Gene Model Identifier
TTHERM_00526270
Standard Name
COI3
Aliases
PreTt06365 | 66.m00164 | 3722.m00022 | ATG4.1
Description
TTHERM_00526270 consists of two genes: COI3 and a gene encoding peptidase family C54 containing protein.
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Biological Process
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Signal Peptide Present?: No
TTHERM_00526270
Fullscreen View
No Data fetched for StockID
(v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_13377.1 9.997093137033517e-262 peptidase family C54 containin
Oxytricha Contig22038.0.g106 9.000751454575209e-33 Peptidase family C54
WormBase WBGene00013595 5.0000961330688895e-23 locus:atg-4.1 status:Confirm
DictyBase DDB_G0283753 0.0000000000000030004923591262316 DDB_G0283753 on chromosome: 4
Stentor Coeruleus SteCoe_35096 0.000000000000012664165549094176
SGD YNL223W 0.0000000006000548789370351 ATG4 Conserved cysteine protea
Paragraph No Gene Name Paragraph Text 111 JUB1 ,JUB2 ,JUB3 ,JUB4 ,HPL2 ,COI3 ,COI6 ,COI16 ,JUB6 This protein co-localizes with Pdd1p in heterochromatin body in the new macronucleus.
Ref:26688337 : Kataoka K, Mochizuki K (2015) Phosphorylation of an HP1-like Protein Regulates Heterochromatin Body Assembly for DNA Elimination. Developmental cell 35(6):775-88Ref:25588944 : Woehrer SL, Aronica L, Suhren JH, Busch CJ, Noto T, Mochizuki K (2015) A Tetrahymena Hsp90 co-chaperone promotes siRNA loading by ATP-dependent and ATP-independent mechanisms. The EMBO journal 34(4):559-77Ref:22366125 : Liu ML, Yao MC (2012) Role of ATG8 and autophagy in programmed nuclear degradation in Tetrahymena thermophila. Eukaryotic cell 11(4):494-506
>TTHERM_00526270(coding)ATG GTC TTA ATT GCA GTA TCT TAT TTG CTT TGC AGA AGT ACT CAA ATT TAT AGA TAG TTA TTA GAA TTT AGA GAT ATA TAT ATA CTT TGT AAA ACT TGG ATT ATT TAT AAA ATC TAA TTT AAT AAA TCT ACT AAT TCA GTC GCA TTA GCA AAT ATT TTA GAG ATG TCT TAG TCT AAA GAA ATT GAT TAT TTC AAA TCC ATA AAG CTA TCA ATG TCC AAA GCT TTT TCT GAA GAT GGA AGA CGT GTT TCT ACT AAT AAT ATT ACT GAA GGT ATT ATG AGC TAC GGG ATG TAG CAG ATA TAC AGA TTT AAT AAA TGG GGA ACT TCA TGT AAA ACA ATA GAT CTT AAG GTT GAT ATC CCA TCT TTC ATA TTA GGA AAT GAT TTA ACA CCG CAA AGA GTA AAG TTA GTT TAG GAT AAA AGT AGA GTT TTA CAA GAT GAT GGC AAT TAG AAT AAA TAC AGA ATG CTT ATG TTG TCT AAT TCA AGT GAT ATT AGA GTA GAC ACA GAA CCA AAA TAA GAA GAA ATA ATA TCT AAA GAA ACA TAC TAA ACA TAA GAG ACT TCT GGA TAA GAC TAT GAT GAT GAA GAT TAT CAA GAA ACA GAA AAA TAA ATG AAA GAA AAA TCA AAA TAA ATA CTT TAA ATT TAC TAA AAC ACA ATC CTT TTT ACA TAT AGA AAA AAC TTC TAT CCT TTA CTA AAA GAC AAA ATA AAT GAC CCA CAA AAG AAT TAA ACT TCA GAT GCG GGA TGG GGC TGT ATG ATT CGA GCT GGA TAA ATG ATT TTT GCT TAG ACT ATA AAG AGA CAT TTA AAA AAA ACA GAC TAT ATA GAA TAG CAT TAG CTA ATA AAC ATT ATA ATA GGC TTT TTA GAA GAA GAG GAA GTA CAA GAA GGA GGA AAA GGA TAT ATT TTT AAT TAA TAA AGT TAT ATA TAA GAT AGA ATT CGT CCT TAT AGC ATA CAT CAA ATT ACT AAT AGA GCA TTT TGT AAA TAT AAA ATA CAA CCA GGG TAA TGG TAC ACT CCA AAT TAA ATC GCC ATC ATA TTA AAG GAG CTC CAT AAA AAA AAT AAA ATT AAA GGA ACT GAA AAT TTA AAA ATA GAT GTT CAT AGT AGT GAT AAA CCA ATT ATA TTT GAA AAA ATC TTG TAA ACA CTT TTG GGG CGT TAA GGC AAA ATT AAT TTA AAC TGC AAC CAT GAA AAT TAG TAA TCA AGA AAC TCA ATA AAT CAA GAT TAA GAT GAT TCG TTT GAA AAA ATC ATG CCT CCT AAC TAG CAA GAA ATA GAA GAG TTT TCA AGC TAG TAT GAA GAA AGC AAG GAA GAT TAG ACA GAT AAT TTA TGT TGT AAA GAC TGC TTT AAA ACA GAC AAC AAG CTG TTT CTC CTT CTA CCA TGC AGA CTA GGA TTA GAT GAA ATC AGC CCA ATT CAT ATA GAA ATC CTT AAA AAA TTA TTG TCT CTC AAA CAA TCT GTT GGA ATG ATA GGA GGT AAA CCA AAC AAA GCT CAC TAC TTT TTA GGA TTT GTA GGA GAT GAT TTA TTA TAT TTA GAT CCT CAT TAT ATC AAA GAA TGT GTT AGA AAA GAA GAT CTA ATG GAA AAT ATT TCT TCT TAT TTC GAA GAA GAT GTT TTT AAA ATG CCA ATA AAT AAA ATT AGT ACC TCA TTG GTG TTT GGA TTT TAT TTT AGT GGC GTT GAT GAG CTA AAT AAA TTC TAT AAA TTT TTA AGA TAA CTA GAA AAA GAA TAT AAA GAT GAT TTT TTC CTT GTA ATT GAA AAA TAA ACT CCT TCT TAT GCA ATG TCG AAT ATC TCT GAG ATA AAA AAG TTG ACT AAG TAA ATA AAG ATT ACT TAA AAA GAT AAT TAA AAT CTT TTG GAA TAA TAA TTT GAG AAT TAT GAT GGA TCA GTA GGT GAT GAC TTT GAT GAA GAT GAT GAT ACA AGC TAT GAT GAA TAA GAA TGC TAT GAA GAC AAA TTA GAT GAA TTC GAT TAA TAT AAT AAC TTA GAA GAA TCA GAC TAT TCT TAA AAG CTT AAA CAA TAA ACT AAT TTA AAA AAC TAC AGT GAC CCA TTT GGT ACT GAA AGC CAT TCC GAA AAC CAA TTA AAA TAT GGA AAA TTG GCT AAT CAT GAG CTA CCA ATA AGA AAC CAG ATC TAA AAA AAA TAA AGT GAA GAG GAA TTA AAA AAT CTT GTA AAT TTA ATT TAA TTA TAG TAA CAA AAT CAG CAG ATA AGT AAC TTA TTA TAA AAT CAG AAT TGT ATT TGA >TTHERM_00526270(protein)M V L I A V S Y L L C R S T Q I Y R Q L L E F R D I Y I L C K T W I I Y K I Q F N K S T N S V A L A N I L E M S Q S K E I D Y F K S I K L S M S K A F S E D G R R V S T N N I T E G I M S Y G M Q Q I Y R F N K W G T S C K T I D L K V D I P S F I L G N D L T P Q R V K L V Q D K S R V L Q D D G N Q N K Y R M L M L S N S S D I R V D T E P K Q E E I I S K E T Y Q T Q E T S G Q D Y D D E D Y Q E T E K Q M K E K S K Q I L Q I Y Q N T I L F T Y R K N F Y P L L K D K I N D P Q K N Q T S D A G W G C M I R A G Q M I F A Q T I K R H L K K T D Y I E Q H Q L I N I I I G F L E E E E V Q E G G K G Y I F N Q Q S Y I Q D R I R P Y S I H Q I T N R A F C K Y K I Q P G Q W Y T P N Q I A I I L K E L H K K N K I K G T E N L K I D V H S S D K P I I F E K I L Q T L L G R Q G K I N L N C N H E N Q Q S R N S I N Q D Q D D S F E K I M P P N Q Q E I E E F S S Q Y E E S K E D Q T D N L C C K D C F K T D N K L F L L L P C R L G L D E I S P I H I E I L K K L L S L K Q S V G M I G G K P N K A H Y F L G F V G D D L L Y L D P H Y I K E C V R K E D L M E N I S S Y F E E D V F K M P I N K I S T S L V F G F Y F S G V D E L N K F Y K F L R Q L E K E Y K D D F F L V I E K Q T P S Y A M S N I S E I K K L T K Q I K I T Q K D N Q N L L E Q Q F E N Y D G S V G D D F D E D D D T S Y D E Q E C Y E D K L D E F D Q Y N N L E E S D Y S Q K L K Q Q T N L K N Y S D P F G T E S H S E N Q L K Y G K L A N H E L P I R N Q I Q K K Q S E E E L K N L V N L I Q L Q Q Q N Q Q I S N L L Q N Q N C I >TTHERM_00526270(gene)ATG GTC TTA ATT GCA GTA TCT TAT TTG CTT TGC AGG TAA AGT AAA TTA ACA CAC TTT GTT TAT TTA TTT ATA AGT ATA AAT TAT TAG AAG TAC TCA AAT TTA TAG ATA GTT ATT AGA ATT TAG AGA TAT ATA TAT ACT TTG TAA AAC TTG GAT TAT TTA TAA AAT CTA ATT TAA TAA ATC TAC TAA TTC AGT CGC ATT AGC AAA TAT TTT AGA GAT GTC TTA GTC TAA AGA AAT TGA TTA TTT CAA ATC CAT AAA GCT ATC GTA AAA ATT TTG AAA TTT ATT TTT ACA CTA TTC AAT CTC CAA ATC ATT ATT CAA TTA AAA TCA TAT TTT TTT CTA TCT ATC TTT ATT TTT AGA ATG TCC AAA GCT TTT TCT GAA GAT GGA AGA CGT GTT TCT ACT AAT AAT ATT ACT GAA GGT ATT ATG AGC TAC GGG TAA TCC ATA AAT CAT TAT ATT AAA CAG CCA TAT TTT ATA TTT ATA TCA CTT AAT AGA AAA GCA TTA TAT GAA TTC AAT TTT TAA AAA CAT TTA TTA GGA TGT AGC AGA TAT ACA GAT TTA ATA AAT GGG GAA CTT CAT GTA AAA CAA TAG ATC TTA AGG TTG ATA TCC CAT CTT TCA TAT TAG GAA ATG ATT TAA CAC CGC AAA GAG TAA AGT TAG TTT AGG ATA AAA GTA GAG TTT TAC AAG ATG ATG GCA ATT AGA ATA AAT ACA GAA TGC TTA TGT TGT CTA ATT CAA GTG ATA TTA GAG TAG ACA CAG AAC CAA AAT AAG AAG AAA TAA TAT CTA AAG AAA CAT ACT AAA CAT AAG AGA CTT CTG GAT AAG ACT ATG ATG ATG AAG ATT ATC AAG AAA CAG AAA AAT AAA TGA AAG AAA AAT CAA AAT AAA TAC TTT AAA TTT ACT AAA ACA CAA TCC TTT TTA CAT ATA GAA AAA ACT TCT ATC CTT TAC TAA AAG ACA AAA TAA ATG ACC CAC AAA AGA ATT AAA CTT CAG ATG CGG GAT GGG GCT GTA TGA TTC GAG CTG GAT AAA TGA TTT TTG CTT AGA CTA TAA AGA GAC ATT TAA AAA AAA CAG ACT ATA TAG AAT AGC ATT AGC TAA TAA ACA TTA TAA TAG GTT AAA TAC ATT AAT TAT TAT TAT TAT TAT CTA AAA AAC TAA TTT GAT ACA TCA AAA ATT TAG GCT TTT TAG AAG AAG AGG AAG TAC AAG AAG GAG GAA AAG GAT ATA TTT TTA ATT AAT AAA GTT ATA TAT AAG ATA GAA TTC GTC CTT ATA GCA TAC ATC AAA TTA CTA ATA GAG CAT TTT GTA AAT ATA AAA TAC AAC CAG GGT AAT GGT ACA CTC CAA ATT AAA TCG CCA TCA TAT TAA AGG AGC TCC ATA AAA AAA ATA AAA TTA AAG GAA CTG AAA ATT TAA AAA TAG ATG TTC ATA GTA GTG ATA AAC CAA TTA TAT TTG AAA AAA TCT TGT AAA CAC TTT TGG GGC GTT AAG GCA AAA TTA ATT TAA ACT GCA ACC ATG AAA ATT AGT AAT CAA GAA ACT CAA TAA ATC AAG ATT AAG ATG AGT AAA ATA TTA AAG CCA ATA TTT AGA GTG CTA AAA TAT TCT AAT TAA TTT ATA AAA AAT ATT AAT TAG AAT ATT TTA ATT TGA TAA AAA TCA ATA TAT TGA TTT AAT TTT ATT ATT AAT TAA CAG TTC GTT TGA AAA AAT CAT GCC TCC TAA CTA GCA AGA AAT GTA AAT AAA TAA ATA TTT TAT ATT ATC AAG TTA AAT AAA ATG TTT TGT ATA CAA TAA AGA GAA GAG TTT TCA AGC TAG TAT GAA GAA AGC AAG GAA GAT TAG ACA GAT AAT TTA TGT TGT AAA GAC TGC TTT AAA ACA GAC AAC AAG CTG TTT CTC CTT CTA CCA TGC AGA CTA GGA TTA GAT GAA ATC AGC CCA ATT CAT ATA GAA ATC CTT AAA AAA TTA TTG TCT CTC AAA CAA TCT GTT GGA ATG ATA GGT AAG AAA ATA AAT TGC ATT TAT TGG ATA TAA ATT ATT TTA TTA AAT ATA CTT GAT AAT TTA ATA GAA TTT TAA TAA AAA TTT TTG AAT TTA CTT TTC CAA AAA CCA TTT TAA ATA AAG ATT ATT TAT TTG AAA AAA TAT TTT TAA ATT TTT CTA AAT GTA AAA AAT AAG GTT TAT GAT TAT ATT AAC TCA TTT TTT TAA TTT CTT AAT TAA TTA AGG AGG TAA ACC AAA CAA AGC TCA CTA CTT TTT AGG ATT TGT AGG AGA TGA TTT ATT ATA TTT AGA TCC TCA TTA TAT CAA AGA ATG TGT TAG AAA AGA AGA TCT AAT GGA AAA TAT TTC TTC TTA TTT CGA AGA AGA TGT TTT TAA AAT GCC AAT AAA TAA AAT TAG TAC CTC ATT GGT GTT TGG ATT TTA TTT TAG TGG CGT TGA TGA GCT AAA TAA ATT CTA TAA ATT TTT AAG ATA ACT AGA AAA AGA ATA TAA AGA TGA TTT TTT CCT TGT AAT TGA AAA ATA AAC TCC TTC TTA TGC AAT GTC GAA TAT CTC TGA GAT AAA AAA GTT GAC TAA GTA AAT AAA GAT TAC TTA AAA AGA TAA TTA AAA TCT TTT GGA ATA ATA ATT TGA GAA TTA TGA TGG ATC AGT AGG TGA TGA CTT TGA TGA AGA TGA TGA TAC AAG CTA TGA TGA ATA AGA ATG CTA TGA AGA CAA ATT AGA TGA ATT CGA TTA ATA TAA TAA CTT AGA AGA ATC AGA CTA TTC TTA AAA GCT TAA ACA ATA AAC TAA TTT AAA AAA CTA CAG TGA CCC ATT TGG TAC TGA AAG CCA TTC CGA AAA CCA ATT AAA ATA TGG AAA ATT GGC TAA TCA TGA GCT ACC AAT AAG AAA CCA GAT CTA AAA AAA ATA AAG TGA AGA GGA ATT AAA AAA TCT TGT AAA TTT AAT TTA ATT ATA GTA ACA AAA TCA GCA GAT AAG TAA CTT ATT ATA AAA TCA GAA TTG TAT TTG A
Login
Recent Activity
Recent Papers
Identifiers and Description
Gene Ontology Annotations 
Domains
Gene Expression Profile
Signal Peptide
Homologs (v.2006 protein sequences)
General Information 
Associated Literature 
Sequences
