Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00784350

Standard Name

CYC21 (CYClin)

Aliases

PreTt25539 | 131.m00112 | 3813.m01615

Description

Cyclin, N-terminal domain containing protein

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.5%

TetraMine Data

TTHERM_00784350

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_11420.29.997093137033517e-262cyclin domain-containing prote
in (1232 aa)
OxytrichaContig537.1.g1369.99893167504554e-35Cyclin
DictyBaseDDB_G02776679.001422350855153e-28DDB_G0277667 on chromosome: 2
position 8286817 to 8288311
WormBaseWBGene000226979.997975313387782e-28locus:cyy-1 Uncharacterized
cyclin-like protein ZK353.1
status:Partially_confirmed U
niProt:P34624 protein_id:CCD
73200.1
Stentor CoeruleusSteCoe_114707.095474162284704e-23

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:27192402: Yan GX, Dang H, Tian M, Zhang J, Shodhan A, Ning YZ, Xiong J, Miao W (2016) Cyc17, a meiosis-specific cyclin, is essential for anaphase initiation and chromosome segregation in Tetrahymena thermophila. Cell cycle (Georgetown, Tex.) 15(14):1855-64

Sequences

>TTHERM_00784350(coding)
ATGAAGAGGTGGGAGGAATAGCAAAAGAATAAAGTTCATCAATCTCGTATTAAAAACGTT
AAAGCTGCTGTTTCAAATACAGGAGTACGCAAATCAGGAAAACTCAATAAATCTTTAAAT
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TATGGCTATGATTTGAAGAAATTTAATTACTTAAGTTAAAATTAGCTAAACAGCCTTCTT
GATGAAATAAGAGTTTAACCTGGACATAAGACAAAATTAATTGATTTATTAGATTTAATA
TCGAATGAGATGATCCCAGAAATAGAGAATAATTCTATGTGGAATGCATTATCTCCTGGT
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AAGTAGGAAGAAGAAAAATCTAAGCTTTAGTAAAAAGAAAAAGAATTAGATTTTAAGTAA
AAGTAGGAAATTGAGAAACTTAAATAAAAGTCAGATGGAGGTAGCAAAACCCTTGCTTAA
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GGAATTCACAAGAAAGGAAGACCCCAAACTGCAAAATATTCAAGAAATGTACCTTATGTT
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GATGGTGGAAAATTGACTTCAACTTTAGTAAATTTAGATATAGAAGAAATGTGCTTCTGC
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AATCGAACAACTAATCCTATTGAAGAACCCACGATGATTCATGATGATTATAATTAAAGC
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GATGACGAAAAAGAATTTGAATACACAGAAAACGAAGAAGATGATGAGGATGAATCGAAC
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AAAAATAATAAATATGATTTAGACGATACATAAAATTAAGAAAAAAGCCTATAAGAACCA
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TAAAAAAACAAAAAGTCATTCCCATTGAGACCTTTAGATTTGAAAACTATTTTATACTTG
CAAAATAATGCAAACAGAGCTCAAAGTAACCTAAAAGAAATGTATTAAAACCCTTTAAAC
AAGAGCTTTTGA


>TTHERM_00784350(protein)
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QNSISDYYESEKNNLESIPLYRILKLQNLQRYAKELVSRGYGYDLKKFNYLSQNQLNSLL
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NSAKQIPSKQHFYALGKQPATTKNQRQQNIVPNLQRKNSQPHVSTQNRANHHMYYQGNQR
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NSTSTKNPSLNNSKTNQTSSTISGSSIAQKSVNSTQINNSKQQTSSITQTKPQSSQTQKR
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KQEEEKSKLQQKEKELDFKQKQEIEKLKQKSDGGSKTLAQTAKDLASQLQHNDQPQQNQS
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MFDVIQINEMERVFLNFIDYNLYVKGADYAKYYFILREFAQKNKKSFPLRPLDLKTILYL
QNNANRAQSNLKEMYQNPLNKSF


>TTHERM_00784350(gene)
GGAAATCAATCAATAATTAAAACAAAAAAGAAAAATTTTGATAATCAATATTTTAAAGTT
ATTTATTATAGTTAAATAAGCAATTAAGTAGTAAAAACTCACTAGGTATATACAAAAGCT
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TAGGATTAAAAATAATTTTTTTAAAAATTCAAGGTTTAACCTGGACATAAGACAAAATTA
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TATTATCAAGGAAATTAAAGATAAATAAAATCTCATACTTCTCATGTAAAGAAGCGCACA
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GAATTTTAAGAAGCTATTGAAAGTTTAGTCAATTAGTATAATTTTGCTAATAATCGTTAA
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CTATAATAGCTCTTGTTTACATCGAAAGGCTTTTAAATAATAGTGGTTTTTACATGACCC
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ATGAGTCTTTTGAAAATAAAAACTTTTCACAGGCATTCCCTATGTTTGATGTGATATAAA
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CCGATTATGCAAAATATTATTTTATATTGAGAGAATTTGCATAAAAAAACAAAAAGTCAT
TCCCATTGAGACCTTTAGATTTGAAAACTATTTTATACTTGCAAAATAATGCAAACAGAG
CTCAAAGTAACCTAAAAGAAATGTATTAAAACCCTTTAAACAAGAGCTTTTGA