Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00047440

Standard Name

DIS32 (Exosome complex exonuclease DIS3-2)

Aliases

PreTt11223 | 3.m01807 | 3824.m02982

Description

RNB-like protein; associated with cytoplasmic exosome

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• cytoplasm (IDA) | GO:0005737 | Ref:SUPR000278

Molecular Function

• RNA binding (IEA) | GO:0003723
• ribonuclease activity (IEA) | GO:0004540

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.9%

TetraMine Data

TTHERM_00047440

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Stentor Coeruleus	SteCoe_21077	0
WormBase	WBGene00001001	9.997093137033517e-262	locus:dis-3 Probable exosome complex exonuclease RRP44 s tatus:Partially_confirmed Un iProt:Q17632 protein_id:CAA9 4677.2
Tetrahymena borealis	EI9_01706.1	9.997093137033517e-262	RNB-like protein (947 aa)
DictyBase	DDB_G0293614	9.997093137033517e-262	DDB_G0293614 on chromosome: 6 position 3144728 to 3147821
Oxytricha	Contig19321.0.g57	9.997093137033517e-262	RNB domain
SGD	YOL021C	9.997093137033517e-262	DIS3 Exosome core complex cata lytic subunit; possesses both endonuclease and 3-5 exonuclea se activity; involved in 3-5 R NA processing and degradation in both the nucleus and the cy toplasm; has similarity to E. coli RNase R and to human DIS3

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:SUPR000278

Sequences

>TTHERM_00047440(coding)
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GTCACTGAATTGTATTTAAGAGATGATATCTCATGTGGTTTAGTGAATTGCCAAATATGC
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GTTTTAATGCAAACTACTGTGCACAACATTTAAAAAAAAAACCAAAACACATATACAAGC
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AACTCGACCACTATATTTGAGTTTGTTAAATCGATTAAAGGTGAATATCCTAATTTGATG
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TAATTCTACCAAATGTATGAAACTAACTCTCTTATTGAAGAGTTTATGCTTCTTGGAAAT
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AATCTTGATTACTCTTCAAACAGGAATTTAGCAGATAGTTTGGATAAAGTAAACAGACCT
AATGATCATTTCTTTAATAAATTGGTTCGTATCATGACTACCAGATCCATGAATGAAGCC
ACATATTTTTGTACAGCTGATGCTGATTATCCTGAATTTTATCATTATGGTTTGGCTGCA
CCCCTTTATACTCACTTCACCTCTCCAATTCGTAGATATGCTGATGTTTTAGTTCACAGA
CTCCTTGCTGCCGCTATTGATATTGAAGCTATTCCAGCATATATGTCAAACAAGCTTAAA
ATGGCTAAAATTTGCGAAAAAATGAATATGAGAAATCGTATGGCTCGTTTTGCATCACGC
TCCAGCTCAGATTATAACACTTATTTATTTTTTAAAGATAAACAAATTGAAGAAGTTGCT
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GGACAAATTAAATTTAGTGAAAAAGATTTAAAAGAAAACGAGAAATTGTTGCAAGAGCTC
AAACAAAATTAATCTTTAATAATTGATTTCGTTGTAAATGGAAACAGACATAAATTATTT
GATTACCTTAAAGTAAGAGTAAGTGTTGGCATGAAAAACTTTCATAAATAAATTACTTTA
GAATATTTAGGTCCTAACTGA

>TTHERM_00047440(protein)
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EYTVLTQLDVILNCPKLVNVVLMQTTVHNIQKKNQNTYTSLRNLVEGEIYRNIHIYANEY
SKYTYTPIQQNEKQETRDTRAVLEAAVWYQNHLKSSMRDIEILFITSDYQSHKIALEKGL
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QGKLKIDRNDINDGTVFIPKYDFEIKIIGQPNLNRALHGDLIAIELLPENEWISSNYMGD
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GHFKMLIGDSGDTKAEGDVILLEHNVEYRAFSKQVLDCLPPQDDKWQIPQSEIKKRVDLR
GINVCSIDPPGCKDIDDALHCISLPNGNFEVGVHIADVSYFVRPDTAIDKEAQNRCTTVY
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QFYQMYETNSLIEEFMLLGNVAVAEKIVSHFPSISILRQHSQPKPKQIKELSQILQKIGF
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SSSDYNTYLFFKDKQIEEVAMVSSISKTGATVVVPRYGLEGQIKFSEKDLKENEKLLQEL
KQNQSLIIDFVVNGNRHKLFDYLKVRVSVGMKNFHKQITLEYLGPN

>TTHERM_00047440(gene)
ATGAACACATCAATTAGCGTTCAATTTGAGAAGTATAGAAGAGGAGGTATCGGCAAAAAG
GTCACTGAATTGTATTTAAGAGATGATATCTCATGTGGTTTAGTGAATTGCCAAATATGC
AAAACACCTGGTAGAATATTAGAAATAATATTTAGAATAATAATAACTATCGTAGAAATT
AACTAAAATTTAACTTTAATCCAACAGGAAATACTCTACATATTGAAGGAGAAGATAGAA
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TATATGCTAACGAATATAGCAAATACACATACACTCCCATCCAATAAAATGAAAAGTAAG
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GTCAAAGCAGGTGACCTGTTCTAAGGTAAACTTAAGATAGATAGAAACGATATTAATGAT
GGTACTGTATTTATCCCAAAATATGATTTTGAAATTAAGATCATTGGATAACCTAACTTA
AATCGTGCTTTGCATGGAGATTTAATAGCTATAGAGCTTTTACCAGAGAACGGTAATTTA
CATGCCATTTATCTATCTACAAAAGATTTAAATATTTTTATTTTAATTTATTAAAGAGTG
GATATCATCAAATTATATGGGTGATAATGAAGACGAAGAAGAAGATTTCAAGAATGTGCA
TGAAGCTGTCAAAACAAACAATTCTAATAAATAGTTAGAAGAAAAATATTTAAATGTAGT
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AATCTAAAGATATTTCTGCGGAGAAGTTACACCAGAAGCTATCAATTTACCAAATTTACC
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AAGGGATCTCAATTATAAGGAAAAAAAATATAAATTGGTTTCGATAACTGGAGTAAATCT
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GAAGGAGATGTTATTTTGCTAGAACACAACGTTGAATATAGAGCTTTTTCTAAGTAAGTT
CTTGATTGTTTACCTCCATAAGACGATAAATGGTAAATTCCATAATCAGAAATAAAAAAG
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GATGATGCTCTTCACTGTATATCTTTACCAAATGGTAATTTTGAAGTTGGTGTACATATT
GCAGACGTAAGCTATTTTGTTCGTCCTGATACTGCTATTGACAAAGAAGCCTAAAATAGG
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TACTACTGTCTATTTAGTAGATAGAAGAACAGATATGCTTCCAAAGCTTTTAACCGAAAC
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TCTCAATTACGGTAAAGCACAATCTATGATTGATGACGTTAATGACAATTCAGAGCTTAC
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ATAGTTTGGATAAAGTAAACAGACCTAATGATCATTTCTTTAATAAATTGGTTCGTATCA
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