Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_01128530
Standard Name
CYC13 (CYClin 13)
Aliases
PreTt30032 | 247.m00028 | 3817.m00175
Description
CYC13 amine-terminal domain cyclin; Cyclin; N-terminal domain containing protein; regulates activity of cyclin-dependent kinases; expressed during conjugation
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
No Data fetched for Domains
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 19%
TetraMine Data
TTHERM_01128530
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_20785.1 9.997093137033517e-262 cyclin domain-containing prote
in (802 aa)
Oxytricha Contig725.1.g114 0.000000000000020000882446601127 Cyclin, N-terminal domain
DictyBase DDB_G0277439 0.0000009995106777214876 cycD on chromosome: 2 position
8066558 to 8068733
SGD YLR210W 0.000009002574193719714 CLB4 B-type cyclin involved in
cell cycle progression; activ
ates Cdc28p to promote the G2/
M transition; may be involved
in DNA replication and spindle
assembly; accumulates during
S phase and G2, then targeted
for ubiquitin-mediated degrada
tion
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
Ref:27192402 : Yan GX, Dang H, Tian M, Zhang J, Shodhan A, Ning YZ, Xiong J, Miao W (2016) Cyc17, a meiosis-specific cyclin, is essential for anaphase initiation and chromosome segregation in Tetrahymena thermophila. Cell cycle (Georgetown, Tex.) 15(14):1855-64
Sequences
>TTHERM_01128530(coding)ATG CAA AAA GAT TCA AGT TAG ATT GGA GAT TAA TTT CTT TTA AGT CTA GGA AGT TTG ACA TAG AGT GTA CCC ACT AAT ATT AGC GCT ATG TCT AAT TGT TCT TCA GGA TAG CAA TTT GTA AGC CAT AGC AAT ACC TTA TTA AAA GTA TAG TCC TTA GAA GCA ACA TCT CCT ACA GCA GTA GCA GCT GTT GGA TTT TAA AGT CAA AGT TAA AAC ACT GAA GCA GTA ATA AAA TCA GGA GAA TTA AAA AGT GTA ATG AGC AGT GAC AAT TTA CTA AAT CTG GCA CCA TCA ACA TAA TCT TAA GCT CCT CCT TAG GCA CCA TTT ACT CTT ACT AGC AGC ACT AGT GTA ACT ATT AGC AGC ATT GGT ACT TAA ATT TAA AGC TTA ACC ACT TAG ATT CCA AGC AAT ATG CTA TAT ACA TAC TTC AAT TGC AAA CAT CAG GCA ATA GTT ACA TAT TCA AAG TGC TAG TTC TGC AAA GAG TGT GGT GTT AGA ATG TAT AAA AAT GGT TAA ATG CTT GCA CTC AAG TCT CAG TAG ATG AAT TAC AAA CTT AAC ACT AAT CCT TTA AGG TTA TAT TCA AAC ACA TAT AAA TAG AAA AAG TAA AAA AAC ACT ATT AAT TTT TAA GAA CAC TAA GAC TAC TTA AAG CAA AGA GAG CGC ACT ATA AAT TAT GTA ATC GAT TTG GCT GAT AGA ATG AGA TTG AGT AAA TAA ACT GCT TTC TTG AGT ATT ATG TTC CTT GAT TAC TTG GTT GCT AAT GAT ACC AAT TCA GAA TTG TGC ACA TTT AAA ATT AAA GAT CAT TTA TAA ATA TTT GGA GCT GTT TGT GTA ATG TTA GCA GCA AAA AGT ATT GAA TTA GAT GAA AGA ATA CCT TTT TTA TCT TCT CTT AAA AAA TAT ATG TGC TTA AAT TAA TAC TCT AAA GAA GAT TTA AGA AAG GCA GAA TAG AAG ACT GTA TAA ATT CTG AAA TTT AAT ATG TAG TTT CCT ACT CTT TAT GAT TTA TTG GAG TAT TAT GGC TCA TAA GGT GTT GTT TTT TCT AAT GAT TTA TAA AAG GGT ACA ACA TTC ACA TCA ATT TTA AGC CCA ACT CCA TTT TTA TCC AAT GAA ACT AAA AAT ACA AGT GCA AAG AAA GAA CGT TTT ATA AAT AAT AGA ACT ATA GAG TTA GAG TTT TAA GGT ACC GCT CCT TCT TCT TCA GCA CAA AAT TAG TAA TAG TCA GAG GAT AGC ACT AAA AAC AGT TCA CCT AAT TCG AAC GAC TAT TCC TCA ACT CAA GAA ACT TCA TCT AAA AAT TCA AAC AGT GAT GAA GCA AAC CCC TCA TGC TCT CCA CCA CCT CAT TCA AAA ATA GTG GAA CCT TAA CCT CAA GTA GTT AAA GAA TTT GAT ATT TCA CCT ATT AAA TTA TAT GAT ATA GTA TCT AAG ATA GAA AAA GAT TTT AGC AGA ATA GCT TTC TTG GCT ATA AAA GAT GAG AAA TTT TAC GAA TAA GAT CTT GAA ATC TTA GGA GCT GCT TGT ATA TGC TAT TTA AGA GAA AAA TAA AAT ATT TCA AAT CCT TAC AGA GAT GAA ATT TTA TAA ATT TGT AGC TAA GAT AGA GCC TAA GTT TTA TCT TGT TGC CTC ACT TTT TTA TCT AAA TTT GAT ACC TAC TTT AAG CCT CAT AGT TAT TTG AAT GGA TCT ACA TCC TCT GGA ATA TCT CCT CTA AAG GAC ATT AGA ACT AAT TTG AAA TAA GGA TTC TAC ACT TCT GAT AAT TAT AAG AGC GCT TCC AAT CTA ACA ACA ACA GCA ACT ACT CGT ATT TTA TAA GAA AAT AAA AAA CCT TTA TTT GAC AAC ATT GAT TTA AAC AGC TAC AGA ATA AGA GAA AAA TCA TTT GAA AAA ATT GGT ATT AGC TAT TAG AGT TAA AGA AGC TCT ATA GCA TCT TAA CAT GTT TCT AAA AAT ACT ATA TCT GGG CTG TAG AAT AAT AGA AAT AAC TTT TTT GAG TAT GCT AAA CTT AAC GAA TAG AAA ATA AAT AAT TTA AGC TCA ATT ACT AAC ATA TCA ACT TCT AAT GCC TCT TCT ACT TCT TAA GCA GCT GCA AAT AGT GGT ATC GCC TCT AGT TCT AAT TAA ATA CTT TAA TCT GGT TCA TTA ACA TCA ACA TCT TCA AAT ATT AAT AGC TTA TAA AGC AAA TTA TTG CAA TAA TAA AAC GCT TTC AGC TCA GGC GCT TTT CAT TCA AGC AGC TCT TCT TCT AAC GCA TTA TCA TCT GGC CTT TCT TCT ATT AGC TCT TAC TAA AAG CCA TAT TAG CTA GCA TTA AAT TAA TAT TCA TCA AAA CCA CTT CTA TCT ACT ACA ACA TCT ACA GTA AAT AGT AAG ATT CCT TAA AGT ATA CCT AAT TTT GAT GAC GAA GCT AAA TGG AAT AGT CAC TTC ACT AAA ACT ATA AAT TCA ATA AAT TTC CGT GCA AGC TCC TTC AAC TCT AAC TCA TTT TTG AGA AGA AAC AAA TTT TGA >TTHERM_01128530(protein)M Q K D S S Q I G D Q F L L S L G S L T Q S V P T N I S A M S N C S S G Q Q F V S H S N T L L K V Q S L E A T S P T A V A A V G F Q S Q S Q N T E A V I K S G E L K S V M S S D N L L N L A P S T Q S Q A P P Q A P F T L T S S T S V T I S S I G T Q I Q S L T T Q I P S N M L Y T Y F N C K H Q A I V T Y S K C Q F C K E C G V R M Y K N G Q M L A L K S Q Q M N Y K L N T N P L R L Y S N T Y K Q K K Q K N T I N F Q E H Q D Y L K Q R E R T I N Y V I D L A D R M R L S K Q T A F L S I M F L D Y L V A N D T N S E L C T F K I K D H L Q I F G A V C V M L A A K S I E L D E R I P F L S S L K K Y M C L N Q Y S K E D L R K A E Q K T V Q I L K F N M Q F P T L Y D L L E Y Y G S Q G V V F S N D L Q K G T T F T S I L S P T P F L S N E T K N T S A K K E R F I N N R T I E L E F Q G T A P S S S A Q N Q Q Q S E D S T K N S S P N S N D Y S S T Q E T S S K N S N S D E A N P S C S P P P H S K I V E P Q P Q V V K E F D I S P I K L Y D I V S K I E K D F S R I A F L A I K D E K F Y E Q D L E I L G A A C I C Y L R E K Q N I S N P Y R D E I L Q I C S Q D R A Q V L S C C L T F L S K F D T Y F K P H S Y L N G S T S S G I S P L K D I R T N L K Q G F Y T S D N Y K S A S N L T T T A T T R I L Q E N K K P L F D N I D L N S Y R I R E K S F E K I G I S Y Q S Q R S S I A S Q H V S K N T I S G L Q N N R N N F F E Y A K L N E Q K I N N L S S I T N I S T S N A S S T S Q A A A N S G I A S S S N Q I L Q S G S L T S T S S N I N S L Q S K L L Q Q Q N A F S S G A F H S S S S S S N A L S S G L S S I S S Y Q K P Y Q L A L N Q Y S S K P L L S T T T S T V N S K I P Q S I P N F D D E A K W N S H F T K T I N S I N F R A S S F N S N S F L R R N K F >TTHERM_01128530(gene)ATG CAA AAA GAT TCA AGT TAG ATT GGA GAT TAA TTT CTT TTA AGT CTA GGA AGT TTG ACA TAG AGT GTA CCC ACT AAT ATT AGC GCT ATG TCT AAT TGT TCT TCA GGA TAG CAA TTT GTA AGC CAT AGC AAT ACC TTA TTA AAA GTA TAG TCC TTA GAA GCA ACA TCT CCT ACA GCA GTA GCA GCT GTT GGA TTT TAA AGT CAA AGT TAA AAC ACT GAA GCA GTA ATA AAA TCA GGA GAA TTA AAA AGT GTA ATG AGC AGT GAC AAT TTA CTA AAT CTG GCA CCA TCA ACA TAA TCT TAA GCT CCT CCT TAG GCA CCA TTT ACT CTT ACT AGC AGC ACT AGT GTA ACT ATT AGC AGC ATT GGT ACT TAA ATT TAA AGC TTA ACC ACT TAG ATT CCA AGC AAT ATG CTA TAT ACA TAC TTC AAT TGC AAA CAT CAG GCA ATA GTT ACA TAT TCA AAG TGC TAG TTC TGC AAA GAG TGT GGT GTT AGA ATG TAT AAA GTG TTT TAT TTT TTC AAT TCA TTA TTC AAC TAT GTT CTT TTA TAA TCA GCA TTA TAT TAA AAA AAA ATC TTT CAA ATA TTA TAG AAT GGT TAA ATG CTT GCA CTC AAG TCT CAG TAG ATG AAT TAC AAA CTT AAC ACT AAT CCT TTA AGG TTA TAT TCA AAC ACA TAT AAA TAG AAA AAG TAA AAA AAC ACT ATT AAT TTT TAA GAA CAC TAA GAC TAC TTA AAG GTA AAT AAA ATT TAA AAT AAA TTA ATT ATT TTA GAT AAA CTT AAT GGT CCA TTG ATT TGA TCT GAT TTT ATT TTG CAG TTG GGT TTG TTA AAT TTA TGA AAT TGT TAT TTT TTA AAT TTG TAA TAA AGG ATA ATA TCA CTA TTC TAT AAA AAT TTA AAG AAA TTA ACA TGA TTT GAT GCT ATG CTT TAT CTA TTA TAT TAA GAG ACA TCT AAC AAA AAT AAG TGA GTA AGT GAG GTT GAG ATA TGA AGC AAA ATA TTA TAA TCT AAA CTT CAT TGT GAG TTT AAG CAA TAG AAA ATA TAA AAA TCA AAA ATC TTT TGT CAA AAA TTT TTA TTT TTC AAG AAA TTC AAA AAT AAA TAG CAT GAA ATT TCT TAA TAA ATG CAA AAT CTC TTG ATT GCG ATT ACA GCA ATT ATC CTA TAC TCC CTC ATA TTT TTA ACC AAC CAA TCA CTA GGT TTC TTA TGT AAA AGA GAT TAT ATT AAA ATT TTT AAA GAT CAA ATT ATC AAT TTC ATT TAA TGA ATC CCA CAT ATT ACA ATT TTT TTC CAG CTC AAA AAA AGT TTA TTT TAC AAA ATT TTA ATT TTA ATT GAA AAA TCT ATA CTA AAA TTG AAT TTT TGA TTC AAA TAA AAG TAA AAA TAG ATA GAC TTG CCT ACT CAC TCT TTT TCA AAT CAA ATT CTA ATA GCA AAC AAC TGT ATT TTT AAA TTC GTG CTA GAT TTA AAA CTA AAT CAT TCA ATT TGA ATT TTT ACC TAA TCT AAT TAT ATA TTT ATT TGC TTT AAC TGT TTT CAT ACT TTA TGC TGT TAT TTA CAA CAT TCA TTC TAA ATC TTA AAA ATT TAA TGT TTA ACA AAT AGC AAA GAG AGC GCA CTA TAA ATT ATG TAA TCG ATT TGG CTG ATA GAA TGA GAT TGA GTA AAT AAA CTG CTT TCT TGA GTA TTA TGT TCC TTG ATT ACT TGG TTG CTA ATG ATA CCA ATT CAG AAT TGT GCA CAT TTA AAA TTA AAG ATC ATT TAT AAA TAT TTG GAG CTG TTT GTG TAA TGT TAG CAG CAA AAA GTA TTG AAT TAG ATG AAA GAA TAC CTT TTT TAT CTT CTC TTA AAA AAT ATA TGT GCT TAA ATT AAT ACT CTA AAG AAG ATT TAA GAA AGG CAG AAT AGA AGA CTG TAT AAA TTC TGA AAT TTA ATA TGT AGT TTC CTA CTC TTT ATG ATT TAT TGG AGT ATT ATG GCT CAT AAG GTG TTG TTT TTT CTA ATG ATT TAT AAA AGG GTA CAA CAT TCA CAT CAA TTT TAA GCC CAA CTC CAT TTT TAT CCA ATG AAA CTA AAA ATA CAA GTG CAA AGA AAG AAC GTT TTA TAA ATA ATA GAA CTA TAG AGT TAG AGT TTT AAG GTA CCG CTC CTT CTT CTT CAG CAC AAA ATT AGT AAT AGT CAG AGG ATA GCA CTA AAA ACA GTT CAC CTA ATT CGA ACG ACT ATT CCT CAA CTC AAG AAA CTT CAT CTA AAA ATT CAA ACA GTG ATG AAG CAA ACC CCT CAT GCT CTC CAC CAC CTC ATT CAA AAA TAG TGG AAC CTT AAC CTC AAG TAG TTA AAG AAT TTG ATA TTT CAC CTA TTA AAT TAT ATG ATA TAG TAT CTA AGA TAG AAA AAG ATT TTA GCA GAA TAG CTT TCT TGG CTA TAA AAG GTA AAA AAT ACA TTT TTA ATG AAT TTA TAA ATT AAT TAC AAT AAT TTT ATT TTC ATT TTC TAC GAT TAA TTA TTT GGA ATA ATG AGG ACT CAA ATA TAA AAT TAT AAG AAA TAA CAA AGC TAA CAA AAA TAA AAA CAT AAA AAA TCA CTA AAA AAA TAG AAA AAT GGA TGT ATC AAA TAA AAC TTA ATG CTA AAA TAA TAG CCG TTG CGT TTG TAA ATG AAT AAA TAA TAA TTT TAA CTA TTG AGT CAG TAA TTT AGG AAA AGA AAC CCT AAA CTA AAA GAA CAA ACA ATA AAA TAT CCT GCA ACT TTA TTT TAT ACT GTA TTA TAG TAA AAG CAT GCA TCT ATG CAT GAA TCA TCT AAA AAT TCA TAG AAT TTA TTA ATT AAC TAA TTT TTA GTT TTT ATG GAA AAA AAT TGT TCT AAA TAA ATC CTA TTT AAA TAT TTA ATA AAA TTT CTT TTT TAT TGA GTC ATT CAA AAA ATA CAA TTT GCC TCT CTC TAT AAA TCA GTC AAT CAA TCA ATC TTT CTT CAG ATT TAT TTA AAA ATT TTT TTA TTA GCT AGC TAA AAT TTA TTG ATA ATT CAT ATA ATT TTT TTT ATA TTT ACT AAT AGA TGA GAA ATT TTA CGA ATA AGA TCT TGA AAT CTT AGG AGC TGC TTG TAT ATG CTA TTT AAG AGA AAA ATA AAA TAT TTC AAA TCC TTA CAG AGA TGA AAT TTT ATA AAT TTG TAG CTA AGA TAG AGC CTA AGT TTT ATC TTG TTG CCT CAC TTT TTT ATC TAA ATT TGA TAC CTA CTT TAA GCC TCA TAG TTA TTT GAA TGG ATC TAC ATC CTC TGG AAT ATC TCC TCT AAA GGA CAT TAG AAC TAA TTT GAA ATA AGG ATT CTA CAC TTC TGA TAA TTA TAA GAG CGC TTC CAA TCT AAC AAC AAC AGC AAC TAC TCG TAT TTT ATA AGA AAA TAA AAA ACC TTT ATG TAA TAT ATT ATT TTT TAA TCC TTT CAA AAT TTT ATT TAT TAA AAA TAA AAA CTA ATT CTC GTT TTA AAT AAC AGT TGA CAA CAT TGA TTT AAA CAG CTA CAG AAT AAG AGA AAA ATC ATT TGA AAA AAT TGG TAT TAG CTA TTA GAG TTA AAG AAG CTC TAT AGC ATC TTA ACA TGT TTC TAA AAA TAC TAT ATC TGG GCT GTA GAA TAA TAG AAA TAA CTT TTT TGA GTA TGC TAA ACT TAA CGA ATA GAA AAT AAA TAA TTT AAG CTC AAT TAC TAA CAT ATC AAC TTC TAA TGC CTC TTC TAC TTC TTA AGC AGC TGC AAA TAG TGG TAT CGC CTC TAG TTC TAA TTA AAT ACT TTA ATC TGG TTC ATT AAC ATC AAC ATC TTC AAA TAT TAA TAG CTT ATA AAG CAA ATT ATT GCA ATA ATA AAA CGC TTT CAG CTC AGG CGC TTT TCA TTC AAG CAG CTC TTC TTC TAA CGC ATT ATC ATC TGG CCT TTC TTC TAT TAG CTC TTA CTA AAA GCC ATA TTA GCT AGC ATT AAA TTA ATA TTC ATC AAA ACC ACT TCT ATC TAC TAC AAC ATC TAC AGT AAA TAG TAA GAT TCC TTA AAG TAT ACC TAA TTT TGA TGA CGA AGC TAA ATG GAA TAG TCA CTT CAC TAA AAC TAT AAA TTC AAT AAA TTT CCG TGC AAG CTC CTT CAA CTC TAA CTC ATT TTT GAG AAG AAA CAA ATT TTG A