Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00715810

Standard Name

Brop-1 (Bromodomain containing protein 1)

Aliases

PreTt19055 | 113.m00094 | 3673.m00018

Description

bromodomain protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF06451 ) Moricin
• ( TIGR01612 ) rhoptry protein
• ( PF05316 ) Mitochondrial ribosomal protein (VAR1)
• ( TIGR00156 ) conserved hypothetical protein TIGR00156

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.7%

TetraMine Data

TTHERM_00715810

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_16850.1	9.997093137033517e-262	hypothetical protein (1370 aa)
Oxytricha	Contig18584.0.g108	1.999598840915195e-17	Bromodomain
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WormBase	WBGene00022473	0.000000000003001226732525078	locus:bet-1 status:Partially _confirmed UniProt:Q95Y80 protein_id:CCD68309.1
SGD	YDL070W	0.00000000030007160092483236	BDF2 Protein involved in trans cription initiation at TATA-co ntaining promoters; associates with the basal transcription factor TFIID; contains two bro modomains; corresponds to the C-terminal region of mammalian TAF1; redundant with Bdf1p

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:29523178: Saettone A, Garg J, Lambert JP, Nabeel-Shah S, Ponce M, Burtch A, Thuppu Mudalige C, Gingras AC, Pearlman RE, Fillingham J (2018) The bromodomain-containing protein Ibd1 links multiple chromatin-related protein complexes to highly expressed genes in Tetrahymena thermophila. Epigenetics & chromatin 11(1):10

Sequences

>TTHERM_00715810(coding)
ATGTCAAAGAAAATAGTGAAAGGAGGAGGTAGTAACACAGCAATTAAGAATACATCAAAA
CCTCTGGAAGAGAGTATTTTAGATATTATAAATGACATTAGCAAGCGTTAGTATTCGTTA
GATTTTAGAGAACCTGTCGATGTAAAAGCATTAGGATTGAGCGATTATTATGACATTGTT
AAAAAGCCAATGGACATATCCACTCTCAAAAATAATTTTTTGGAGGGTGTTTATAAGACA
ATAAAAGAAGTATGGGAAGATTTTGATTTAATCGTGAATAACTGCAAGGCTTATAATAGA
ATTCCAGACCACCCAATAAACCAAAAAGCTGATCAAATGAAAAGCCGTGTAGATAAAAAT
TTTTAAAAGTTATTAGAAGATTATAAGGCTCTAGGAGTTGATACAGATGGATACTAAATA
CAAATAGATTTAGATGATCTAAAGGCAAAAGAAGAAAAAAAAAGGAAGATTAAGTTAGAT
GGACTGGATGAAAAAAATATACTAATTGGCGGTGACAAAAGACTAAATCTTATCCCTGGT
TCATTAAATGAAAGAAAATTTTTCGAACTCTCAAATTAAGAATTATAGATGATGTAGGCA
GGAAAAAATATACAAATGTTGCCTCTCAACTAACCTTTGTAACAAGAGGATCCTGTGTTC
TAGCCAACGTCTTTGAAAATATCCTTAAACGCACCAAACTTAAGTTTGAATTTGAGTAAT
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TAAGAACTGCAAACTCTGCTTGCCTAACTCAAGCTTGAGCTTGAAGTTTAAACAAAAAAA
AAGTCTGATGTAGAAAAATAAAGAATCCTATGTAAAAATGTATACATTCTTTCAAAAAAA
TAAAGAAGAGGAGTCCATCAACTTGTTTAACAATTTGAAACAGAAGAAAATACCTTAATT
AATCCTGAAGGCACATTGAATAATTTTTCAACTCAAAGTAATCTAAATGGGAGTGAACAT
ATAAATGCTTAAGACATAAATGATGCAGCTACAAGTGGTACGTCCTTAAAAACCCCTTAA
AAAAGAGAAGATAATGGAAATCTTGATGATTAAACAGCTAAAAAAATGGAAATAGAAAAT
AAAGAAATATAGAAAAGTTAGGATCAAGAAGGTCGCTATAATGATGATGACGATGATGAT
AATGATATTATCATTAAAAAGAAAAGTAACTTTATTGACGATCTATCTCTAAAGTAAAAT
GAATCTACTTCTTAGATAGGATCTAATAAGATAAAAATTCCTACTTCTTAAACACTCAAC
AAGGAGGCCAACTCATCAACACAACTAAACGATTCGAAGATATCATTGAAATAGTCTCAA
ATAGGCCAAAAATCAAATAATGATTCATTCTCAACTCCAACAAAATAATAACTATTAAAC
AGCTCCAATTTATCATCTGAAAAAATTAAATAGAGTAGCAAAACTAACAATTTAAATGCT
TCAGAATCTAAATTTTAAAGTAATACAAATGACGGTGAAGAGAGTGAAGAAGAATTTGTA
CCTTAATCGCTAAATACTTCTAAATAGACTCCATCTGATTCTTTGGCTACACCATAATAA
ACTAATTCTATTAAACTACATGGACTCAAACCTACTAGCAGCACTGCTAATTCTGCCCAT
TTAAAGCATAAATTGCATGCTTCTGCTAGTGGAGATAAAATTTAAATTAAAAAGCCTACA
GATCTTAATAGTTCTCTACGAAAGGAAGGAGTCACACCAGAAAAAATTTTAAGCTAAGCA
AAAAAAGATTTCACTCCTGAAAAAAGTGGAAGCTCTGGTAAGCAACTTGCTAATTAATAG
GCAAAATAATTAGGCAATGGAAATAATCCTTAAAAAGTAAGACCAAACGGTCATTTAAAT
GGTTAAACAAATAGCTAAAGCAATTTATCTCCTTAGTCCTAGGAGCTTAAAAAAAAATTA
AATGCCAACACTCCAACTAAATCAGCTCTTTCTTAAGGAAAATCTACAATGAGTGGCAAT
GTCTTGCAAAAAAAGAATCCTTCCTCCGATAGTATTATAAAAGTGAAGATAGGAGGAGAA
TCTATATAAAAAAGTGTGTAAGATCTAAATGCAAATAAAATTAAAAGGCCAGAAGACGAA
ATAAAAATAAAGCTAAAAGATTCAACATTCAAAACTGCAGAAAAAGATGGGGAAGAAAGA
AAAGTAAACAAAATAACTATCCCAAATCCACAAGCAGCAGGTGGAAACTTTTTACCTACA
CCTGAATTGAAGCAGTCATAGAGTCTTAAGGCTGCATAAATTATTTAAATGGGTTAAGAG
AAAAAAAACAGAGAAATGGAAGAAAAGCAAAAAACTGAAGAGTAAAAGAGATTGGAAGAG
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TAAAAATAAGCTGAAGCTGCTGCTGCAGCAGCTGCAGCCGCTCTTGCTAATAATGAAGTT
TCTGATAAGCCAGTGAATACCAGCGAACCTCCAAAAATTATTCTTATGAAGAGTTAGAGT
TTAAAACCTGAAGAAGGTGCCTCCACAGGATCAAATTTAATAAAAATTCCTTTTGATGCC
TCATTAGCAAAAATGAGCTCAACTCAATCTTAACCAAATAGCCAACTTGACATTGGCTAC
AACTCAAGATAAATTTATGATAAAATTATCCCTTCAAAACCTAAGAAAACATAAAGCATA
TAGTAAGAGTAGAATGCAAATACATCAAATAGTCAAAATTTGAATTTCAATAAAATAAAG
ATTAATGTTGGAGGATCTCCAGTAATGCCACCTGCTAATAACCCATCTATTTAAAATTTT
CCTATTCCTTAAATTTCAGTTGGAGGTGAGCGTGTAGATTTTAAATTTGTTTTAGATAGA
AAGGCTCTTAAAAAAGAGTATGAGAACATGATAAAAAGAAAACAGTTAAAGTATAAAAAA
CTGCTGGAACTTAATCTAACAAAAATGTAGAAAGTAACTAATTGGATGATAAGAGAGTGG
GCAAAGTAGAAAAAAGATGTTCGTTCTGAAACTTTAGATTATTTTAGAGATATCTTAAAT
GAAAGATAGAAAATTAAAGATAATCTCGATATTCGTAAAATTCAGCTGTTCTTAAAAATG
TTTTTATACAGGCTCAGAGATTTCTACAAAGATCTCAAGCCTGATTATATTGACAAGCTG
AAAAATATTAGTGAAAAGCTATACAGAATTGGTTCTAGAGCTATTGTATACAAAACTCCA
CTCTCTATCAGAGATAACCCTAAAAACGCTTCATTAGATACTTAAGTCAGTAACAACTAG
ATCTTAGATGAATCTCATCCTTTGAAAAAATTGCAAGAGGAAATACTTGAAATAGAAAGA
GAAATGAAGCTGTTCCGTCGTATGCTTAGCAGAGATATCTAGAAATACTAAGAACCAGAT
GCGACAACTCAAAAGTCTAAAAAATCAAAAAACAAAGATGACGGAAGCTAATATAACGGA
GGTAATGATAACGATTAGTAAGGAGGATATATGAATGGTGGTTAAGGTTATGACGATTCA
AAAGATGCAATTTATGGAATGGGAGATAAAGATTAGTAATAAAAGTAAAGTGAAATACTG
TCATTCTTCTTGGAGTATAACAAAAGCTTTGAAAAGCACTCCTCTAATTTGCAAAAAATC
CAACACTTTTTGGCATATTAAAATTATAGCAATATTCTAAATTAATTATAGAGCAAGAAT
CCAATAAAGAGCGACTAACTATTTGATATATGCGAGACTTTTGTTGAAGATGAAAATAAT
AATTAAGTAGAAATTCTTTAATACTTCAAAAAAAAGAGAAAAATTTCTGAACATACATCT
TCAGAAAGTATGACAAATAACAATAATGATACAAAGATTGAAGAAGAAGGTAAATAAAAA
TAGAATGATTAAGAAATCGATGAATTAAATTCTAATATATTTGACAATGTTACTTTATCT
TTTAACTTCAATCTTGACTCTAAGAAAGAAGATGAAGAAGGAAAAGAAAACACTTTCATA
AGTAAAAGTCAAGACAATTCATTTAATAATCCAAAATAAGCAATAAATGTATTCAGTTAG
TTTGATGATGATGAAGATGATTCTACTGAAGCAATAATGGAAGAGAGAAAATATTAAGAG
TTTAAATCTAAAATAAACTAAAAAAATCTCAAAGAATGCAATAGTGGAAGTGATATTTTG
GGAAAAAATATAAGTGATATAAATATTTCCAACGTAATCAACCCAGAGTTTGACTATTTC
GGAGTGAAAAAACTCAATTAAATGATTAATAACAAAGTTATAAACAAAAAATTCTGCCAA
AATATAAACTCATTTATAAAATAGAAATTTTAAATTGTTGAAATCAACAAAATAAAATGC
AAAAATGCTATTATTTACTAAAAAATGAAAACAAATGATGATCTAGTTAAAAATTTATAT
TAAAAATAGTAATTATTAGAGCCAAAGATAAATATTAAAATAGCTCCTCCGTTTTTGGAT
GATCTCAATATTAATTGTTTGCAAACACTAATAAATTTATAAATTTAGGTTGAATTGAGA
CTTGAGAATGAATAAAATCCTAAAAGCTAAATGGATATAGAAAATAGCCAAAACAACTAA
GCTGAAAAATCTTTAGAATTTCATATTTAAAATAATGTTAACTATGCTTGTTGTGCATAC
TTTACAGAGTTACCCAATATAAAGGATGAAATATAGCTAAATTGTAAAGAAAATGCTGAC
TTCTATTCGATTCTATGCTAAGAAGATGTAGAGCAAGTTGTTTAATCATTTAAAATATAG
AAACAATTATATAGATTGTTATCGTAAGATAGCTTCTTAACTTAAGAAGTAATAAATAGT
GAGGCAGTTTGTATAACAAAATAAAGATTAAGATAAATTGATCCTTAAAACAACAAATTT
TTGTTAGAAATTTCTCTCTGGACTCCTACTGATAATCTAGGTTATTTATCAATAAAACTA
AACAATGAAGAAATATTTTCACCACTCAATTTTATTTAAAAAATAAAAAAGTTTTAACAA
TATCAGATTTAACAAAAGCAAATTTAACAACAACAACAACAACAATTGTAATAACAACAA
AAAAAATATATCTAAAATCAATCACAATGA

>TTHERM_00715810(protein)
MSKKIVKGGGSNTAIKNTSKPLEESILDIINDISKRQYSLDFREPVDVKALGLSDYYDIV
KKPMDISTLKNNFLEGVYKTIKEVWEDFDLIVNNCKAYNRIPDHPINQKADQMKSRVDKN
FQKLLEDYKALGVDTDGYQIQIDLDDLKAKEEKKRKIKLDGLDEKNILIGGDKRLNLIPG
SLNERKFFELSNQELQMMQAGKNIQMLPLNQPLQQEDPVFQPTSLKISLNAPNLSLNLSN
STITGEQPTPTNNQVGMKQPRITGDNTQKVKKQKDYSAKIQELQTLLAQLKLELEVQTKK
KSDVEKQRILCKNVYILSKKQRRGVHQLVQQFETEENTLINPEGTLNNFSTQSNLNGSEH
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NDIIIKKKSNFIDDLSLKQNESTSQIGSNKIKIPTSQTLNKEANSSTQLNDSKISLKQSQ
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PQSLNTSKQTPSDSLATPQQTNSIKLHGLKPTSSTANSAHLKHKLHASASGDKIQIKKPT
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LLEISLWTPTDNLGYLSIKLNNEEIFSPLNFIQKIKKFQQYQIQQKQIQQQQQQQLQQQQ
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>TTHERM_00715810(gene)
ATGTCAAAGAAAATAGTGAAAGGAGGAGGTAGTAACACAGCAATTAAGAATACATCAAAA
CCTCTGGAAGAGAGTATTTTAGATATTATAAATGACATTAGCAAGCGTTAGTATTCGTTA
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AAAAAGCCAATGGACATATCCACTCTCAAAGTCGGTGCTTTTTTTATCCTCCTTATATAT
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AACTCCAACAAAATAATAACTATTAAACAGCTCCAATTTATCATCTGAAAAAATTAAATA
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AACTGAAGAGTAAAAGAGATTGGAAGAGTTAAAAAAGAGATAAAATCGTCTTAAAAAGAA
AGAATAAATGCTGCTATAAGCTCATTAATAAAAATAAGCTGAAGCTGCTGCTGCAGCAGC
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ACCAAATAGCCAACTTGACATTGGCTACAACTCAAGATAAATTTATGATAAAATTATCCC
TTCAAAACCTAAGAAAACATAAAGCATATAGTAAGAGTAGAATGCAAATACATCAAATAG
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TGCTAATAACCCATCTATTTAAAATTTTCCTATTCCTTAAATTTCAGTTGGAGGTGAGCG
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AAAAAGAAAACAGTTAAAGTATAAAAAACTGCTGGAACTTAATCTAACAAAAATGTAGAA
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TTTAGATTATTTTAGAGATATCTTAAATGAAAGATAGAAAATTAAAGATAATCTCGATAT
TCGTAAAATTCAGCTGTTCTTAAAAATGTTTTTATACAGGCTCAGAGATTTCTACAAAGA
TCTCAAGCCTGATTATATTGACAAGCTGAAAAATATTAGTGAAAAGCTATACAGAATTGG
TTCTAGAGCTATTGTATACAAAACTCCACTCTCTATCAGAGATAACCCTAAAAACGCTTC
ATTAGATACTTAAGTCAGTAACAACTAGATCTTAGATGAATCTCATCCTTTGAAAAAATT
GCAAGAGGAAATACTTGAAATAGAAAGAGAAATGAAGCTGTTCCGTCGTATGCTTAGCAG
AGATATCTAGAAATACTAAGAAGTAATTTCAAATCATCTTATCATTTAAATTTTTTGAAT
CATTTTTATCTAATTTAACAAAAATATTTTTAAATTGATTTTTAACAATTTTTTACGATT
TATTTCATTTAACAAAAGCAGCCAGATGCGACAACTCAAAAGTCTAAAAAATCAAAAAAC
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AATGGTGGTTAAGGTTATGACGATTCAAAAGATGCAATTTATGGAATGGGAGATAAAGAT
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AAGCACTCCTCTAATTTGCAAAAAATCCAACACTTTTTGGCATATTAAAATTATAGCAAT
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AATGTTAACTATGCTTGTTGTGCATACTTTACAGAGTTACCCAATATAAAGGATGAAATA
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AATCTAGGTTATTTATCAATAAAACTAAACAATGAAGAAATATTTTCACCACTCAATTTT
ATTTAAAAAATAAAAAAGTTTTAACAATATCAGATTTAACAAAAGCAAATTTAACAACAA
CAACAACAACAATTGTAATAACAACAAAAAAAATATATCTAAAATCAATCACAATGA