Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00113060

Standard Name

CHS5 (CHitin Synthase)

Aliases

PreTt27120 | 8.m00380 | 3812.m02417

Description

Chitin synthase family protein

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.4%

TetraMine Data

TTHERM_00113060

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_03920.19.997093137033517e-262chitin synthase (860 aa)
OxytrichaContig20733.0.g186.001376218974307e-41Chitin synthase
SGDYNL192W5.998312950603665e-35CHS1 Chitin synthase I, requir
es activation from zymogenic f
orm in order to catalyze the t
ransfer of N-acetylglucosamine
(GlcNAc) to chitin; required
for repairing the chitin septu
m during cytokinesis; transcri
ption activated by mating fact
or
Stentor CoeruleusSteCoe_242382.6102790696677047e-23
WormBaseWBGene000004970.0000000029989608248573072locus:chs-2 status:Confirmed
UniProt:G5EBQ8 protein_id
:CCD71483.1

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00113060(coding)
ATGATTTCAGAATAGAGCCTAAATCAAAGACTGATCATTAATGAAAATGAATTTAATGCA
TCATGTTTAGACTAAACTTCTAATAATTCTGATTCTAAATAACAGACAGACCCATAAATG
TATTAAAAACCATTAGATTTATTTATGGTTTGCACAGGATAAGATGATTAAGATGGAAAG
CTACAACCTTTAAATATTTTCACTTAAAAAATTCAACCTAAAACTGAATATTTATAAGAA
GAAAGTCCATATATTGTTAATTTTGATGAGAGCTCTTATCTCAATCCTAGTCAATTAAGA
CCAATAGCAGAAACAGATGGATTGATTGGTTATTATAGCAAAAATAAATATAAAAATGTC
ATTTAAATGCTAATATGTGTTACTATGTATAGTGAGGATAGGCACTTTCTTGAGTAAACT
CTTCTTCACATACAAAAAAATCTTTAAGGATTTTCAGAATTAGGAGTGTAAAATTTTTAA
ATCGTTGTTGCTGTAATTTATGATGGCATAATGAAAATCAAAGAAGAAGTGGTTGAATTT
TATTGTGAGCTTGAGAAAGGAGAGAGTATAGATCTAGATAGAAATCTTAAAACTAGAAGA
GAGTTAATTCAAAACTAAATTGACTTCTTAGAGCTATAAAAATAATCATATCTTTTAGAT
GCAAATGAAGGACTACCTCCTTCAATACCCAAAAACATATCTCTATTTTATCAAAACAAA
ATATAAATAAAATAATTCGATAAATAAAATAGAAATTCAAAGATTAAAATTCTGTGTCCT
TACAATGCAGAATTTAATTAAAATGAACCTAATTTAACAGTTTTTTCTATTTTTAAACAT
AAAAATGCCAAGAAACTATCTTCTCATCTATGGTTTTTTGAAGGTTTATGTAGGTAAGTG
AGACCAAAATATGTGTCATTCGTAGATGTAGGCACACTGCCTTCTGAATTAGGACTTGTT
TAGTTTTATAAAGTTATGGAAGGAAACTATCATATTGGGGGAGTATGTGGTTTCTTAGGG
TTAGAAGAACCCCCTGAAGGAGGACAAGAAGATAACACAAATTAAAAAAAGAATATAAAT
TAGAAACATTTAAATAATAAAAACTTTGATTCTTTCTTAGGCTTCTTGCATGTTTTACCA
GGAGCTTGGTCTGCTTATAGATACGATGCTTTAGAAGTCTAGAGCAATTAAAAAACTAAT
TTTATGCAAGAGAACTATTTTCAGTCAGTTTTAAACCCTGATTTATTGACAAATGATATC
AAAGAAGCAAATAAATTTCTAGCTGAAGACAGAATTTTGTGTTTAGGAATAATTTCAGCG
AAAGGATAAAATTATCAATTAAAGTATATTCCAGATGCATATGCTGTGACTGATTCTCCA
TAAACTTTAGAGGAGTTCATCTAATAGCGCAGAAGATGGACTAACAGCATGATATTCGCC
CTTAACCATGTTCTTAAAAATTATAAATAAAGTATTAAAGAAAGTATCCATTCTAAGTGG
TTTAGTAAAGTTAGACTACCATTGAATATGTATTTTGCTTTTCTAGGTTTAATTAACTAT
ATTCTGTTGCCAGCATTCTTTTTATTTATGGCTGTTTTGTCTGGATACCAATTCTACATA
CCCTCTAAATAACCTGGTAAATCTTATGTTGATTCAAGCTCTTAGTAATAGTCATGTATA
CTAGATTACGATTTAACTTCATCTGAAACAATGTGTGATACTAATATCAAACAAGATTGC
TATTAAGAGTGCCAAACTGGAGAACTCACAATTTATTAAAAAATCTTCAACATATTCATG
AAAATACTACCTCTTAGTATTGTTATGACTGTGCTGTTATTTATGATTGTGTGTCTCACT
TTTAAAATGAAAAAGCAGAATTTTTCAGAATATTTATAGCTATTCAACTCTGTTATCAAC
GAAGAAGATAAAAAGTAGATTGAAGAGTTCAGGTAAATCTTAAGAGCTTAGAATAAGTCT
TCTTAATAGATTGAAACGAAAGTCAATAACCTAATTTAAAAGCTAGGAGAAAAAAGACTT
AATGATTTCAAAATTTTATTTGAATCAAAGAAATCTCACAAGCTCCCTCAAGATCTAAGG
AAAATTAAATCAGAATATGACAGATTATATACACAAAAGTACTACAATAAAGTTTATAAA
ATATTTGCTTCACTTTTCTCCATTTAGACTTTATTGCTTGTTTTTGTCATTACCTTCTCG
CTATATATAAATATATTTGCTCCTTAAATTTATAAAGACATTGGATTCTACCCTTTACCA
AAGTGGATGAGATTATACATTATTATAATTATAATCATAAACACTGGATTTTTCTTTATG
ATTATGGGATTTCATTTACTTTTCTAACCTAGATTAGTTTGGCTTGCCTTCAAATCTTAC
TTATCATTTACCTTTTATGCTCCTGTTTACTAAATATTTTTGTCTATTTACTCTTTTTGC
AATCTAGATGATGTAACTTGGGGAACTAAAGGTTTGCAAAGCTCTACTTAAAATTAAATT
TTTGTTTCAGACAAAGTTAGATATGTTAGATATTGGGTTTGGATAAACTCTTCTTTTATT
TTAGCTTTCTTAAGTGCAAGTTTAATACCTTTAGATAAAACTCCTTATGTTGTTATTGGA
CTGGGTATTTATTGCACATTATATAATGTACTTAGGATATCAGGAGGAACCATTAATTAC
TTAAAGTACTATCTTTTTGATAAATTGAAGATTAAAAAATAATTAAACAAAATTGTTACT
AGTAATTTATAAAATTAAGAAGAGTTGAAAAGGGATTACTTAAAATCTTTATCCCTGACT
ACTGTTAAGTAGATTAATACTTAAGAAACTAGTTAGTAATAGTTTTTTGAAGATAAAGAA
TAACTAGTATTCTCTCGTTCAATTAGTAAAAATTATAGCTAAAATAATAGCTAATAAGAA
TTCTTTAGAACAGATGAAAAAGAAATCTTTAGATATTGA


>TTHERM_00113060(protein)
MISEQSLNQRLIINENEFNASCLDQTSNNSDSKQQTDPQMYQKPLDLFMVCTGQDDQDGK
LQPLNIFTQKIQPKTEYLQEESPYIVNFDESSYLNPSQLRPIAETDGLIGYYSKNKYKNV
IQMLICVTMYSEDRHFLEQTLLHIQKNLQGFSELGVQNFQIVVAVIYDGIMKIKEEVVEF
YCELEKGESIDLDRNLKTRRELIQNQIDFLELQKQSYLLDANEGLPPSIPKNISLFYQNK
IQIKQFDKQNRNSKIKILCPYNAEFNQNEPNLTVFSIFKHKNAKKLSSHLWFFEGLCRQV
RPKYVSFVDVGTLPSELGLVQFYKVMEGNYHIGGVCGFLGLEEPPEGGQEDNTNQKKNIN
QKHLNNKNFDSFLGFLHVLPGAWSAYRYDALEVQSNQKTNFMQENYFQSVLNPDLLTNDI
KEANKFLAEDRILCLGIISAKGQNYQLKYIPDAYAVTDSPQTLEEFIQQRRRWTNSMIFA
LNHVLKNYKQSIKESIHSKWFSKVRLPLNMYFAFLGLINYILLPAFFLFMAVLSGYQFYI
PSKQPGKSYVDSSSQQQSCILDYDLTSSETMCDTNIKQDCYQECQTGELTIYQKIFNIFM
KILPLSIVMTVLLFMIVCLTFKMKKQNFSEYLQLFNSVINEEDKKQIEEFRQILRAQNKS
SQQIETKVNNLIQKLGEKRLNDFKILFESKKSHKLPQDLRKIKSEYDRLYTQKYYNKVYK
IFASLFSIQTLLLVFVITFSLYINIFAPQIYKDIGFYPLPKWMRLYIIIIIIINTGFFFM
IMGFHLLFQPRLVWLAFKSYLSFTFYAPVYQIFLSIYSFCNLDDVTWGTKGLQSSTQNQI
FVSDKVRYVRYWVWINSSFILAFLSASLIPLDKTPYVVIGLGIYCTLYNVLRISGGTINY
LKYYLFDKLKIKKQLNKIVTSNLQNQEELKRDYLKSLSLTTVKQINTQETSQQQFFEDKE
QLVFSRSISKNYSQNNSQQEFFRTDEKEIFRY


>TTHERM_00113060(gene)
ATGATTTCAGAATAGAGCCTAAATCAAAGACTGATCATTAATGAAAATGAATTTAATGCA
TCATGTTTAGACTAAACTTCTAATAATTCTGATTCTAAATAACAGACAGACCCATAAATG
TATTAAAAACCATTAGATTTATTTATGGTTTGCACAGGATAAGATGATTAAGATGGAAAG
CTACAACCTTTAAATATTTTCACTTAAAAAATTCAACCTAAAACTGAATATTTATAAGAA
GAAAGTCCATATATTGTTAATTTTGATGAGAGCTCTTATCTCAATCCTAGGTAAAATATC
AAAAAAATATTTATATTTTAAGAAAAAAAGATAAACTCCTTTATTCTTTGAACTCCCTTA
CCAGAATTATTTTAATTATGATTATTAATTACGTACGTCATAATTGTAATTTTACTTCTT
TCAAATTACATTATTAAGTATTTAGGCAATATTTTATTCATATTTAAATTATTATCATTT
GTTCATATTTAATTGATAGAAGAAGTTATTTTAATCTAGTTTACAAAATTTCATTATAAA
TTTGCTCTATTTAGAATTACATATTATAGTTAATTTTATACAATAACTTCCAAAGTAATT
CAAATTAAATCAAGACCTTTAATTAATATAGATCTAAATTTACTCAGCCTAAATATTTTT
ACCAGAATTCCTTTATTATTTATTCTAATCATACTTTTAGTAAATTAATCAAATACAACG
TATTATTCTATCATACTCAGAAAATTTTAAAAGGATTAAAGAATTGACAGATTAAATGCA
ATTATTTTGCTTTTTTTCATTTAATTACAAATAAATAAAAAATGTTAGGGTTTGCCAATA
CTATTTTTTAATATAAGAAAAAAATTTCTAATTTAAATAAATAGTAAATATTAATTTTAA
ATAAATTTAAATATAAAATCTATTATAAATTAAAAAAGAGAGAAACAACTAAAAAAAATA
AATTATTTTTATAAACTTTAAAAACAAAATAATTTAATAATATTTTTTATTTCCCAAAAG
TCAATTAAGACCAATAGCAGAAACAGATGGATTGATTGGTTATTATAGCAAAAATAAATA
TAAAAATGTCATTTAAATGCTAATATGTGTTACTATGTATAGTGAGGATAGGCACTTTCT
TGAGTAAACTCTTCTTCACATACAAAAAAATCTTTAAGGATTTTCAGAATTAGGAGTGTA
AAATTTTTAAATCGTTGTTGCTGTAATTTATGATGGCATAATGAAAATCAAAGAAGAAGT
GGTTGAATTTTATTGTGAGCTTGAGAAAGGAGAGAGTATAGATCTAGATAGAAATCTTAA
AACTAGAAGAGAGTTAATTCAAAACTAAATTGACTTCTTAGAGCTATAAAAATAATCATA
TCTTTTAGATGCAAATGAAGGACTACCTCCTTCAATACCCAAAAACATATCTCTATTTTA
TCAAAACAAAATATAAATAAAATAATTCGATAAATAAAATAGAAATTCAAAGATTAAAAT
TCTGTGTCCTTACAATGCAGAATTTAATTAAAATGAACCTAATTTAACAGTTTTTTCTAT
TTTTAAACATAAAAATGCCAAGAAACTATCTTCTCATCTATGGTTTTTTGAAGGTTTATG
TAGGTAAGTGAGACCAAAATATGTGTCATTCGTAGATGTAGGCACACTGGTATTTTAATT
ACAAATTGTAATTTAAATAATTTATAGATTATTTTTTATTTATAAAAAGCCTTCTGAATT
AGGACTTGTTTAGTTTTATAAAGTTATGGAAGGAAACTATCATATTGGGGGAGTATGTGG
TTTCTTAGGGTTAGAAGAACCCCCTGAAGGAGGACAAGAAGATAACACAAATTAAAAAAA
GAATATAAATTAGAAACATTTAAATAGTAAATTATCTAACCAAGATTAAAATAATTGGAC
CAAATAACTTAATCAAATAAAAAATGCTCATTAAACTAAAAGCAACAAAAATATAATTTA
TTCGAAAGAAGAAATTTGCTAAATTTACAACTAATTTGAAAATAACTTTAGAAACAAAAG
TTAACAAAAGATATTTAATAAAAATTATTATGTTACAAATTTAATGCTTTGGATCTTATT
ATTTCCTCTATTTTTAATCAGATTTTTGTTAGTTCACATAATTTTTAGAATTTTAGCTAA
ACTTTGCAGCTTAATTGGGTTATTTTTAGAGAATTTTCTTTCAATCTTCTCTTCTTTAAG
ACTAGCTCAAGTATATGAATATACATCAGGACATATAATAGATAAAAACTTTGATTCTTT
CTTAGGCTTCTTGCATGTTTTACCAGGAGCTTGGTCTGCTTATAGGTAGATAAATATTTA
TTATGTTTTTTACTTAGTAATTTTTATAATTTCATAAAAATAAAGATACGATGCTTTAGA
AGTCTAGAGCAATTAAAAAACTAATTTTATGCAAGAGAACTATTTTCAGTCAGTTTTAAA
CCCTGATTTATTGACAAATGATATCAAAGAAGCAAATAAATTTCTAGCTGAAGACAGAAT
TTTGTGTTTAGGAATAATTTCAGCGAAAGGATAAAATTATCAGTAATGAATAACTTGTTT
TTTATCAATAACCATGTTTTTATTTAAAAATTTATAAATTAAAAGATTAAAGTATATTCC
AGATGCATATGCTGTGACTGATTCTCCATAAACTTTAGAGGAGTTCATCTAATAGCGCAG
AAGATGGACTAACAGCATGATATTCGCCCTTAACCATGTTCTTAAAAATTATAAATAAAG
TATTAAAGAAAGTATCCATTCTAAGTGGTTTAGTAAAGTTAGACTACCATTGAATATGTA
TTTTGCTTTTCTAGGTTTAATTAACTATATTCTGTTGCCAGCATTCTTTTTATTTATGGC
TGTTTTGTCTGGATACCAATTCTACATACCCTCTAAATAACCTGGTAAATCTTATGTTGA
TTCAAGCTCTTAGTAATAGTCATGTATACTAGATTACGATTTAACTTCATCTGAAACAAT
GTGTGATACTAATATCAAACAAGATTGCTATTAAGAGTGCCAAACTGGAGAACTCACAAT
TTATTAAAAGTATTTATTTTATAATGTAAATATTTAATATAAAATTTAAATATTTTAATT
AGAATCTTCAACATATTCATGAAAATACTACCTCTTAGTATTGTTATGACTGTGCTGTTA
TTTATGATTGTGTGTCTCACTTTTAAAATGAAAAAGCAGAATTTTTCAGAATATTTATAG
CTATTCAACTCTGTTATCAACGAAGAAGATAAAAAGTAGATTGAAGAGTTCAGGTAAATC
TTAAGAGCTTAGAATAAGTCTTCTTAATAGATTGAAACGAAAGTCAATAACCTAATTTAA
AAGCTAGGAGAAAAAAGACTTAATGATTTCAAAATTTTATTTGAATCAAAGAAATCTCAC
AAGCTCCCTCAAGATCTAAGGAAAATTAAATCAGAATATGACAGATTAGTAATGAAATTT
AAATAAAAAATAATATTTAATTTTATTTTAAAATTTTTAAATTTAGTATACACAAAAGTA
CTACAATAAAGTTTATAAAATATTTGCTTCACTTTTCTCCATTTAGGTAATTTTTTTCAA
TTTATAATATTTGATATCATTTTAATAAACATTTTTATTTCAAATATTTTTGTTTGGATA
AAAAAATTTTTTATTTTTATTTTAATCCTTGAAAGAGTTAATTAAATTTTATTTGAAAAA
ATAGACTTTATTGCTTGTTTTTGTCATTACCTTCTCGCTATATATAAATATATTTGCTCC
TTAAATTTATAAAGACATTGGATTCTACCCTTTACCAAAGTGGATGAGATTATACATTAT
TATAATTATAATCATAAACACTGGATTTTTCTTTATGATTATGGGATTTCATTTACTTTT
CTAACCTAGATTAGTTTGGCTTGCCTTCAAATCTTACTTATCATTTACCTTTTATGCTCC
TGTTTACTAAATATTTTTGTCTATTTACTCTTTTTGCAATCTAGATGATGTAACTTGGGG
AACTAAAGGTTTGCAAAGCTCTACTTAAAATTAAATTTTTGTTTCAGACAAAGTTAGATA
TGTTAGATATTGGGTTTGGATAAACTCTTCTTTTATTTTAGCTTTCTTAAGTGCAAGTTT
AATACCTTTAGATAAAACTCCTTATGTTGTTATTGGACTGGGTATTTATTGCACATTATA
TAATGTACTTAGGATATCAGGTAAATTTGTATTAATTGTGAATGATTTTTGTATAAAATT
TGTTTCTATAAAACAATAATAGGAGGAACCATTAATTACTTAAAGTACTATCTTTTTGAT
AAATTGAAGATTAAAAAATAATTAAACAAAATTGTTACTAGTAATTTATAAAATTAAGAA
GAGTTGAAAAGGGATTACTTAAAATCTTTATCCCTGACTACTGTTAAGTAGATTAATACT
TAAGAAACTAGTTAGTAATAGTTTTTTGAAGATAAAGAATAACTAGTATTCTCTCGTTCA
ATTAGTAAAAATTATAGCTAAAATAATAGCTAATAAGAATTCTTTAGAACAGATGAAAAA
GAAATCTTTAGATATTGA