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Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00304170Standard Name
DIS31 (Exosome complex exonuclease DIS3-1)Aliases
PreTt21223 | 29.m00184 | 3696.m00007Description
Nucleolar exosome component, involved in rRNA processing and RNA degradationGenome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
Molecular Function
- RNA binding (IEA) | GO:0003723
- ribonuclease activity (IEA) | GO:0004540
Domains
Gene Expression Profile
- Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.8%
TetraMine Data
TTHERM_00304170
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_11576.1 9.997093137033517e-262 RNB-like protein (1268 aa)
Oxytricha Contig21538.0.g91 2.9996910481190226e-100 RNB domain
DictyBase DDB_G0278757 8.003693242657371e-87 DDB_G0278757 on chromosome: 3
position 1123519 to 1127550
WormBase WBGene00018612 6.001756404910437e-77 locus:disl-2 DIS3-like exonu
clease 2 status:Confirmed
UniProt:Q09568 protein_id:CC
D71518.1
SGD YOL021C 3.0011931572567413e-53 DIS3 Exosome core complex cata
lytic subunit; possesses both
endonuclease and 3-5 exonuclea
se activity; involved in 3-5 R
NA processing and degradation
in both the nucleus and the cy
toplasm; has similarity to E.
coli RNase R and to human DIS3
Stentor Coeruleus SteCoe_21077 3.532628572200807e-24
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00304170(coding)
ATGTAATTGACAATCTAAGAATAATATTAAAAAGAAGCCAAGAAAAGAAATTATAAGCAT
AAGAAATTTTATAAAAAATCAAATTTTCTTTTAAGATCAAAGATTTAATTGCTGACTATT
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ATGTGTCTCTACTTGAAAGACCACTCTGTTTAATCAAAAGGCATGGTAATTTCTTTCGGT
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CCCATTATAGTAAGTCTCACAAGCACAGATACTTTCCCTATCGATTATAAAGTAAAAATT
TCTCTTCCAGATCCAGATGATAAAAAAGTTACTCACGTTTTGGAATGA>TTHERM_00304170(protein)
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VTSMTIFIPDHETQRTVYFKDYKNILKAKVEKEKDGNKLMITYKTASMPRENTVYFHEFS
PIIVSLTSTDTFPIDYKVKISLPDPDDKKVTHVLE>TTHERM_00304170(gene)
ATGTAATTGACAATCTAAGAATAATATTAAAAAGAAGCCAAGAAAAGAAATTATAAGCAT
AAGAAATTTTATAAAAAATCAAATTTTCTTTTAAGATCAAAGATTTAATTGCTGACTATT
TAACAAACAAACAAACAAATAAACCTACAAACAGTTTATCAAAGATAGTTAATTTTTCTG
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TAAACAAAGAAGATTTCTTATATTAATTAATAAATGATTAATTAAATACAAAGAGCCTAA
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ATATACCTTAGTAAGGAGTGGACTCACAAAAAATGTTTGATGATATTCTACTTTTAGCTA
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TTAAGAAAAGATTTAAACTCAATGAAAAATTATGGCCTGTAGATTTTACTCTTGAAGAAA
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AAGAAATGGTAAAACAATGCAAATCACTTGCTGTCCTTCGTTAACATTGCTATCCTTCAG
ATATAAAGCAAAAGCAACTGAATGTAATTGCTAAGAAATTCGGACATTAAATTGATTTCT
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TCTTTCGGTGTCACTAGCATGACCATTTTCATACCAGATCATGAAACCTAAAGAGTAATT
GATTATTATTTAATAATTTTATAAAATAATTTTTTTTAATTTAATAAATTAAGACTGTTT
ACTTCAAAGATTATAAAAATATCTTGAAAGCTAAAGTAGAAAAAGAAAAAGATGGTAATA
AGTTAATGATTACATATAAGACTGCAAGCATGCCTAGAGAAAACACTGTTTACTTCCATG
TACATAATTTCAAATTTATATTTGTGTTGCTAATTGTTTAAAAATAAATTTAAATAGGAA
TTCTCTCCCATTATAGTAAGTCTCACAAGCACAGATACTTTCCCTATCGATTATAAAGTA
AAAATTTCTCTTCCAGATCCAGATGATAAAAAAGTTACTCACGTTTTGGAATGA
