Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00433390

Standard Name

CYC10 (CYClin)

Aliases

PreTt26482 | 48.m00245 | 3831.m01583

Description

Fusion of a cyclin protein to a cyclin-dependent kinase; Cyclin, N-terminal domain containing protein. Sequence similarity to the CDC2 subfamily of the protein kinase CDK family (Eisen et al., 2006)."

Genome Browser (Macronucleus)

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Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

Biological Process

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.8%

TetraMine Data

TTHERM_00433390

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_04170.19.997093137033517e-262cyclin domain-containing prote
in (1077 aa)
OxytrichaContig19750.0.g989.997093137033517e-262Protein kinase domain
Stentor CoeruleusSteCoe_262825.440559879258653e-75
DictyBaseDDB_G02728137.002411919958887e-50cdk1 on chromosome: 2 position
2216835 to 2217926
WormBaseWBGene000004051.9990449803848145e-49locus:cdk-1 Cyclin-dependent
kinase 1 status:Confirmed
UniProt:P34556 protein_id:C
AA81590.1
SGDYBR160W7.00293386439118e-45CDC28 Catalytic subunit of the
main cell cycle cyclin-depend
ent kinase (CDK); alternately
associates with G1 cyclins (CL
Ns) and G2/M cyclins (CLBs) wh
ich direct the CDK to specific
substrates

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:27192402: Yan GX, Dang H, Tian M, Zhang J, Shodhan A, Ning YZ, Xiong J, Miao W (2016) Cyc17, a meiosis-specific cyclin, is essential for anaphase initiation and chromosome segregation in Tetrahymena thermophila. Cell cycle (Georgetown, Tex.) 15(14):1855-64
  2. Ref:16933976: Eisen JA, Coyne RS, Wu M, Wu D, Thiagarajan M, Wortman JR, Badger JH, Ren Q, Amedeo P, Jones KM, Tallon LJ, Delcher AL, Salzberg SL, Silva JC, Haas BJ, Majoros WH, Farzad M, Carlton JM, Smith RK, Garg J, Pearlman RE, Karrer KM, Sun L, Manning G, Elde NC, Turkewitz AP, Asai DJ, Wilkes DE, Wang Y, Cai H, Collins K, Stewart BA, Lee SR, Wilamowska K, Weinberg Z, Ruzzo WL, Wloga D, Gaertig J, Frankel J, Tsao CC, Gorovsky MA, Keeling PJ, Waller RF, Patron NJ, Cherry JM, Stover NA,

Sequences

>TTHERM_00433390(coding)
ATGTTTTAAAATACAAATTTCAACTGCAATCAGGAAGGTTAAAGTTAGAGAATTAATTCG
AATGTCTAGGGCTCAAGTGGTAAAGAGAGGAGATAACAGAACTAATCACAGAAGATGAAC
AATTAATAAAAAAATGAGTAGAGAAGCAAGTAAAAAAATAGACGTAGCAGTAGAAAATCT
TAGAGTAAGAATTCAAATAATAATGCTACATAGATAGAATAGCAAAACTAGTAATAAGAA
TTGATAAATAACTAAAGAGTAGAGAGCGCTTAAAATTCCAACAAAAAAATAGGATAATCT
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AATAAAACTAATTTTTTAAGCTCTCCAAATGAAAATTCATACTAAGATTCACCTGCTTAA
AATCAATAGCAGCGAAGTGTTTCTCCTGTCAAAGAAGAGAGAAAGTATGATTCAGATGAT
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AATATCCAAAATAATAACAACATGAATATTCATATTAACTAAATGAATTAAAGTATCGCA
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TTAAGCCACATTCACTAGCACCACTCACATAACTTACAGCAAATGTGCTGTCCTTTAAAT
AACAGTAGCAATTTGAACAGTATGATAAGCAGCAATAACTTTGATATTAATAACACTAGT
AGTTGTCATGAGAAATCTAGTTCAAAGCAGAGAAATGTAAATGGAAAAGGCAAAAAATAT
GGATATAAACATGGATAAATGAATCTGAACTGTGATTAAAATAGTTTGAATGGTAAAGAG
CAGCACAAAACATGCCAAATAAATTGCGAATAAGCACTATGCTAGAATAATAAAAGCTTA
AGAAATTTATCAAACTTACTAAAAAGCTTGAAATTTTCACCTCTACTTGCTTAATAATAG
TAAGTAACATAGAGCTTAATGACTTTACCCTTCGAACTTCACTTCATTATTTGTTCTTAT
TTATCTCCCAAAGATATTTACCTGCGCCTTGCAAATGTAAATTAGTACTTCCGTAAAATG
TGTAAAGATACTCGTCTTTGGAGCTATATCTAGAAGTTTTAGACTTTGACCATTAATGAC
AAATATTAGAAGAATATCCCTGTAGTAGAACGCAGATCCAAAGGAAGACTCTTTTCAGCA
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ATAGTTACAAAAAGATAAGAGTATAACTTGAAGGAATATACAAGAAGATATATCAGCTAA
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AAGGAAATTGCTTACTAGATTCTTGAAGGTTTAAATTACTTGCATCACTAAGGAATTATG
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TTCGGTCTTTCAAGACTTGTTTCGATTCCCCACATACCATACACTCCTGAAGATCCTAAA
GAAAGAGAACGCTCAGGAAGAGAAGCTCGCCGTCTTTGGTACAGAGCTCCTGAGCTCCTT
TTGAGAAAAAGCATCTACACCTTTGAAATTGATATGTGGTCTTTTGGCTGTCTTTTAGCT
GAAATTGTTTTGAATGAACCTTTATTTGCTGGAGATTCTGAAATTGAGTAGCTTTTCAAG
GTATTCAAATTTATTGGTTCTCCAGATTCAGAAACCTTAATGTCAATGTGTGACAACCCT
GATTACTAGCAAACCTTCCCAAAATGGAAAATGATCAATTTATCCCATATCTGTGAATAA
AATTAGAGTGAAGAATTCAAATAATTAAAGACCACAATGATTCCCAACAGATAGAACGGA
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TTCTTCGATGAAATAAGATAGTAAAGAACTTTAATGAATATTCCCATGCAAATTGATGAA
ACCATTAATATTAATAAGTGTTGCAGCTAAGTAGTACCTTCATGCTATTTTTAGTTCTCA
CTACCTTACTGCCATTTATCAACAATTTATTAAACTATGGTTAAATAAGAAAAGATAGAA
ACCTTGATCAAACCTGATTACATGAAAGACTAAGCCTTAATCACTGAAAATATGCGTATA
ATACTTATTGATTGGCTAACTGATGTAAGCGTTCATTTCGAAGCATAAGACGAAACTCTT
CATTATTGTATTTCTTACATCGACAGAGCTTTGGGTATCATGAATATTGATAAACAAAAA
CTGCAGTTAGTAGGAGTAAGTTGCATGAAAATTGCAGATGTATTTAATGAGAGATCTAGA
GAATATTACAAATAAGAAAACGCTATCGAATATGCATACATAACAGCAGAAGAGTATAAT
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ACTCCAAATATGATGTATTTTTTAAAAATAATGTGCACTTTATTTGATACTGACTCCTAG
GTTTCCGTTATTGCTATGTTCCTGGCCGACTTGCTACTTATGAGTTACGAAGCATTGAGA
TTTAAACCAAGCTTACTAGCCAGTTGCTGTATATTTTTGAGCTTTTTGACTAACGAGAGA
GAACTTCCTACTTAAGAAAAGCTAAATGAAGTTCGTAGCCTTTTAGACCATTATACTATT
AATGAGTTTAAAGAAGCAGCTGAATTTGTTAGAAAATTCTGGCATTATTATAGATCTGAT
CCCAACACACTAAACTTCTAATCAGTCTACAATAAGTATGCTGTTGTATATGGTCTAGAA
GCAAGACTAATTAATGCTCCTATAATAGAATAAGCCTAATACAGCTAATGGATCTATACA
AAATGA


>TTHERM_00433390(protein)
MFQNTNFNCNQEGQSQRINSNVQGSSGKERRQQNQSQKMNNQQKNEQRSKQKNRRSSRKS
QSKNSNNNATQIEQQNQQQELINNQRVESAQNSNKKIGQSTNSTLSSSIQSSPSSYTSQF
PSISEITQLTVLKGNSNNYTNKTNFLSSPNENSYQDSPAQNQQQRSVSPVKEERKYDSDD
QENNPSLANLQTSNTNNSINNIQNNNNMNIHINQMNQSIASNNNLGISNFMNGNSSQSNH
LSHIHQHHSHNLQQMCCPLNNSSNLNSMISSNNFDINNTSSCHEKSSSKQRNVNGKGKKY
GYKHGQMNLNCDQNSLNGKEQHKTCQINCEQALCQNNKSLRNLSNLLKSLKFSPLLAQQQ
QVTQSLMTLPFELHFIICSYLSPKDIYLRLANVNQYFRKMCKDTRLWSYIQKFQTLTIND
KYQKNIPVVERRSKGRLFSAVSRLDHNQFMIRNVNIMISNAGQDDGVPTSILRELSYLQA
LDHPNITKIHEVDIKNVIVQIVTKRQEYNLKEYTRRYISQVQDDSKGLTRPQYKIPLIKV
KEIAYQILEGLNYLHHQGIMHRNLKIDNILLDKDVVKISDFGLSRLVSIPHIPYTPEDPK
ERERSGREARRLWYRAPELLLRKSIYTFEIDMWSFGCLLAEIVLNEPLFAGDSEIEQLFK
VFKFIGSPDSETLMSMCDNPDYQQTFPKWKMINLSHICEQNQSEEFKQLKTTMIPNRQNG
FQKLKNLGTILGMQGMQLLNSLLQLNPYKRISSQEALNHPFFDEIRQQRTLMNIPMQIDE
TININKCCSQVVPSCYFQFSLPYCHLSTIYQTMVKQEKIETLIKPDYMKDQALITENMRI
ILIDWLTDVSVHFEAQDETLHYCISYIDRALGIMNIDKQKLQLVGVSCMKIADVFNERSR
EYYKQENAIEYAYITAEEYNAAQLIAMEKKILKVLSFQLNTPNMMYFLKIMCTLFDTDSQ
VSVIAMFLADLLLMSYEALRFKPSLLASCCIFLSFLTNERELPTQEKLNEVRSLLDHYTI
NEFKEAAEFVRKFWHYYRSDPNTLNFQSVYNKYAVVYGLEARLINAPIIEQAQYSQWIYT
K


>TTHERM_00433390(gene)
ATGTTTTAAAATACAAATTTCAACTGCAATCAGGAAGGTTAAAGTTAGAGAATTAATTCG
AATGTCTAGGGCTCAAGTGGTAAAGAGAGGAGATAACAGAACTAATCACAGAAGATGAAC
AATTAATAAAAAAATGAGTAGAGAAGCAAGTAAAAAAATAGACGTAGCAGTAGAAAATCT
TAGAGTAAGAATTCAAATAATAATGCTACATAGATAGAATAGCAAAACTAGTAATAAGAA
TTGATAAATAACTAAAGAGTAGAGAGCGCTTAAAATTCCAACAAAAAAATAGGATAATCT
ACCAATTCTACTTTATCGTCCTCCATTTAATCATCTCCTAGTTCTTATACTTCATAGTTT
CCTTCTATAAGTGAAATTACTTAGTTAACTGTCCTTAAAGGAAATTCAAATAATTATACA
AATAAAACTAATTTTTTAAGCTCTCCAAATGAAAATTCATACTAAGATTCACCTGCTTAA
AATCAATAGCAGCGAAGTGTTTCTCCTGTCAAAGAAGAGAGAAAGTATGATTCAGATGAT
CAAGAGAATAACCCAAGTCTTGCAAACTTATAAACAAGCAATACAAATAACTCCATAAAC
AATATCCAAAATAATAACAACATGAATATTCATATTAACTAAATGAATTAAAGTATCGCA
AGTAATAATAACTTAGGAATTTCAAATTTCATGAATGGCAACAGTAGCCAAAGCAATCAT
TTAAGCCACATTCACTAGCACCACTCACATAACTTACAGCAAATGTGCTGTCCTTTAAAT
AACAGTAGCAATTTGAACAGTATGATAAGCAGCAATAACTTTGATATTAATAACACTAGT
AGTTGTCATGAGAAATCTAGTTCAAAGCAGAGAAATGTAAATGGAAAAGGCAAAAAATAT
GGATATAAACATGGATAAATGAATCTGAACTGTGATTAAAATAGTTTGAATGGTAAAGAG
CAGCACAAAACATGCCAAATAAATTGCGAATAAGCACTATGCTAGAATAATAAAAGCTTA
AGAAATTTATCAAACTTACTAAAAAGCTTGAAATTTTCACCTCTACTTGCTTAATAATAG
TAAGTAACATAGAGCTTAATGACTTTACCCTTCGAACTTCACTTCATTATTTGTTCTTAT
TTATCTCCCAAAGATATTTACCTGCGCCTTGCAAATGTAAATTAGTACTTCCGTAAAATG
TGTAAAGATACTCGTCTTTGGAGCTATATCTAGAAGTTTTAGACTTTGACCATTAATGAC
AAATATTAGAAGAATATCCCTGTAGTAGAACGCAGATCCAAAGGAAGACTCTTTTCAGCA
GTATCCCGTCTAGATCATAATCAGGTAAAAAATAAATTGTCCTTCATTTTAAATTTTCTA
TTTCAAATTTTAAATCAATCAATCAATCAATCAACAAACATATTTGAAAACAAATTCTTG
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TGTTCAATTAAATTAAAAAAAAGTTTATGATTAGAAACGTGAACATTATGATAAGCAATG
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TTGATCACCCAAATATCACAAAGTAATTTTAATTATTAATTCATTAACAAGTGAAAAACT
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AAGATAAGAGTATAACTTGAAGGAATATACAAGAAGATATATCAGCTAAGTTCAGGATGA
CAGTAAGGGACTCACTCGTCCTCAATACAAAATTCCTTTGATTAAAGTTAAGGAAATTGC
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AAAGATTGATAATATTTTGCTTGATAAAGATGTTGTAAAAATATCAGATTTCGGTCTTTC
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CATCTACACCTTTGAAATTGATATGTGGTCTTTTGGCTGTCTTTTAGCTGAAATTGTTTT
GAATGAACCTTTATTTGCTGGAGGTAAAAATAAATAAAATAAAAATTAATTTAAAACAAA
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TGAAACTGATAGCAATCAATATATTAAATGTCTTTAAAAGCAGATAAATTTACAAATAAT
CTAGATTTAGGATAGCTTTCTAAATTAATATCAAGCATAAGTTAAAAACAGAAAATTTAA
ATTTGAATGCAAATTCATAAAATTAAGATATTAAGGCAACAAACAATTATCAATTTAATT
TATTTTATTTTTTGTTGTTTTTTTTCACTCAAAAAGAAAAATAGATAAAATAGACAAAAT
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AAATGACAAATAAATTGATTAATTCTTTTTATACTAAATAGATTCTGAAATTGAGTAGCT
TTTCAAGGTATTCAAATTTATTGGTTCTCCAGATTCAGAAACCTTAATGTCAATGTGTGA
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TGAATAAAATTAGAGTGAAGAATTCAAATAATTAAAGACCACAATGATTCCCAACAGATA
GAACGGATTTTAAAAACTTAAAAATTTAGGCACTATCTTGGGAATGTAAGGAATGTAGCT
TTTGAACTCATTACTTCAATTAAATCCTTATAAGAGAATATCTTCTCAAGAGGCTCTTAA
CCATCCATTCTTCGATGAAATAAGATAGTAAAGAACTTTAATGAATATTCCCATGCAAAT
TGATGAAACCATTAATATTAATAAGTGTTGCAGCTAAGTAGTACCTTCATGCTATTTTTA
GTTCTCACTACCTTACTGCCATTTATCAACAATTTATTAAACTATGGTTAAATAAGAAAA
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GCGTATAATACTTATTGATTGGCTAACTGATGTAAGCGTTCATTTCGAAGCATAAGACGA
AACTCTTCATTATTGTATTTCTTACATCGACAGGTAAATAAAAACCAAATCTTCTTATTT
TTTTTAAGTTATAATTTTATTTTTTAAAATAATTATTTTAATTAAACGTCTTTAATTAAT
CTTTACTAAATTAATGAATAATATTATAAATCAAAAGAGCTTTGGGTATCATGAATATTG
ATAAACAAAAACTGCAGTTAGTAGGAGTAAGTTGCATGAAAATTGCAGAGTAAGAAATTA
ATTTAATAATAAAGAATTTATTAATATTTAAAATTTAAAAATAGTGTATTTAATGAGAGA
TCTAGAGAATATTACAAATAAGAAAACGCTATCGAATATGCATACATAACAGCAGAAGAG
TATAATGCAGCTTAACTCATTGCTATGGAGAAAAAAATTCTAAAAGTTCTCTCTTTCTAA
TTAAATACTCCAAATATGATGTATTTTTTAAAAATAATGTGCACTTTATTTGATACTGAC
TCCTAGGTTTCCGTTATTGCTATGGTAAATTATTTATTAATAAAATAAATAAATCGTATA
AAAAATAAAAGCAAAAATTATACTGATTACTTTTTATTATGTTTTGCTTTTATTTTTTTC
AATATTATTTTAGTTTAAAATTTTTTGATTTTTAATTTAAATTTATATTTGAAAATTAAA
AGTTCCTGGCCGACTTGCTACTTATGAGTTACGAAGCATTGAGATTTAAACCAAGCTTAC
TAGCCAGTTGCTGTATATTTTTGAGCTTTTTGACTAACGAGAGAGAACTTCCTACTTAAG
AAAAGCTAAATGAAGTTCGTAGCCTTTTAGACCATTATACTATTAATGAGTTTAAAGAAG
CAGCTGAATTTGTTAGAAAATTCTGGCATTATTATAGATCTGATCCCAACACACTAAACT
TCTAATCAGTCTACAATAAGTATGCTGTTGTATATGGTCTAGAAGCAAGACTAATTAATG
CTCCTATAATAGAATAAGCCTAATACAGCTAATGGATCTATACAAAATGA