Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00683180Standard Name
CHL1 (CHromosome Loss 1)Aliases
PreTt16155 | 103.m00146 | 3734.m00058Description
DNA repair helicase (rad3); DNA repair helicase; involved in nuclear excision repair; localizes to the micronucleusGenome Browser (Macronucleus)
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Genome Browser (Micronucleus)
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Gene Ontology Annotations
Cellular Component
- micronucleus (IDA) | GO:0031040 | Ref:SUPR000143
Molecular Function
- ATP binding (IEA) | GO:0005524
- ATP-dependent DNA helicase activity (IEA) | GO:0004003
- DNA binding (IEA) | GO:0003677
Domains
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.2%
TetraMine Data
TTHERM_00683180
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_17807.2 9.997093137033517e-262 DNA repair helicase (559 aa)
WormBase WBGene00010839 4.9995060293141384e-98 locus:chl-1 status:Partially
_confirmed UniProt:Q21489
protein_id:CAA88959.2
SGD YPL008W 1.999022616705709e-90 CHL1 Probable DNA helicase inv
olved in sister-chromatid cohe
sion and genome integrity; int
eracts with ECO1 and CTF18; mu
tants are defective in silenci
ng, rDNA recombination, aging
and the heat shock response; F
ANCJ-like helicase family memb
er
Oxytricha Contig5554.0.g99 5.9988196117913e-83 Helicase C-terminal domain
Stentor Coeruleus SteCoe_25318 2.7487850079102147e-43 DictyBase DDB_G0286621 6.0018235484001396e-36 fncJ on chromosome: 4 position
4729555 to 4732791
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00683180(coding)
ATGAACAATAGAAGCACAAATAATGATTTAAAAGACAAAATTAAATAAAGCTTTCCTTAC
AATCCTTACGATATTTAATTAGAGTTTAGTTTGAACTTGTATGAGTCTTTGAATGTGAAG
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TTATCAAGTTGGATTAAAAAAAGAGTAAAGCCAGCTCATTCTTTTGAAAGTACCAAAAAA
AATATTAAAATTTTTTTCGAAAAAAAACAACAACATAAGATTTGA>TTHERM_00683180(protein)
MNNRSTNNDLKDKIKQSFPYNPYDIQLEFSLNLYESLNVKKLCIFESPTGTGKSLSLICG
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TNLKLLQDDIDYLFLHNIHTLDQMRSESLNNQVCPYYLSKRSVIDAEVICVPYVTLLDEN
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TQETRLGQKIHFFSQSPKYVPSQIPPQVNKSLKDINIQELLKNSPYMVVENVMNFLWKMQ
DSISKSEKYSIIIKNISKIEESSIQLMCLDVIEPLYKVIQESACVVLAGGTMEPLSEFEL
LINQVGKNNFKHFSCGHIIDEENCSVFCVSTLVEQSDKPLIFNYQNKKDDQLFQNSIDII
HQLAQTIPDGLVIFVQSYTFLEKLKSILLENQNLLQQIQQYKKIYMDDKDNSNNTILEKY
QKEINKEKEIGSKKNGAILISVIGGRLSEGINFSDQLARCVVVFGMPYSNIKSAELIEKM
NHYDSISKKNNFSFSGNDYYENLCMKSVNQAIGRSIRHKDDYSVILLIDQRFSQEKNINR
LSSWIKKRVKPAHSFESTKKNIKIFFEKKQQHKI>TTHERM_00683180(gene)
ATGAACAATAGAAGCACAAATAATGATTTAAAAGACAAAATTAAATAAAGCTTTCCTTAC
AATCCTTACGATATTTAATTAGAGTTTAGTTTGAACTTGTATGAGTCTTTGAATGTGAAG
AAGCTTTGTATATTTGAAAGTCCTACTGGTACAGGTAAGAGTTTGAGCTTAATTTGTGGC
GCGTTTAATTGGTTTAAAGATAACTAAGAAAACTACGATTTGATTAAAGGTTTCAAAGAA
AGGAGAGACAAAATTTTATTAGGAGAAGTCAATATAGATAGTAAAAAAGAAGAATCAAAT
AGCTTGCCTGCATGGCTAACGAATATAAATGATATTAATAGAAGTATTTTTTACGAAAAA
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TTTTTGTTTAATAAATTTTTAGAATAAGATATGAAGAGTACAAAAAAAATATTATCAAAT
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ATTACAAGAAATCTAAAAGTCAAATTAGATAAAACAATGAATAAGATGAAAATGATAATG
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TATAAGAAATATTGAAAACGAAATTTAAAGATATGAGAGTTATAACTTTAGGAAGTAGAT
AAAATCTTTGCTTGAAATTTGATGAATAATCTAAACAATCTTTACAATAAATAGATGATT
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TCACTAATTTAAAATTATTGCAAGATGATATTGATTATTTGTTTTTACATAATATTCACA
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TTAATTAGCTCAAACAATTCCTGACGGTCTAGTTATTTTTGTATAAAGCTATACGTTTCT
AGAGAAACTAAAGAGCATCCTCTTAGAAAACTAAAATTTACTTTAATAAATCTAATAATA
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TGTAATAGGTGGGAGACTAAGTGAAGGTAACTTAATTTTAATTTAATTTAGAAAAAGATA
TTATAAAATTTACTTTATAGATCTAACTCTAATTTTTTTTAAAGGGATAAATTTTAGTGA
TTAACTTGCAAGGTGCGTTGTAGTATTTGGAATGCCCTATTCAAATATTAAAAGTGCCGA
ATTAATAGAAAAAATGAATCACTATGATTCCATATCAAAAAAAAATAACTTTAGCTTTAG
TGGAAATGATTATTATGAAAATTTGTGTATGAAATCTGTGAACTAAGCAATTGGCAGGTC
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TGAAAGTACCAAAAAAAATATTAAAATTTTTTTCGAAAAAAAACAACAACATAAGATTTG
A