Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00392760Standard Name
CPD2 (CAP-D2 homolog)Aliases
PreTt23504 | 42.m00238 | 3813.m01460 | CPDT2Description
non-SMC mitotic condensation complex subunit 1 amine-terminal protein; Condensin subunit; homolog of CAP-D2 or S. cerevisiae YCS4Genome Browser (Macronucleus)
![]()
Genome Browser (Micronucleus)
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Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
No Data fetched for Domains
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.5%
TetraMine Data
TTHERM_00392760
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_11482.1 9.997093137033517e-262 hypothetical protein (1495 aa)
Oxytricha Contig17170.0.g39 6.996594825025754e-146 non-SMC mitotic condensation c
omplex subunit 1
SGD YLR272C 9.001992589090134e-64 YCS4 Subunit of the condensin
complex; required for establis
hment and maintenance of chrom
osome condensation, chromosome
segregation, chromatin bindin
g of condensin, tRNA gene clus
tering at the nucleolus, and s
ilencing at the mating type lo
cus
DictyBase DDB_G0293984 5.000412888119721e-59 ncapD2 on chromosome: 6 positi
on 3563765 to 3568484
Stentor Coeruleus SteCoe_9969 7.095474162284704e-23 WormBase WBGene00001087 0.000000000003998907168546896 locus:dpy-28 Condensin compl
ex subunit 1 status:Confirme
d UniProt:Q9U2M1 protein_i
d:CAA16340.3
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
- Ref:29237819: Howard-Till R, Loidl J (2018) Condensins promote chromosome individualization and segregation during mitosis, meiosis, and amitosis in Tetrahymena thermophila. Molecular biology of the cell 29(4):466-478
Sequences
>TTHERM_00392760(coding)
ATGGTTGATTATTTCGTATTTCCTTATACTTACGAAGACATCTTGAAGTCTGCAGACGAG
AGATATTGCGTCAATGCGGAAGAATAGAGGAGAATAAAAAATATGGAAGATAAGAGAATG
AATAGAACCCTGAAAGAATTAGAATCTGCCTTTGTCGAGGACTATACTGAAATAAAGTAG
CACGAAAGATTCGATATACTCTACTTTCTGATCGATAATTTCGGCTCAAAAAATAGTGAA
TCTCCAAATTTAATCAAGTTTAGTCTATCCACAATTGAATAAACAGGAGAATTGCTTCTT
ACATATTTAAATTCGCATTTGAGAAGAGTAAAAGAGGATTGCTAGAATCAGAATATTGCT
CCTGAAGTACTTGCAGATGATAGACATTCTTTGAAAATGATTATATTTTTGACTACCTTC
TTCCTTAGAAACACATGCATAAGACGTATATCAACAATGAAGGAAGATAACAATGACGAA
GCTCATCAAAATAAGAAAGGCAAAAAGAATACAGGTGGAGAAGAAAATTATGATAATCTA
ATTGAAAAGCAAAGAATTTGCATAGATTTGCTATAGAAGACTCTTTAATTAGATCTCAAA
ACTCTTTACCAAAAGAAATCTATTGATGAGGAATTTTATAAATATTATTTGGCTACTGCT
TTAAGATTACTCGAAAGTAAGCCTTTCATTAGGGCAGAAAAGGCTCGTACCAATATATTT
GCTATTATTAGAACTGTCATGAGAGTATTTTCTGAGTATAACAAATAAGAATTGAAGCAA
GTTTAACTTAATTTCATTAATCTTATCTATGAAGACGAAAATTTAGTTCAGCCTATTGCA
GATTTTATAATTGATCTTTATAATGATAAAAATTTAATCTTTTCAAAGGAATTTACTTTC
GATTTGCTACAAATATTGGTCACTTTCTTGCAAGAAAAAACAAGCCCTTCTTCTGAAAAT
ACAGTATTTAAAAATGCTAGAGATTTCTTCTCTATTTTAAGTAACCACTTGCCTAAAATT
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AATACTGTCTGTGAAATTTTGGGAAATATTTTAAAAAATGTGCTTACTGCTTAAAACGAA
GAAGATGAGGAATTCATTTTAAATGAAGAATCAAAGATAAAGTAAAAAGAAAAACTTTTG
GATCGTTTAATTGACAGAGTTTATGATAAGCATGCTTACAGTCGTGCATAAGTCTTAACA
ATATTAGCCGATTTATGCGAGAACAATGCTATCCCACCTCAATTTTTACCATAAATATTA
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TTTATCACAAAAGAATAAGTCATTAAAGAAATCAAAAAGCTTGATATGTAAAATTTATCA
TGTGCAGAATAGCTTGAAAAGATTGAAGAAAGACTCAGAGAAATCACTCAATCTGAAGAC
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ATAAAAGCTTAGATGGCTTAAATTGCTTAATTATAAAGCAGATATTAGGAATATTAAGAT
TTTTTGCATGCACTTGATATTCTTATCCCTATTTTAATTTAGCTTCTTGGTTCCAAGAGT
GTCTATGATGTTTTAGAAACTATTAGACTTTTGATGTACTTAAAGAAGTATAACATCACA
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AGCTTTGAAGAATTGCTCTTAAGCATGATGGACACACATAAGATATCTTAAGAAGAACTT
AAAAGCTAGAATCTTAAGGCCTATCCTATTCAAGATTAGGTTTTTGCTGAAGTTTGGGAA
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ATTCAAATTCTTCGTATTATCAGTAGCAGATAAAAGAGCAATTGGAGCATGAAACTTGAA
AGCTTTAAGAACATCCTCAATTACTATAAGAAATTCGTCAATAAAGTTGACTGGGTTATT
GTCAAAGAAATTGCTTGCATTTCAGAATAGGTAAAATCAGAAGATAACAAGGCTATTATT
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GAGTGGTTCTTGTCATGTGAACAGATCATCAGATTGACATTTTTAACATTTACAAACCCA
GAAACTATCATAAAATATTTAATTAAAAAAATGAGCCAATTTTTGTTTGAAAAGAAAATT
GCTAATGAAGGTGGTGCTGTTGATGAAGAAGAAGATGAACCTAATTAGAATAAAGATGAC
TTAGAAATGCAGCTTGAGAAAGATAACAAAAAGGATGATGGAGTTTAAAAGCCTCTTACA
AGCAAAGCCTATGAGCATAAGCTAGCTCAAGTCTTGTACGTTGCAGGTAATAGTGCATTA
AAATTCTTGATGCATTGTGATAGAATCGAAGAATATTTGAATAAACGTAGAATAGAAGCT
GAAAACAACAAATAGAAGGAAATGTAAAATGATGCTAATGACAATGAAGATAAAGACATA
GATAAGATCAATGGAGGTTTCGAGGCTGAATTTGAAGAACATCAAAGAACTTTGCATAGT
ATTTAGGATAAACTCATCATCGAGTCTCCAATTTATAGCTACTTCTGTAGTATCGCAACA
AAAATATGTTGGAATATGTTCAATTCACTAAGTTTAGCTCAAAGAAGCGAAGCAGATAAT
ATCAATAATAAATTAAGAAGAAATGTTATTTTGGACAGAGTTGCAATGCTATGTTTAATT
AAATTTATGTGTGTTTCCTCTTAAGTATGTAAGAAAAATCTTGATTTAATTTTCAATATG
TTGGAATCTTAAGCTGATGCAATCGTTAAAACAAATATCTTAATTGGTATTGGTGACCTC
TATCATAGATATCCTATCATACTTGAAAGATACTTACACTTTGTCTACAAGTCACTTTCT
GACAAAGATGTTAGAGTTAGAAAGACCTGCTTGATGGTTATAACTCACTTAGTGCTTAAC
GATATGCTTAAGGTCAAAGCTGAAATCTCCTCTATTGCAATTCTAATTGAAGACTCTGAT
TAGAGAATTCAAAATATGGTTAAGTTATTCTTCCATGAGTTGAATAAGAAAGATCCCAAG
GCTATTTACAATTTGTTGCCTGAATTGATTGGCAGATTATCTACTGAGAATATTAATGAG
TCTATCTTTAATAACTTTTGTGAAAATGTGTTACCACATATCGATAAGGATAAATAAGCA
GAGTCTCTTGTTGATAAACTTTGCTAACGTTTCACTTTAGTTAACACTGAAAAGGAATGG
ATTAATATCTCTCATGCTCTTAAAATGTTCTCGTACAATGAAAAGAGCTTAAAGAAACTA
TTGGAACACTTTGAATCTAAATATAGAGAGAAATTGAATATTCCCATTATTTTAGAAAAC
TTCAAGGCAATAATCTTAAAAACCAAAAAAATGCCTCGTTAATCATAGGAGTAAAAGCAA
TTAATTGATGAACTTGACAGCAAAATATCTAATTTCAAAAAAGAGACTTTTGATGATAAA
AAATACAAGAAAGAGAAGCCTAAACCCAAACAAGCAGCTGGAACTAAAGGAAACTAAGCT
AACAAAGGAGCTGTAGGAAATGCCTAAAAGAAAGGAAAATAAAATGTTTAAGTACCCAAT
CCATAATAATCAAAGAAAGGTTAATAGTAAATGATGGAAATTGAGTCTGATGAAGAAGAA
GAAGCTGTATTTTAACCTAATAGAAGATCTCAACAATAACAACAGCAACAGCTTCGTGGA
GGACCTGGTAAAATTTTAAAATCTAATTTGGAAGAAGTGAAAAATGTTAAGAATGCTTTA
TTAGCAGCCAACCATCCAAATAACTAAAGGAACACCAAATAAAGGGCTGAACCTGAAGAA
ATTGATATTGAAGATGATGATTTTGATGAAGAGGAGGAAGAAGAGTTTGTTGGACATAAC
AGAGGTTAATCTAGCAGAGCTTAATAAAGTAATTAAAGAGCATCATCAAGAAATGTACAG
AGAAAATCGTTGAAAGAAGATTCAGATGATGATGACTTTGATGAGGAGTTTTGA>TTHERM_00392760(protein)
MVDYFVFPYTYEDILKSADERYCVNAEEQRRIKNMEDKRMNRTLKELESAFVEDYTEIKQ
HERFDILYFLIDNFGSKNSESPNLIKFSLSTIEQTGELLLTYLNSHLRRVKEDCQNQNIA
PEVLADDRHSLKMIIFLTTFFLRNTCIRRISTMKEDNNDEAHQNKKGKKNTGGEENYDNL
IEKQRICIDLLQKTLQLDLKTLYQKKSIDEEFYKYYLATALRLLESKPFIRAEKARTNIF
AIIRTVMRVFSEYNKQELKQVQLNFINLIYEDENLVQPIADFIIDLYNDKNLIFSKEFTF
DLLQILVTFLQEKTSPSSENTVFKNARDFFSILSNHLPKIFINNLSCFLTLFDSESYLMR
NTVCEILGNILKNVLTAQNEEDEEFILNEESKIKQKEKLLDRLIDRVYDKHAYSRAQVLT
ILADLCENNAIPPQFLPQILKAAISRTRDVGAIVRRKALQLISRVVNYYVYIYQTNKDGK
FITKEQVIKEIKKLDMQNLSCAEQLEKIEERLREITQSEDPAELLLQQDEIESLTTRQKS
IKAQMAQIAQLQSRYQEYQDFLHALDILIPILIQLLGSKSVYDVLETIRLLMYLKKYNIT
TSELGIKKMIVLIWSKEKAVKEEVMQTYWSIYMNNKEQKPQRIAKNLINLMIDTNITEAS
SFEELLLSMMDTHKISQEELKSQNLKAYPIQDQVFAEVWEIFTKNFRRLCEADPNRERTE
QESLEYEKELILQKKEMRSAIQILRIISSRQKSNWSMKLESFKNILNYYKKFVNKVDWVI
VKEIACISEQVKSEDNKAIIESIAQILTVLLIRGHGTEDSEWFLSCEQIIRLTFLTFTNP
ETIIKYLIKKMSQFLFEKKIANEGGAVDEEEDEPNQNKDDLEMQLEKDNKKDDGVQKPLT
SKAYEHKLAQVLYVAGNSALKFLMHCDRIEEYLNKRRIEAENNKQKEMQNDANDNEDKDI
DKINGGFEAEFEEHQRTLHSIQDKLIIESPIYSYFCSIATKICWNMFNSLSLAQRSEADN
INNKLRRNVILDRVAMLCLIKFMCVSSQVCKKNLDLIFNMLESQADAIVKTNILIGIGDL
YHRYPIILERYLHFVYKSLSDKDVRVRKTCLMVITHLVLNDMLKVKAEISSIAILIEDSD
QRIQNMVKLFFHELNKKDPKAIYNLLPELIGRLSTENINESIFNNFCENVLPHIDKDKQA
ESLVDKLCQRFTLVNTEKEWINISHALKMFSYNEKSLKKLLEHFESKYREKLNIPIILEN
FKAIILKTKKMPRQSQEQKQLIDELDSKISNFKKETFDDKKYKKEKPKPKQAAGTKGNQA
NKGAVGNAQKKGKQNVQVPNPQQSKKGQQQMMEIESDEEEEAVFQPNRRSQQQQQQQLRG
GPGKILKSNLEEVKNVKNALLAANHPNNQRNTKQRAEPEEIDIEDDDFDEEEEEEFVGHN
RGQSSRAQQSNQRASSRNVQRKSLKEDSDDDDFDEEF>TTHERM_00392760(gene)
ATGGTTGATTATTTCGTATTTCCTTATACTTACGAAGACATCTTGAAGTCTGCAGACGAG
AGATATTGCGTCAATGCGGAAGAATAGAGGAGAATAAAAAATATGGAAGATAAGAGAATG
AATAGAACCCTGAAAGAATTAGAATCTGCCTTTGTCGAGGACTATACTGAAATAAAGTAG
CACGAAAGGTAAATTAATAATTGTTATCAAACAAACATCAGCAGTCATTTGCAAATATAA
ATTGAATAAAAATGAAAATTATTTTTAAGGATTAGCAAATATTAACCCTTATTAACGTAT
TTAAATTAGATTCGATATACTCTACTTTCTGATCGATAATTTCGGCTCAAAAAATAGTGA
ATCTCCAAATTTAATCAAGTTTAGTCTATCCACAATTGAATAAACAGGAGAATTGCTTCT
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AGCTCATCAAAATAAGAAAGGTAAGCTTTAAAATGAATGAATCAATTAACTATCAAACAA
AATGGAAATATGGAATTTAAAATAAACTAATAATTAAATAAATCAAAATATTCTATTCAA
ATAAAAATTAATAAATCCCTCTAAATTGATGAAATTTGAAAATTTTATTTGAAATAACAT
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TTTGCATAGATTTGCTATAGAAGACTCTTTAATTAGATCTCAAAACTCTTTACCAAAAGA
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GTAAGCCTTTCATTAGGGCAGAAAAGGCTCGTACCAATATATTTGCTATTATTAGAACTG
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TTAATCTTATCTATGAAGACGAAAATTTAGTTCAGCCTATTGCAGATTTTATAATTGATC
TTTATAATGATAAAAATTTAATCTTTTCAAAGGAATTTACTTTCGATTTGCTACAAATAT
TGGTCACTTTCTTGCAAGAAAAAACAAGCCCTTCTTCTGAAAATACAGTAAATTTTTTAT
TTGAAAACGAAATAAGTGATTATTCATTCATTCTATAATAAAAATAATAAGGTATTTAAA
AATGCTAGAGATTTCTTCTCTATTTTAAGTAACCACTTGCCTAAAATTTTCATTAACAAT
TTATCATGCTTCTTGACATTATTTGATTCTGAATCCTATTTAATGCGTAATACTGTCTGT
GAAATTTTGGGAAATATTTTAAAAAATGTGCTTACTGCTTAAAACGAAGAAGATGAGGAA
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TTATGCGAGAACAATGCTATCCCACCTCAATTTTTACCATAAATATTAAAAGCTGCTATT
AGCAGAACTAGAGATGTTGGTAAGTAAATTAAAATAAATTATAAATAAATAATATTTAAT
AAATATAAAGGTGCTATTGTCAGAAGAAAAGCTCTCTAATTGATTAGCAGAGTAGTTAAT
TATTATGTTTATATCTACCAAACCAACAAAGATGGAAAGTTTATCACAAAAGAATAAGTC
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GAAAATAAAAGAAATCAATATTAAAACATAGAAATTTAATAAATCAATGGATATAAATTT
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TGCTGAATTGCTTTTACAACAGGATGAAATTGAAAGCTTAACAACCAGACAAAAAAGTAT
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CTATGATGTTTTAGAAACTATTAGACTTTTGATGTACTTAAAGAAGTATAACATCACAAC
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AGAAGAAGTTATGCAAACATATTGGTCTATATACATGAATAATAAAGTAAAAATTATTAT
TAAAATCTGTAAAATTTTATCAATTTATAAATTATTTTAGGAACAAAAGCCTTAGAGAAT
CGCTAAAAATTTGATCAATTTGATGATAGATACTAACATAACTGAAGCTTCTAGCTTTGA
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GAATCTTAAGGCCTATCCTATTCAAGATTAGGTTTTTGCTGAAGTTTGGGAAATATTCAC
TAAAAATTTTAGACGTTTATGTGAAGCTGATCCTAACCGTGAAAGAACTGAGCAAGAAAG
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GAGTAATTTAGAAATTTGATTTAATTATTTTAAATTAATATTAAATTTAACAAAAGACAT
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TGCTGTTGATGAAGAAGAAGATGAACCTAATTAGAATAAAGATGACTTAGAAATGCAGCT
TGAGAAAGATAACAAAAAGGATGATGGAGTTTAAAAGCCTCTTACAAGCAAAGCCTATGA
GCATAAGCTAGCTCAAGTCTTGTACGTTGCAGGTAATAGTGCATTAAAATTCTTGATGCA
TTGTGATAGAATCGAAGAATATTTGAATAAACGTAGAATAGAAGCTGAAAACAACAAATA
GAAGGAAATGTAAAATGATGCTAATGACAATGAAGATAAAGACATAGGTAATTTGTTTAT
ATTTTTAAAGAGCTTTTGATTAAAATTGGTCATTTATTTTCTATTTAAAGATAAGATCAA
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ACTCATCATCGAGTCTCCAATTTATAGCTACTTCTGTAGTATCGCAACAAAAATATGTTG
GAATATGTTCAATTCACTAAGTTTAGCTCAAAGAAGCGAAGCAGATAATATCAATAATAA
ATTAAGAAGAAATGTTATTTTGGACAGAGTTGCAATGCTATGTTTAATTAAATTTATGTG
TGTTTCCTCTTAAGTATGTAAGAAAAATCTTGATTTAATTTTCAATATGTTGGAATCTTA
AGCTGATGCAATCGTTAAAACAAATATCTTAATTGGTATTGGTGACCTCTATCATAGATA
TCCTATCATACTTGAAAGATACTTACACTTTGTCTACAAGTCACTTTCTGACAAAGATGT
TAGAGTTAGAAAGACCTGCTTGATGGTTATAACTCACTTAGTGCTTAACGATATGCTTAA
GGTCAAAGCTGAAATCTCCTCTATTGCAATTCTAATTGAAGACTCTGATTAGAGGTATAT
CTAATATTTTATTTCCATTTAATTTATTTATTTACAATTAAAAATAATTTACCAAGAATT
CAAAATATGGTTAAGTTATTCTTCCATGAGTTGAATAAGAAAGATCCCAAGGCTATTTAC
AATTTGTTGCCTGAATTGATTGGCAGATTATCTACTGAGAATATTAATGAGTCTATCTTT
AATAACTTTTGTGAAAATGTGTTACCACATATCGATAAGGATAAATAAGCAGAGTCTCTT
GTTGATAAACTTTGCTAACGTTTCACTTTAGTTAACACTGAAAAGGAATGGATTAATATC
TCTCATGCTCTTAAAATGTTCTCGTACAATGAAAAGAGCTTAAAGAAACTATTGGAACAC
TTTGAATCTAAATATAGAGAGAAATTGAATATTCCCATTATTTTAGAAAACTTCAAGGCA
ATAATCTTAAAAACCAAAAAAATGCCTCGTTAATCATAGGAGTAAAAGCAATTAATTGAT
GAACTTGACAGCAAAATATCTAATTTCAAAAAAGAGACTTTTGATGATAAAAAATACAAG
AAAGAGAAGCCTAAACCCAAACAAGCAGCTGGAACTAAAGGAAACTAAGCTAACAAAGGA
GCTGTAGGAAATGCCTAAAAGAAAGGAAAATAAAATGTTTAAGTACCCAATCCATAATAA
TCAAAGAAAGGTTAATAGTAAATGATGGAAATTGAGTCTGATGAAGAAGAAGAAGCTGTA
TTTTAACCTAATAGAAGATCTCAACAATAACAACAGCAACAGCTTCGTGGAGGACCTGGT
AAAATTTTAAAATCTAATTTGGAAGAAGTGAAAAATGTTAAGAATGCTTTATTAGCAGCC
AACCATCCAAATAACTAAAGGAACACCAAATAAAGGGCTGAACCTGAAGAAATTGATATT
GAAGATGATGATTTTGATGAAGAGGAGGAAGAAGAGTTTGTTGGACATAACAGAGGTTAA
TCTAGCAGAGCTTAATAAAGTAATTAAAGAGCATCATCAAGAAATGTACAGAGAAAATCG
TTGAAAGAAGATTCAGATGATGATGACTTTGATGAGGAGTTTTGA