATTGCCAAATATGC
AAAACACCTGGTAGAATATTAGAAATAATATTTAGAATAATAATAACTATCGTAGAAATT
AACTAAAATTTAACTTTAATCCAACAGGAAATACTCTACATATTGAAGGAGAAGATAGAA
CAATTTTTATTTTAGATGAATATACCGTCTTAACTTAGTTAGATGTCATTCTTAATTGCC
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TATATGCTAACGAATATAGCAAATACACATACACTCCCATCCAATAAAATGAAAAGTAAG
AAACAAGAGATACTCGTGCAGTGCTTGAAGCAGCTGTTTGGTATTAAAATCATTTAAAGG
TAAAGACTTATATAAATAGTAATAGTTTATAATTGTTGATATAATAATATTTTCTATTTA
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GTCAAAGCAGGTGACCTGTTCTAAGGTAAACTTAAGATAGATAGAAACGATATTAATGAT
GGTACTGTATTTATCCCAAAATATGATTTTGAAATTAAGATCATTGGATAACCTAACTTA
AATCGTGCTTTGCATGGAGATTTAATAGCTATAGAGCTTTTACCAGAGAACGGTAATTTA
CATGCCATTTATCTATCTACAAAAGATTTAAATATTTTTATTTTAATTTATTAAAGAGTG
GATATCATCAAATTATATGGGTGATAATGAAGACGAAGAAGAAGATTTCAAGAATGTGCA
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AATCTAAAGATATTTCTGCGGAGAAGTTACACCAGAAGCTATCAATTTACCAAATTTACC
TAGTGGTATAGAACTTAGAGAATTTATTCCTGCAGATGGACGTTTCCCCCATTTCTACTT
AAGAACCACAAATGTAGATATTTTTATCATTTTTAAAATATACTTATCTATAAAAATAAA
AAGGGATCTCAATTATAAGGAAAAAAAATATAAATTGGTTTCGATAACTGGAGTAAATCT
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GAAGGAGATGTTATTTTGCTAGAACACAACGTTGAATATAGAGCTTTTTCTAAGTAAGTT
CTTGATTGTTTACCTCCATAAGACGATAAATGGTAAATTCCATAATCAGAAATAAAAAAG
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GATGATGCTCTTCACTGTATATCTTTACCAAATGGTAATTTTGAAGTTGGTGTACATATT
GCAGACGTAAGCTATTTTGTTCGTCCTGATACTGCTATTGACAAAGAAGCCTAAAATAGG
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TACTACTGTCTATTTAGTAGATAGAAGAACAGATATGCTTCCAAAGCTTTTAACCGAAAC
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TCTCAATTACGGTAAAGCACAATCTATGATTGATGACGTTAATGACAATTCAGAGCTTAC
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CTTATTGAAGAGTTTATGCTTCTTGGAAATGTTGCAGTTGCTGAAAAGATAGTATCTCAC
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ATAGTTTGGATAAAGTAAACAGACCTAATGATCATTTCTTTAATAAATTGGTTCGTATCA
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ACAAATTGAAGAAGTTGCTATGGTATCAAGCATTAGTAAAACTGGTGCTACTGTTGTTGT
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