Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00488350Standard Name
COP1 (COat Protein (COP) complex subunit 1)Aliases
PreTt08338 | 60.m00135Description
COP1 coatomer subunit betaGenome Browser (Macronucleus)
![]()
Genome Browser (Micronucleus)
![]()
Gene Ontology Annotations
Cellular Component
- COPI vesicle coat (IEA) | GO:0030126
- membrane coat (IEA) | GO:0030117
Molecular Function
- protein binding (IEA) | GO:0005515
- structural molecule activity (IEA) | GO:0005198
Biological Process
- vesicle-mediated transport (IEA) | GO:0016192
- intracellular protein transport (IEA) | GO:0006886
Domains
- ( PF03789 ) ELK domain
- ( PF02985 ) HEAT repeat
- ( PF01602 ) Adaptin N terminal region
- ( PF07718 ) Coatamer beta C-terminal region
- ( TIGR00741 ) ribosomal subunit interface protein
- ( PF08385 ) Dynein heavy chain, N-terminal region
- ( PF08752 ) Coatomer gamma subunit appendage domain
- ( TIGR01716 ) transcriptional activator, Rgg/GadR/MutR family, C-terminal
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.9%
TetraMine Data
TTHERM_00488350
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_13523.1 9.997093137033517e-262 adaptin N-terminal region fami
ly protein (954 aa)
Oxytricha Contig21140.0.g103 4.999394169176705e-180 Adaptin N terminal region
DictyBase DDB_G0284735 1.9992336839414155e-150 copB on chromosome: 4 position
2394561 to 2397811
WormBase WBGene00021292 9.996472444528484e-132 locus:copb-1 Coatomer subuni
t beta status:Confirmed Un
iProt:Q9TYL9 protein_id:CCD6
1981.1
SGD YDR238C 9.998919090800975e-129 SEC26 Essential beta-coat prot
ein of the COPI coatomer, invo
lved in ER-to-Golgi protein tr
afficking and maintenance of n
ormal ER morphology; shares 43
% sequence identity with mamma
lian beta-coat protein (beta-C
OP)
Stentor Coeruleus SteCoe_21807 8.074506789675094e-73
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00488350(coding)
ATGGCATCAGCAAATATATAATAAGCTAGCGAGCACAAAGAACGTTATTGTAGCATTTAT
ATTAGAGCTGAATAAGAGCAGCTCACTCCTTAAGAAATTAAGACTCTTCTTATGGGAAAA
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AAGCTTAAAGACGAAATGATTTTAGTTTGCAACAGTTTGAGATCAGACTTGTTGCATCCA
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TAAATATCTAATACACCTACAACTTTGAAGTTAGCCACTAATATATATGTTTAACTATTG
TTAAATAACTCAGAAAACAATGTTAAAATGGTAGTTCTTGATAAAATTTAATATATTCTC
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TAATTCAAAGAATAATTTAAATTATATATGCTTAACGACGAAGAGGAAATCAAAAATGCT
ACAGTAATTTGTGTCAATTTCTATGCTAAGACCAAGCTAGGTGATGATTTCCTCATAAAC
ATCAGCGCAGAGTCTCAAAATGGTTCTGTTACAGGAACAATTAGAATCAGAAGTAAAGTT
AAAGGTGTAGTTGTAAGCATAGGATAAAAATATAGGTAATGA>TTHERM_00488350(protein)
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FDKLTMTIITYLVPYQAENHDLKKILLYYWEIIEKVNKDGKLKDEMILVCNSLRSDLLHP
NEYLRGRTLRLVSRIMYKGILEPLISSIMESLNHKHTYVRRNAIIAIYQIFLNFGDDLIN
DIDTEMEKVLQNETDLSTKRNAFLLLYHTNLEKAMAYLYQIIQDDRVDEMGDIMQLSVLE
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ARKQSVDASEQQDSQFRIILSQYSYIGSIAARTLLKLVFKIKLDAKKYNKYTSQILLVFC
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KRTDLEQQREEKKDSHIAKQPDDLIVIRALKGKQAEIGDLDLQDEEINQIEFKGVGEDND
FASKLNKLVQLTGYSDPIYAESFVYIHKYDIQFETLLINRTTKPLQKVQIEFFTQENDQK
RVIEKAQAVTLQPNQSAYVKTSLKFTSIDIGVIFGAINYENIAGIEQAYLITKEIDIDLI
DFVYPAEIDFNSYREMWAKYEWENRIVINPQKIEMLQFFLQFKEQFKLYMLNDEEEIKNA
TVICVNFYAKTKLGDDFLINISAESQNGSVTGTIRIRSKVKGVVVSIGQKYRQ>TTHERM_00488350(gene)
ATGGCATCAGCAAATATATAATAAGCTAGCGAGCACAAAGAACGTTATTGTAGCATTTAT
ATTAGAGCTGAATAAGAGCAGCTCACTCCTTAAGAAATTAAGACTCTTCTTATGGGAAAA
TATGAAGAAAAGATTAAAGGTCTTAAGTCCCTCATTTATGCAATTATTCAGGATGAGAAT
TTTGATAAATTGACCATGACTATTATAACTTACTTGGTTCCTTATCAAGCTGAAAACCAT
GACCTCAAGAAGATTTTGTTGTACTACTGGGAAGTAAATAAATAAATAGATCAATAAATT
ATGAGCAATATTTATCATGAAAGCAAGCAAATATTCAAAAGCTGAATAAAAACCAGATAA
ATTAATTTATTTTAATTGATTTTGCAGTAAATAAATATAAATGAAATCATTTAGAAATAT
CTATGAATATGTTTTTGAGCTTGAAATGATGAATATTAAATAAGAAGAAGCATATTAATT
TTATTATAAAATGAATATAAAAATAGATCATTGAGAAGGTCAATAAAGATGGTAAGCTTA
AAGACGAAATGATTTTAGTTTGCAACAGTTTGAGATCAGACTTGTTGCATCCAAACGAGT
ATTTAAGAGGAAGAACTCTTCGTTTGGTTTCAAGAATTATGTATAAGGGTATTTTAGAGC
CTTTAATTTCAAGTATTATGGAAAGCTTAAATCACAAGCACACTTATGTTAGAAGAAATG
CTATTATCGCTATTTACTAAATATTTTTAAATTTCGGTGATGATCTGATTAATGATATCG
ATACTGAAATGGAAAAGGTCCTCTAAAACGAAACTGATTTGTCAACCAAAAGAAACGCTT
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ATTTGGAATTGGAATGTATTTAGTTAAATAGCCAACAAATTGACTGATCATTCATTCTTT
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TGTCAAATTTTAGGTTTTTAGATCTCATTATTTAATTAATAGTTCAATAGTTGGTTTAAA
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TTAATTTGAATAGAAAAACTTGCAAATATGATCCTAGCTAGAAATCTAAGCTTATGAAAT
GCATTTTATTCTTCTAAAAATCCCGTAGTCCTTCTGTTTAGTTTGAGTGTGCTAATACTT
TAATATAAATATCTAATACACCTACAACTTTGAAGTTAGCCACTAATATATATGTTTAAC
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ACAATCCTTCTAACTAAATTCGTAAAAATGCCATTGATATTATTTCAAGCTTAACTAACT
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TACATATACAATGGTGTTCTCTGGATTCTTGGTGAATACTCCTCAGGAGAATAAGTCACC
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ATTTATATTAATTAAAACTAAAATTTATTTTAATGTCTAAAAAAGCGAGATGTTATAATT
CTTCCTCTAATTCAAAGAATAATTTAAATTATATATGCTTAACGACGAAGAGGAAATCAA
AAATGCTACAGTAATTTGTGTCAATTTCTATGCTAAGACCAAGCTAGGTAAAAAAATGAT
AAAGAAATAACTTTAAACTAAATTTAAATTATATAATATTAGGTGATGATTTCCTCATAA
ACATCAGCGCAGAGTCTCAAAATGGTTCTGTTACAGGAACAATTAGAATCAGAAGTAAAG
TTAAAGTAATTTTAATAATTTATCTAAATGAAGGTCGTTAACAATATATAATATAAAAAA
AGGGTGTAGTTGTAAGCATAGGATAAAAATATAGGTAATGA