Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00962160

Standard Name

CYC12 (CYClin 12)

Aliases

PreTt23704 | 178.m00085

Description

Cyclin, N-terminal domain containing protein; regulates activity of cyclin-dependent kinases

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF07720 ) Tetratricopeptide repeat
  • ( PF00134 ) cyclin, N-terminal domain

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.5%

TetraMine Data

TTHERM_00962160

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_15840.19.997093137033517e-262hypothetical protein (727 aa)
OxytrichaContig22290.0.g200.0000007001298633766835Cyclin, N-terminal domain
SGDYPR120C0.000050024383570459175CLB5 B-type cyclin involved in
DNA replication during S phas
e; activates Cdc28p to promote
initiation of DNA synthesis;
functions in formation of mito
tic spindles along with Clb3p
and Clb4p; most abundant durin
g late G1 phase

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:27192402: Yan GX, Dang H, Tian M, Zhang J, Shodhan A, Ning YZ, Xiong J, Miao W (2016) Cyc17, a meiosis-specific cyclin, is essential for anaphase initiation and chromosome segregation in Tetrahymena thermophila. Cell cycle (Georgetown, Tex.) 15(14):1855-64

Sequences

>TTHERM_00962160(coding)
ATGGGTAAAAGAAGCTGCGAAAAGGGAGAAAGGGGGAAAAAATGCTAGAAGTAAAGTAAT
TTAAGTAATAATGTGAATGGAGTTTCTAAATTGATAACAAAGAGCCCATAACCATAAAAT
TAATCTCATCATTCTTACAGGACAAGATTATAAATTATGTAAAATGAGAAGTAAGGAATG
AACTTAATGAATACGGAACTGACTGTAACTACTGCCTGTACAGTCACACTTTCAAATTAT
AATATGAATAACAGCAAAGGTTCTTACTTTGATTAAAGTTCGACTACTATAAACTGTGAC
TTTAGTACCACATTTGCTAATTCTACTTAGTAGACTTAATACAATAACACAAACTGTGCC
ATAATGGAAGATACTATCAATCCAGATTATTTTGAGCAATTTTTTAAAGTTGGAAACAAT
AACTAAAATAACCAGAGACCTAGAAGGTTAAAAATTTAAAAACTTTAATTCTAGAACAAT
GAAGATACACAAAAATTGCAGGACAAATTTAAGAATCCTCAGCTTTAACAAAAAAAAATA
ACAAAGAAGTAGCTCTAAAAATTCCAACCTCAAGATTTTCTTTCTGAATTAGAAGACATT
TTTAAAAATTTAAATGAATCCATAAAGACTTACAATTATAAGATTCCTTCCAATCCAAAT
TACTAAAAAAAGGCTTCTGCCACCTAAATTTTCCATCCTATCACTTTCAAAAAGAGAATA
CTTCTCATAGACAACATTATAAAACTTGGAGTGTATTTCAATTACCAAAGACAGATTGTG
CAGTAAGCAATCGCTCTTTTCGACACTCTCTTCCTCCAGCCTAATAACCAAATAAAGGAA
AAAAACCTTTAACTGTATGCGATTACCTCCCTATTCATTTCAGCTAAGAAGGAAGATTCT
AATAAGTAAACGCTAGACAAATACGTAGAATTCACAAATTAGTACACAAATTAAGATTTT
ATCAACTGCGAGATGAGTATATTAAATCTCCTCAAGTGGTAAATCAGTCCTTTAAGTTTA
GAAACAGTCAATGGAGTTATCATTGATTTGCTAGAAGGCAAATTTTTCGGATGTGGCTAC
ATGAAGTAAAATTTCGCCTTCTAATTCCGTCTAAATGTGCTCGTAGATTTGATTAACTTG
AAGTAGAACTTAACAAATTTCTAATACTGTATTAAAAACATTTCTCTAGCACTAATCTTC
GTCAGTCTTACTATTGCTCAAGGTTGTTTTTCAAGCCTCGACTAAGCATAGATTGACTTG
ACAGAAAATATATTCCATCTCTGTAATTAAACCACTTCTTCTTGCAACAGTACCACTCTA
GCTAAAATAAATGATATCTTTGCCCAATTCATGCGTAAATACTTCTACCTTACTTCTATC
AGCGATATTGCTTTAGAAATTTAGTATGTTGCTAAGTTCCTAGACTTTCTCTCAGATCCA
ATTATTTATTAAGTCCCTAAAAAGATCCATATTTAAGCACACTTCCCAAACGCAGTGGAG
TTTATTTAAACTTCAAAGTTCTTGTGA


>TTHERM_00962160(protein)
MGKRSCEKGERGKKCQKQSNLSNNVNGVSKLITKSPQPQNQSHHSYRTRLQIMQNEKQGM
NLMNTELTVTTACTVTLSNYNMNNSKGSYFDQSSTTINCDFSTTFANSTQQTQYNNTNCA
IMEDTINPDYFEQFFKVGNNNQNNQRPRRLKIQKLQFQNNEDTQKLQDKFKNPQLQQKKI
TKKQLQKFQPQDFLSELEDIFKNLNESIKTYNYKIPSNPNYQKKASATQIFHPITFKKRI
LLIDNIIKLGVYFNYQRQIVQQAIALFDTLFLQPNNQIKEKNLQLYAITSLFISAKKEDS
NKQTLDKYVEFTNQYTNQDFINCEMSILNLLKWQISPLSLETVNGVIIDLLEGKFFGCGY
MKQNFAFQFRLNVLVDLINLKQNLTNFQYCIKNISLALIFVSLTIAQGCFSSLDQAQIDL
TENIFHLCNQTTSSCNSTTLAKINDIFAQFMRKYFYLTSISDIALEIQYVAKFLDFLSDP
IIYQVPKKIHIQAHFPNAVEFIQTSKFL


>TTHERM_00962160(gene)
ATGGGTAAAAGAAGCTGCGAAAAGGGAGAAAGGGGGAAAAAATGCTAGAAGTAAAGTAAT
TTAAGTAATAATGTGAATGGAGTTTCTAAATTGATAACAAAGAGCCCATAACCATAAAAT
TAATCTCATCATTCTTACAGGACAAGATTATAAATTATGTAAAATGAGAAGTAAGGAATG
AACTTAATGAATACGGAACTGACTGTAACTACTGCCTGTACAGTCACACTTTCAAATTAT
AATATGAATAACAGCAAAGGTTCTTACTTTGATTAAGTAACATCTTCATTTTGACAAATT
ATTTTTACACTTTAAGTGAGTTTATTTGTTTGTTCTGCTTTCAAATTTAAAGCCGCGTTT
TTTGCTTTTAACTTTTTTAGAAATTACTTTTTTTGGGTAGCTACTTGCTCATTCGTCAGA
AATATAAATATTGAAAAAATCAATAAATAAATAAATATACTATAATACTGCAATCATTTC
ATACCATATTCAAAGAACAAATAAATTATCCTAGATATTTTTGTTAGTAGAATGAGAGAG
AATATCAAGCTAAAACGGATGAATCGTAGTATCAATTAGATGGGTGCAAGCGATTAGAAT
ATAAAAATAGTTAGAATAAAAATAAAATTATGAAATATCTTTTTTATCATGTGATCAATA
AACAACCTAATAAATCACCCCAATTAATCAATAAGTCAATTTTTTAGTTGATTTAATTAT
TGAAAAGAAATAGAAAAATGTAATAAAATTAACTAAGTCCAAAGAGTATTGAGCGAATAA
ACTTTAATTAAAATACGATCTAATCAATTTTTTTTTTTCGCTCAAAATTTTAATTTATTT
GTTGCTCACCAATTGAAAAATAAATCAACTTATTTTCTTACTCAACAAAAAAACTCAATA
CTATTCTGACGATTAATTTATTATTTTTACAAAAACTTTCTACGTTACTTTTTTCTTTCT
TTCTTTCTTTTTTTTCACCTAATCTGAATTTCCAAAATTTTCAGTGAAAACGAATGAATA
AATGAATGACTGATCAAATAAATTATTAATTAATTTTCATTACACAAAAATTTAACAAAT
TTATAAATTAATATAATAAACATAGAGTTCGACTACTATAAACTGTGACTTTAGTACCAC
ATTTGCTAATTCTACTTAGTAGACTTAATACAATAACACAAACTGTGCCATAATGGAAGA
TACTATCAATCCAGATTATTTTGAGCAATTTTTTAAAGTTGGAAACAATAACTAAAATAA
CCAGAGACCTAGAAGGTTAAAAATTTAAAAACTTTAATTCTAGAACAATGAAGATACACA
AAAATTGCAGGACAAATTTAAGAATCCTCAGCTTTAACAAAAAAAAATAACAAAGAAGTA
GCTCTAAAAATTCCAACCTCAAGATTTTCTTTCTGAATTAGAAGACATTTTTAAAAATTT
AAATGAATCCATAAAGACTTACAATTATAAGATTCCTTCCAATCCAAATTACTAAAAAAA
GGCTTCTGCCACCTAAATTTTCCATCCTATCACTTTCAAAAAGAGAATACTTCTCATAGA
CAACATTATAAAACTTGGAGTGTATTTCAATTACCAAAGACAGATTGTGCAGTAAGCAAT
CGCTCTTTTCGACACTCTCTTCCTCCAGCCTAATAACCAAATAAAGGAAAAAAACCTTTA
ACTGTATGCGATTACCTCCCTATTCATTTCAGCTAAGAAGGAAGTAAGCTTTTAATTTAA
TTTATCAGCTAAATATCTTAAGCTACCAATATACATACATAAATAACATGCAATTTAAAT
TTATGAGACACTTTAATTAAATTAATTTTCCTTAAATGTTAGGATTCTAATAAGTAAACG
CTAGACAAATACGTAGAATTCACAAATTAGTACACAAATTAAGATTTTATCAACTGCGAG
ATGAGTATATTAAATGTATTTATTTATTCTTCCTTTCTTAGACACTTTTCATTTCTATCA
AAAATTGAATTAAATTTATTTCTTTAATTTAGATTTTTAATTAATTTAATTTTCTAAAAA
AAGCTCCTCAAGTGGTAAATCAGTCCTTTAAGTTTAGAAACAGTCAATGGAGTTATCATT
GATTTGCTAGAAGGCAAATTTTTCGGATGTGGCTACATGAAGTAAAATTTCGCCTTCTAA
TTCCGTCTAAATGTGCTCGTAGATTTGATTAACTTGAAGTAGAACTTAACAAATTTCTAA
TACTGTATTAAAAACATTTCTCTAGCACTAATCTTCGTCAGTCTTACTATTGCTCAAGGT
TGTTTTTCAAGCCTCGACTAAGCATAGATTGACTTGACAGAAAATATATTCCATCTCTGT
AATTAAACCACTTCTTCTTGCAACAGTACCACTCTAGCTAAAATAAATGATATCTTTGCC
CAATTCATGCGTAAATACTTCTACCTTACTTCTATCAGCGATATTGCTTTAGAAATTTAG
TATGTTGCTAAGTTCCTAGACTTTCTCTCAGATCCAATTGTAAAAATTAAATTTAAATAA
ATTACAAAATATATTATTTAGTTAAAATATTAAAAAAATTAATAAATTAGCCATAAATTT
AATCTACTTCAGTATTTTAATTTAATGAGAAATTTTAATCATTCGATAAATGAACGAGTA
AAATAGGTTGAAAATAATTAATCTAGAAGCTAAAAATAATTAATTAAATAGCATAGAAGA
AGATATAGGATAGATTTAAAAAAATGAAAACTTAAGATTCAAAAATTAAAATAAAACTAG
AAAAATTATTTTTAAATAGATTAAATTGATTTGAATTTAAAATTATTAATTTGTGAAATT
TATCTAAATCAAAATCTTGTCTAAGAAGAAAAATAAATAATAAAAAATTAGATTTTAGAA
AAAAAAATAAGAAAAAATTTGATTTTATAAAACAAACTGAAAAAATGGAAATATAATTTT
TAAAAAGTAAGAAAAAATCTATTTTATTCAATCTGAGTTGTAATAAAATATTAAAATGAA
TTAATAATAAAAAATTGATATTAAAAGTAATTTAAAAAATTAGAAAATAAAAATGGCAAA
TTTTATTTCAAAATTATTTTTTAGCTTTATTGATAATGATAAAAATTAATATTAAACATT
TTTATTATTTAAAAAAGATTTATTAAGTCCCTAAAAAGATCCATATTTAAGCACACTTCC
CAAACGCAGTGGAGTTTATTTAAACTTCAAAGTTCTTGTGA