Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00149340
Standard Name
CCT2 (Chaperonin Containing TCP-1 ortholog 2)
Aliases
PreTt20693 | 12.m00367 | 3700.m00089 | APF1
Description
CCT2 TCP-1 (CTT or eukaryotic type II) chaperonin family beta subunit; TCP-1/cpn60 chaperonin family protein; involved in tertiary and quaternary structure stabilization
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
Molecular Function Biological Process
Domains
( TIGR02348 ) chaperonin GroL
( PF00118 ) TCP-1/cpn60 chaperonin family
( TIGR02345 ) T-complex protein 1, eta subunit
( TIGR02341 ) T-complex protein 1, beta subunit
( TIGR02347 ) T-complex protein 1, zeta subunit
( TIGR02340 ) T-complex protein 1, alpha subunit
( TIGR02342 ) T-complex protein 1, delta subunit
( TIGR02344 ) T-complex protein 1, gamma subunit
( TIGR02346 ) T-complex protein 1, theta subunit
( TIGR02343 ) T-complex protein 1, epsilon subunit
( TIGR02339 ) thermosome, various subunits, archaeal
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 11.3%
TetraMine Data
TTHERM_00149340
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Stentor Coeruleus SteCoe_808 0
WormBase WBGene00000378 9.997093137033517e-262 locus:cct-2 T-complex protei
n 1 subunit beta status:Conf
irmed UniProt:P47207 prote
in_id:CAA92697.1
Tetrahymena borealis EI9_04994.1 9.997093137033517e-262 TCP-1/cpn60 chaperonin family
protein (539 aa)
DictyBase DDB_G0291358 9.997093137033517e-262 cct2 on chromosome: 6 position
177191 to 179304
Oxytricha Contig11549.0.g94 9.997093137033517e-262 TCP-1/cpn60 chaperonin family
SGD YIL142W 9.997093137033517e-262 CCT2 Subunit beta of the cytos
olic chaperonin Cct ring compl
ex, related to Tcp1p, required
for the assembly of actin and
tubulins in vivo
General Information
Paragraph No Gene Name Paragraph Text 42 CCT2 APF1 (Assistant Protein Folder) is homologous with members of the TCP-1/cpn60 chaperonin family and is found in abundance in prokaryotes, chloroplasts and mitochondria. It contains one domain (E-value= 7.8x10-136) that is possibly used to stabilize and protect disassembled polypeptides under heat shock conditions. In addition to its role as a heat shock protein, they may also function to assist in amino acid chain folding into their three-dimensional protein structures. This paragraph was provided by Hannah Chia and Jesse Honig, undergraduates at the Keck Science Department of Claremont McKenna, Pitzer, and Scripps Colleges.
Associated Literature
Ref:SUPR000170 Ref:SUPR000226
Sequences
>TTHERM_00149340(coding)ATG AGC ATG GAT ATG GTT GGT AAT GTC TTG CCT CAA GTT CTT AGG AAC GAG GCC TCT GAA GAA AAG GGT GAA ATG GCT AGA CTT TCA TCT TTT GTC GGA GCT ATT GCT GTT GCA GAT TTA GTT AAA ACC ACT TTA GGT CCT AAG GGT ATG GAT AAA ATT CTT AGA CCT ACT GGC GCT GGT CCT AAG GCT GAC ACT ATC ACT GTC ACT AAT GAT GGT GCT ACC ATT TTG AGA TCT ATG TAT ATT GAT AAT CCC GCT GCT AAG ATT TTA ATT GAA ATT TCT AAG ACT TAA GAC GAA GAA GTT GGT GAT GGT ACC ACT ACT GTT GCT GTC TTA GCT GGT GAA TTA TTA AGA GAA GGT GAA AAA TTG GTT AAC CAA AAG ATT CAC CCT TAA CAC ATC ATC AAT GGT TGG AGA AAG GCT AGA GAC TGT GCT CAA CAC ACT CTT AAT TTA ATT GCT AGA GAT AAC TCC AAG AAT GAA GAA AAG TTC AGA GAA GAT TTA CTT AAC ATT GCA AGA ACT ACT CTT TCT TCC AAG CTT TTG ACT TAA GAC AAG GAA CAC TTT GCT AGA TTA GCT GTC GAA GCT GTT CTC AGA TTA AGA GGT TCT GGT AAT CTT GAT CAA ATC TAA ATC ATT AAA AAG TCT GGT GGT TCT ATC AGA GAT TCT TAC CTT GCT GAC GGT CTT ATT TTA GAA AAG TCC ATT ACT GTC GGT TGC CCC AAG AGA CTT GAA AAT GCA AAG ATT ATG GTT GCT AAC ACT CCT ATG GAT TAC GAC AAG ATT AAG ATT TAC GGT ACC AAG GTT AAA GTA GAA AGC ATG GAT AAA ATT GCT GAA ATT GAA ACT GCT GAA AAG GAA AAA ATG AAG GCT AAG GTC GAA AAG ATT CTT GCT TAC GAA CCC ACT GTC TTC ATT AAC AGA TAA TTG ATT TAT AAC TAT CCT GAA TAA ATG TTA GCT GAT AAA GGT TTG ATG GTT ATT GAA CAC GCT GAT TTC GAT GGT ATT GAA AGA CTT TCC GCT GCT ACC GGT GCT GAA ATT CTC TCT ACT TTC GAT AAT CCT GAA AGA GCT GAA AAG ATT ATG GGT AGA TGC AAA CTT ATT GAA GAA ATT ATT ATT GGT GAA GAC AAG TTC ATT CAA TTC TCT GGA TGT GAA AAG GGT GAA GCT TGC ACT ATT GTC TTG AGA GGT GCT TCT ACT CAC ATT ATT GAC GAA GCT GAT AGA TCT CTC CAC GAT GCA CTT TGT GTT CTT ATT ACT ACA GTT AAG AAC TCT AAG GTT GTC TAT GGT GGT GGT AAC TCT GAA ATC CAA ATG GCT CTT GCT GTT GAA AAG CTT ACT TAA TCT GTT AAG GGC AAA TAA GCA CTC GCC ATT GAA GCA TAT GCT AGA GCT TTA AGA TAA TTA CCT ACT ATT ATA GCT GAT AAT GGT GGT TAT GAT GCT CCT GAA TTA GTT TAA GCT TTG AAG GTC GAA ATC GCT GAA GGT TCT ACT TCC GCT GGT CTT GAT ATG ATG AAC GGT GAA GTT GCT GAT ATG GAA AAG CTC GGT GTT ACT GAA TGT TTA AGA GTT AAG GAA TAG GCT TTA TTA TCT GCT TCA GAA GCT GCT GAA CTT ATT CTT AGA GTT GAT AGC ATT ATC AGA TGT GCT CCT AGA AGA AGA GAT AGA ATG TGA >TTHERM_00149340(protein)M S M D M V G N V L P Q V L R N E A S E E K G E M A R L S S F V G A I A V A D L V K T T L G P K G M D K I L R P T G A G P K A D T I T V T N D G A T I L R S M Y I D N P A A K I L I E I S K T Q D E E V G D G T T T V A V L A G E L L R E G E K L V N Q K I H P Q H I I N G W R K A R D C A Q H T L N L I A R D N S K N E E K F R E D L L N I A R T T L S S K L L T Q D K E H F A R L A V E A V L R L R G S G N L D Q I Q I I K K S G G S I R D S Y L A D G L I L E K S I T V G C P K R L E N A K I M V A N T P M D Y D K I K I Y G T K V K V E S M D K I A E I E T A E K E K M K A K V E K I L A Y E P T V F I N R Q L I Y N Y P E Q M L A D K G L M V I E H A D F D G I E R L S A A T G A E I L S T F D N P E R A E K I M G R C K L I E E I I I G E D K F I Q F S G C E K G E A C T I V L R G A S T H I I D E A D R S L H D A L C V L I T T V K N S K V V Y G G G N S E I Q M A L A V E K L T Q S V K G K Q A L A I E A Y A R A L R Q L P T I I A D N G G Y D A P E L V Q A L K V E I A E G S T S A G L D M M N G E V A D M E K L G V T E C L R V K E Q A L L S A S E A A E L I L R V D S I I R C A P R R R D R M >TTHERM_00149340(gene)ATG AGC ATG GAT ATG GTT GGT GTA AGA TTT TCA AAA ATT CAC AAT AAG TAA AAG CTA ACT AAC TAT ATT TTT TAT AAT TAA ATT AAC AGA ATG TCT TGC CTC AAG TTC TTA GGA ACG AGG CCT CTG AAG AAA AGG GTG AAA TGG CTA GAC TTG TAA TTT TTA TTT TTG CTT TTA TCC TTA TCA ATT AAT TAA TTA TGT TAA TTT ACA TTC TAC TTC AAA AAT TAA CTT TAA TAA ATT TTA AAT CTA GTC ATC TTT TGT CGG AGC TAT TGC TGT TGC AGA TTT AGT TAA AAC CAC TTT AGG TCC TAA GGG TAT GGT AAT GAA TTA ATG CTT TTC GAT TTA AGC TAG TTT GAT TCT AAT TTT TTT TTA TTA CTC TAA TAG GAT AAA ATT CTT AGA CCT ACT GGC GCT GGT CCT AAG GCT GAC ACT ATC ACT GTC ACT AAT GAT GGT GCT ACC ATT TTG AGA TCT ATG TAT ATT GAT AAT CCC GCT GCT AAG ATT TTA ATT GGT AAT TTA CAT ATT TTT ATT GCA ACA GAA AGT CTA TAG CTA ATT TGC TTT TCA GTT TAT AAA CAT GCC TTA ATC AAG TTT GTT TAG CGA GTT ATT AAA TAA ATG CAT TAA CAT TGC AAA GGC GAT TAA AAA TAA AAT TTT AAG GAT TAA AGT AGC ACG CAT CAG AAA ATA GGA TTA TCT ATT TAA AAG TTT TAA GTT TAT TTT CCA GTA TGA TAA GTG AAG AAT TAG TGA AAT GTT TTA AAG TTA GTT TTC AAA AAT CTA ACA ATA TAA TTG AGA ATA TCA TAA AGA AAT TAT TCT AAA CAC CTA TAT TCA ACA CAT TAT ATA AAT TGG TTG AGA TAA CTT ATC TTT GAG CAC TAC ACT ATA CTT CCT TAA CTA CCA TAC TGA AAA TAA AAC AAG CAC ATA ATG AAT ATC TTT CTT TGT TTG CAT TTT AGC ATA GTT TTA AAA AAA TTT AAT TCT AAT AAA AAT AAA TAA ATG GTA TCT AAA AAA TTT ATT GAT AAT AAT TAG AAA TTT CTA AGA CTT AAG ACG AAG AAG TTG GTG ATG GTA CCA CTA CTG TTG CTG TCT TAG CTG GTG AAT TAT TAA GAG AAG GTG AAA AAT TGG TTA ACC AAA AGA TTC ACC CTT AAC ACA TCA TCA ATG GTT GGA GAA AGG CTA GAG ACT GTG CTC AAC ACA CTC TTA ATT TAA TTG CTA GAG ATA ACT CCA AGA ATG AAG AAA AGT TCA GAG AAG ATT TAC TTA ACA TTG CAA GAA CTA CTC TTT CTT CCA AGC TTT TGA CTT AAG ACA AGG AAC ACT TTG CTA GAT TAG CTG TCG AAG CTG TTC TCA GAT TAA GAG GTT CTG GTA ATC TTG ATC AAA TCT AAA TCA TTA AAA AGT CTG GTG GTT CTA TCA GAG ATT CTT ACC TTG CTG ACG GTC TTA TTT TAG AAA AGT CCA TTA CTG TCG GTT GCC CCA AGA GAC TTG AAA ATG CAA AGT AAT TAT TTT ATT TAT TCA TTC ATT CAT TCT TAC ATA TAT TCA ACA AAG GAT ATA TAG CTT TAT CTT GAA TTT ATT CAA ATT CTA ATC AAT AAA ATT ATT ATT AAA AAA ATA ACT TAT TTA TTT ATT TAA CTT AAT CTC AAA AGG ATT ATG GTT GCT AAC ACT CCT ATG GAT TAC GAC AAG ATT AAG ATT TAC GGT ACC AAG GTT AAA GTA GAA AGC ATG GAT AAA ATT GCT GAA ATT GAA ACT GCT GAA AAG GAA AAA ATG AAG GCT AAG GTC GAA AAG ATT CTT GCT TAC GAA CCC ACT GTC TTC ATT AAC AGA TAA TTG ATT TAT AAC TAT CCT GAA TAA ATG TTA GCT GAT AAA GGT TTG ATG GTT ATT GAA CAC GCT GAT TTC GAT GGT ATT GAA AGA CTT TCC GCT GCT ACC GGT GCT GAA ATT CTC TCT ACT TTC GAT AAT CCT GAA AGA GCT GAA AAG ATT ATG GGT AGA TGC AAA CTT ATT GAA GAA ATT ATT ATT GGT GAA GAC AAG TTC ATT CAA TTC TCT GGA TGT GAA AAG GGT GAA GCT TGC ACT ATT GTC TTG AGA GGT GCT TCT ACT CAC ATT ATT GAC GAA GCT GAT AGA TCT CTC CAC GAT GCA CTT TGT GTT CTT ATT ACT ACA GTT AAG AAC TCT AAG GTT GTC TAT GGT GGT GGT AAC TCT GAA ATC CAA ATG GCT CTT GCT GTT GAA AAG CTT ACT TAA TCT GTT AAG GGC AAA TAA GTA ATA AAT TTT TTT ATT TTT ATA TAT TTT AAT AAT ATA ATT CTG CTT ATT AAA ATA CTT TTG TTT CCA AGT GAT TTT GTA TTT CAA TAA CTT TTA TTT TAT AAT TTA GGC ACT CGC CAT TGA AGC ATA TGC TAG AGC TTT AAG ATA ATT ACC TAC TAT TAT AGC TGA TAA TGG TGG TTA TGA TGC TCC TGA ATT AGT TTA AGC TTT GAA GGT CGA AAT CGC TGA AGG TTC TAC TTC CGC TGG TCT TGA TAT GAT GAA CGG TGA AGT TGC TGA TAT GGA AAA GCT CGG TGT TAC TGT AAA AAT TTT TAT TTA AAA AAT TAA TAT TTA TCT AAA TTA TTT ATT TTA AAA TCT AAA GGA ATG TTT AAG AGT TAA GGA ATA GGC TTT ATT ATC TGC TTC AGA AGC TGC TGA ACT TAT TCT TAG AGT TGA TAG CAT TAT CAG ATG TGC TCC TAG AAG AAG AGA TAG AAT GTG A