Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00499530

Standard Name

BrEt-2 (Bromodomain and ET domain 2)

Aliases

PreTt07996 | 63.m00174 | 3716.m00028

Description

bromodomain domain protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF00439 ) Bromodomain
• ( PF04702 ) Vicilin N terminal region
• ( PF06133 ) Protein of unknown function (DUF964)

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.9%

TetraMine Data

TTHERM_00499530

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_09681.1	9.997093137033517e-262	bromodomain containing protein (921 aa)
SGD	YDL070W	3.001003044337619e-17	BDF2 Protein involved in trans cription initiation at TATA-co ntaining promoters; associates with the basal transcription factor TFIID; contains two bro modomains; corresponds to the C-terminal region of mammalian TAF1; redundant with Bdf1p
WormBase	WBGene00000366	6.001122775063233e-17	locus:cbp-1 Protein cbp-1 status:Partially_confirmed U niProt:P34545 protein_id:CAD 18875.2
DictyBase	DDB_G0270170	2.0004286606204839e-16	DDB_G0270170 on chromosome: 1 position 4360881 to 4366105
Oxytricha	Contig20804.0.g30	0.00000000000001000191320216021	Bromodomain
Stentor Coeruleus	SteCoe_26840	0.00000000000009357622968840175

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:29523178: Saettone A, Garg J, Lambert JP, Nabeel-Shah S, Ponce M, Burtch A, Thuppu Mudalige C, Gingras AC, Pearlman RE, Fillingham J (2018) The bromodomain-containing protein Ibd1 links multiple chromatin-related protein complexes to highly expressed genes in Tetrahymena thermophila. Epigenetics & chromatin 11(1):10

Sequences

>TTHERM_00499530(coding)
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ATGCTACCTAGAGGATACTCACTGTAATTCTCATCTTCTCACACTAGACGTGTTCAAATG
AATCCAAATGCTACAAAGTTAAATCAATATGAGCAAACACTGATCTAAGAGAGGTTAAAG
TAAACTAGATCCAAGATGAATCAGGCAGCAAATGCTTAAAATGCCGCATCATTAGCAGCC
CAACAAAATAAAAATGATAAAGATAAAAAGTTGTAATCCAAAAAAGAAAATATACCTGAA
AAAGAATAAATAGCCGATTCTCCAGAAAGCGGAAATACAAAGAAAAGAAAGTAGTAGGAA
AAAATTTTAGAAAAGTAAGCAGCAAAAAGCTTAAAACAGCAAAATTAAGTTTTATAGTAA
GTAATTAGTGTTGACACACAATAGAAAGGAACAATTCCTGTTTCTGAAGACATAAGGGTG
TGCTTTTCGATATTGTAATAACTAAAGAAAAGCGAAAATGCAGGTCCATTTTTATAAAAA
GTTGATGCCTTAGCACAATAATGCCCTGACTACTATAAAATAATAAGAGATCCAATGGAT
TTATCGAAAGTGGAGTCAAATTTAAAACAGGGCTATTATTAAACTACTTTACAATTCGCA
GATGATGTTAGAAAGATATGGAATAACTCCTTTACATATAACTAAAAAGGAAGCTAAATC
TATAAAATGACAGAAGAAATGAGCAGGTTATTTGAAAAAATTTTTACTCAGGTAAAAAGT
TAATCACTTCCTAACCCTATGGAGTATCAAGATTCAATAGACGCTTCTTCCAACTCTATC
AACAATAATACCGCTTCGTCATTAAAGAAGAGAGCTAATAAATAAGCATAAAATGTTACT
TAATAATAGAATTAGATTTAATAGCTATCTTCTGCTTCAGTGCCAATAACTTAAAATTCA
GCTATACCAGCAAATCCTCCAAAACCTGAAAAATAAAAAAAGACTAAATAAACTGCTAAC
TAACCTGATACAACTGCATAATAAGCCAAAGCTAAAGATAAATATTAAACCAAATTAAGT
TAAGATGAAATCAACTAACTTTATTAAAATATCGGATCGCTTACAGAAGACGATACAAAA
TAATTATACGAGTTAATAAAGGATTACTGTGAAACAAATAACGAATAGATTGAATTAAAT
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TAATAATAGTTGTAATAATAATAATAATTACAGCAGCAATAAATCCAATAATAGAAATAG
CAATAGTCATAAGATGAATAGTAAGACAATAAAAAGAAGAAGAAGATTGGAAAATTGGAA
AAGAAAGACATCCCATTAACTATCAGTGAAAAGAAGCAACTAGGAATAAATATACGTAGA
CTTCCTCCAGAAGATTTAAATGGAATTTGGAGTATAGTATAAGATAGCTAATAAAATAGT
GAAGTGATAGAATTTGATATTGATACATTGCCAGTAAGAAAAGCTAGAGAATTAGAAGCA
TATGTCAAGTAAAGAGCTGCATTTCAACAAAAAAAACAACGTGTTTAGAAAAATTAACCA
AATAACCTTTTATCAGACAGCTAACAATAAGCTAAAGCTTAGTTACCATACTCTACGCCT
ACAACAACTACAACTGCAAGTACTACAGTAAATACTAATTAAACTCCAATTGATGCTGCA
GTAAACAACTTCCCACAATAAACTAGCTTTACTGCTGCTTAGTAATATCCTGCCACAGCT
TACGCTAGTAATCCAGGTTATACATAAGCAAATTAACTTATTCAAAATAATGGTTCTGCT
TAAAATGCTGCAAGTGCAAAAGTCAACAACAGCTAAATGATATAGTAGGGATAGTATGTT
CAAGCTAATCCAGTAGCTTAGTAATAACTACCCATTGCTTAAGCAACTACATAATAAAAC
ATGGCTTCTATATAAGGATACAATCATTTAAATTAATAATAGTATGCTTAGCAATCGACA
TACTAAAATTAAATGATGATGAATTAATATCCTTCTGCTTTTCCTATTTAGTAACCTATG
CAAAGCGCTGTCATCGGTGGTTATCAGAACAGACCCAGCTAATAGTATGATGCAGGTTAA
TAAGGCATGGCAATACCAAGCATGATTAATTAAACTTAGCAACCTTATTCAGGATAGCAG
TATAATCAATAGGGATAAGCATAATATTAAGGATATGGAAATAACATGCAAAATATGTAT
ATGAATTAGCCTCTTAGTGCTAATTCAAATGGCAATCACAATAGAAATATTGTGCCTAAT
TAACAAATTCAATATGGAGCTAATACATAAGTGTAAAATGGAATCAGCTAATACCCTCAA
TCGTAAAATTACTACAATGCTTAATATCAATCAAACCCAAGCTAGTATTAGTAACATTTA
CAATAAATGAATGTAAATCCACAGTACAGCAGTAATAGTAATTAAGCTTAGTAATATAAC
GGTCATATTTAAAATTAGAATAACAGTGAGTAAAGTTCTGAAGCAATGCTCTCTGAAAGT
GAGGAAGAGTGA

>TTHERM_00499530(protein)
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YVKQRAAFQQKKQRVQKNQPNNLLSDSQQQAKAQLPYSTPTTTTTASTTVNTNQTPIDAA
VNNFPQQTSFTAAQQYPATAYASNPGYTQANQLIQNNGSAQNAASAKVNNSQMIQQGQYV
QANPVAQQQLPIAQATTQQNMASIQGYNHLNQQQYAQQSTYQNQMMMNQYPSAFPIQQPM
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MNQPLSANSNGNHNRNIVPNQQIQYGANTQVQNGISQYPQSQNYYNAQYQSNPSQYQQHL
QQMNVNPQYSSNSNQAQQYNGHIQNQNNSEQSSEAMLSESEEE

>TTHERM_00499530(gene)
ATGAGTGATGTAATATCTTAAATAACTTCCTAAACAGAAGAGCAATCATTTATACTCAAT
TATTTGTGAATTAACTATCATTTTATTCTCTAAATTTTTTGAATTTCAGCAAACCTAATC
TTTGTGTATGATTTTAAAATTAGTAAGTATAAGAAATATTTTTGACATAAGAGTAATCAA
AGTACATCAATAGTATGCTACCTAGAGGATACTCACTGTAATTCTCATCTTCTCACACTA
GACGTGTTCAAATGAATCCAAATGCTACAAAGTTAAATGTAATTTACTTAAAATTTTTTA
GACCAAACTTTTGAGCTTTGTTTACAATTTTTGATGTTACATTAAAGATCATAATTTTAA
ACTTGGAAGAAAACTCTTAAGTATTAAGATAAATAACGATATGAAGGCATTCATATACTC
TTCACCCAAATACAATGCATAGGAAATAAATAAAATGAAATAGAATTTATAATATATTAG
TATAGCAAAATATGTTGCATAGAAAGATATGAAAAATAAAGTTCCTAAATTTTAGATTGA
TTTATTTAAATATCAAACAAAAGCAATATGAGCAAACACTGATCTAAGAGAGGTTAAAGT
AAACTAGATCCAAGATGAATCAGGCAGCAAATGCTTAAAATGCCGCATCATTAGCAGCCC
AACAAAATAAAAATGATAAAGATAAAAAGTTGTAATCCAAAAAAGAAAATATACCTGAAA
AAGAATAAATAGCCGATTCTCCAGAAAGCGGAAATACAAAGAAAAGAAAGTAGTAGGAAA
AAATTTTAGAAAAGTAAGCAGCAAAAAGCTTAAAACAGCAAAATTAAGTTTTATAGTAAG
TAATTAGTGTTGACACACAATAGAAAGGAACAATTCCTGTTTCTGAAGACATAAGGGTGT
GCTTTTCGATATTGTAATAACTAAAGAAAAGCGAAAATGCAGGTCCATTTTTATAAAAAG
TTGATGCCTTAGCACAATAATGCCCTGACTACTATAAAATAATAAGAGATCCAATGGATT
TATCGAAAGTGGAGTCAAATTTAAAACAGGGCTATTATTAAACTACTTTACAATTCGCAG
ATGATGTTAGAAAGATATGGAATAACTCCTTTACATATAACTAAAAAGGAAGCTAAATCT
ATAAAATGACAGAAGAAATGAGCAGGTTATTTGAAAAAATTTTTACTCAGGTAAAAAGTT
AATCACTTCCTAACCCTATGGAGTATCAGTAATAATTTTTTATTTAAATTATAAATGTAA
ATTCATTCAGAATGCTGAAAAATATGAATTTTTGTTAACTTAAACGAAGTAAAACACAAA
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GGTTTTGAGTTGATTCATTTAAAAAATATAATTTTTGAACGAAATCCTCTATTTATTCAA
TAAAATTTCCTCAAAATTGTTGCACTTAATCTTCATTAGTTAATTAAGTGAAAATAAAAA
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TAACAAAAAATTTCAAATAAAAAGCAATAGGTTGATGGTTGTAGCATTTAAATACATTTT
TAATTAAAATTTACACATTTACTTATATATCTTTTTGATCAAAAAATAAACAACATCAAG
ATCCTTTGCTTTCACTTACTTACATATATTAGGATATATAAATATAATTTTTTAATTTTA
GTTTACCAAAGTCGTAGAACTTAATAAATAAAAAATTAAATATCCTTCATTAATTAATTA
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TTCTTCCAACTCTATCAACAATAATACCGCTTCGTCATTAAAGAAGAGAGCTAATAAATA
AGCATAAAATGTTACTTAATAATAGAATTAGATTTAATAGCTATCTTCTGCTTCAGTGCC
AATAACTTAAAATTCAGCTATACCAGCAAATCCTCCAAAACCTGAAAAATAAAAAAAGAC
TAAATAAACTGCTAACTAACCTGATACAACTGCATAATAAGCCAAAGCTAAAGATAAATA
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AGAAGACGATACAAAATAATTATACGAGTTAATAAAGGATTACTGTGAAACAAATAACGA
ATAGATTGAATTAAATATAGATAATCTCCCTATTAAAACTGCAAGAGAAGTACAAGAATT
CGTTCTTTTCAAAAGACGTTTACCATCTTAGCAATAAGTCAATCAATAACAATAATAATA
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TGATAGAATTTGATATTGATACATTGCCAGTAAGAAAAGCTAGAGAATTAGAAGCATATG
TCAAGTAAAGAGCTGCATTTCAACAAAAAAAACAACGTGTTTAGAAAAATTAACCAAATA
ACCTTTTATCAGACAGCTAACAATAAGCTAAAGCTTAGTTACCATACTCTACGCCTACAA
CAACTACAACTGCAAGTACTACAGTAAATACTAATTAAACTCCAATTGATGCTGCAGTAA
ACAACTTCCCACAATAAACTAGCTTTACTGCTGCTTAGTAATATCCTGCCACAGCTTACG
CTAGTAATCCAGGTTATACATAAGCAAATTAACTTATTCAAAATAATGGTTCTGCTTAAA
ATGCTGCAAGTGCAAAAGTCAACAACAGCTAAATGATATAGTAGGGATAGTATGTTCAAG
CTAATCCAGTAGCTTAGTAATAACTACCCATTGCTTAAGCAACTACATAATAAAACATGG
CTTCTATATAAGGATACAATCATTTAAATTAATAATAGTATGCTTAGCAATCGACATACT
AAAATTAAATGATGATGAATTAATATCCTTCTGCTTTTCCTATTTAGTAACCTATGGTAC
TTTCTTGTTCACTTTTTTAAAACTTTTTAAAAATTTTATCAAATATAAAAGCAAAGCGCT
GTCATCGGTGGTTATCAGAACAGACCCAGCTAATAGTATGATGCAGGTTAATAAGGCATG
GCAATACCAAGCATGATTAATTAAACTTAGCAACCTTATTCAGGATAGCAGTATAATCAA
TAGGGATAAGCATAATATTAAGGATATGGAAATAACATGCAAAATATGTATATGAATTAG
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AATGTAAATCCACAGTACAGCAGTAATAGTAATTAAGCTTAGTAATATAACGGTCATATT
TAAAATTAGAATAACAGTGAGTAAAGTTCTGAAGCAATGCTCTCTGGTAATTTTAAAAAA
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GAGGAAGAGTGA