Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00624260

Standard Name

CDK16 (Cyclin-Dependent Kinase 16)

Aliases

PreTt07414 | 87.m00194 | 3814.m00898

Description

Protein kinase domain containing protein; sequence similarity to the CDKL protein kinase family

Genome Browser (Macronucleus)

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Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 11.1%

TetraMine Data

TTHERM_00624260

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_12009.29.997093137033517e-262protein kinase domain-containi
ng protein (601 aa)
OxytrichaContig11847.0.g486.001942730007306e-142Protein kinase domain
WormBaseWBGene000127799.996584278131743e-91status:Partially_confirmed U
niProt:Q9U2H1 protein_id:CAB
63367.1
DictyBaseDDB_G02886775.9981191891941984e-64cdk5 on chromosome: 5 position
1885785 to 1886770
Stentor CoeruleusSteCoe_63314.2960271311739114e-61
SGDYBL016W2.0008958828286524e-54FUS3 Mitogen-activated serine/
threonine protein kinase invol
ved in mating; phosphoactivate
d by Ste7p; substrates include
Ste12p, Far1p, Bni1p, Sst2p;
inhibits invasive growth durin
g mating by phosphorylating Te
c1p, promoting its degradation

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:16933976: Eisen JA, Coyne RS, Wu M, Wu D, Thiagarajan M, Wortman JR, Badger JH, Ren Q, Amedeo P, Jones KM, Tallon LJ, Delcher AL, Salzberg SL, Silva JC, Haas BJ, Majoros WH, Farzad M, Carlton JM, Smith RK, Garg J, Pearlman RE, Karrer KM, Sun L, Manning G, Elde NC, Turkewitz AP, Asai DJ, Wilkes DE, Wang Y, Cai H, Collins K, Stewart BA, Lee SR, Wilamowska K, Weinberg Z, Ruzzo WL, Wloga D, Gaertig J, Frankel J, Tsao CC, Gorovsky MA, Keeling PJ, Waller RF, Patron NJ, Cherry JM, Stover NA,
  2. Ref:SUPR000264

Sequences

>TTHERM_00624260(coding)
ATGAATAAATACGAAATATTAGGAGTCGTTGGAGAAGGTGCTTATGGTGTAGTCCTCAAG
TGTAGAAATCGCGAAACAAACGAAATTTTGGCTATAAAAAAATTTAAAGAAACTGAGGAT
GATGAATTAGTTCGCAAAAATATATAGAGAGAAGTAAAAATGTTAAAAACTCTTAAGCAC
AAAAATATAGTAGGCCTTGTCGAAGCGTTCAAGCGCAAAGGAAGAATATACTTGGTCTTT
GAGTATGTTGAAAAAAATTTATTAGAAGTCCTTGAAGAAAAGCCTAGCGGATTAGATCCT
GAATTCATTAGGAGAATTATATATTAGTTATTGAAAGCTCTTGATCACTGTCACAAACAT
AATATTATTCACAGAGATATTAAACCTGAGAATTTATTGGTAAATAGTGATGGAACTCTA
AAATTATGTGACTTTGGTTTTGCTAGGCATATGCCACCAAAATAAAATGAAATTTTAACA
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AGCTTTCCTGTAGATAATTGGGCTATTGCTTGTATTATGGGTGAATTAATAGATGGATAG
CCTTTATTCCCTGGTGAAAATGAAATTGACTAGCTATATTTGATTTAAAAATTATTAGGA
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AAAGCTTTAACATTTATGAAGGGACTTCTGAAAATGGATCCAAGAGAAAGAATGAATGTC
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GATCACAATAGTTAATCACAGCACAATAAATCCATAGAGAAAAACCAAGAAAACTAAAAT
ATCCGTTCTTATGGTTCTAAAAATAATATTGATGAGAAAAAGAATGAAGATCAAGATGAG
AGAGATTCTTAATTTGAGAAGAAAAGCCAAACCATCCACCACGAATAAAATTAAAAAAAC
GGAATATATGCTAAGCTCAACAAAGAAAATAATAATTAATCTTAAAAGATACTTGGGAAG
AACTATTTTTCTTAAAACAAACTACCACCTCAATATTTACAAAACTCTAAGATGATGCAG
AACACCGTTTATAATTACAATATTGATAAAGATGATTCATCCTTTACTGAAGCGAATGGA
AATTCTAAAAGAAATAGCAACTAGTTTGAAAACACTAAGAATAGACTCTTGTATGACAGC
ATGAGCGTTTAAAAACCACCTAAAATGGGTCCAGCTGGCTCTTCCCTCAAAAAAAATCAA
ATTGATCCAAAGAGCAGTTATAACTCAACTATTGGAATGAGCACATTAGGGATATCAGGT
GGCGCTTTGCCTACTATTAATAATCACAATAAAAAATTTGCTACTAATAATGAAAAGGGA
GGGTCACCTTCATCTCATCATTCAAAGATGTCATTTGGTAGTACATAAAATTACAATAAA
ATGTATTTCTAATCACCAACAAATTAAATAAATGTAAGCACAGGAGCTGCAGGAGCTAAT
GGCATGACGGCATCAAAACTCCTAAATGATATAAATATGCAAAAAATACAAAACTTGAAT
GTCATTTATAACACTAATACATATAACTACAATAATGTTTAACCTGTGAACTAAGTAGGA
AATGCTTTTATTAACTAAAATTCTTAATCTAAAAAGAGTTTTGGAACTGGAACAATGTAT
AAAAAGAAGAATTATTGA


>TTHERM_00624260(protein)
MNKYEILGVVGEGAYGVVLKCRNRETNEILAIKKFKETEDDELVRKNIQREVKMLKTLKH
KNIVGLVEAFKRKGRIYLVFEYVEKNLLEVLEEKPSGLDPEFIRRIIYQLLKALDHCHKH
NIIHRDIKPENLLVNSDGTLKLCDFGFARHMPPKQNEILTDYVATRWYRSPELLLSDPGY
SFPVDNWAIACIMGELIDGQPLFPGENEIDQLYLIQKLLGPLTPDQKEMFIKNPRYVGLK
FPEIPKPETIERRYLGKLSKKALTFMKGLLKMDPRERMNVQEAMAHPLFDGIRELYDDDN
DHNSQSQHNKSIEKNQENQNIRSYGSKNNIDEKKNEDQDERDSQFEKKSQTIHHEQNQKN
GIYAKLNKENNNQSQKILGKNYFSQNKLPPQYLQNSKMMQNTVYNYNIDKDDSSFTEANG
NSKRNSNQFENTKNRLLYDSMSVQKPPKMGPAGSSLKKNQIDPKSSYNSTIGMSTLGISG
GALPTINNHNKKFATNNEKGGSPSSHHSKMSFGSTQNYNKMYFQSPTNQINVSTGAAGAN
GMTASKLLNDINMQKIQNLNVIYNTNTYNYNNVQPVNQVGNAFINQNSQSKKSFGTGTMY
KKKNY


>TTHERM_00624260(gene)
ATGAATAAATACGAAATATTAGGAGTCGTTGGAGAAGGTGCTTATGGTGTAGTCCTCAAG
TGTAGAAATCGCGAAACAAACGAAATTTGTAAGTTTTTATGAGAACAAATAGTTTATGCT
TTATTTAAAAGAACTGGTTTTTTACATATTTTGGCACTAAACATTAATAACATTTTATTT
AGTATCCTTTGTTTAAATATTTTTATAATAATCGTAGTGGCTATAAAAAAATTTAAAGAA
ACTGAGGATGATGAATTAGTTCGCAAAAATATATAGAGAGAAGTAAAAATGTTAAAAACT
CTTAAGCACAAAAATATAGTAGGCCTTGTCGAAGCGTTCAAGCGGTATTATTAATTACTT
TAAATAATTACTTCAAATACAAAGCTATTCAATAAGTCAAAAGATAAAAAACTAGCAAAG
CTAAAAAAATACATTTATGCTAAAAACCCTTGTTTACAAATGTCTTTATAAAAATTTTAA
AAGGCATGTTTCGAAAGGCTAAATAAATTTATTGAGCTAATAAATGCTTATTTTTGTTAT
TTTCAAGTTTTCTACTATCAGAATACTAAATAGCTTTTAATTTACTAATGAAAAATCAAT
TCTATTAGTGATGATTCAATAAAATAAATTGATATATGAATGAGTTGAATCTATAATAAT
TATTCAATTTTAAACAACAGCAAAGGAAGAATATACTTGGTCTTTGAGTATGTTGAAAAA
AATTTATTAGAAGTCCTTGAAGAAAAGCCTAGCGGATTAGATGTAAACAAAATTTGTCTT
TATTTTATCATTAAAAAAATTATGAAATTAAAGAAATCGCAAAGTATAAAGTTACTTTTT
TTTCAAAAGCTATTTAAAGTAAAATGTATAAACATGTATAACGCATTTAATTTAAATAAG
ATACTGATTATTCTTTTAGGAGTTAATTTTGATAAATAAATATATAGTACAATCTATAAA
ATTTTTTAGTTATTTAATTTATTTTTTAAATAAGTAATTTAATAAAAGTAGCTTCATAGT
ATAGTAAAATAAAAAATAATAGAAATTTTAATATAATTCATTATAAAATTTTATTTAAAT
TTATTTACATTAATATATTATTTTTAAATAGCCTGAATTCATTAGGAGAATTATATATTA
GTTATTGAAAGCTCTTGATCACTGTCACAAACATAATATTATTCACAGAGATATTAAACC
TGAGAATTTATTGGTAAATAGTGATGGAACTCTAAAATTATGTGACTTTGGTTTTGCTAG
GCATATGCCACCAAAATAAAATGAAATTTTAACAGATTATGTAGCTACAAGATGGTACAG
ATCTCCTGAATTGCTATTAAGTGATCCTGGTTACAGCTTTCCTGTAGATAATTGGGCTAT
TGCTTGTATTATGGGTGAATTAATAGATGGATAGCCTTTATTCCCTGGTGAAAATGAAAT
TGACTAGCTATATTTGATTTAAAAATTATTAGGACCACTTACACCAGACTAAAAGGAAAT
GTTTATAAAAAATCCAAGGTATGTAGGATTAAAATTTCCTGAGATTCCCAAGCCTGAAAC
AATCGAAAGGAGGTATCTAGGAAAATTATCTAAAAAAGCTTTAACATTTATGAAGGGACT
TCTGAAAATGGATCCAAGAGAAAGAATGAATGTCTAAGAAGCTATGGCTCACCCATTATT
TGATGGCATAAGAGAATTATATGATGATGATAATGATCACAATAGTTAATCACAGCACAA
TAAATCCATAGAGAAAAACCAAGAAAACTAAAATATCCGTTCTTATGGTTCTAAAAATAA
TATTGAGTAAAATGACTGAATAAATAAATCAAATAATTCATAATTTTTAATTAAAAAAGT
GAGAAAAAGAATGAAGATCAAGATGAGAGAGATTCTTAATTTGAGAAGAAAGTAAAATCA
TTAATACATTATATTTATCTTTGAATATTTTATATTTATATAACTTACTTAGAGCCAAAC
CATCCACCACGAATAAAATTAAAAAAACGGAATATATGCTAAGCTCAACAAAGAAAATAA
TAATTAATCTTAAAAGGTATATTTTACAAATTTTAGTGCTAAAGTTAAAAATATTAATTT
TATTAGATACTTGGGAAGAACTATTTTTCTTAAAACAAACTACCACCTCAATATTTACAA
AACTCTAAGATGATGCAGAACACCGTTTATAATTACAATATTGATAAAGATGATTCATCC
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AATAATTTAATTAATATTTATTTTGAATAACTTACAGAATAGCAACTAGTTTGAAAACAC
TAAGAATAGACTCTTGTATGACAGCATGAGCGTTTAAAAACCACCTAAAATGGGTCCAGC
TGGCTCTTCCCTCAAAAAAAATCAAGTAATTTCATATGTTTAATTTTTTTATTAAAAATT
TTTACCTTTCCAAAGTAAATAAATTAAATCAATAAAACTTTTTACCATTCCATCATTGGA
GGTCATGGTAGTTAAGGAGGACTTTAAATCTCTGATAGAGTAAAAAAAATCATCATTTAT
AAAATTGTGATTGCTGTTTTTAAATTATTTATCTTTTATAATTTGATAATTTAGATTGAT
CCAAAGAGCAGTTATAACTCAACTATTGGAATGAGCACATTAGGGATATCAGGTGGCGCT
TTGCCTACTATTAATAATCACAATAAAAAATTTGCTACTAATAATGAAAAGGTAATAAAT
TTTGAACATTTTTTTAATATTTAATGTTGATTTGATAAGAAAATTTTAATTTTTAACTCT
TCACTTAACAGGGAGGGTCACCTTCATCTCATCATTCAAAGATGTCATTTGGTAGTACAT
AAAATTACAATAAAATGTATTTCTAATCACCAACAAATTAAGTATTATAAATTTAACATT
TTTAACAAAAGAAATTGTTTTTTTAAAATTTTATTAATTTTAAATCAAAAGATAAATGTA
AGCACAGGAGCTGCAGGAGCTAATGGCATGACGGCATCAAAACTCCTAAATGATATAAAT
ATGCAAAAAATACAAAACTTGAATGTCATTTATAACACTAATACATATAACTACAATAAT
GTTTAACCTGTGAACTAAGTAGGAAATGCTTTTATTAACTAAAATTCTTAATCTAAAAAG
AGTTTTGGAACTGGAACAATGTATAAAAAGAAGAATTATTGA