Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00827080

Standard Name

CYC18 (CYClin 18)

Aliases

PreTt08485 | 143.m00090

Description

Cyclin, N-terminal domain containing protein; regulates activity of cyclin-dependent kinases

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.1%

TetraMine Data

TTHERM_00827080

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_19074.19.997093137033517e-262cyclin domain-containing prote
in (806 aa)
OxytrichaContig19213.0.g106.997942222381785e-66Cyclin, N-terminal domain
DictyBaseDDB_G02754931.0000844672813518e-48cycB on chromosome: 2 position
6000211 to 6001649
SGDYLR210W1.9998323414791308e-36CLB4 B-type cyclin involved in
cell cycle progression; activ
ates Cdc28p to promote the G2/
M transition; may be involved
in DNA replication and spindle
assembly; accumulates during
S phase and G2, then targeted
for ubiquitin-mediated degrada
tion
Stentor CoeruleusSteCoe_40811.0806392777072785e-30
WormBaseWBGene000008653.998693556225637e-29locus:cyb-1 G2/mitotic-speci
fic cyclin-B1 status:Confirm
ed UniProt:Q10653 protein_
id:CAA94384.1

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:27192402: Yan GX, Dang H, Tian M, Zhang J, Shodhan A, Ning YZ, Xiong J, Miao W (2016) Cyc17, a meiosis-specific cyclin, is essential for anaphase initiation and chromosome segregation in Tetrahymena thermophila. Cell cycle (Georgetown, Tex.) 15(14):1855-64

Sequences

>TTHERM_00827080(coding)
ATGGTAGACAACTTTCGCTTCTACACAGATATGGGTAATCAAGATAATTAATTTGACATT
GACAGTTCTAAAGAAAATAATGATTTATTTGGCATGAGTGGTTTGCTTGTTAGTCTTTGT
AAATAAAATAACAACTTGGTACCTAATTAGCAGGAAAGAATGGACATACAAAGCAGAGTA
GGCAAGGATATTACAAATGTGCTACAAAATCAAATGCACAACAACTTACCCATCAAAAAG
GCAATTAGCAGCAACTTTTAGGATGAAAAAAATTAAATAAATATGCAAAAGAGCTTGTAA
TAAATTCGTGCTCACAACAGAACTACCTCTAGCATTCTATTTGTAGGAAATAAAGGCAAA
AAAGATGGTATATAAGCTAATACAACTCAAGAATAATAACAATTTTAATTTAACGACTAA
GCAAGAGCTTTTTCTAATAAACCAGTCTATAATAACAATGTAAAAGTGAATAAAAGTGGT
AATTTTGCACAAATAACTAGCAATTATCACTAGATGAATAGAATCCCAGAATAATTTTCT
TGTGAAAAAGAAAACACTAATTCTTATGCAGCTTAATTTCATCTTTAGTAACAATCTAAT
TAAATTTAAAACATGCAATGCTAGACCAACTTTTTGGCTCACAGTACCAACAATCTTCAA
TACAACAACTTCAATAACAAATCAAATCCTCATTTAAATATTTTCGCTTCTTAAGCAGTT
AGCACTTCGTTAAACTAGCCCTTATCAACAATCACAGATTTACCTCTAGTCCAGCCAATT
TAAAATGAAGAAGAAAATGAAAAATGCGTATCTGGAACAGATAGCTAATAGCTCAACTCT
TCTAATAAGTTAGCTCATTTAGAATATATCCGCGAAATCATTTCTCACTTAAGAGCAACA
GAGAACAATTTCAGTGCTAAAGGAGGATACATGGGTGTTGTTTAGAAAGAGATAAATGAA
AGAATGAGATCAATTTTATTAGATTGGTTAGTTGATGTTCATTTCAAATTCAAACTTCGT
ACTGAAACCTTATTTATTACCATTAATCTTATTGATAGATATTTGGAATAAGTACCATTA
GAAAGTAGTAGACTCTAATTGCTTGGTATAACTTCTTTATTTATTGCAGCTAAGTACGAA
GAAGTATACTCTGTTCCTCATATTAGTGACTTAGTCTATGTTTGTGATAATGCTTATAAG
AAGGAAGAAATTTTTGACATGGAAGGATCAATATTAAAAGTTCTTAACTTTAATATTTTA
TGTGTTACTTCGTTCCGTTTCTTAGATTATTTTATTTAGTTTGATGAATTGGGAGAGAAA
AATTACTACCTTGCTCGCTATTTAATAGAAATTGCACTGCTTGAGTATAAAATGATCAGT
AATGCTCCAAGTCTTCTTGCCTCTGCTGCCATATATTTAGTCAATAAAATAAGAAAGAGA
GATGTTGCATGGAAAGAAAGCATGATCGAAATCACTGGTTATTTGGAATAAGATATCCGT
CCATGTGCTAAATTAATTTGCCATATTGTTTAAACAATTGATTAACGTAAGTACTTGGTT
TCCCTTCGCAAAAAATTCTAAAAGCCCTAATTCCTTGAAGTTGCTAAAATCAAAATTGAG
CAACGCAAAGAAAATAATGCTTTTTGCAAAAACTAAATTAAAAATAACAACAACGGAAAT
TGCATTTAGGCTTCATAAAATCTAACTAGTTCGGTATGTGCTCCCTTCCAAGAATGTGCC
TCTAAAGACTAAGAAATAATTCCTGAAATATAAAACGATAATAGCAGCAATAATTTCAAC
AATCCTAATAACTATTAGCAATAAAATCAACCAGCTTACAGTTACAATAATTTTTAGAAT
TACCATTCTAATAGCAATAATAATATTTAAAATGACTAATGCAACATAAATTTATAAGAG
TAGTAATTGCAATAAGTACAATCTGTAGATATTACTGTACCACTTTAAGCAGCCTGTGTT
TTGATTGAAAAGAGGTTTGCTGAAATAAAGCCAAGTAACTATGTCTAATGTCTAATTAAT
AAAGCTCTTTAAGGAACCTAGCCAATTGAGCTTAAAGTACCTTCATAAATGTTACTCTTT
ATGATTGAAAAAAAAATTAAAAATATTTAAAATAAAACTTTGCTTTGGCAACTTCCTATC
AGATTAGTTAAAATAGTAACAAACTCAATGTTCAACCCTGAAAATATTGAAGATCTTGGT
TTGATTCCAACTGAATTTGTTAACTTTATGATTGAAACTATTTATAATGAATAATAAATA
CTGTAATAAAATTCTCAAAGATAATATTTCAGCAACCATCACCACAATACTACAACCAGT
AATAGCAACAATGTGGCTAATTCAAATACAGTCGTTTTCTAAAATTTCTTTAACAATTGA


>TTHERM_00827080(protein)
MVDNFRFYTDMGNQDNQFDIDSSKENNDLFGMSGLLVSLCKQNNNLVPNQQERMDIQSRV
GKDITNVLQNQMHNNLPIKKAISSNFQDEKNQINMQKSLQQIRAHNRTTSSILFVGNKGK
KDGIQANTTQEQQQFQFNDQARAFSNKPVYNNNVKVNKSGNFAQITSNYHQMNRIPEQFS
CEKENTNSYAAQFHLQQQSNQIQNMQCQTNFLAHSTNNLQYNNFNNKSNPHLNIFASQAV
STSLNQPLSTITDLPLVQPIQNEEENEKCVSGTDSQQLNSSNKLAHLEYIREIISHLRAT
ENNFSAKGGYMGVVQKEINERMRSILLDWLVDVHFKFKLRTETLFITINLIDRYLEQVPL
ESSRLQLLGITSLFIAAKYEEVYSVPHISDLVYVCDNAYKKEEIFDMEGSILKVLNFNIL
CVTSFRFLDYFIQFDELGEKNYYLARYLIEIALLEYKMISNAPSLLASAAIYLVNKIRKR
DVAWKESMIEITGYLEQDIRPCAKLICHIVQTIDQRKYLVSLRKKFQKPQFLEVAKIKIE
QRKENNAFCKNQIKNNNNGNCIQASQNLTSSVCAPFQECASKDQEIIPEIQNDNSSNNFN
NPNNYQQQNQPAYSYNNFQNYHSNSNNNIQNDQCNINLQEQQLQQVQSVDITVPLQAACV
LIEKRFAEIKPSNYVQCLINKALQGTQPIELKVPSQMLLFMIEKKIKNIQNKTLLWQLPI
RLVKIVTNSMFNPENIEDLGLIPTEFVNFMIETIYNEQQILQQNSQRQYFSNHHHNTTTS
NSNNVANSNTVVFQNFFNN


>TTHERM_00827080(gene)
ATGGTAGACAACTTTCGCTTCTACACAGTAAATAAATAACATTCGTAGTTCTATTATTAA
TTTATAATTATCTTTTACATTTCTAGGATATGGGTAATCAAGATAATTAATTTGACATTG
ACAGTTCTAAAGAAAATAATGATTTATTTGGCATGAGTGGTTTGCTTGTTAGTCTTTGTA
AATAAAATAACAACTTGGTACCTAATTAGCAGGAAAGAATGGACATACAAAGCAGAGTAG
GCAAGGATATTACAAATGTGCTACAAAATCAAATGCACAACAACTTACCCATCAAAAAGG
CAATTGTAAATAATTTATTTTATACAAATGAAAGAACTTTTTTATGCTAACTGAAGAAAT
ATTTTTGCATAATTGCAAAGTAGAGTTAGCAAATAATAAGCAAGACAAGCAAATTATTAT
TTTATTAAATAGAGCAGCAACTTTTAGGATGAAAAAAATTAAATAAATATGCAAAAGAGC
TTGTAATAAATTCGTGCTCACAACAGAACTACCTCTAGCATTCTATTTGTAGGAAATAAA
GGCAAAAAAGATGGTATATAAGCTAATACAACTCAAGAATAATAACAATTTTAATTTAAC
GACTAAGCAAGAGCTTTTTCTAATAAACCAGTCTATAATAACAATGTAAAAGTGAATAAA
AGTGGTAATTTTGCACAAATAACTAGCAATTATCACTAGATGAATAGAATCCCAGAATAA
TTTTCTTGTGAAAAAGAAAACACTAATTCTTATGCAGCTTAATTTCATCTTTAGTAACAA
TCTAATTAAATTTAAAACATGCAATGCTAGACCAACTTTTTGGCTCACAGTACCAACAAT
CTTCAATACAACAACTTCAATAACAAATCAAATCCTCATTTAAATATTTTCGCTTCTTAA
GCAGTTAGCACTTCGTTAAACTAGCCCTTATCAACAATCACAGATTTACCTCTAGTCCAG
CCAATTTAAAATGAAGAAGAAAATGAAAAATGCGTATCTGGAACAGATAGCTAATAGCTC
AACTCTTCTAATAAGTTAGCTCATTTAGAATATATCCGCGAAATCATTTCTCACTTAAGA
GCAACAGAGGTATGATATTTGTTCATTTTGAGATTTTAGAATAAAATTCATAAAAGACAG
TATTTAACTGATAATAAAATTCTATAAACAAATACATAAAATAAAATAAAAAACAAGGCT
TAAGTTTCTTTAGATTAATTTTTTAGTTTAAGGAAATATTCTTAAAGAGCTGTTAAATTT
TGCAAAGAAATCAATCCCCATAAAATTAAAGAATCAAACTAAATGACGAATTGAATTGAT
GAATGAATAAATTAAAAACTTTATTAACGACTACTTTTCAAGCAATTAATTAATCAAACA
ATACATAAAAAATAATATTGAAGTATTTATTAACTTGCAATTTTTAAAAATAATCCCCAC
CCACACACAAACAAAAATAGATACAAAATTTCGAAGTCTTAATTAAAGCTTGACTAAATA
TTTAAATTCCATTCTAATGCAAATAAATATTTATTTGATAATAATAAATCAAATTTTTAA
ATCTATTCTCTGCAATATGCATTTTTTAAAACAAACAAAAAAGTTAACAATAATTCTAAT
TTATTGAAATTTTTTGAAGATAAATTTAAGGATGATTTTTTTAAATAAAAAATTAAGAAA
ATTGTTGATTTTTAATAAAAATAAAATGCTTAATTTTATTAAAAAAATTATTTTACATAA
AATTAATTTATTTTAAATATGAATAGAACAATTTCAGTGCTAAAGGAGGATACATGGGTG
TTGTTTAGAAAGAGATAAATGAAAGAATGAGATCAATTTTATTAGATTGGTTAGTTGATG
TTCATTTCAAATTCAAACTTCGTACTGAAACCTTATTTATTACCATTAATCTTATTGATA
GATATTTGGAATAAGTACCATTAGAAAGTAGTAGACTCTAATTGCTTGGTATAACTTCTT
TATTTATTGCAGCTAAGTACGAAGAAGTATACTCTGTTCCTCATATTAGTGACTTAGTCT
ATGTTTGTGATAATGCTTATAAGAAGGAAGAAATTTTTGACATGGAAGGATCAATATTAA
AAGTTCTTAACTTTAATATTTTATGTGTTACTTCGTTCCGTTTCTTAGATTATTTTATTT
AGTTTGATGAATTGGGAGAGAAAAATTACTACCTTGCTCGCTATTTAATAGAAATTGCAC
TGCTTGAGTATAAAATGATCAGTAATGCTCCAAGTCTTCTTGCCTCTGCTGCCATATATT
TAGTCAATAAAATAAGAAAGAGAGATGTTGCATGGAAAGAAAGCATGATCGAAATCACTG
GTTATTTGGAATAAGATATCCGTCCATGTGCTAAATTAATTTGCCATATTGTTTAAACAA
TTGATTAACGTAAGTACTTGGTTTCCCTTCGCAAAAAATTCTAAAAGCCCTAATTCCTTG
AAGTTGCTAAAATCAAAATTGAGCAACGCAAAGAAAATAATGCTTTTTGCAAAAACTAAA
TTAAAAATAACAACAACGGAAATTGCATTTAGGCTTCATAAAATCTAACTAGTTCGGTAT
GTGCTCCCTTCCAAGAATGTGCCTCTAAAGACTAAGAAATAATTCCTGAAATATAAAACG
ATAATAGCAGCAATAATTTCAACAATCCTAATAACTATTAGCAATAAAATCAACCAGCTT
ACAGTTACAATAATTTTTAGAATTACCATTCTAATAGCAATAATAATATTTAAAATGACT
AATGCAACATAAATTTATAAGAGTAGTAATTGCAATAAGTACAATCTGTAGATATTACTG
TACCACTTTAAGCAGCCTGTGTTTTGATTGAAAAGAGGTTTGCTGAAATAAAGCCAAGTA
ACTATGTCTAATGTCTAATTAATAAAGCTCTTTAAGGAACCTAGCCAATTGAGCTTAAAG
TACCTTCATAAATGTTACTCTTTATGATTGAAAAAAAAATTAAAAATATTTAAAATAAAA
CTTTGCTTTGGCAACTTCCTATCAGATTAGTTAAAATAGTAACAAACTCAATGTTCAACC
CTGAAAATATTGAAGATCTTGGTTTGATTCCAACTGAATTTGTTAACTTTATGATTGAAA
CTATTTATAATGAATAATAAATACTGTAATAAAATTCTCAAAGATAATATTTCAGCAACC
ATCACCACAATACTACAACCAGTAATAGCAACAATGTGGCTAATTCAAATACAGTCGTTT
TCTAAAATTTCTTTAACAATTGA