Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00728870Standard Name
CPH1 (homolog of CAP-H, BRN1 condensin gene)Aliases
PreTt07289 | 118.m00117 | 3739.m00039Description
condensin complex subunit 2; condensin subunit- kleisinGenome Browser (Macronucleus)
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Genome Browser (Micronucleus)
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Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.2%
TetraMine Data
TTHERM_00728870
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_17942.1 4.999717172196908e-122 hypothetical protein (294 aa)
Oxytricha Contig18145.0.g34 4.999245259173412e-21 Condensin complex subunit 2
DictyBase DDB_G0292066 6.998542127613979e-20 ncapH on chromosome: 6 positio
n 1141212 to 1144129
SGD YBL097W 0.0000000006999585478469937 BRN1 Subunit of the condensin
complex; required for chromoso
me condensation and for cluste
ring of tRNA genes at the nucl
eolus; may influence multiple
aspects of chromosome transmis
sion
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
- Ref:29237819: Howard-Till R, Loidl J (2018) Condensins promote chromosome individualization and segregation during mitosis, meiosis, and amitosis in Tetrahymena thermophila. Molecular biology of the cell 29(4):466-478
Sequences
>TTHERM_00728870(coding)
ATGAATAAAAGTCACAAAGGTGGTAGATTACTTAAGAAAAAAATATTATAAGAAGTATAG
GAAAAAGATGATTATTATGACGACGAAGATTTATTAACTAATGAAGAATTAAAAATGATG
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ATAAACAAAGAAAATGCCTTCGAAATACCTCTTCCAGATGTTAAGAATATGTCTGATTTT
GCAAAGGTAAGCGAAGCTTCTTGGTAGAAATTATCTAGCTCTATCGATTCTGGTTCGAAG
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ATTAGATCTGAGTTTATTAACAAAGATGAAGATCATCATGGCAAATAAGAGCAAGACAGT
GAAGACCTTATTAATAAAGAAAGGGAAAAGATATTTAAGAAAAATAAAAAGATAAATGAA
TCTACCATTGAAAAAAATTTATCTAACATTACATTGAATAAGTATGATATATAGTTTGAA
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GTACACAATCTACCTTAGGATTCAAGTGCAAGATAATCTTTAGATAAAGATTAGCAAAAT
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CTTGTTGCTATACTACACTTGTGCAATGAAAATAATCTGCAATTATATAATAATACCTAA
GATAATTTTCTCATCAAAAGAAATACTATCTAAGAATAACAATTGCAAGAAATGTCTTAA
GATTGA>TTHERM_00728870(protein)
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QQRLQEEEEQYKGFNGDDEYDIINQIDEYTLLGATPFRNTQMEVMNDNYDCTNTQANNNL
SQQNVNTQITSQYEHTQSYPESKNQQRKKQNVRKMKIQELKQRIWINLQDKIQDQVEISY
TDLINQLQLQKQEQASIQSCLVAILHLCNENNLQLYNNTQDNFLIKRNTIQEQQLQEMSQ
D>TTHERM_00728870(gene)
ATGAATAAAAGTCACAAAGGTGGTAGATTACTTAAGAAAAAAATATTATAAGAAGTATAG
GAAAAAGATGATTATTATGACGACGAAGATTTATTAACTAATGAAGAATTAAAAATGATG
TAAGCAAATGCAAAAAATGCTAAGAATAAGATCTAAATTAGAGTTAAATCAGATAGTTTA
TTAAATGAATATTCGTACAAATAAAAAATGTTAGGAAAAACGAATAACTCCTTCTACTAA
AATAGAAATGGCATTAATACAAAAAAAATGAACAATTAAACTACTTATAAATCTGATAAA
TTAATTTTGGATGAAGAAGAAGATGAAGAAGAAGAAAATGTATTAAGAGAATTAAACGTT
ATTGATGTTAAAGATATTTTAGAAGATGCACGTAGAAAATCAGAAGGTAATAATAACTAG
TAAAAAAAGAACTAAGATGCTCTATGCTTAATATTAGCTCAAATGCTTCTTAAAAATGTA
TTTTTTTATTTATCAATTCATTCAGCCTTTATTTTTTATATATGGTAATTTAAAAAAAAA
AATTAATAGAAAATAAACAAAGAAAATGCCTTCGAAATACCTCTTCCAGATGTTAAGAAT
ATGTCTGATTTTGCAAGTATTTTTTGAAATTATTTTATTTGATTATGTTAAATTAACTCC
TTTAAAAATACTTATAATGAATTTAAAAGAGGTAAGCGAAGCTTCTTGGTAGAAATTATC
TAGCTCTATCGATTCTGGTTCGAAGATATATGGATATAGAGTAGATAGCTTGCACTAAGA
ATCATTTAAGATGCTTAGTGGTTTGATTAGATCTGAGTTTATTAACAAAGATGAAGATCA
TCATGGCAAATAAGAGCAAGACAGTGAAGACCTTATTAATAAAGAAAGGGAAAAGATATT
TAAGAAAAATAAAAAGATAAATGAATCTACCATTGAAAAAAATTTATCTAACATTACATT
GAATAAGTATGATATATAGTTTGAAGTAGATCCTTTATTCTGCAAAACTAGTGAAAAATT
TGATGATAGCAGCTCTAAAGGAATTCTTTTAAATAATATAAAGGTAATTTTATTCAGAAT
TCTTTAATACAAATTTTTAAAAATTATTTAGATAGACTCTAATTTAAAATTATTAATTGA
TTCAGAAAATTTTGTACACAATCTACCTTAGGATTCAAGTGCAAGATAATCTTTAGATAA
AGATTAGCAAAATACTCCTATGAAGAAAGTAATTAAATCTCTCTTTTAACTTGAAGTGAA
ATATTTATTTTTTTTTATTAATTTTATAGAAATCCGACAAAAAAAAAGTTAAAGGACTAT
ATAAAAATGAGAAATTATCTCTCTAGAGTAAGTTAAACCAGAACGAATACAATTTAATTG
CTTATTTTTACAAGATATTTAGATAAGAAGTGATTTATACGAGCTAGAGCTCTGTAGTGG
TTTAGAAAATTTTGTAGGCAATATGCTAAACTTGGAAGATTCTAACAAGAAATTTAATAG
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TAAAAAATTAGTTGATGAACTAGTTATGAATTAAAATGAACAAGAATTAATTAATGATAT
TCAAATGATTTTAACTCAAACAGCTAAGAAAGGAAAAACTGCCATGAAAATGAGTTAAAA
GAGCATATTAAACGAATCTCAAGACAGTGCATTTCATTAAGAAAACCAAATTATCTCAAC
AAATATGAGTCCTTTTTAAGATATATAATTTAACTCTTAAAATCAAAAAAGCGAATATTT
AAGTGAAAAATTAAGATAAAGTTAATTTCTTAATAGTACCAATAATTAAATGGAAGTTAT
TAATGAAGGGATACTCTGTAATGATAACCCATAAGATTATTATTAGTAATGTGATGATGA
TGTCCCTAATTATAGCTCAAATTAATATAAATTATTGACAGATGATTTACCCAGCAAAGA
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GGACAGATTATTTTCTTTATAAAATATGGCTATTAGAATGACTTAAATTGGAAGTGGATT
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TAATTTTGATATTTATTATAGAAAAGATAAAACTTAATGGATGAATCCTATTGACTGGAA
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GATACAGAAATCACACATTTACAATTATTGAGCATAGACTACCATTACAAACCATAATGG
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TTATTTTGACTTGAAAGAAATTGAAGAATAAGAAAGACTTGCTTAATAAAGATTGTAAGA
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TGATGAATATACATTATTAGGAGCAACTCCGTTTAGAAATACCTAAATGGAGGTTATGAA
TGACAATTACGATTGCACTAATACTTAAGCTAATAATAATTTATCTCAATAAAATGTAAA
TACATAGATTACAAGTTAATATGAGCACACTCAAAGTTATCCAGAAAGCAAAAATCAATA
AAGAAAAAGTAAGAAATTTTTTAAGATAAAAGCTTTTTTATATTTCCTTAAAAAAAATAA
ATAGAATAAAATGTTAGAAAAATGAAAATATAAGAACTTAAATAGAGAATTTGGATAAAT
TTATAGGACAAGATTTAAGACCAAGTTGAGGTAATCCAAACTTTTAATTTAAAATTTAGT
TTCTTATTTTAATAAATTAAAGATATCTTATACTGACTTGATTAATCAGCTTTAACTTCA
AAAGTAAGAATAGGCCTCTATCTAAAGTTGTCTTGTTGCTATACTACACTTGTGCAATGA
AAATAATCTGCAATTATATAATAATACCTAAGATAATTTTCTCATCAAAAGAAATACTAT
CTAAGAATAACAATTGCAAGAAATGTCTTAAGATTGA