Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00113050

Standard Name

CHS6 (CHitin Synthase)

Aliases

PreTt27119 | 8.m00379 | 3812.m02416

Description

Chitin synthase family protein

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.9%

TetraMine Data

TTHERM_00113050

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_03920.19.997093137033517e-262chitin synthase (860 aa)
OxytrichaContig20733.0.g184.9986056260133516e-43Chitin synthase
SGDYNL192W3.9997566980151843e-38CHS1 Chitin synthase I, requir
es activation from zymogenic f
orm in order to catalyze the t
ransfer of N-acetylglucosamine
(GlcNAc) to chitin; required
for repairing the chitin septu
m during cytokinesis; transcri
ption activated by mating fact
or
Stentor CoeruleusSteCoe_242381.9287498479639178e-22
WormBaseWBGene000004970.000000009996807949091551locus:chs-2 status:Confirmed
UniProt:G5EBQ8 protein_id
:CCD71483.1

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00113050(coding)
ATGTCTGAAGAATAATCACAATCAAAAAAGAGTTTACCTTAAACTGATTTTGAATTTTAA
TAGTCTAAAGATAATGAAACACTAATAAAAAATGCCCCATTATAAATTGATGAACATTCA
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ATTCTTCAAATGCTTGTCTGTGTCACTATGTATAGTGAAGAGAGAAACTTTCTTGAATAG
ACTCTTCTTCATATACAAAATAATCTCAAAGGATTTTAAGAACTTGGAGTTTAAGATTTT
TAGGTAGTTGTTGCCGTTATCTATGATGGAATCATGAAAGTAAAAGAAGAAGTTGTTGAT
TTTTATCTTGAAATTGATTCAGAAAATGGTTACAATCTTGATAAAAATTTAAAAAGGAGA
AGAGAAGTTATTTAGAGCTAAATGGACTATCTAACATTTACTAATTAATCTCATCTCTTA
GATACAAATGAAGGTCTTCCCCCAACTATACCTAAATAAATATCTTTATTGTATTAAAAC
AAATTTCAATTATATCTTTAAGATGAAAATAACCGCGATTCTAAAGTATAAATAATTTGC
CCTCAAAATCCTCTATTTGACACTTATCATCCTACCTTAACAGTATTTTCTCTCTTTAAA
CATAAAAATGCAAAAAAGTTATCTTCTCATTTATGGTTCTTTGAAGGTTTGTGTCGTTAA
ACAAGGCCTAAGTATGTTTGCTTTGTGGATGCTGGAACATTACCTTCTTAATATGGTATA
GTCAAATTTTACTAAGCAATGGAGGGAAATTAAACAATAGGAGGAGTATGTGGCTTCTTG
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ATTGGCCATATCATAGATAAAAACTTTGATTCTTTTTTAGGATTTATGCATGTGCTACCA
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ATTATATTGCCATCGTTTTTTTTATTTATGGTAATATTATCAGGATATTAATTTTACATT
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ATAATACCATTAAAAATTATTATCTAAAATTAGGTTTTTTAATATGTTGATGAAAACTCT
TCCTTTTGTTGTATATGCTTGTCATTTAAAATGAAAAAATAAAATATTTCTGAGTATTTG
AAACTATTTAATTATGTTTTAACATTAGAAGATAAGTAGAATATATCATCTTACTAGTAA
CAGCTCAAAGAAAGAAAAAAAACTCCCAAATAAATAGAAGCTTGTTCAAATAATTTAATT
TTTAAACTTGGAGAAAAAAGATTGAAAGATCTTAAAATTATATTTGATTAAAACTAATCA
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GATCTTGGATTTTAAATGCTACCAAAATAGATGAGAGGCTATATAATCATAATTTTAATA
TTTAAAGGGGGTCTTATTTTACTTATTCTATTTCTCCATACTATCTTTTAGCCTAAGATA
TTGTGGTTATTTGTAAAATCTTACTTTTCTTATATTTTATACTCTCCAGTGTATTAAATA
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AAAACTCCATATGTGATTATTGGAATAGGTATATATGATTCTCTTTACAATTCAGTTAGA
ATTATAGGTAAATTATATAATATAATTTATTAAGTATGA


>TTHERM_00113050(protein)
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KFQLYLQDENNRDSKVQIICPQNPLFDTYHPTLTVFSLFKHKNAKKLSSHLWFFEGLCRQ
TRPKYVCFVDAGTLPSQYGIVKFYQAMEGNQTIGGVCGFLGLEEPPEGGGGQSKSDNEKL
VKLKKNLKQLKELAQVQEYAIGHIIDKNFDSFLGFMHVLPGAWSAYRYDALEVRKGEKSN
FMQDSYFKSVLNPELLTDDIKEANKFLAEDRILCLGIISAKGSNYILKYVPEALAVTDSP
ETLEEFIHQHRRWTNSMIFALNHVLQNYKASIQGSKHSKFYSKICLPVNMLFAYLGLVNY
IILPSFFLFMVILSGYQFYIPSNIHGIALINENLAQNKCQIDYQLKEFDLQCNSEIKSNC
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KLFNYVLTLEDKQNISSYQQQLKERKKTPKQIEACSNNLIFKLGEKRLKDLKIIFDQNQS
HKLPKDLQNIKSEYDRIYTQKHNNKVYKIFASLFSIEASIFMIILSAALYINLFTPDIYS
DLGFQMLPKQMRGYIIIILIFKGGLILLILFLHTIFQPKILWLFVKSYFSYILYSPVYQI
YLTIFSFCNLDDVTWGTKGLQNSTQNQTFLTDKVRYVKYWVFLNSSLIIAFLCASLIPLD
KTPYVIIGIGIYDSLYNSVRIIGKLYNIIYQV


>TTHERM_00113050(gene)
ATGTCTGAAGAATAATCACAATCAAAAAAGAGTTTACCTTAAACTGATTTTGAATTTTAA
TAGTCTAAAGATAATGAAACACTAATAAAAAATGCCCCATTATAAATTGATGAACATTCA
TTATATTAGAAACCATTAGACCTATATATGGTTTGCACAGGTTAAGATGATTTAAATGGT
TAGTTAGAACCATTAAATGTGTATACATAAACTATTTAACCAAAGATTCATCAAATATTT
AACGGATAGGCTTATTACACTTATTTTGATGAAGCATCTTATAGAAACTTAGGGTAAATA
AAATCTTTAAAACAGTTAAATTTTTAGTATTTCTCGTTTTATTATTTTGTTTATATTTAG
TTTTTTCATCATATTTTTTCCTAATTTTTTATTTATTTATATATTAAATCAATCAATCAA
TATTGATTATTTCTTAGTAATAGGAGTAAGTTATTAAGTAGATAAATATCAAAACAAAGT
ATATTTTTCATACTTAATTAAACAAAAAATTCCAATTATTTTTTCCTTAAAATATTTCGA
CAATAATTATCATATTTCAATATCAAAAATAAATACTTAATTTATTTGAATTATATCTTT
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ATATCTTTATTGTATTAAAACAAATTTCAATTATATCTTTAAGATGAAAATAACCGCGAT
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ACAGTATTTTCTCTCTTTAAACATAAAAATGCAAAAAAGTTATCTTCTCATTTATGGTTC
TTTGAAGGTTTGTGTCGTTAAACAAGGCCTAAGTATGTTTGCTTTGTGGATGCTGGAACA
TTAGTAAAAATAATTATATTAATTCCCTTTTAAAAATCTTTGTTTTTTCTATTTTAAAAT
TTTATATTTAAAATTAAGCCTTCTTAATATGGTATAGTCAAATTTTACTAAGCAATGGAG
GGAAATTAAACAATAGGAGGAGTATGTGGCTTCTTGGGATTAGAAGAACCACCTGAAGGA
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AAATAAAAGGAATAAAAATAAATCAAAATTTATACAACGAGTGAAATTAATCAAATTTTT
GATCAGTTATCAAATAATTTCAGAAATTAAAAGTAGAATCAAATATTCAAAAGAAATTAC
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ATGATTAATGTTTTCTTTAAACTGATTTCTAAGCTTGGATCTCTTGTAGCCAAATTTTTA
GAAAATTTCCTATAAATTTTTGCATCTATAAGGCTAGCATAAGTCCAAGAATATGCGATT
GGCCATATCATAGATAAAAACTTTGATTCTTTTTTAGGATTTATGCATGTGCTACCAGGA
GCTTGGTCTGCTTACAGGTGAAATAAAAAAGTTTTAATTATTTTTATTTATTTTTCATGC
ATTTATTTATAAAAGGTATGATGCTCTGGAAGTAAGAAAGGGTGAAAAATCTAATTTTAT
GCAAGATAGCTACTTTAAATCTGTTTTGAATCCTGAGCTATTAACAGATGACATCAAAGA
AGCAAATAAATTTTTAGCAGAAGATAGAATACTTTGTCTAGGTATTATTTCAGCTAAAGG
TTCTAATTACATGTATCTTGCTTATAAATTTTATAAAGAATGTTTCTTAATCTTCAAATT
AAATTTGTCTATGAATTATAATTTTTGATGATTTTAATTGTGAATAATTTGTAAATTTAA
TTAAAACATAGATTAAAATATGTCCCTGAAGCACTTGCTGTAACAGACTCACCTGAAACA
TTAGAAGAATTCATACACTAACACAGAAGATGGACAAACAGCATGATTTTTGCACTCAAC
CATGTTTTATAAAATTATAAAGCCAGTATTTAAGGCAGTAAGCATTCAAAGTTTTATAGT
AAAATTTGCTTACCTGTTAATATGCTTTTTGCTTATCTTGGATTAGTCAATTATATTATA
TTGCCATCGTTTTTTTTATTTATGGTAATATTATCAGGATATTAATTTTACATTCCATCC
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GATTGTTTAACTGGGGAGCTTAACATTTATCAAAAGTAATTTAACACTTTACATATAATA
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GAATATATCATCTTACTAGTAACAGCTCAAAGAAAGAAAAAAAACTCCCAAATAAATAGA
AGCTTGTTCAAATAATTTAATTTTTAAACTTGGAGAAAAAAGATTGAAAGATCTTAAAAT
TATATTTGATTAAAACTAATCACATAAGCTTCCAAAAGATCTTTAGAATATAAAATCAGA
ATATGATAGAATAGTAATTCTTTTTTTATTAATTATAAATAAACTGGATATTTATTTTTT
TTAATTTAAAGTACACACAAAAGCATAATAATAAAGTTTACAAAATATTTGCTTCTCTTT
TTTCCATAGAGGTAAATCATCTTTTTTTTAATTAAATAAAATTAAGCTATTTTCATCAAT
TTTAAAACCATAAAAACACAAAATAAATTTAATAACTTAAAATTAATATTTTTGTAGGCT
TCTATTTTTATGATCATACTCAGTGCTGCTTTATATATCAACTTATTTACTCCAGATATA
TACTCTGATCTTGGATTTTAAATGCTACCAAAATAGATGAGAGGCTATATAATCATAATT
TTAATATTTAAAGGGGGTCTTATTTTACTTATTCTATTTCTCCATACTATCTTTTAGCCT
AAGATATTGTGGTTATTTGTAAAATCTTACTTTTCTTATATTTTATACTCTCCAGTGTAT
TAAATATACCTAACAATTTTCTCATTCTGTAATCTTGATGATGTCACATGGGGTACAAAA
GGCTTGCAAAATTCAACACAAAATTAAACATTTTTAACTGACAAAGTTAGGTATGTGAAG
TATTGGGTGTTTCTGAATTCTTCTTTAATAATAGCATTCCTTTGTGCTAGCTTAATACCA
TTAGATAAAACTCCATATGTGATTATTGGAATAGGTATATATGATTCTCTTTACAATTCA
GTTAGAATTATAGGTAAATTATATAATATAATTTATTAAGTATGA