Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01128530

Standard Name

CYC13 (CYClin 13)

Aliases

PreTt30032 | 247.m00028 | 3817.m00175

Description

Cyclin; N-terminal domain containing protein; regulates activity of cyclin-dependent kinases; expressed during conjugation

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 19%

TetraMine Data

TTHERM_01128530

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_20785.19.997093137033517e-262cyclin domain-containing prote
in (802 aa)
OxytrichaContig725.1.g1140.000000000000020000882446601127Cyclin, N-terminal domain
DictyBaseDDB_G02774390.0000009995106777214876cycD on chromosome: 2 position
8066558 to 8068733
SGDYLR210W0.000009002574193719714CLB4 B-type cyclin involved in
cell cycle progression; activ
ates Cdc28p to promote the G2/
M transition; may be involved
in DNA replication and spindle
assembly; accumulates during
S phase and G2, then targeted
for ubiquitin-mediated degrada
tion

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:27192402: Yan GX, Dang H, Tian M, Zhang J, Shodhan A, Ning YZ, Xiong J, Miao W (2016) Cyc17, a meiosis-specific cyclin, is essential for anaphase initiation and chromosome segregation in Tetrahymena thermophila. Cell cycle (Georgetown, Tex.) 15(14):1855-64

Sequences

>TTHERM_01128530(coding)
ATGCAAAAAGATTCAAGTTAGATTGGAGATTAATTTCTTTTAAGTCTAGGAAGTTTGACA
TAGAGTGTACCCACTAATATTAGCGCTATGTCTAATTGTTCTTCAGGATAGCAATTTGTA
AGCCATAGCAATACCTTATTAAAAGTATAGTCCTTAGAAGCAACATCTCCTACAGCAGTA
GCAGCTGTTGGATTTTAAAGTCAAAGTTAAAACACTGAAGCAGTAATAAAATCAGGAGAA
TTAAAAAGTGTAATGAGCAGTGACAATTTACTAAATCTGGCACCATCAACATAATCTTAA
GCTCCTCCTTAGGCACCATTTACTCTTACTAGCAGCACTAGTGTAACTATTAGCAGCATT
GGTACTTAAATTTAAAGCTTAACCACTTAGATTCCAAGCAATATGCTATATACATACTTC
AATTGCAAACATCAGGCAATAGTTACATATTCAAAGTGCTAGTTCTGCAAAGAGTGTGGT
GTTAGAATGTATAAAAATGGTTAAATGCTTGCACTCAAGTCTCAGTAGATGAATTACAAA
CTTAACACTAATCCTTTAAGGTTATATTCAAACACATATAAATAGAAAAAGTAAAAAAAC
ACTATTAATTTTTAAGAACACTAAGACTACTTAAAGCAAAGAGAGCGCACTATAAATTAT
GTAATCGATTTGGCTGATAGAATGAGATTGAGTAAATAAACTGCTTTCTTGAGTATTATG
TTCCTTGATTACTTGGTTGCTAATGATACCAATTCAGAATTGTGCACATTTAAAATTAAA
GATCATTTATAAATATTTGGAGCTGTTTGTGTAATGTTAGCAGCAAAAAGTATTGAATTA
GATGAAAGAATACCTTTTTTATCTTCTCTTAAAAAATATATGTGCTTAAATTAATACTCT
AAAGAAGATTTAAGAAAGGCAGAATAGAAGACTGTATAAATTCTGAAATTTAATATGTAG
TTTCCTACTCTTTATGATTTATTGGAGTATTATGGCTCATAAGGTGTTGTTTTTTCTAAT
GATTTATAAAAGGGTACAACATTCACATCAATTTTAAGCCCAACTCCATTTTTATCCAAT
GAAACTAAAAATACAAGTGCAAAGAAAGAACGTTTTATAAATAATAGAACTATAGAGTTA
GAGTTTTAAGGTACCGCTCCTTCTTCTTCAGCACAAAATTAGTAATAGTCAGAGGATAGC
ACTAAAAACAGTTCACCTAATTCGAACGACTATTCCTCAACTCAAGAAACTTCATCTAAA
AATTCAAACAGTGATGAAGCAAACCCCTCATGCTCTCCACCACCTCATTCAAAAATAGTG
GAACCTTAACCTCAAGTAGTTAAAGAATTTGATATTTCACCTATTAAATTATATGATATA
GTATCTAAGATAGAAAAAGATTTTAGCAGAATAGCTTTCTTGGCTATAAAAGATGAGAAA
TTTTACGAATAAGATCTTGAAATCTTAGGAGCTGCTTGTATATGCTATTTAAGAGAAAAA
TAAAATATTTCAAATCCTTACAGAGATGAAATTTTATAAATTTGTAGCTAAGATAGAGCC
TAAGTTTTATCTTGTTGCCTCACTTTTTTATCTAAATTTGATACCTACTTTAAGCCTCAT
AGTTATTTGAATGGATCTACATCCTCTGGAATATCTCCTCTAAAGGACATTAGAACTAAT
TTGAAATAAGGATTCTACACTTCTGATAATTATAAGAGCGCTTCCAATCTAACAACAACA
GCAACTACTCGTATTTTATAAGAAAATAAAAAACCTTTATTTGACAACATTGATTTAAAC
AGCTACAGAATAAGAGAAAAATCATTTGAAAAAATTGGTATTAGCTATTAGAGTTAAAGA
AGCTCTATAGCATCTTAACATGTTTCTAAAAATACTATATCTGGGCTGTAGAATAATAGA
AATAACTTTTTTGAGTATGCTAAACTTAACGAATAGAAAATAAATAATTTAAGCTCAATT
ACTAACATATCAACTTCTAATGCCTCTTCTACTTCTTAAGCAGCTGCAAATAGTGGTATC
GCCTCTAGTTCTAATTAAATACTTTAATCTGGTTCATTAACATCAACATCTTCAAATATT
AATAGCTTATAAAGCAAATTATTGCAATAATAAAACGCTTTCAGCTCAGGCGCTTTTCAT
TCAAGCAGCTCTTCTTCTAACGCATTATCATCTGGCCTTTCTTCTATTAGCTCTTACTAA
AAGCCATATTAGCTAGCATTAAATTAATATTCATCAAAACCACTTCTATCTACTACAACA
TCTACAGTAAATAGTAAGATTCCTTAAAGTATACCTAATTTTGATGACGAAGCTAAATGG
AATAGTCACTTCACTAAAACTATAAATTCAATAAATTTCCGTGCAAGCTCCTTCAACTCT
AACTCATTTTTGAGAAGAAACAAATTTTGA


>TTHERM_01128530(protein)
MQKDSSQIGDQFLLSLGSLTQSVPTNISAMSNCSSGQQFVSHSNTLLKVQSLEATSPTAV
AAVGFQSQSQNTEAVIKSGELKSVMSSDNLLNLAPSTQSQAPPQAPFTLTSSTSVTISSI
GTQIQSLTTQIPSNMLYTYFNCKHQAIVTYSKCQFCKECGVRMYKNGQMLALKSQQMNYK
LNTNPLRLYSNTYKQKKQKNTINFQEHQDYLKQRERTINYVIDLADRMRLSKQTAFLSIM
FLDYLVANDTNSELCTFKIKDHLQIFGAVCVMLAAKSIELDERIPFLSSLKKYMCLNQYS
KEDLRKAEQKTVQILKFNMQFPTLYDLLEYYGSQGVVFSNDLQKGTTFTSILSPTPFLSN
ETKNTSAKKERFINNRTIELEFQGTAPSSSAQNQQQSEDSTKNSSPNSNDYSSTQETSSK
NSNSDEANPSCSPPPHSKIVEPQPQVVKEFDISPIKLYDIVSKIEKDFSRIAFLAIKDEK
FYEQDLEILGAACICYLREKQNISNPYRDEILQICSQDRAQVLSCCLTFLSKFDTYFKPH
SYLNGSTSSGISPLKDIRTNLKQGFYTSDNYKSASNLTTTATTRILQENKKPLFDNIDLN
SYRIREKSFEKIGISYQSQRSSIASQHVSKNTISGLQNNRNNFFEYAKLNEQKINNLSSI
TNISTSNASSTSQAAANSGIASSSNQILQSGSLTSTSSNINSLQSKLLQQQNAFSSGAFH
SSSSSSNALSSGLSSISSYQKPYQLALNQYSSKPLLSTTTSTVNSKIPQSIPNFDDEAKW
NSHFTKTINSINFRASSFNSNSFLRRNKF


>TTHERM_01128530(gene)
ATGCAAAAAGATTCAAGTTAGATTGGAGATTAATTTCTTTTAAGTCTAGGAAGTTTGACA
TAGAGTGTACCCACTAATATTAGCGCTATGTCTAATTGTTCTTCAGGATAGCAATTTGTA
AGCCATAGCAATACCTTATTAAAAGTATAGTCCTTAGAAGCAACATCTCCTACAGCAGTA
GCAGCTGTTGGATTTTAAAGTCAAAGTTAAAACACTGAAGCAGTAATAAAATCAGGAGAA
TTAAAAAGTGTAATGAGCAGTGACAATTTACTAAATCTGGCACCATCAACATAATCTTAA
GCTCCTCCTTAGGCACCATTTACTCTTACTAGCAGCACTAGTGTAACTATTAGCAGCATT
GGTACTTAAATTTAAAGCTTAACCACTTAGATTCCAAGCAATATGCTATATACATACTTC
AATTGCAAACATCAGGCAATAGTTACATATTCAAAGTGCTAGTTCTGCAAAGAGTGTGGT
GTTAGAATGTATAAAGTGTTTTATTTTTTCAATTCATTATTCAACTATGTTCTTTTATAA
TCAGCATTATATTAAAAAAAAATCTTTCAAATATTATAGAATGGTTAAATGCTTGCACTC
AAGTCTCAGTAGATGAATTACAAACTTAACACTAATCCTTTAAGGTTATATTCAAACACA
TATAAATAGAAAAAGTAAAAAAACACTATTAATTTTTAAGAACACTAAGACTACTTAAAG
GTAAATAAAATTTAAAATAAATTAATTATTTTAGATAAACTTAATGGTCCATTGATTTGA
TCTGATTTTATTTTGCAGTTGGGTTTGTTAAATTTATGAAATTGTTATTTTTTAAATTTG
TAATAAAGGATAATATCACTATTCTATAAAAATTTAAAGAAATTAACATGATTTGATGCT
ATGCTTTATCTATTATATTAAGAGACATCTAACAAAAATAAGTGAGTAAGTGAGGTTGAG
ATATGAAGCAAAATATTATAATCTAAACTTCATTGTGAGTTTAAGCAATAGAAAATATAA
AAATCAAAAATCTTTTGTCAAAAATTTTTATTTTTCAAGAAATTCAAAAATAAATAGCAT
GAAATTTCTTAATAAATGCAAAATCTCTTGATTGCGATTACAGCAATTATCCTATACTCC
CTCATATTTTTAACCAACCAATCACTAGGTTTCTTATGTAAAAGAGATTATATTAAAATT
TTTAAAGATCAAATTATCAATTTCATTTAATGAATCCCACATATTACAATTTTTTTCCAG
CTCAAAAAAAGTTTATTTTACAAAATTTTAATTTTAATTGAAAAATCTATACTAAAATTG
AATTTTTGATTCAAATAAAAGTAAAAATAGATAGACTTGCCTACTCACTCTTTTTCAAAT
CAAATTCTAATAGCAAACAACTGTATTTTTAAATTCGTGCTAGATTTAAAACTAAATCAT
TCAATTTGAATTTTTACCTAATCTAATTATATATTTATTTGCTTTAACTGTTTTCATACT
TTATGCTGTTATTTACAACATTCATTCTAAATCTTAAAAATTTAATGTTTAACAAATAGC
AAAGAGAGCGCACTATAAATTATGTAATCGATTTGGCTGATAGAATGAGATTGAGTAAAT
AAACTGCTTTCTTGAGTATTATGTTCCTTGATTACTTGGTTGCTAATGATACCAATTCAG
AATTGTGCACATTTAAAATTAAAGATCATTTATAAATATTTGGAGCTGTTTGTGTAATGT
TAGCAGCAAAAAGTATTGAATTAGATGAAAGAATACCTTTTTTATCTTCTCTTAAAAAAT
ATATGTGCTTAAATTAATACTCTAAAGAAGATTTAAGAAAGGCAGAATAGAAGACTGTAT
AAATTCTGAAATTTAATATGTAGTTTCCTACTCTTTATGATTTATTGGAGTATTATGGCT
CATAAGGTGTTGTTTTTTCTAATGATTTATAAAAGGGTACAACATTCACATCAATTTTAA
GCCCAACTCCATTTTTATCCAATGAAACTAAAAATACAAGTGCAAAGAAAGAACGTTTTA
TAAATAATAGAACTATAGAGTTAGAGTTTTAAGGTACCGCTCCTTCTTCTTCAGCACAAA
ATTAGTAATAGTCAGAGGATAGCACTAAAAACAGTTCACCTAATTCGAACGACTATTCCT
CAACTCAAGAAACTTCATCTAAAAATTCAAACAGTGATGAAGCAAACCCCTCATGCTCTC
CACCACCTCATTCAAAAATAGTGGAACCTTAACCTCAAGTAGTTAAAGAATTTGATATTT
CACCTATTAAATTATATGATATAGTATCTAAGATAGAAAAAGATTTTAGCAGAATAGCTT
TCTTGGCTATAAAAGGTAAAAAATACATTTTTAATGAATTTATAAATTAATTACAATAAT
TTTATTTTCATTTTCTACGATTAATTATTTGGAATAATGAGGACTCAAATATAAAATTAT
AAGAAATAACAAAGCTAACAAAAATAAAAACATAAAAAATCACTAAAAAAATAGAAAAAT
GGATGTATCAAATAAAACTTAATGCTAAAATAATAGCCGTTGCGTTTGTAAATGAATAAA
TAATAATTTTAACTATTGAGTCAGTAATTTAGGAAAAGAAACCCTAAACTAAAAGAACAA
ACAATAAAATATCCTGCAACTTTATTTTATACTGTATTATAGTAAAAGCATGCATCTATG
CATGAATCATCTAAAAATTCATAGAATTTATTAATTAACTAATTTTTAGTTTTTATGGAA
AAAAATTGTTCTAAATAAATCCTATTTAAATATTTAATAAAATTTCTTTTTTATTGAGTC
ATTCAAAAAATACAATTTGCCTCTCTCTATAAATCAGTCAATCAATCAATCTTTCTTCAG
ATTTATTTAAAAATTTTTTTATTAGCTAGCTAAAATTTATTGATAATTCATATAATTTTT
TTTATATTTACTAATAGATGAGAAATTTTACGAATAAGATCTTGAAATCTTAGGAGCTGC
TTGTATATGCTATTTAAGAGAAAAATAAAATATTTCAAATCCTTACAGAGATGAAATTTT
ATAAATTTGTAGCTAAGATAGAGCCTAAGTTTTATCTTGTTGCCTCACTTTTTTATCTAA
ATTTGATACCTACTTTAAGCCTCATAGTTATTTGAATGGATCTACATCCTCTGGAATATC
TCCTCTAAAGGACATTAGAACTAATTTGAAATAAGGATTCTACACTTCTGATAATTATAA
GAGCGCTTCCAATCTAACAACAACAGCAACTACTCGTATTTTATAAGAAAATAAAAAACC
TTTATGTAATATATTATTTTTTAATCCTTTCAAAATTTTATTTATTAAAAATAAAAACTA
ATTCTCGTTTTAAATAACAGTTGACAACATTGATTTAAACAGCTACAGAATAAGAGAAAA
ATCATTTGAAAAAATTGGTATTAGCTATTAGAGTTAAAGAAGCTCTATAGCATCTTAACA
TGTTTCTAAAAATACTATATCTGGGCTGTAGAATAATAGAAATAACTTTTTTGAGTATGC
TAAACTTAACGAATAGAAAATAAATAATTTAAGCTCAATTACTAACATATCAACTTCTAA
TGCCTCTTCTACTTCTTAAGCAGCTGCAAATAGTGGTATCGCCTCTAGTTCTAATTAAAT
ACTTTAATCTGGTTCATTAACATCAACATCTTCAAATATTAATAGCTTATAAAGCAAATT
ATTGCAATAATAAAACGCTTTCAGCTCAGGCGCTTTTCATTCAAGCAGCTCTTCTTCTAA
CGCATTATCATCTGGCCTTTCTTCTATTAGCTCTTACTAAAAGCCATATTAGCTAGCATT
AAATTAATATTCATCAAAACCACTTCTATCTACTACAACATCTACAGTAAATAGTAAGAT
TCCTTAAAGTATACCTAATTTTGATGACGAAGCTAAATGGAATAGTCACTTCACTAAAAC
TATAAATTCAATAAATTTCCGTGCAAGCTCCTTCAACTCTAACTCATTTTTGAGAAGAAA
CAAATTTTGA