Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00726380
Standard Name
CYC30 (CYClin 30)
Aliases
PreTt21903 | 117.m00155
Description
amine-terminal domain cyclin
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10%
TetraMine Data
TTHERM_00726380
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_04628.1 9.997093137033517e-262 hypothetical protein (319 aa)
Oxytricha Contig11713.0.g24 0.000000000000004001928599951003 Cyclin, N-terminal domain
DictyBase DDB_G0286617 0.000000019990673443141236 cycK on chromosome: 4 position
4722525 to 4724281
WormBase WBGene00000507 0.000008000552149328928 locus:cit-1.1 Cyclin-T1.1
status:Confirmed UniProt:P34
425 protein_id:CCD63445.1
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
Ref:27192402 : Yan GX, Dang H, Tian M, Zhang J, Shodhan A, Ning YZ, Xiong J, Miao W (2016) Cyc17, a meiosis-specific cyclin, is essential for anaphase initiation and chromosome segregation in Tetrahymena thermophila. Cell cycle (Georgetown, Tex.) 15(14):1855-64
Sequences
>TTHERM_00726380(coding)ATG AAA TTG TAC AAG AAA AGT GAG ATA TTT TCT GAA AAA TAT AAT AAG AAT AGT GAA TTA GAA ATA AGT CCA GAA GTT CAA AAG AAA ATC ATG GAT GGA AAT GCT GCA TTT ATA ATT GAT TTA ATA GCA AGT TTA AAA ATT CCT AGC TTC ACT ATA TCA TCA CTT GGA ATC CAG CTC GTT AAT TAT TTT TTT ATT GGA AAG AGC TAC TTG AAC TAT GAT AGA TTC ATT TAC TGT GCT GCT GCT TTG ATG CTG GCA TTT AAA ATA AAG GAA TAA GAT CAT TAT AGG TTA AAG CCT ATT ATT ATG GGA TAT TAC CAG TAA GCA CCA AGA AGG GAC TAG ACA TAG ATA ATG AAT GAT ACG ATA TAT TAA TAA ATT AAA AAT AAA ATT TGC ATA GCT GAA AGC AAA TTG TTA AAA GCA ATA TAA TTT GAA TTC GAT ATA TAG CTT CCC TTT GAT TTC TTG CAA ACA ATT ATT GAA TTC TGT AAT GAA AAA GAT CAA GAT AAA GAA CGT ATA TAT TAT GCC ACT AAG GTA ATA AGT TAT GAT AGC TTT AGA AGT TAT GCT CCT CTT ATT TTT AAA CCA CAA ATT ATA GCT GTT TCT GCT TTT ATG ATT AGC TGC TCT TAA TTT AAC ATA GAA CCA CAC TTA AGA ATT CCT GAA AGA TTC AAA GAA AAG TAT AAT CCT GAG ACT ATG AGA GAA GAA GAA GCT TAT GAA AGA TGG CTG CAA GAA ATT TCT ATA GAA TTA AAA ACA TAA ATT ACT GCT GAA GAT ATA AAA GAT TGC TTG TAC GTA CTA AAT GAA CTT CTT TAT CTT CAC TAT AAT CCT AAA GAA GAT GAT TTA AAA AAA TTT GAA TAG TAT GAA ACC TCT CTT GAA TAA AGC AAA ATT AAA AAT GAT CAA AAT GAA AAA CCA AAT TAA GAA AAA TAG ACT GAA TAA AAA ATG GAT ATT GAA TAA TAG TGA >TTHERM_00726380(protein)M K L Y K K S E I F S E K Y N K N S E L E I S P E V Q K K I M D G N A A F I I D L I A S L K I P S F T I S S L G I Q L V N Y F F I G K S Y L N Y D R F I Y C A A A L M L A F K I K E Q D H Y R L K P I I M G Y Y Q Q A P R R D Q T Q I M N D T I Y Q Q I K N K I C I A E S K L L K A I Q F E F D I Q L P F D F L Q T I I E F C N E K D Q D K E R I Y Y A T K V I S Y D S F R S Y A P L I F K P Q I I A V S A F M I S C S Q F N I E P H L R I P E R F K E K Y N P E T M R E E E A Y E R W L Q E I S I E L K T Q I T A E D I K D C L Y V L N E L L Y L H Y N P K E D D L K K F E Q Y E T S L E Q S K I K N D Q N E K P N Q E K Q T E Q K M D I E Q Q >TTHERM_00726380(gene)ATG AAA TTG TAC AAG AAA AGT GAG ATA TTT TCT GAA AAA TAT AAT AAG AAT AGT GAA TTA GAA ATA AGT CCA GAA GTT CAA AAG AAA ATC ATG GAT GGA AAT GCT GCA TTT ATA ATT GAT TTA ATA GCA AGT TTA AAA ATG TAA ATA ATT GTT TTT TGA GAG ATT TGG TTT TAA TTT ATA CAT AAT TTA TTA GCC AAG TTT ATT CAA ATA GTA ATT TAA GAC ATT TCT TTA AAA ATC CTA TAG TCC TAG CTT CAC TAT ATC ATC ACT TGG AAT CCA GCT CGT TAA TTA TTT TTT TAT TGG AAA GAG CTA CTT GAA CTA TGA TAG ATT CGT AAT TAC GCA TTT ACA AAT GAA TGA AAT TAA TTC AAA TCA AAG AAA GTT TAT TCG AAA AAT ACA TCA AAA AAT ATG AAT AAA CAA ATA TAA TTG AGA AGA ATA TAA TTT TGA ATT TAT ATT ATT ATC ATA ATG CAT TAT AAA ATG GGA GTT AGT TAG TTA ATT GAT TTT ATT TTT AAT TAG ATT TAC TGT GCT GCT GCT TTG ATG CTG GCA TTT AAA ATA AAG GAA TAA GAT CAT TAT AGG TTA AAG CCT ATT ATT ATG GGA TAT TAC CAG TAA GCA CCA AGA AGG GAC TAG ACA TAG ATA ATG AAT GAT ACG ATA TAT TAA TAA ATT AAA AAT AAA GTA AAA AAT AAT AAT AAT AAA TAA TTT TAA TCT AAT TAA ATT ATA AAT AAA AAA GAT TTG CAT AGC TGA AAG CAA ATT GTT AAA AGC AAT ATA ATT TGA ATT CGA TAT ATA GCT TCC CTT TGA TTT CTT GCA AAC AAT TAT TGA ATT CTG TAA TGA AAA AGA TCA AGA TAA AGA ACG TAT ATA TTA TGC CAC TAA GGT AAT AAG TTA TGA TAG CTT TAG AAG TTA TGC TCC TCT TAT TTT TAA ACC ACA AAT TAT AGC TGT TTC TGC TTT TAT GAT TAG CTG CTC TTA ATT TAA CAT AGA ACC ACA GTA ATA ATC TTT TTT TAT TAT TTC AGT TGA ATA AAA TAA TAT GTT CAA TTA TTA GCT TAA GAA TTC CTG AAA GAT TCA AAG AAA AGT ATA ATC CTG AGA CTA TGA GAG AAG AAG AAG CTT ATG AAA GAT GGC TGC AAG AAA TTT CTA TAG AAT TAA AAA CAT AAA TTA CTG CTG AAG ATA TAA AAG GTA ATT TTA TTT AGA CTA ATT TTA AAA TCA AAT TTA TTT ATT TTA TTG TTT AAA TAA TTA TAA GAT TGC TTG TAC GTA CTA AAT GAA CTT CTT TAT CTT CAC TAT AAT CCT AAA GAA GAT GAT TTA AAA AAA TTT GAA TAG TAT GAA ACC TCT CTT GAA TAA AGC AAA ATT AAA AAT GAT CAA AAT GAA AAA CCA AAT TAA GAA AAA TAG ACT GAA TAA AAA ATG GAT ATT GAA TAA TAG TGA