Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00185770
Standard Name
CDK9 (Cyclin-Dependent Kinase 9)
Aliases
PreTt29899 | 14.m00466
Description
cyclin-dependent kinase-like Serine/Threonine kinase family protein; CDKL kinase family protein; involved in DNA replication
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
Molecular Function Biological Process
Domains
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.1%
TetraMine Data
TTHERM_00185770
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_09902.1 9.997093137033517e-262 protein kinase domain-containi
ng protein (707 aa)
Oxytricha Contig9279.0.0.g16 9.997639769646959e-151 Protein kinase domain
WormBase WBGene00012779 1.9993206333383003e-80 status:Partially_confirmed U
niProt:Q9U2H1 protein_id:CAB
63367.1
DictyBase DDB_G0288677 5.001742359316081e-68 cdk5 on chromosome: 5 position
1885785 to 1886770
Stentor Coeruleus SteCoe_22120 7.175095973164411e-66
SGD YBR160W 5.997098480211051e-62 CDC28 Catalytic subunit of the
main cell cycle cyclin-depend
ent kinase (CDK); alternately
associates with G1 cyclins (CL
Ns) and G2/M cyclins (CLBs) wh
ich direct the CDK to specific
substrates
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
Ref:16933976 : Eisen JA, Coyne RS, Wu M, Wu D, Thiagarajan M, Wortman JR, Badger JH, Ren Q, Amedeo P, Jones KM, Tallon LJ, Delcher AL, Salzberg SL, Silva JC, Haas BJ, Majoros WH, Farzad M, Carlton JM, Smith RK, Garg J, Pearlman RE, Karrer KM, Sun L, Manning G, Elde NC, Turkewitz AP, Asai DJ, Wilkes DE, Wang Y, Cai H, Collins K, Stewart BA, Lee SR, Wilamowska K, Weinberg Z, Ruzzo WL, Wloga D, Gaertig J, Frankel J, Tsao CC, Gorovsky MA, Keeling PJ, Waller RF, Patron NJ, Cherry JM, Stover NA, Ref:SUPR000261
Sequences
>TTHERM_00185770(coding)ATG AAT AAA TAT GAA GTT AAA GGA GTT GTG GGT GAA GGC GCA TAT GGC GTT GTT TTA AAG TGT ATG AAT AAG GAA AAC GGA GAA TAT GTT GCT ATA AAG AAA TTC AAG GAA TCA GAT GAG GAT GAA GTG GTT AAG AAG ACC ACT CTC AGA GAA GTT AAA ATT TTA AGA ATG CTT AAG TAA GAA AAT ATA GTT CAG TTA AGA GAA GCA TTC AGA AGA AAG GGA AAA TTG TAT TTA GTC TTT GAA TAT GTT GAA AAC AAC TTG CTT GAA ATT CTT GAA GAA AGG CCG AAT GGG CTG GAT CAA GAC GAT GTT AGA AAA TAT ATT TAT CAG TTA TGC AAG AGT ATT AGT TAT TGC AAC TCA ATG GAT ATT ATA CAT AGA GAT ATT AAG CCA GAA AAT CTT CTC ATT AGC AAG GAT GGT ACT CTC AAG CTT TGT GAT TTT GGA TTT GCC AGA GTT TTG CCT TAG AAA GGA GGC AAC TTA ACA GAT TAT GTT GCT ACT AGA TGG TAT AGA GCA CCA GAG TTG CTT CTT GGT TAC ACA GAT TAT GGT AAA GAA GTA GAT ATG TGG GCT GTA GGT TGT ATT ATG GGA GAA TTA ACT GAT GGA TAG CCT CTC TTT CCA GGA TAA AAT GAG ATA GAT TAA CTC TAT GTG ATT TAA AAA GTA CTA GGA CCA CTA ACT GCT GAA CAA TAA GAA GTA TTT TTA AAA CAT CCT GGA TTC TTG GGA GTA AAA TTA CCA GAA ATA AGT AAA CCA GAA ACA ATA GAA AAG AGA TAT TTG GGA AAA CTA TCA AAA AAA GCC CTT TCA TTT ATG AAA AAC CTA CTT AAA ATG GAT CCT TCT TAA AGA ATG AGT GCA GAT GAG GCT TTA TAG CAC CCT TAT TTC GAT GGA ATT AGA GAT AAA GAA ATT TAA TAA ACA ATT AAA CAT GGA AGA ATT GAA GAA AGA GTA GAA TCT GCA ACA ATT AAA GAG CCT AAA CAA ATC AAT TAA AAT GGC ACA AAT TCT GGT TTT TAT AAT TAA CAA ACT TAA AAT GCT TCA ACT ATT AAG CCA AAA GAT AAA CCT CCT CAA TAA TAA GCT ATT CCT CCA AAA AAT TAA ACT CAA TAA CCA CCT CTT GGA TCT AAC AAA CAA AAG GCA TTA CAG TAG TAA CCA GAC CAA TAA TAA TAA AGA GTT AAT AAC TTT GTA AAA AAT GGC GTA AGA CAA GAA AAG AAT ACT CCA AGT CAT GAG AAT AAT AGA ATA ATT AAA AAA GAT ATT TAT CCT CAT CCA TAA ATA AAC TTT ATG TAG TCA AGC TAT TCA AAT ATT CCA GAT ATT TAC ATT AAA ACG AAA AAT GCT CAA AAT CAG CAG TAT AAT TAT GAA ATT CAA GAA AAT TAT CAA CCA GAT TTT CAT AAT GAG GAC CCA GAT GAT TCA CAG TAA CCT TCC GTT CCC CAA GTG TTA ATT AGA AAC GAC ACT CAT GGA AAT CAT AAT AAT ATG GTT AAC GTT TCA ATC GAA GAT AAT ACT CCA TAC TCT AAA TTT AAT GAA AGA AAT AAA TCG AAA GAA AAC ATC ATA CCA AAA GGA AAG AAG AAA AAA TCA TAG ATG TCA AAT ATA GAA AAT TTC TAT CAA GAT AAT GCA GAA AAT TCT AAT AAT CAA GAA GAA GAT GCA GAA GGT CGC AAA AGC CCT CTT CTG ACA AAT AAC AAA CTT TAT GGT ACA TCA GTC GCA CAG CAA AAG AAA TTC AGA TTT AAT GTT ATG GCT CAG AAT ATT CAA CAA AAT GAG GAG GCT TAA GAA TAT CCA AGA TAA TAA AGT AGA GCA AAT AGC AGG TCT AAA TTT TAT AAA AAT GGA TAA CTC CAA AAG AAT GCC AAC TAT GTA AGT TCA TAG CAG ATG AAT GTG CTT TTG CAC ACA GAA GAA GGT CCT GAC TAT GAA GAG AAA GGA CTT AAT TTA AAT AGC AAC ACA AAT AAT AAT AAT ATG AAC GTA AAC AAT AAC AAT ATC AGT AGT TAA AAT ATG ATG GAA TAG CAA GTA ATG GGA AAT GAA ATC TTT TAG AGT ACT AGT TAA TTG CCT TAT ATT TAG TAA TCA TCT TCA AAT TAT AAT CCA AAC TTT AAA TTT TAT AAT ATG TAC CAT TAG TAA TAG AAG TAG ACC TAA AAA CCA AGT GGT AAA ATG AGT ACT TAA CAT AAT AAT AAT ACA AAT TAA AAT ATG AAT TAC GAC CAA TAT ACT TAC TCA ATG CAC CCT TAC GAT TAG TAA GAT TAA GAA ATG AAG AAC TTA AAC ATA ATT TAC AAC AAT AAT ACA TAC AAT TAT AAT ATA AAT AAC TCT CCA CTT TGG AAT TCG ATT AGC AAG AAA AAA ATA TGA >TTHERM_00185770(protein)M N K Y E V K G V V G E G A Y G V V L K C M N K E N G E Y V A I K K F K E S D E D E V V K K T T L R E V K I L R M L K Q E N I V Q L R E A F R R K G K L Y L V F E Y V E N N L L E I L E E R P N G L D Q D D V R K Y I Y Q L C K S I S Y C N S M D I I H R D I K P E N L L I S K D G T L K L C D F G F A R V L P Q K G G N L T D Y V A T R W Y R A P E L L L G Y T D Y G K E V D M W A V G C I M G E L T D G Q P L F P G Q N E I D Q L Y V I Q K V L G P L T A E Q Q E V F L K H P G F L G V K L P E I S K P E T I E K R Y L G K L S K K A L S F M K N L L K M D P S Q R M S A D E A L Q H P Y F D G I R D K E I Q Q T I K H G R I E E R V E S A T I K E P K Q I N Q N G T N S G F Y N Q Q T Q N A S T I K P K D K P P Q Q Q A I P P K N Q T Q Q P P L G S N K Q K A L Q Q Q P D Q Q Q Q R V N N F V K N G V R Q E K N T P S H E N N R I I K K D I Y P H P Q I N F M Q S S Y S N I P D I Y I K T K N A Q N Q Q Y N Y E I Q E N Y Q P D F H N E D P D D S Q Q P S V P Q V L I R N D T H G N H N N M V N V S I E D N T P Y S K F N E R N K S K E N I I P K G K K K K S Q M S N I E N F Y Q D N A E N S N N Q E E D A E G R K S P L L T N N K L Y G T S V A Q Q K K F R F N V M A Q N I Q Q N E E A Q E Y P R Q Q S R A N S R S K F Y K N G Q L Q K N A N Y V S S Q Q M N V L L H T E E G P D Y E E K G L N L N S N T N N N N M N V N N N N I S S Q N M M E Q Q V M G N E I F Q S T S Q L P Y I Q Q S S S N Y N P N F K F Y N M Y H Q Q Q K Q T Q K P S G K M S T Q H N N N T N Q N M N Y D Q Y T Y S M H P Y D Q Q D Q E M K N L N I I Y N N N T Y N Y N I N N S P L W N S I S K K K I >TTHERM_00185770(gene)ATG AAT AAA TAT GAA GTT AAA GGA GTT GTG GGT GAA GGC GCA TAT GGC GTT GTT TTA AAG TGT ATG AAT AAG GAA AAC GGA GAA TAT GGT AAA TTT ACT TAT TAT TAC TAT TAA TAT TAA AGT GAA ACA TCA ACA TTT ATT TTA AGG TTA TTT TCA ATT CAA TAT GAT TTA TCA AAC AAT AAA CCA ACA AAT ATA TAA TAA ATA TAA TGT TAG ATT AAT ATT TAA CCA ATA TTA TCA TTA GTT GCT ATA AAG AAA TTC AAG GAA TCA GAT GAG GAT GAA GTG GTT AAG AAG ACC ACT CTC AGA GAA GTT AAA ATT TTA AGA ATG CTT AAG TAA GAA AAT ATA GTT CAG TTA AGA GAA GCA TTC AGA AGG TAC ATA TTT ATA AAT AAA GAA ATA AAT AGA ATA AAA TGA GAT AAA TAT AAA ATT GGA GCT TTT TTG AAT AAA TAA ATA AGA ATA GAA TAA AAT ATT TCT TTA TAT TTT TAT TAT TAG TTT AAG GAA ATT TGC TAG TTT GTT TAA TTG TTT CGT TTG ATT AAA GAA ACA GCT AGC TAC AGA TAA ATT ATA TGC ATA ATC ATA ATT GTA TTA AAT AGA AAG GGA AAA TTG TAT TTA GTC TTT GAA TAT GTT GAA AAC AAC TTG CTT GAA ATT CTT GAA GAA AGG CCG AAT GGG CTG GAT GTA ATT AAT TTA TTA TTA ACA TAC ATA TTC AAG TCA TTA AAA AAA TAG TTT AAT GAA GTT AAC TTA TTT ATT TAT TAA TTC TAA CTC TTT TTA TAT ATC TGT TTA TTA GCA AGA CGA TGT TAG AAA ATA TAT TTA TCA GTT ATG CAA GAG TAT TAG TTA TTG CAA CTC AAT GGA TAT TAT ACA TAG AGA TAT TAA GCC AGA AAA TCT TCT CAT TAG CAA GTA ATA TTT TAG AAT AGC TTG TTT CTT TTC ATA AAT TCA CGA TTG ATT GAT TGA TTG ATT GAT TGC TTA ATT TGT TCT TGA TAA AAT TAA TTT GCT AAT ATT GCT TTT CAT TAA ATT TTA TTA AAG GGA TGG TAC TCT CAA GCT TTG TGA TTT TGG ATT TGC CAG AGT TTT GCC TTA GAA AGG AGG CAA CTT AAC AGA TTA TGT TGC TAC TAG ATG GTA AAT ATC TAA ATA ACT AAA TAA CAA TTT TAA TTA TTT ATT TTT TTA GTT CAT TTT AAA ATA TAT TTC ATT CGT TTT GAA CTA AAA ATT TGA TAA ATA TTT TAC TTA ATT GAG ATA TTT ATT CTA AAA CCA AAT ATA TTT CTA ATT CGT TTA TTG ATT TAT AGG TAT AGA GCA CCA GAG TTG CTT CTT GGT TAC ACA GAT TAT GGT AAA GAA GTA GAT ATG TGG GCT GTA GGT TGT ATT ATG GGA GAA TTA ACT GAT GGA TAG CCT CTC TTT CCA GGA TAA AAT GAG ATA GAT TAA CTC TAT GTG ATT TAA AAA GTA CAA ATA ATT TAT TTA TTT AAT TAG TAA ATT TAA GCT AAA TTA TAA GCT TTT TAT TGA TTT ATT AAG CTC TTT TAA AGA GTA TCC TAG TAC CTT TTT ACT TAA TTA TTA TGC TTT TGC TGA ATT TTC TAA AAA TTT TTG TGA ATT TAA ACA AAA ATT CAT AGA TTT TTT ATT ATA ATT GGA TAA CAA ATT GTA TTT GCC CAC ATA ATA TTC AAT ATA TGA TTA CTT TAA ATA AAT TAT ATT TTA TTC AAA TAG GTA CTA GGA CCA CTA ACT GCT GAA CAA TAA GAA GTA TTT TTA AAA CAT CCT GGA TTC TTG GGA GTA AAA TTA CCA GAA ATA AGT AAA CCA GAA ACA ATA GAA AAG AGA TAT TTG GGA AAA CTA TCA AAA AAA GCC CTT TCA TTT ATG AAA AAC CTA CTT AAA ATG GAT CCT TCT TAA AGA ATG AGT GCA GAT GAG GCT TTA TAG CAC CCT TAT TTC GAT GGA ATT AGA GAT AAA GAA ATT TAA TAA ACA ATT AAA CAT GGA AGA ATT GAA GAA AGA GTA GAA TCT GCA ACA ATT AAA GAG CCT AAA CAA ATC AAT TAA AAT GTA ATA AAT TAT AAT TTT TAT TTT TGT GTT ATG AGT TTA TTT TTT AAA AAA GGG CAC AAA TTC TGG TTT TTA TAA TTA ACA AAC TTA AAA TGC TTC AAC TAT TAA GCC AAA AGA TAA ACC TCC TCA ATA ATA AGC TAT TCC TCC AAA GTA AGT ATT TTT ATT TAT AAA AGC ATC AAA AAA ATA ATT TAA ATT TAA TAA AGA AAT TAA ACT CAA TAA CCA CCT CTT GGA TCT AAC AAA CAA AAG GCA TTA CAG TAG TAA CCA GAC CAA TAA TGT AAA ATT TAT ATA TTT ATT TTA AAG GTT TTT ATT AAT TTA AAA AGT ATC AAT CTA CCT ACC TAC CTA CCC ATC ATT TAT CAT ATT AAT CAA ATA AAA AAT AAT TTT TTT AAG TTT TTA ATC GAC TCA TTT ATC ATC AAA TAG ATG ATA AAA ATG TTT AAA ATA AAT TGA TAT TTT ACA ATA AAT AAT ATT AAT ATT CCA TAA AAT ATA TTT AAT TAG AAT AAA GAG TTA ATA ACT TTG TAA AAA ATG GCG TAA GAC AAG AAA AGA ATA CTC CAA GTC ATG AGA ATA ATA GAA TAA TTA AAA AAG ATA TTT ATC CTC ATC CAT AAA TAA ACT TTA TGT GTA AGA AAA GCT TAT TTA TAT AAA AAC TTC TTT TTT GCT TAA TAG AAT TTT TTA ATT TTT ATA ATA GAG TCA AGC TAT TCA AAT ATT CCA GAT ATT TAC ATT AAA ACG AAA AAT GCT CAA AAT CAG CAG TAT AAT TAT GAA ATT CAA GAA AAT TAT CAA CCA GAT TTT CAT AAT GAG GAC CCA GAT GAT TCA CAG TAA CCT TCC GTT CCC CAA GTG TTA ATT AGA AAC GAC ACT CAT GGA AAT CAT AAT AAT ATG GTT AAC GTT TCA ATC GAA GAT AAT ACT CCA TAC TCT AAA TTT AAT GAA AGA AAT AAA TCG AAA GAA AAC ATC ATA GTA TCT AAT AAA AAT CAA TCA CTC ATT TAA TCT AAA AAA ATA TAA TTT TAT TAA GCC AAA AGG AAA GAA GAA AAA ATC ATA GAT GTC AAA TAT AGA AAA TTT CTA TCA AGA TAA TGC AGG TAT TTT CTT ATT TTA TTA TAT TAT GAA TAA TAA TTC AAC AAA AAG TGA TTT ATT ATT TAA TAG AAA ATT CTA ATA ATC AAG AAG AAG ATG CAG AAG GTC GCA AAA GCC CTC TTC TGA CAA ATA ACA AAC TTT ATG GTA CAT CAG TCG CAC AGC AAA AGA AAT TCA GAT TTA ATG TTA TGG CTC AGA ATA TTC AAC AAA ATG AGG AGG CTT AAG AAT ATC CAA GAG TAA AAA TAA TTA ATT TTT TTG GAT TAA AAA TTT TTC TTT TTA GTA GCT TTT TAC TTT TTA TAG CTA ATA AAT ATT TAC TAA AAA TAG TAA TAA AGT AGA GCA AAT AGC AGG TCT AAA TTT TAT AAA AAT GGA TAA CTC CAA AAG AAT GCC AAC TAT GTA AGT TCA TAG CAG ATG AAT GTG CTT TTG CAC ACA GAA GAA GGT CCT GAC TAT GAA GAG AAA GGA CTT AAT TTA AAT AGC AAC ACA AAT AAT AAT AAT ATG AAC GTA AAC AAT AAC AAT ATC AGT AGT TAA AAT ATG ATG GAA TAG CAA GTA ATG GGA AAT GAA ATC TTT TAG AGT ACT AGT TAA TTG CCT TAT ATT TAG TAA TCA TCT TCA AAT TAT AAT CCA AAC TTT AAA TTT TAT AAT ATG TAC CAT TAG TAA TAG AAG TAG ACC TAA AAA CCA AGT GGT AAA ATG AGT ACT TAA CAT AAT AAT AAT ACA AAT TAA AAT ATG AAT TAC GAC CAA TAT ACT TAC TCA ATG CAC CCT TAC GAT TAG TAA GAT TAA GAA ATG AAG AAC TTA AAC ATA ATT TAC AAC AAT AAT ACA TAC AAT TAT AAT ATA AAT AAC TCT CCA CTT TGG AAT TCG ATT AGC AAG AAA AAA ATA TGA