Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00540340Standard Name
CPH2 (homolog of CAP-H or BRN1 condensin gene)Aliases
PreTt12192 | 70.m00188 | 3728.m00085Description
condensin complex subunit 2; condensin subunit- kleisinGenome Browser (Macronucleus)
![]()
Genome Browser (Micronucleus)
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Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.4%
TetraMine Data
TTHERM_00540340
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_18236.1 9.997093137033517e-262 hypothetical protein (975 aa)
Oxytricha Contig18145.0.g34 0.000000000000020000882446601127 Condensin complex subunit 2
SGD YBL097W 0.000030009396760408108 BRN1 Subunit of the condensin
complex; required for chromoso
me condensation and for cluste
ring of tRNA genes at the nucl
eolus; may influence multiple
aspects of chromosome transmis
sion
DictyBase DDB_G0292066 0.00007000107212225429 ncapH on chromosome: 6 positio
n 1141212 to 1144129
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
- Ref:29237819: Howard-Till R, Loidl J (2018) Condensins promote chromosome individualization and segregation during mitosis, meiosis, and amitosis in Tetrahymena thermophila. Molecular biology of the cell 29(4):466-478
Sequences
>TTHERM_00540340(coding)
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AGTCAGCTAGTTAAATCTGACGATTTAGCTATGAAGACTTCTAATAAACCTATCAGGAGA
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TTGGATGCTGAAAGCGATCAAGAAAGTGATGATGATTCACATCTCACTCCAGAATAAAAA
TAACTAAAAGATAGATGGCTTCAAATATTCCAAAAAATATCTAAAAGTAGAATAAAGACG
GATGAAGCTTTTGATTTTGATGTAGAATAGGAACTTTAATTAGTTTTGTATGAGTGGAAA
GACTCAGGATGTATATTAGAGTGTATTTCCAAGCTCTATTCTATGAAAGTTGATAGACTA
TCAAAAGAGGCTTATCATTTATTAGCATGTATAGCAAGAGGATAAATAGGTGGAGACAAG
AGTAAAGAAATGGAAAATGAAGAATAAGAGGATGAAAGCAAGAATGAAGGAAATAAATAA
GACAGAAACGATTAAAAAAAAAAGATAGTTTCATTTGAAGAAAAATAAATCTAACAAGGA
TCTTTTGAAAATTTTGATCCGTTTATTGCTGGTTAAAAGCAGATAGAAAAGCCAGAAAAA
TTAATTGTTGATAAGTATGATATTCTTTTTGATCTAGATCCTCTATTTAGGAAGAAAAGC
TAGTATTTTGACGATACTAGCTCGGAAGGTCTTCTTCTTAATGTACTGGAAGTAGATAAA
GAGCTTTGTATAAATTTGTCTGAATTAGATGAGGCATTGGGCAAATAGTAAAAATTAGTT
TAAAGAGATTAAAAAAAATAGACTAAGTCAAATTATATGAAATTATTCACTTAAGAAGAA
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ATCATGGATGAAAATTCTGCTTCTATAGTCAATTAAGTGCTTTAAAATGAGAATGATAAA
ATTTTATTAAACGAAATAAACCTAGCATATTAAATGAATGCTTTTACCTCATAAAATTTT
ATGTACAGAAACCTGAGTGACGATTCATTGTTTCAAAATGCATCTCAGTCTTCATAAAAC
AAAGAAGATTTTATTTTATCATAAATGTCTTAAAGTTACACGCCTGATAACAGTATTTTT
AAGAACACAAAGCAGATAAGATTCGATTTGAATGACGAATACTAAGGTTTTGATTCTTCA
AATGACTATGCAAATTATCATGATGAAAATCCATCAACTTAAGAAACAAAGCAAATTGAT
AATTCTTTACTTCATAATTCTTTAAACAAAGTAGGAGGAGGAGATAAAACAATATTCTCT
AATTTTCTCATGAATTTAAATTGGGGAGACCCTAAGCAATGGGATATACAAAAGCTGAGT
GCTAATAAAAGGAAAAAAATACGTTCAAAAAAATTGTAAGATGATCTATTACTTGGAGAG
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GAAAGATTAACGAAGCCACAAAAATATATTGATTTTAGCCTAAATAATGGAAAAGAAGAA
AGCTATAAAGAAGTAATAGGCAAGAAATTTTAGAGATATAAGAGTAATTTAGGATTAAAA
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GTATTCTAAATAGGTTTAAAATACATAGAAAATACAAAATAAAGTAGAATAAAGGAATTT
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AGCTAAAATGCTATTAATTAAAATGATGAATATTAAAATGAGTACGAAGCTATTGGCTTT
GATGATTTATATGATGAAATGGATGATAGATTTTACAATCCTTAGAAGTATAATAATTAA
AGAGATAATAGATTTTTTAACACACAAAGAGAAGGCTAAAGTCAATTTGATATTTAAATG
AATAACTCACCATACGGAAGATATCAATACCCTTTCTCTGCTAATAATAATTCACAAAGT
CTCTACACTCAAAATAAAACCCAAAACTTTTTTTCATAAACTATAAAAAGAAAGCCTGTG
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AATAACAGCTAATTAACCTAATTAAGTTAAATTGTATAAGAAAATTAAAATAAAAGAGGA
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CCAAATTCTCTTGGATAAGATAATTAAGCTTAGGGAGTTTCAGTCTAGAATTGCTTTATT
AGCATACTGCATTTGGCAAACGAAAAACATCTTAGACTTGTTGATCCAAGTCACACTGAG
TTAGAATTTTTTATTTTCTTGGATTAAACATTACAAGAAAATGAAAACTCATAAAACCTT
AGACGAAGCAAAATTTAAGAATCTTGA>TTHERM_00540340(protein)
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DRNDQKKKIVSFEEKQIQQGSFENFDPFIAGQKQIEKPEKLIVDKYDILFDLDPLFRKKS
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RRSKIQES>TTHERM_00540340(gene)
ATGAATGCAAACAAAAAGCAAACAAAAATTAGAAGGGCAAAAAGCACTTTGAAGAGTTCT
AGAAAGGAAAAATATAGCATAGAAGATTTAGAAACAGAAAAGGAAAGTAACATATCATCT
TATGATCTTGATTATTAGGATGATATTTGGGAGATTAATTCTAATTAAAAAGCAGCTGAA
ATATCTTTTTCTTAGAAAAAAAATGTAAGTGTGAATAGCAGTCTTAAAGGGAGAAATAAT
AGTCAGCTAGTTAAATCTGACGATTTAGCTATGAAGACTTCTAATAAACCTATCAGGAGA
GTTAACACAAGCATAAGCATGAGTTAGAGCTCTGTATAAATATAGGATGAAAGCATAGAT
TTGGATGCTGAAAGCGATCAAGAAAGTGATGATGATTCACATCTCACTCCAGAATAAAAA
TAACTAAAAGATAGATGGCTTCAAATATTCCAAAAAATATCTAAAAGTGTAAGAATTTAT
TTTTTATATTTACTATCTTAGTAAGTATAAAGTAAAGTTAAGACACATCATTATTTTTTA
AAACATTAAATACAAAGAGAATAAAGACGGATGAAGCTTTTGATTTTGATGTAGAATAGG
AACTTTAATTAGTTTTGTATGAGTGGAAAGACTCAGGATGTATATTAGAGTGTATTTCCA
AGCTCTATTCTATGAAAGTTGATAGACTATCAAAAGAGGCTTATCATTTATTAGCATGTA
TAGCAAGAGGATAAATAGGTGGAGACAAGAGTAAAGAAATGGAAAATGAAGAATAAGAGG
ATGAAAGCAAGAATGAAGGAAATAAATAAGACAGAAACGATTAAAGTATTCTTTAAAAAA
TCATTATTTTATATTTTAATCATTCAATTAATTAATAATTAGAAAAAAAGATAGTTTCAT
TTGAAGAAAAATAAATCTAACAAGGATCTTTTGAAAATTTTGATCCGTTTATTGCTGGTT
AAAAGCAGATAGAAAAGCCAGAAAAATTAATTGTTGATAAGTATGATATTCTTTTTGATC
TAGATCCTCTATTTAGGAAGAAAAGCTAGTATTTTGACGATACTAGCTCGGAAGGTCTTC
TTCTTAATGTACTGGAAGTAGATAAAGAGCTTTGTATAAATTTGTCTGAATTAGATGAGG
CATTGGGCAAATAGTAAAAATTAGTTTAAAGAGATTAAAAAAAATAGACTAAGTCAAATT
ATATGAAATTATTCACTTAAGAAGAATTTAAAAATAAATTCTCAGCTCCTGTTGAAGATT
AGATTATCGATTTATTTCCAGAATTAATTGATTTTAAGATGTCAGTGATTGACGAAGTTT
CTTAATAATTGCTATTTGATAATATTTAAAGTTTAAACTCTGAGAATGATATTAAGATTC
TAACTCAAAATAATAAAAAAATGGAAATCATGGATGAAAATTCTGCTTCTATAGTCAATT
AAGTGCTTTAAAATGAGAATGATAAAATTTTATTAAACGAAATAAACCTAGCATATTAAA
TGAATGCTTTTACCTCATAAAATTTTATGTACAGAAACCTGAGTGACGATTCATTGTTTC
AAAATGCATCTCAGTCTTCATAAAACAAAGAAGATTTTATTTTATCATAAATGTCTTAAA
GTTACACGCCTGATAACAGTATTTTTAAGAACACAAAGCAGATAAGATTCGATTTGAATG
ACGAATACTAAGGTTTTGATTCTTCAAATGACTATGCAAATTATCATGTATGTATAAATT
TCAGTTAAAACTTCTTCAATAAAATAGAAAATTGTAAAATATATTATAGGATGAAAATCC
ATCAACTTAAGAAACAAAGCAAATTGATAATTCTTTACTTCATAATTCTTTAAACAAAGT
AGGAGGAGGAGATAAAACAATATTCTCTAATTTTCTCATGTAAATTTTTAATTTATGTAA
TGTTTCTCAATAAAAATTTATTAAAAAGGAATTTAAATTGGGGAGACCCTAAGCAATGGG
ATATACAAAAGCTGAGTGCTAATAAAAGGAAAAAAATACGTTCAAAAAAATTGTAAGATG
ATCTATTACTTGGAGAGATAAAGGAAGATATGGAAGCTGAAGAATAAAATGAAAACATAG
CCATGAATAACCAGTATGAAAGATTAACGAAGCCACAAAAATATATTGATTTTAGCCTAA
ATAATGGAGTAATTTGTCAAAACATTAAAGATTAATTATAATTTATTTTCTAAACCAAAA
AGAAAGAAGAAAGCTATAAAGAAGTAATAGGCAAGAAATTTTAGAGATATAAGAGTAATT
TAGGATTAAAATATGTAAAAATAAAGTAGAAAAGTACTATTCAAAAAGATTATAAAATTA
CCAGTGAGCAGTACTAATTTTAATTATATTATGATAATATTTAAATATTTATTTTTTAAA
AGAGTATTCTAAATAGGTTTAAAATACATAGAAAATACAAAATAAAGTAGAATAAAGGAA
TTTACTAGTGAATATGACAGTTAATTTGATATATTTTAGTAGAGCTAATAGAATTAAAAT
ACAAGCTAAAATGCTATTAATTAAAATGATGAATATTAAAATGAGTACGAAGCTATTGGC
TTTGATGATTTATATGATGAAATGGATGATAGATTTTACAATCCTTAGAAGTATAATAAT
TAAAGAGATAATAGATTTTTTAACACACAAAGAGAAGGCTAAAGTCAATTTGATATTTAA
ATGAATAACTCACCATACGGAAGATATCAATACCCTTTCTCTGCTAATAATAATTCACAA
AGTCTCTACACTCAAAATAAAACCCAAAACTTTTTTTCATAAACTATAAAAAGAAAGCCT
GTGAGAATTAGAGATTTAAAAGAAACAGTATGGTAGACTATGACTTAATAGAAGAGCAAA
GAAAATAACAGCTAATTAACCTAATTAAGTTAAATTGTATAAGAAAATTAAAATAAAAGA
GGAAAAAGAAAAAATAAAGCCAAGCTATCTGAAAATGAAGAATAGGAGTAAATTGAAAGT
GCGATTACTCAAATTAATAGTGAAGATGTTTCTCTCAAGTTTAGTGATTTAATGCATTAA
TTACCAAATTCTCTTGGATAAGATAATTAAGCTTAGGGAGTTTCAGTCTAGAATTGCTTT
ATTAGCATACTGCATTTGGCAAACGAAAAACATCTTAGACTTGTTGATCCAAGTCACACT
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CTTAGACGAAGCAAAATTTAAGAATCTTGA