Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00837980
Standard Name
CDK6 (Cyclin Dependent Kinase 6)
Aliases
PreTt17811 | 146.m00112 | 3743.m00043
Description
hypothetical protein; Protein kinase domain containing protein; sequence similarity to the CDKL protein kinase family; involved in DNA replication
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
Molecular Function Biological Process
Domains
( PF00069 ) protein kinase domain
( PF07714 ) protein tyrosine kinase
( PF01519 ) Protein of unknown function
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.7%
TetraMine Data
TTHERM_00837980
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_19538.1 6.000921370366457e-140 hypothetical protein (659 aa)
Oxytricha Contig2395.0.g83 0.000000000000001999258566166494 Leucine Rich repeat
DictyBase DDB_G0290485 0.0000000000000299873730555305 dlrA on chromosome: 5 position
4410371 to 4413091
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
Ref:16933976 : Eisen JA, Coyne RS, Wu M, Wu D, Thiagarajan M, Wortman JR, Badger JH, Ren Q, Amedeo P, Jones KM, Tallon LJ, Delcher AL, Salzberg SL, Silva JC, Haas BJ, Majoros WH, Farzad M, Carlton JM, Smith RK, Garg J, Pearlman RE, Karrer KM, Sun L, Manning G, Elde NC, Turkewitz AP, Asai DJ, Wilkes DE, Wang Y, Cai H, Collins K, Stewart BA, Lee SR, Wilamowska K, Weinberg Z, Ruzzo WL, Wloga D, Gaertig J, Frankel J, Tsao CC, Gorovsky MA, Keeling PJ, Waller RF, Patron NJ, Cherry JM, Stover NA,
Sequences
>TTHERM_00837980(coding)ATG AAT TAT GAA ATT TAA AAT TAA GAG AGT TAC TAT TTG TAT CTA TCA AGC ACA TAT GGA GCA GAG TTT ATT GAA ACT AAG CTT TCC TTA CAT AGC AAT ATT AGA AAA TTA AAA TTA GTA TTA AAT ACA AAT GAT AAG GAA GGT ATA AAT TAG TTA GGA TTG CAA CTT ACA AAT TTA AAT CAT TTA CTA GAA TTA ACC ATC ATT ATT TAA GAA GAG AGT TGC TTT AAT GAA AAC ATT TTA CAA GAT TTT TTT TAA TAT TTC TAA TAA CTG AAA AAT TTA GTC AAA TTG GAA GTA AAT GTT GCT AGA TAA AGC CCC TTT TAA GAA TAA AGA TCT TCA TAT TTA TCT AAC GCT ATT TAA AAT TTA GTA AAT TTA GAG AGT CTT ATT ATA AAT TTC GAA GGA GAA AAT AAC CTA TCT TAA AAT GGA GCT TCT GCT ATT GGA TAT TGC TTA AGA TAT TTG AAG AAA CTC AAT AAT TTA AAT TTA TAA ATT GGT TAT GAT TTT ATA GGA AAA TAA GGA TGC GAA AAA TTA GCT GAT GGA ATT GCT CAT CTT ATT AAT TTA CAA TAA TTG ACT ATT TCT ATT AGA GAG TAT AAT TTA ATA GAA AGT GGA TCT ATT TAG CTT GGA AAA AGC TTA GAG AAT TTA ACT AAT TTG AGC TAT TTA AAA CTA AAT ATA GAA ATG GAT AAC TAA ATA GAA TCT CAA GGT GCT ATA GCT TTA GCA AAA GGA ATT TCA AGT CTT ACT AAT TTG AAT CGT TTG GAA CTC TTA ATA GGT TAT AAT AAT AAT ATT GGC TAG TAG GGA GCA ATT AGC CTA GGA AAT GCG CTT ATA AAA TTG AAA AGT TTA GAC TAT CTT GAA CTA ATT ATT TCT GGT GGA AAT GAA ATT TAA TTC AAA GGT GCT TAG GGT ATT GCA GAA GGT TTA AAG GCT TTA AAA AAT CTA AAA GAT CTT AAA TTA AAT ATT CTA GGA GAT AAT TAA TTA GGA TAA AAA GGT TCT ACT TCG ATA ATC AAA TCA TTA TCT TAT CTT AAA AAT CTA GAA AAC TTA GAA TTT GAT ATT GGT GAA GTT GAT TAT ATT GAA AAA GAA GGG GCA ATA CAA CTT GGA AAG TCA ATT TAA CAA ATG AAA AAT TTA AAT AAT TTA AAT TTA TGG ATC CAT GAC TGT AAT GAT ATT TAG CAA GGA GGC GCT AAA TCA ATT GGC TAA GGA TTA TCT CAT CTT TCA AAT TTG AAA TTT CTT AAT TTG AAT ATC TTT TCT GTA AAT CAA ATA GGC CCT AAA GGT ATT CAA GCA ATA GCA AAT GGT ATA AAA TGT TCA AAA AAC ATG GAG AGT CTA TCT CTG TGG ATA GAT CAT GAT AAC TAA ATA GGT AGT TAA GGA TGT ATC TTT ATT GGA GAG TCA CTA TGT CAT TTA AAA GAT TTA AAA ACT TTA AAC ATT GAT ATT GGT GTT TAT TCA AAA GTA GGG AAA GAG GGA ATA ATA GGA TTA TCT CAG TGC TTT AAA TAT CTC AAT TAA TTA TAA GAC CTA AAT TTT AGC ATA AAA GGT TAT AAT AAT TTG ACA TAA GAA GGG TTT TAA TAA TTC TCA ATC AAT ATG AAA AGT TTA GTC AAT TTA AAA ATA TTA GGA TTA TAC TTT GGT AGC AGA AAT TAA ATA GGT GGG TAA GGA ATG AGT TAT TTA GGT CAA TAG CTT TTA CAT TTA TAA AAT TTA AAT AAG TTT TCA CTT GGT TTA GGA GAA GAA AAT AAA TTA TCT GAA AAT TCT CTA AAA AAT TTT GGT GAA AGT TTT AAT CAT ATA AAT AGT TTA ACT CAT ATT GAT TTA GAT ATT TAT AAA CAT AAT TTG AAA AAT AAT GAT TTC GGG AAT ATA GGA AAT GCT TTG AGT ATG TGC AAA AAA CTT TAA TTC CTA AAA ATA AAA GTA GAT TAA GAA CAT TAA ATA ACT TAA AAC AAC ATA AAA TTA TTT GCT AAT AAC CTC AGT TAG AAT AAA ACT GTC ATT TAA ATT AAA TAT TCT CTT AAT TTG GAT AGA GAG GAC CCA GAC GAT TAT GGA AAT TAA GAT GAA GAG GAT GAG GAA ATA GAA GAT GAT CTT GAA GAG GAA AAT AAT GAA ATT TTA GAT GAA GAG AAT AGC TTA TAG AAT GAC TAA GTA AAA GAA GAA GAT GAA GAT ATA GAC AAA GAA GGC GAT GAT ATG AAA GAA GAT GAA AAC TTA TCA GAA AAT GAA GGC AAT TAT CAA AAA GAT GAT GAA GAA TTT GAT AAA GAA GAT TTG GAA AAT ATG GAT ATA TAA GAA TTT TAA TAG GAT ATG AGT TAT TTA GGA AAC CAA AAC AGT CAA AGT GAG ATA TCA AAT TAA CAA TAA ATT TAG GAT TTA GAT GCT TTT GCT AAA AAA TTA TTT ATA AGA AAA ATA AAA TAA TTA GTT AAT TTA ATT CAT TGA >TTHERM_00837980(protein)M N Y E I Q N Q E S Y Y L Y L S S T Y G A E F I E T K L S L H S N I R K L K L V L N T N D K E G I N Q L G L Q L T N L N H L L E L T I I I Q E E S C F N E N I L Q D F F Q Y F Q Q L K N L V K L E V N V A R Q S P F Q E Q R S S Y L S N A I Q N L V N L E S L I I N F E G E N N L S Q N G A S A I G Y C L R Y L K K L N N L N L Q I G Y D F I G K Q G C E K L A D G I A H L I N L Q Q L T I S I R E Y N L I E S G S I Q L G K S L E N L T N L S Y L K L N I E M D N Q I E S Q G A I A L A K G I S S L T N L N R L E L L I G Y N N N I G Q Q G A I S L G N A L I K L K S L D Y L E L I I S G G N E I Q F K G A Q G I A E G L K A L K N L K D L K L N I L G D N Q L G Q K G S T S I I K S L S Y L K N L E N L E F D I G E V D Y I E K E G A I Q L G K S I Q Q M K N L N N L N L W I H D C N D I Q Q G G A K S I G Q G L S H L S N L K F L N L N I F S V N Q I G P K G I Q A I A N G I K C S K N M E S L S L W I D H D N Q I G S Q G C I F I G E S L C H L K D L K T L N I D I G V Y S K V G K E G I I G L S Q C F K Y L N Q L Q D L N F S I K G Y N N L T Q E G F Q Q F S I N M K S L V N L K I L G L Y F G S R N Q I G G Q G M S Y L G Q Q L L H L Q N L N K F S L G L G E E N K L S E N S L K N F G E S F N H I N S L T H I D L D I Y K H N L K N N D F G N I G N A L S M C K K L Q F L K I K V D Q E H Q I T Q N N I K L F A N N L S Q N K T V I Q I K Y S L N L D R E D P D D Y G N Q D E E D E E I E D D L E E E N N E I L D E E N S L Q N D Q V K E E D E D I D K E G D D M K E D E N L S E N E G N Y Q K D D E E F D K E D L E N M D I Q E F Q Q D M S Y L G N Q N S Q S E I S N Q Q Q I Q D L D A F A K K L F I R K I K Q L V N L I H >TTHERM_00837980(gene)ATG AAT TAT GAA ATT TAA AAT TAA GAG AGT TAC TAT TTG TAT CTA TCA AGC ACA TAT GGA GCA GAG TTT ATT GAA ACT AAG CTT TCC TTA CAT AGC AAT ATT AGA AAA TTA AAA TTA GTA TTA AAT ACA AAT GAT AAG GAA GGT ATA AAT TAG TTA GGA TTG CAA CTT ACA AAT TTA AAT CAT TTA CTA GAA TTA ACC ATC ATT ATT TAA GAA GAG AGT TGC TTT AAT GAA AAC ATT TTA CAA GAT TTT TTT TAA TAT TTC TAA TAA CTG AAA AAT TTA GTC AAA TTG GAA GTA AAT GTT GCT AGA TAA AGC CCC TTT TAA GAA TAA AGA TCT TCA TAT TTA TCT AAC GCT ATT TAA AAT TTA GTA AAT TTA GAG AGT CTT ATT ATA AAT TTC GAA GGA GAA AAT AAC CTA TCT TAA AAT GGA GCT TCT GCT ATT GGA TAT TGC TTA AGA TAT TTG AAG AAA CTC AAT AAT TTA AAT TTA TAA ATT GGT TAT GAT TTT ATA GGA AAA TAA GGA TGC GAA AAA TTA GCT GAT GGA ATT GCT CAT CTT ATT AAT TTA CAA TAA TTG ACT ATT TCT ATT AGA GAG TAT AAT TTA ATA GAA AGT GGA TCT ATT TAG CTT GGA AAA AGC TTA GAG AAT TTA ACT AAT TTG AGC TAT TTA AAA CTA AAT ATA GAA ATG GAT AAC TAA ATA GAA TCT CAA GGT GCT ATA GCT TTA GCA AAA GGA ATT TCA AGT CTT ACT AAT TTG AAT CGT TTG GAA CTC TTA ATA GGT TAT AAT AAT AAT ATT GGC TAG TAG GGA GCA ATT AGC CTA GGA AAT GCG CTT ATA AAA TTG AAA AGT TTA GAC TAT CTT GAA CTA ATT ATT TCT GGT GGA AAT GAA ATT TAA TTC AAA GGT GCT TAG GGT ATT GCA GAA GGT TTA AAG GCT TTA AAA AAT CTA AAA GAT CTT AAA TTA AAT ATT CTA GGA GAT AAT TAA TTA GGA TAA AAA GGT TCT ACT TCG ATA ATC AAA TCA TTA TCT TAT CTT AAA AAT CTA GAA AAC TTA GAA TTT GAT ATT GGT GAA GTT GAT TAT ATT GAA AAA GAA GGG GCA ATA CAA CTT GGA AAG TCA ATT TAA CAA ATG AAA AAT TTA AAT AAT TTA AAT TTA TGG ATC CAT GAC TGT AAT GAT ATT TAG CAA GGA GGC GCT AAA TCA ATT GGC TAA GGA TTA TCT CAT CTT TCA AAT TTG AAA TTT CTT AAT TTG AAT ATC TTT TCT GTA AAT CAA ATA GGC CCT AAA GGT ATT CAA GCA ATA GCA AAT GGT ATA AAA TGT TCA AAA AAC ATG GAG AGT CTA TCT CTG TGG ATA GAT CAT GAT AAC TAA ATA GGT AGT TAA GGA TGT ATC TTT ATT GGA GAG TCA CTA TGT CAT TTA AAA GAT TTA AAA ACT TTA AAC ATT GAT ATT GGT GTT TAT TCA AAA GTA GGG AAA GAG GGA ATA ATA GGA TTA TCT CAG TGC TTT AAA TAT CTC AAT TAA TTA TAA GAC CTA AAT TTT AGC ATA AAA GGT TAT AAT AAT TTG ACA TAA GAA GGG TTT TAA TAA TTC TCA ATC AAT ATG AAA AGT TTA GTC AAT TTA AAA ATA TTA GGA TTA TAC TTT GGT AGC AGA AAT TAA ATA GGT GGG TAA GGA ATG AGT TAT TTA GGT CAA TAG CTT TTA CAT TTA TAA AAT TTA AAT AAG TTT TCA CTT GGT TTA GGA GAA GAA AAT AAA TTA TCT GAA AAT TCT CTA AAA AAT TTT GGT GAA AGT TTT AAT CAT ATA AAT AGT TTA ACT CAT ATT GAT TTA GAT ATT TAT AAA CAT AAT TTG AAA AAT AAT GAT TTC GGG AAT ATA GGA AAT GCT TTG AGT ATG TGC AAA AAA CTT TAA TTC CTA AAA ATA AAA GTA GAT TAA GAA CAT TAA ATA ACT TAA AAC AAC ATA AAA TTA TTT GCT AAT AAC CTC AGT TAG AAT AAA ACT GTC ATT TAA ATT AAA TAT TCT CTT AAT TTG GAT AGA GAG GAC CCA GAC GAT TAT GGA AAT TAA GAT GAA GAG GAT GAG GAA ATA GAA GAT GAT CTT GAA GAG GAA AAT AAT GAA ATT TTA GAT GAA GAG AAT AGC TTA TAG AAT GAC TAA GTA AAA GAA GAA GAT GAA GAT ATA GAC AAA GAA GGC GAT GAT ATG AAA GAA GAT GAA AAC TTA TCA GAA AAT GAA GGC AAT TAT CAA AAA GAT GAT GAA GAA TTT GAT AAA GAA GAT TTG GAA AAT ATG GAT ATA TAA GAA TTT TAA TAG GAT ATG AGT TAT TTA GGA AAC CAA AAC AGT CAA AGT GAG ATA TCA AAT TAA CAA TAA ATT TAG GAT TTA GAT GCT TTT GCT AAA AAA TTA TTT ATA AGA AAA ATA AAA TAA TTA GTT AAT TTA ATT CAT TGA