Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00715810

Standard Name

Brop-1 (Bromodomain containing protein 1)

Aliases

PreTt19055 | 113.m00094 | 3673.m00018

Description

hypothetical protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF06451 ) Moricin
• ( TIGR01612 ) rhoptry protein
• ( PF05316 ) Mitochondrial ribosomal protein (VAR1)
• ( TIGR00156 ) conserved hypothetical protein TIGR00156

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.7%

TetraMine Data

TTHERM_00715810

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_16850.1	9.997093137033517e-262	hypothetical protein (1370 aa)
Oxytricha	Contig18584.0.g108	1.999598840915195e-17	Bromodomain
DictyBase	DDB_G0270170	0.0000000000000700196834671948	DDB_G0270170 on chromosome: 1 position 4360881 to 4366105
WormBase	WBGene00022473	0.000000000003001226732525078	locus:bet-1 status:Partially _confirmed UniProt:Q95Y80 protein_id:CCD68309.1
SGD	YDL070W	0.00000000030007160092483236	BDF2 Protein involved in trans cription initiation at TATA-co ntaining promoters; associates with the basal transcription factor TFIID; contains two bro modomains; corresponds to the C-terminal region of mammalian TAF1; redundant with Bdf1p

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:29523178: Saettone A, Garg J, Lambert JP, Nabeel-Shah S, Ponce M, Burtch A, Thuppu Mudalige C, Gingras AC, Pearlman RE, Fillingham J (2018) The bromodomain-containing protein Ibd1 links multiple chromatin-related protein complexes to highly expressed genes in Tetrahymena thermophila. Epigenetics & chromatin 11(1):10

Sequences

>TTHERM_00715810(coding)
ATGTCAAAGAAAATAGTGAAAGGAGGAGGTAGTAACACAGCAATTAAGAATACATCAAAA
CCTCTGGAAGAGAGTATTTTAGATATTATAAATGACATTAGCAAGCGTTAGTATTCGTTA
GATTTTAGAGAACCTGTCGATGTAAAAGCATTAGGATTGAGCGATTATTATGACATTGTT
AAAAAGCCAATGGACATATCCACTCTCAAAAATAATTTTTTGGAGGGTGTTTATAAGACA
ATAAAAGAAGTATGGGAAGATTTTGATTTAATCGTGAATAACTGCAAGGCTTATAATAGA
ATTCCAGACCACCCAATAAACCAAAAAGCTGATCAAATGAAAAGCCGTGTAGATAAAAAT
TTTTAAAAGTTATTAGAAGATTATAAGGCTCTAGGAGTTGATACAGATGGATACTAAATA
CAAATAGATTTAGATGATCTAAAGGCAAAAGAAGAAAAAAAAAGGAAGATTAAGTTAGAT
GGACTGGATGAAAAAAATATACTAATTGGCGGTGACAAAAGACTAAATCTTATCCCTGGT
TCATTAAATGAAAGAAAATTTTTCGAACTCTCAAATTAAGAATTATAGATGATGTAGGCA
GGAAAAAATATACAAATGTTGCCTCTCAACTAACCTTTGTAACAAGAGGATCCTGTGTTC
TAGCCAACGTCTTTGAAAATATCCTTAAACGCACCAAACTTAAGTTTGAATTTGAGTAAT
TCCACAATAACTGGCGAATAACCTACTCCAACTAATAATTAAGTTGGGATGAAATAACCT
AGAATAACTGGAGACAATACTTAAAAAGTAAAGAAATAAAAAGACTATTCAGCCAAAATA
TAAGAACTGCAAACTCTGCTTGCCTAACTCAAGCTTGAGCTTGAAGTTTAAACAAAAAAA
AAGTCTGATGTAGAAAAATAAAGAATCCTATGTAAAAATGTATACATTCTTTCAAAAAAA
TAAAGAAGAGGAGTCCATCAACTTGTTTAACAATTTGAAACAGAAGAAAATACCTTAATT
AATCCTGAAGGCACATTGAATAATTTTTCAACTCAAAGTAATCTAAATGGGAGTGAACAT
ATAAATGCTTAAGACATAAATGATGCAGCTACAAGTGGTACGTCCTTAAAAACCCCTTAA
AAAAGAGAAGATAATGGAAATCTTGATGATTAAACAGCTAAAAAAATGGAAATAGAAAAT
AAAGAAATATAGAAAAGTTAGGATCAAGAAGGTCGCTATAATGATGATGACGATGATGAT
AATGATATTATCATTAAAAAGAAAAGTAACTTTATTGACGATCTATCTCTAAAGTAAAAT
GAATCTACTTCTTAGATAGGATCTAATAAGATAAAAATTCCTACTTCTTAAACACTCAAC
AAGGAGGCCAACTCATCAACACAACTAAACGATTCGAAGATATCATTGAAATAGTCTCAA
ATAGGCCAAAAATCAAATAATGATTCATTCTCAACTCCAACAAAATAATAACTATTAAAC
AGCTCCAATTTATCATCTGAAAAAATTAAATAGAGTAGCAAAACTAACAATTTAAATGCT
TCAGAATCTAAATTTTAAAGTAATACAAATGACGGTGAAGAGAGTGAAGAAGAATTTGTA
CCTTAATCGCTAAATACTTCTAAATAGACTCCATCTGATTCTTTGGCTACACCATAATAA
ACTAATTCTATTAAACTACATGGACTCAAACCTACTAGCAGCACTGCTAATTCTGCCCAT
TTAAAGCATAAATTGCATGCTTCTGCTAGTGGAGATAAAATTTAAATTAAAAAGCCTACA
GATCTTAATAGTTCTCTACGAAAGGAAGGAGTCACACCAGAAAAAATTTTAAGCTAAGCA
AAAAAAGATTTCACTCCTGAAAAAAGTGGAAGCTCTGGTAAGCAACTTGCTAATTAATAG
GCAAAATAATTAGGCAATGGAAATAATCCTTAAAAAGTAAGACCAAACGGTCATTTAAAT
GGTTAAACAAATAGCTAAAGCAATTTATCTCCTTAGTCCTAGGAGCTTAAAAAAAAATTA
AATGCCAACACTCCAACTAAATCAGCTCTTTCTTAAGGAAAATCTACAATGAGTGGCAAT
GTCTTGCAAAAAAAGAATCCTTCCTCCGATAGTATTATAAAAGTGAAGATAGGAGGAGAA
TCTATATAAAAAAGTGTGTAAGATCTAAATGCAAATAAAATTAAAAGGCCAGAAGACGAA
ATAAAAATAAAGCTAAAAGATTCAACATTCAAAACTGCAGAAAAAGATGGGGAAGAAAGA
AAAGTAAACAAAATAACTATCCCAAATCCACAAGCAGCAGGTGGAAACTTTTTACCTACA
CCTGAATTGAAGCAGTCATAGAGTCTTAAGGCTGCATAAATTATTTAAATGGGTTAAGAG
AAAAAAAACAGAGAAATGGAAGAAAAGCAAAAAACTGAAGAGTAAAAGAGATTGGAAGAG
TTAAAAAAGAGATAAAATCGTCTTAAAAAGAAAGAATAAATGCTGCTATAAGCTCATTAA
TAAAAATAAGCTGAAGCTGCTGCTGCAGCAGCTGCAGCCGCTCTTGCTAATAATGAAGTT
TCTGATAAGCCAGTGAATACCAGCGAACCTCCAAAAATTATTCTTATGAAGAGTTAGAGT
TTAAAACCTGAAGAAGGTGCCTCCACAGGATCAAATTTAATAAAAATTCCTTTTGATGCC
TCATTAGCAAAAATGAGCTCAACTCAATCTTAACCAAATAGCCAACTTGACATTGGCTAC
AACTCAAGATAAATTTATGATAAAATTATCCCTTCAAAACCTAAGAAAACATAAAGCATA
TAGTAAGAGTAGAATGCAAATACATCAAATAGTCAAAATTTGAATTTCAATAAAATAAAG
ATTAATGTTGGAGGATCTCCAGTAATGCCACCTGCTAATAACCCATCTATTTAAAATTTT
CCTATTCCTTAAATTTCAGTTGGAGGTGAGCGTGTAGATTTTAAATTTGTTTTAGATAGA
AAGGCTCTTAAAAAAGAGTATGAGAACATGATAAAAAGAAAACAGTTAAAGTATAAAAAA
CTGCTGGAACTTAATCTAACAAAAATGTAGAAAGTAACTAATTGGATGATAAGAGAGTGG
GCAAAGTAGAAAAAAGATGTTCGTTCTGAAACTTTAGATTATTTTAGAGATATCTTAAAT
GAAAGATAGAAAATTAAAGATAATCTCGATATTCGTAAAATTCAGCTGTTCTTAAAAATG
TTTTTATACAGGCTCAGAGATTTCTACAAAGATCTCAAGCCTGATTATATTGACAAGCTG
AAAAATATTAGTGAAAAGCTATACAGAATTGGTTCTAGAGCTATTGTATACAAAACTCCA
CTCTCTATCAGAGATAACCCTAAAAACGCTTCATTAGATACTTAAGTCAGTAACAACTAG
ATCTTAGATGAATCTCATCCTTTGAAAAAATTGCAAGAGGAAATACTTGAAATAGAAAGA
GAAATGAAGCTGTTCCGTCGTATGCTTAGCAGAGATATCTAGAAATACTAAGAACCAGAT
GCGACAACTCAAAAGTCTAAAAAATCAAAAAACAAAGATGACGGAAGCTAATATAACGGA
GGTAATGATAACGATTAGTAAGGAGGATATATGAATGGTGGTTAAGGTTATGACGATTCA
AAAGATGCAATTTATGGAATGGGAGATAAAGATTAGTAATAAAAGTAAAGTGAAATACTG
TCATTCTTCTTGGAGTATAACAAAAGCTTTGAAAAGCACTCCTCTAATTTGCAAAAAATC
CAACACTTTTTGGCATATTAAAATTATAGCAATATTCTAAATTAATTATAGAGCAAGAAT
CCAATAAAGAGCGACTAACTATTTGATATATGCGAGACTTTTGTTGAAGATGAAAATAAT
AATTAAGTAGAAATTCTTTAATACTTCAAAAAAAAGAGAAAAATTTCTGAACATACATCT
TCAGAAAGTATGACAAATAACAATAATGATACAAAGATTGAAGAAGAAGGTAAATAAAAA
TAGAATGATTAAGAAATCGATGAATTAAATTCTAATATATTTGACAATGTTACTTTATCT
TTTAACTTCAATCTTGACTCTAAGAAAGAAGATGAAGAAGGAAAAGAAAACACTTTCATA
AGTAAAAGTCAAGACAATTCATTTAATAATCCAAAATAAGCAATAAATGTATTCAGTTAG
TTTGATGATGATGAAGATGATTCTACTGAAGCAATAATGGAAGAGAGAAAATATTAAGAG
TTTAAATCTAAAATAAACTAAAAAAATCTCAAAGAATGCAATAGTGGAAGTGATATTTTG
GGAAAAAATATAAGTGATATAAATATTTCCAACGTAATCAACCCAGAGTTTGACTATTTC
GGAGTGAAAAAACTCAATTAAATGATTAATAACAAAGTTATAAACAAAAAATTCTGCCAA
AATATAAACTCATTTATAAAATAGAAATTTTAAATTGTTGAAATCAACAAAATAAAATGC
AAAAATGCTATTATTTACTAAAAAATGAAAACAAATGATGATCTAGTTAAAAATTTATAT
TAAAAATAGTAATTATTAGAGCCAAAGATAAATATTAAAATAGCTCCTCCGTTTTTGGAT
GATCTCAATATTAATTGTTTGCAAACACTAATAAATTTATAAATTTAGGTTGAATTGAGA
CTTGAGAATGAATAAAATCCTAAAAGCTAAATGGATATAGAAAATAGCCAAAACAACTAA
GCTGAAAAATCTTTAGAATTTCATATTTAAAATAATGTTAACTATGCTTGTTGTGCATAC
TTTACAGAGTTACCCAATATAAAGGATGAAATATAGCTAAATTGTAAAGAAAATGCTGAC
TTCTATTCGATTCTATGCTAAGAAGATGTAGAGCAAGTTGTTTAATCATTTAAAATATAG
AAACAATTATATAGATTGTTATCGTAAGATAGCTTCTTAACTTAAGAAGTAATAAATAGT
GAGGCAGTTTGTATAACAAAATAAAGATTAAGATAAATTGATCCTTAAAACAACAAATTT
TTGTTAGAAATTTCTCTCTGGACTCCTACTGATAATCTAGGTTATTTATCAATAAAACTA
AACAATGAAGAAATATTTTCACCACTCAATTTTATTTAAAAAATAAAAAAGTTTTAACAA
TATCAGATTTAACAAAAGCAAATTTAACAACAACAACAACAACAATTGTAATAACAACAA
AAAAAATATATCTAAAATCAATCACAATGA

>TTHERM_00715810(protein)
MSKKIVKGGGSNTAIKNTSKPLEESILDIINDISKRQYSLDFREPVDVKALGLSDYYDIV
KKPMDISTLKNNFLEGVYKTIKEVWEDFDLIVNNCKAYNRIPDHPINQKADQMKSRVDKN
FQKLLEDYKALGVDTDGYQIQIDLDDLKAKEEKKRKIKLDGLDEKNILIGGDKRLNLIPG
SLNERKFFELSNQELQMMQAGKNIQMLPLNQPLQQEDPVFQPTSLKISLNAPNLSLNLSN
STITGEQPTPTNNQVGMKQPRITGDNTQKVKKQKDYSAKIQELQTLLAQLKLELEVQTKK
KSDVEKQRILCKNVYILSKKQRRGVHQLVQQFETEENTLINPEGTLNNFSTQSNLNGSEH
INAQDINDAATSGTSLKTPQKREDNGNLDDQTAKKMEIENKEIQKSQDQEGRYNDDDDDD
NDIIIKKKSNFIDDLSLKQNESTSQIGSNKIKIPTSQTLNKEANSSTQLNDSKISLKQSQ
IGQKSNNDSFSTPTKQQLLNSSNLSSEKIKQSSKTNNLNASESKFQSNTNDGEESEEEFV
PQSLNTSKQTPSDSLATPQQTNSIKLHGLKPTSSTANSAHLKHKLHASASGDKIQIKKPT
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SIQKSVQDLNANKIKRPEDEIKIKLKDSTFKTAEKDGEERKVNKITIPNPQAAGGNFLPT
PELKQSQSLKAAQIIQMGQEKKNREMEEKQKTEEQKRLEELKKRQNRLKKKEQMLLQAHQ
QKQAEAAAAAAAAALANNEVSDKPVNTSEPPKIILMKSQSLKPEEGASTGSNLIKIPFDA
SLAKMSSTQSQPNSQLDIGYNSRQIYDKIIPSKPKKTQSIQQEQNANTSNSQNLNFNKIK
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LLELNLTKMQKVTNWMIREWAKQKKDVRSETLDYFRDILNERQKIKDNLDIRKIQLFLKM
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GNDNDQQGGYMNGGQGYDDSKDAIYGMGDKDQQQKQSEILSFFLEYNKSFEKHSSNLQKI
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SKSQDNSFNNPKQAINVFSQFDDDEDDSTEAIMEERKYQEFKSKINQKNLKECNSGSDIL
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LLEISLWTPTDNLGYLSIKLNNEEIFSPLNFIQKIKKFQQYQIQQKQIQQQQQQQLQQQQ
KKYIQNQSQ

>TTHERM_00715810(gene)
ATGTCAAAGAAAATAGTGAAAGGAGGAGGTAGTAACACAGCAATTAAGAATACATCAAAA
CCTCTGGAAGAGAGTATTTTAGATATTATAAATGACATTAGCAAGCGTTAGTATTCGTTA
GATTTTAGAGAACCTGTCGATGTAAAAGCATTAGGATTGAGCGATTATTATGACATTGTT
AAAAAGCCAATGGACATATCCACTCTCAAAGTCGGTGCTTTTTTTATCCTCCTTATATAT
TCATAAAAATTATTTAAACCCATTATTGAGCAAATATATTTTTTAGTAGACTAACCATCA
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GAATTAGTTTGAAAAAATCTTAAAACAATATATTTATTTATATTTTTATTTGTAAAAATT
TCTACATTAGAATAATTTTTTGGAGGGTGTTTATAAGACAATAAAAGAAGTATGGGAAGA
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TAAACACTCAACAAGGAGGCCAACTCATCAACAGTAAAAATAAATAATCAACATAATACT
ATAATACTTTTTGTTTGATTCATTCAAATAACAAATATCTTAAAAATTAGCAACTAAACG
ATTCGAAGATATCATTGAAATAGTCTCAAATAGGCCAAAAATCAAATAATGATTCATTCT
CAACTCCAACAAAATAATAACTATTAAACAGCTCCAATTTATCATCTGAAAAAATTAAAT
AGAGTAGCAAAACTAACAATTTAAATGCTTCAGAATCTAAATTTTAAAGTAATACAAATG
ACGGTGAAGAGAGTGAAGAAGAATTTGTACCTTAATCGCTAAATACTTCTAAATAGACTC
CATCTGATTCTTTGGCTACACCATAATAAACTAATTCTATTAAACTACATGGACTCAAAC
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AAAAAGTAAGACCAAACGGTCATTTAAATGGTTAAACAAATAGCTAAAGCAATTTATCTC
CTTAGTCCTAGGAGCTTAAAAAAAAATTAAATGCCAACACTCCAACTAAATCAGCTCTTT
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CTGCATAAATTATTTAAATGGGTTAAGAGAAAAAAAACAGAGAAATGGAAGAAAAGCAAA
AAACTGAAGAGTAAAAGAGATTGGAAGAGTTAAAAAAGAGATAAAATCGTCTTAAAAAGA
AAGAATAAATGCTGCTATAAGCTCATTAATAAAAATAAGCTGAAGCTGCTGCTGCAGCAG
CTGCAGCCGCTCTTGCTAATAATGAAGTTTCTGATAAGCCAGTGAATACCAGCGAACCTC
CAAAAATTATTCTTATGAAGAGTTAGAGTTTAAAACCTGAAGAAGGTGCCTCCACAGGAT
CAAATTTAATAAAAATTCCTTTTGATGCCTCATTAGCAAAAATGAGCTCAACTCAATCTT
AACCAAATAGCCAACTTGACATTGGCTACAACTCAAGATAAATTTATGATAAAATTATCC
CTTCAAAACCTAAGAAAACATAAAGCATATAGTAAGAGTAGAATGCAAATACATCAAATA
GTCAAAATTTGAATTTCAATAAAATAAAGATTAATGTTGGAGGATCTCCAGTAATGCCAC
CTGCTAATAACCCATCTATTTAAAATTTTCCTATTCCTTAAATTTCAGTTGGAGGTGAGC
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TAAAAAGAAAACAGTTAAAGTATAAAAAACTGCTGGAACTTAATCTAACAAAAATGTAGA
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CTTTAGATTATTTTAGAGATATCTTAAATGAAAGATAGAAAATTAAAGATAATCTCGATA
TTCGTAAAATTCAGCTGTTCTTAAAAATGTTTTTATACAGGCTCAGAGATTTCTACAAAG
ATCTCAAGCCTGATTATATTGACAAGCTGAAAAATATTAGTGAAAAGCTATACAGAATTG
GTTCTAGAGCTATTGTATACAAAACTCCACTCTCTATCAGAGATAACCCTAAAAACGCTT
CATTAGATACTTAAGTCAGTAACAACTAGATCTTAGATGAATCTCATCCTTTGAAAAAAT
TGCAAGAGGAAATACTTGAAATAGAAAGAGAAATGAAGCTGTTCCGTCGTATGCTTAGCA
GAGATATCTAGAAATACTAAGAAGTAATTTCAAATCATCTTATCATTTAAATTTTTTGAA
TCATTTTTATCTAATTTAACAAAAATATTTTTAAATTGATTTTTAACAATTTTTTACGAT
TTATTTCATTTAACAAAAGCAGCCAGATGCGACAACTCAAAAGTCTAAAAAATCAAAAAA
CAAAGATGACGGAAGCTAATATAACGGAGGTAATGATAACGATTAGTAAGGAGGATATAT
GAATGGTGGTTAAGGTTATGACGATTCAAAAGATGCAATTTATGGAATGGGAGATAAAGA
TTAGTAATAAAAGTAAAGTGAAATACTGTCATTCTTCTTGGAGTATAACAAAAGCTTTGA
AAAGCACTCCTCTAATTTGCAAAAAATCCAACACTTTTTGGCATATTAAAATTATAGCAA
TATTCTAAATTAATTATAGAGCAAGAATCCAATAAAGAGCGACTAACTATTTGATATATG
CGAGACTTTTGTTGAAGATGAAAATAATAATTAAGTAGAAATTCTTTAATACTTCAAAAA
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TAATATATTTGACAATGTTACTTTATCTTTTAACTTCAATCTTGACTCTAAGAAAGAAGA
TGAAGAAGGAAAAGAAAACACTTTCATAAGTAAAAGTCAAGACAATTCATTTAATAATCC
AAAATAAGCAATAAATGTATTCAGTTAGTTTGATGATGATGAAGATGATTCTACTGAAGC
AATAATGGAAGAGAGAAAATATTAAGAGTTTAAATCTAAAATAAACTAAAAAAATCTCAA
AGAATGCAATAGTGGAAGTGATATTTTGGGAAAAAATATAAGTGATATAAATATTTCCAA
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CAAAGTTATAAACAAAAAATTCTGCCAAAATATAAACTCATTTATAAAATAGAAATTTTA
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AAATGATGATCTAGTTAAAAATTTATATTAAAAATAGTAATTATTAGAGCCAAAGATAAA
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ATAAATTGATCCTTAAAACAACAAATTTTTGTTAGAAATTTCTCTCTGGACTCCTACTGA
TAATCTAGGTTATTTATCAATAAAACTAAACAATGAAGAAATATTTTCACCACTCAATTT
TATTTAAAAAATAAAAAAGTTTTAACAATATCAGATTTAACAAAAGCAAATTTAACAACA
ACAACAACAACAATTGTAATAACAACAAAAAAAATATATCTAAAATCAATCACAATGA