Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00327340

Standard Name

CDC16 (Cell Division Cycle 16)

Aliases

PreTt30237 | 33.m00249 | 3705.m00077

Description

CDC16 tetratricopeptide repeat protein; TPR domain containing protein; subunit of anaphase promoting complex

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF08238 ) Sel1 repeat
• ( PF00515 ) tetratricopeptide repeat
• ( PF07719 ) tetratricopeptide repeat
• ( PF07720 ) Tetratricopeptide repeat
• ( PF07721 ) Tetratricopeptide repeat
• ( TIGR00213 ) D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase
• ( PF01239 ) Protein prenyltransferase alpha subunit repeat
• ( TIGR02521 ) type IV pilus biogenesis/stability protein
• ( TIGR00990 ) mitochondrial precursor proteins import receptor
• ( TIGR02552 ) type III secretion low calcium

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.3%

TetraMine Data

TTHERM_00327340

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_08574.1	9.997093137033517e-262	TPR Domain containing protein (867 aa)
Oxytricha	Contig17304.0.g24	6.99920276797163e-121	TPR repeat
SGD	YKL022C	6.998316056150599e-49	CDC16 Subunit of the anaphase- promoting complex/cyclosome (A PC/C), which is a ubiquitin-pr otein ligase required for degr adation of anaphase inhibitors , including mitotic cyclins, d uring the metaphase/anaphase t ransition; required for sporul ation
DictyBase	DDB_G0286233	3.000555717977434e-27	anapc6 on chromosome: 4 positi on 4222260 to 4225138
WormBase	WBGene00001281	1.9994498063102785e-22	locus:emb-27 status:Confirme d UniProt:G5EG38 protein_i d:CAA88313.1
Stentor Coeruleus	SteCoe_10424	0.00000001522997974471263

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00327340(coding)
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CAATATCCATAGTAAAGTTAATCAGTTAATTCGTAGTAGTCTTCGATTTTTTCAGGTTTG
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AAAGCAAAAAATTGTCATGCTAAGTATGATATTTAAAAAGCCTATGATATATGCATAAAA
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TATTTTTCTTTGGCATACACTTATCATATATCAAACCAATTGAATAAAGCTATAGCTTAT
TATCATAAATCTTTATATTACAAGCATGAAAACCAATTTGCTTTTGACATGCTTGATAGA
TGCCTTAAAGATGCTTCAGAGTATCCTTGGGAAAGTGTATACGAAGCTAAAAATGAATGA

>TTHERM_00327340(protein)
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YHKSLYYKHENQFAFDMLDRCLKDASEYPWESVYEAKNE

>TTHERM_00327340(gene)
ATGTCATAATCTAGCGGATAGAAACCAACAAGCATAGGATTATAGCAAGGTTAGCAGTAG
CAATATCCATAGTAAAGTTAATCAGTTAATTCGTAGTAGTCTTCGATTTTTTCAGGTTTG
CAAGCAGGATCAAGCGCTTCTCCTTCAATAAATAATTTCTTTACTTCTTCAAACATTCAT
AACATAGGATAAATCTAAAATGCAGGTACTTAGTAATAAGCTCAAGTCCAACAAAGTTCA
AATAACTTAATTGGTACGAGTTAAATTCCTAATACAATTCCTGCATCTTAAGTTCCTATT
AATCGCTTTGGGAGAGGCAGTTTCCGTCGTGGGGACAAAGAGTCAAAAACGTATTTGCAA
GAAATTTATGGACCATACTATTTGAATTGTGAATAAAATATTGAGGAAATAAAGGCAACA
GGAAGTGTTTTAGGAAATTCAGGTATTTCTGTCAATTATGGATAGCAAATCTAGTAAAAA
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AATAAGTCTATGCATTCATGGACAGACGCAATTTTTTATGCTGATAAATTAATCACCTTA
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TATAAAAAGGTCCATTCTCTTTTTGCTAAATATAAATTAATTAGCTATAATTCTCATTTT
ACGATACTTGCTGCTAAAGCATTATACAAAAATAAATAGTATGAATAATGCTTAAATTTA
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AATTACTAAGGCTCAACTTCTGCTTAGGGTATTCCTGTTGGATCTAACTTAAATAATCCA
AATTAAGGTTTAGGTGCAAGTACTTTTGGATAGCAATAAGTTGGAGGCCAGCAATTTAAC
AATATTCATCAATAGTTTGGACATAATTTGCATCATAGCCAGAATACTTTCCTTCACTAA
CAATAATAAAATCAGTCATAGCAATAATAGATGAAAAATTAGAATAAGTTAGAAGCTTAA
AAGCATCTATTAAAGGGATTGTGTTATGAAGCAAGCGAAAATAAATAAAACGCAGTTAGT
TCTTACATGGAATGCCTAAAGCGCGATCCAACTTGTCATGAAGCTTTCAAAAGAATGATA
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CCTGAAGATATTTGGATAAAATAATATTATATAGCTAGAATCAGTGAAGATACTGCTTGT
AAATTAGATATTTAAAAAGGAATGGATGAAGAGTTACCATCATCAGTAATAGGAAGCGAT
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GGAAATGTCAACAATGACCCCAAAGCTTAAATTAGAATTTAAAATTTATTGGAAAGATTA
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AAAGCAAAAAATTGTCATGCTAAGTATGATATTTAAAAAGCCTATGATATATGCATAAAA
GCAATTAAAATTGATCCATTATATTTTGACATAATACCTGTATATTGCGCTTGTTTACTT
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TAATAGCTCAATATTTAAGAATAGCTATGAAAACTAATTCATAAAAATTTTTTTAAAGCT
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CTTAAGAACTAATAACCTTAAAACAGCTCTACTTTCCTTCTAATATGCAAAAGAAATCAA
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GAAAATATCTTATTTTTTCTTTTAAATTAAAGGTGTAATCTATTTTAAGTAGAAAGCCTA
TGAAGAAGCAAAGCAAAAGTACTTGCAAGCTATGAATTTGTGTACTGAAGCAACTAATTC
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ATCTGCTATTTAATATTATGAAAGATGCATTCAGTTAGAGCCTAAAAATTATCAAACATA
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