Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00842480

Standard Name

CYC24 (CYClin 24)

Aliases

PreTt16233 | 147.m00085 | 3741.m00030

Description

Cyclin, N-terminal domain containing protein

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.2%

TetraMine Data

TTHERM_00842480

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_18933.19.997093137033517e-262cyclin domain-containing prote
in (636 aa)
OxytrichaContig19213.0.g103.001032840497736e-70Cyclin, N-terminal domain
DictyBaseDDB_G02754931.0002546821282671e-50cycB on chromosome: 2 position
6000211 to 6001649
SGDYDL155W1.000499495426459e-47CLB3 B-type cyclin involved in
cell cycle progression; activ
ates Cdc28p to promote the G2/
M transition; may be involved
in DNA replication and spindle
assembly; accumulates during
S phase and G2, then targeted
for ubiquitin-mediated degrada
tion
WormBaseWBGene000008681.0004783691736523e-35locus:cyb-3 G2/mitotic-speci
fic cyclin-B3 status:Confirm
ed UniProt:Q10654 protein_
id:CAC42336.2
Stentor CoeruleusSteCoe_93461.462486227251231e-31

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:27192402: Yan GX, Dang H, Tian M, Zhang J, Shodhan A, Ning YZ, Xiong J, Miao W (2016) Cyc17, a meiosis-specific cyclin, is essential for anaphase initiation and chromosome segregation in Tetrahymena thermophila. Cell cycle (Georgetown, Tex.) 15(14):1855-64

Sequences

>TTHERM_00842480(coding)
ATGATAATGGGTATTTATTTGTTAAACAAAAAAAATTAAAAAAAGAATAAGAAAGCCTAA
TATCAATTATCAAATCAAATAAAAAACAGTGAAAAAAAAAGTAATAATAATTAAACATAC
AAAATAATTACAATTAAAAAAACCCTTGCATAATACAAAGCAATCCTTTCAAAAGGAAAT
AACCGTATTTAGCACTCCATCTTATCATCTAAAGCTTCCTTCTTTTACTCAATGAGTTTC
TAATACAGAAAGACTAAATAACAACCATCATCATCTTTAGAAAGCTAAGGAAAGCACACT
TATTTAGCTCATGGCAACAACAATTATTATAATAAAGAAAATATTTCCTACTAAACTTCC
TAGCAATATAACTTATATCCCCTCAATAACTTCTATTAGCCACTTTAACAACATTAACCT
TTGCAACAATAGCAAATATTATAGCAATTACCAATCAGCAAAACTTCAAACAACAATTCT
AACAATATATACCCTAACACTAGACGTTTCGGTCGTGACCTTTCTAATATTCAATAAGGC
TAGGGAGCTAATATTTAACAGCATCAGTAAATTCTCAATAAAAAAAACAATAACAACAAT
AACGGATCCTTGACAAACTCAAGATGCACAAGCAGAGAATTGTCAGTTAATAATCGCAGA
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AGTAGCAACAATGTTTCTGTTTAAAATTTTTTTACTGAAAACAGCTTCTATTTCCCTATT
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ACAAGCATAGGATAAAGTTTAATTAATTATAATTCTTAAACATCTGCCTCTCTATCTCAA
GCTCCTTAAACAGACTATACAACTGAATACTTTAATTTTTTATAACAAATGGAGAATGGT
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TGCAAAACTTAATACTTTGAATAAGGTTGCTAGCCTGATTTAAATAGTAGAATGAGGACT
ATTCTAATTGACTGGCTTATAGATGTTCACCTAAAATTTGACTTACTTCCTGAAACACTT
TTCTTGACAGTAAACTTGATAGATAGGTATTTAGAGAAAGGACCAAAAGTTGATAAATCT
AAATTTTAACTAGTTGGTATTGCTGCTCTCTTTATTGCTTGCAAATACGAAGAAATTTAT
CCACCTGAAGTAAAAGATTTCACTCATGTTTGTGATGACGCTTACACAAAACAAGAGCTC
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TTTAGATTTTTAGAGAGGTATGCTCGTATTGCTGAATTCGATTAAAAATAATTTTTGACT
GCATTATACTTCCTAGAAATGGCTTTAGTTGATTACTAAGGAACTAAGTATACTCCTAGC
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AGCGAGGCTTTAATTCGTAACACTAAATACGAATAGCAATAACTTATTCCTGTTGTTGAA
GAGTTATGTGAGATTCATCGTAAGGCTGAACTTAGAGAAAAGTAAACTAAAGACAAAGAT
AAATAATTAAACGCAGTAAAAAGAAAATTTGCTCAACAGCGTTTTGAATCCGTCTATGCA
TATGTTGCTCTATTTTTCTAAAATACAAATAAAGCTGCCCAAACATATTAATAAAATAGT
AACAATTTGATTAGCAACTGA


>TTHERM_00842480(protein)
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NRIQHSILSSKASFFYSMSFQYRKTKQQPSSSLESQGKHTYLAHGNNNYYNKENISYQTS
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PSSTQANQQVQGQSIHTTINTSIGQSLINYNSQTSASLSQAPQTDYTTEYFNFLQQMENG
HSQQSNNIHDQHSQQQQIQHQANSQQNYYSQQKYTSRRNYPDSRSSMELIDYKYINKPEY
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FLTVNLIDRYLEKGPKVDKSKFQLVGIAALFIACKYEEIYPPEVKDFTHVCDDAYTKQEL
FEYEGLILQVLNFNITTPSAFRFLERYARIAEFDQKQFLTALYFLEMALVDYQGTKYTPS
QLACGSILISSIIYNKQERWSEALIRNTKYEQQQLIPVVEELCEIHRKAELREKQTKDKD
KQLNAVKRKFAQQRFESVYAYVALFFQNTNKAAQTYQQNSNNLISN


>TTHERM_00842480(gene)
ATGATAATGGGTATTTATTTGTTAAACAAAAAAAATTAAAAAAAGAATAAGAAAGCCTAA
TATCAATTATCAAATCAAATAAAAAACAGTGAAAAAAAAAGTAATAATAATTAAACATAC
AAAATAATTACAATTAAAAAAACCCTTGCATAATACAAAGCAATCCTTTCAAAAGGAAAT
AACCGTATTTAGCACTCCATCTTATCATCTAAAGCTTCCTTCTTTTACTCAATGAGTTTC
TAATACAGAAAGACTAAATAAGTAATTTATATTTTCCATTCACGTTGCCGTCCTTTTCTC
GCTGCGCCAGTTGCTTTAACATGCGCAGGAGGGCAATAAATTAGTTCACAACTTACCACT
TTTCTTTCTTTTAAATATTAAATTAATTTTAATAAAAATAGCAACCATCATCATCTTTAG
AAAGCTAAGGAAAGCACACTTATTTAGCTCATGGCAACAACAATTATTATAATAAAGAAA
ATATTTCCTACTAAACTTCCTAGCAATATAACTTATATCCCCTCAATAACTTCTATTAGC
CACTTTAACAACATTAACCTTTGCAACAATAGCAAATATTATAGCAATTACCAATCAGCA
AAACTTCAAACAACAATTCTAACAATATATACCCTAACACTAGACGTTTCGGTCGTGACC
TTTCTAATATTCAATAAGGCTAGGGAGCTAATATTTAACAGCATCAGTAAATTCTCAATA
AAGTAATACATTAAAATATTTTGCTCTTATTTAGAGATTCATTCTTTCGTTGCCTTTCAT
TTATAAAAATATTTCTTATTAATTTAATTTGAATATTTGATTTCAAGTCAATTCTACTTT
ATCTATCAATCTATCTATTTACTTATAAATATATATATCTTTTCTTTATAAATACTTTGC
TAATAAAAATTCTCCTTTAAAATTTTAGAAAAACAATAACAACAATAACGGATCCTTGAC
AAACTCAAGATGCACAAGCAGAGAATTGTCAGTTAATAATCGCAGATAAACTAGTTTTGT
AACATAACAACAAGGAAATAATAAATTAAATAGTAGTGTTAATATGGTTTTAGAAAAAAG
TGCTGGTACATCAAACAACAGTCGCTATAGAGGTGTTGTTCCTGCTGCTCGCCTAAATTA
AGTTAACAATCCCAACAGTGGTCTTAAGATGGATGTTGAAAATTAAAGTAGCAACAATGT
TTCTGTTTAAAATTTTTTTACTGAAAACAGCTTCTATTTCCCTATTCCTTCATCTACTCA
AGCTAACTAATAAGTTTAAGGTTAATCTATACACACCACAATAAATACAAGCATAGGATA
AAGTTTAATTAATTATAATTCTTAAACATCTGCCTCTCTATCTCAAGCTCCTTAAACAGA
CTATACAACTGAATACTTTAATTTTTTATAACAAATGGAGAATGGTCATTCCCAATAAAG
TAATAACATACATGACCAACATAGCTAACAATAATAAATTCAACACTAAGCTAATTCACA
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TTATTGATTTTAGTGAACCTAAAGTATTTTTTAATCTTTATTGTAATAGCTTTTTATAAT
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TAGAATGAGGACTATTCTAATTGACTGGCTTATAGATGTTCACCTAAAATTTGACTTACT
TCCTGAAACACTTTTCTTGACAGTAAACTTGATAGATAGGTATTTAGAGAAAGGACCAAA
AGTTGATAAATCTAAATTTTAACTAGTTGGTATTGCTGCTCTCTTTATTGCTTGCAAATA
CGAAGAAATTTATCCACCTGAAGTAAAAGATTTCACTCATGTTTGTGATGACGCTTACAC
AAAACAAGAGCTCTTCGAATATGAAGGTCTCATTCTTCAGGTACTTAACTTCAATATCAC
TACTCCTAGTGCTTTTAGATTTTTAGAGAGGTATGCTCGTATTGCTGAATTCGATTAAAA
ATAATTTTTGACTGCATTATACTTCCTAGAAATGGCTTTAGTTGATTACTAAGGAACTAA
GTATACTCCTAGCCAACTTGCATGTGGATCTATTTTGATTTCAAGCATAATTTACAACAA
ATAAGAAAGATGGAGCGAGGCTTTAATTCGTAACACTAAATACGAATAGCAATAACTTAT
TCCTGTTGTTGAAGAGTTATGTGAGATTCATCGTAAGGCTGAACTTAGAGAAAAGTAAAC
TAAAGACAAAGATAAATAATTAAACGCAGTAAAAAGAAAATTTGCTCAACAGCGTTTTGA
ATCCGTCTATGCATATGTTGCTCTATTTTTCTAAAATACAAATAAAGCTGCCCAAACATA
TTAATAAAATAGTAACAATTTGATTAGCAACTGA