Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00499530Standard Name
BrEt-2 (Bromodomain and ET domain 2)Aliases
PreTt07996 | 63.m00174 | 3716.m00028Description
bromodomain domain proteinGenome Browser (Macronucleus)
![]()
Genome Browser (Micronucleus)
![]()
Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.9%
TetraMine Data
TTHERM_00499530
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_09681.1 9.997093137033517e-262 bromodomain containing protein
(921 aa)
SGD YDL070W 3.001003044337619e-17 BDF2 Protein involved in trans
cription initiation at TATA-co
ntaining promoters; associates
with the basal transcription
factor TFIID; contains two bro
modomains; corresponds to the
C-terminal region of mammalian
TAF1; redundant with Bdf1p
WormBase WBGene00000366 6.001122775063233e-17 locus:cbp-1 Protein cbp-1
status:Partially_confirmed U
niProt:P34545 protein_id:CAD
18875.2
DictyBase DDB_G0270170 2.0004286606204839e-16 DDB_G0270170 on chromosome: 1
position 4360881 to 4366105
Oxytricha Contig20804.0.g30 0.00000000000001000191320216021 Bromodomain
Stentor Coeruleus SteCoe_26840 0.00000000000009357622968840175
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
- Ref:29523178: Saettone A, Garg J, Lambert JP, Nabeel-Shah S, Ponce M, Burtch A, Thuppu Mudalige C, Gingras AC, Pearlman RE, Fillingham J (2018) The bromodomain-containing protein Ibd1 links multiple chromatin-related protein complexes to highly expressed genes in Tetrahymena thermophila. Epigenetics & chromatin 11(1):10
Sequences
>TTHERM_00499530(coding)
ATGAGTGATTAAGTATAAGAAATATTTTTGACATAAGAGTAATCAAAGTACATCAATAGT
ATGCTACCTAGAGGATACTCACTGTAATTCTCATCTTCTCACACTAGACGTGTTCAAATG
AATCCAAATGCTACAAAGTTAAATCAATATGAGCAAACACTGATCTAAGAGAGGTTAAAG
TAAACTAGATCCAAGATGAATCAGGCAGCAAATGCTTAAAATGCCGCATCATTAGCAGCC
CAACAAAATAAAAATGATAAAGATAAAAAGTTGTAATCCAAAAAAGAAAATATACCTGAA
AAAGAATAAATAGCCGATTCTCCAGAAAGCGGAAATACAAAGAAAAGAAAGTAGTAGGAA
AAAATTTTAGAAAAGTAAGCAGCAAAAAGCTTAAAACAGCAAAATTAAGTTTTATAGTAA
GTAATTAGTGTTGACACACAATAGAAAGGAACAATTCCTGTTTCTGAAGACATAAGGGTG
TGCTTTTCGATATTGTAATAACTAAAGAAAAGCGAAAATGCAGGTCCATTTTTATAAAAA
GTTGATGCCTTAGCACAATAATGCCCTGACTACTATAAAATAATAAGAGATCCAATGGAT
TTATCGAAAGTGGAGTCAAATTTAAAACAGGGCTATTATTAAACTACTTTACAATTCGCA
GATGATGTTAGAAAGATATGGAATAACTCCTTTACATATAACTAAAAAGGAAGCTAAATC
TATAAAATGACAGAAGAAATGAGCAGGTTATTTGAAAAAATTTTTACTCAGGTAAAAAGT
TAATCACTTCCTAACCCTATGGAGTATCAAGATTCAATAGACGCTTCTTCCAACTCTATC
AACAATAATACCGCTTCGTCATTAAAGAAGAGAGCTAATAAATAAGCATAAAATGTTACT
TAATAATAGAATTAGATTTAATAGCTATCTTCTGCTTCAGTGCCAATAACTTAAAATTCA
GCTATACCAGCAAATCCTCCAAAACCTGAAAAATAAAAAAAGACTAAATAAACTGCTAAC
TAACCTGATACAACTGCATAATAAGCCAAAGCTAAAGATAAATATTAAACCAAATTAAGT
TAAGATGAAATCAACTAACTTTATTAAAATATCGGATCGCTTACAGAAGACGATACAAAA
TAATTATACGAGTTAATAAAGGATTACTGTGAAACAAATAACGAATAGATTGAATTAAAT
ATAGATAATCTCCCTATTAAAACTGCAAGAGAAGTACAAGAATTCGTTCTTTTCAAAAGA
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TAATAATAGTTGTAATAATAATAATAATTACAGCAGCAATAAATCCAATAATAGAAATAG
CAATAGTCATAAGATGAATAGTAAGACAATAAAAAGAAGAAGAAGATTGGAAAATTGGAA
AAGAAAGACATCCCATTAACTATCAGTGAAAAGAAGCAACTAGGAATAAATATACGTAGA
CTTCCTCCAGAAGATTTAAATGGAATTTGGAGTATAGTATAAGATAGCTAATAAAATAGT
GAAGTGATAGAATTTGATATTGATACATTGCCAGTAAGAAAAGCTAGAGAATTAGAAGCA
TATGTCAAGTAAAGAGCTGCATTTCAACAAAAAAAACAACGTGTTTAGAAAAATTAACCA
AATAACCTTTTATCAGACAGCTAACAATAAGCTAAAGCTTAGTTACCATACTCTACGCCT
ACAACAACTACAACTGCAAGTACTACAGTAAATACTAATTAAACTCCAATTGATGCTGCA
GTAAACAACTTCCCACAATAAACTAGCTTTACTGCTGCTTAGTAATATCCTGCCACAGCT
TACGCTAGTAATCCAGGTTATACATAAGCAAATTAACTTATTCAAAATAATGGTTCTGCT
TAAAATGCTGCAAGTGCAAAAGTCAACAACAGCTAAATGATATAGTAGGGATAGTATGTT
CAAGCTAATCCAGTAGCTTAGTAATAACTACCCATTGCTTAAGCAACTACATAATAAAAC
ATGGCTTCTATATAAGGATACAATCATTTAAATTAATAATAGTATGCTTAGCAATCGACA
TACTAAAATTAAATGATGATGAATTAATATCCTTCTGCTTTTCCTATTTAGTAACCTATG
CAAAGCGCTGTCATCGGTGGTTATCAGAACAGACCCAGCTAATAGTATGATGCAGGTTAA
TAAGGCATGGCAATACCAAGCATGATTAATTAAACTTAGCAACCTTATTCAGGATAGCAG
TATAATCAATAGGGATAAGCATAATATTAAGGATATGGAAATAACATGCAAAATATGTAT
ATGAATTAGCCTCTTAGTGCTAATTCAAATGGCAATCACAATAGAAATATTGTGCCTAAT
TAACAAATTCAATATGGAGCTAATACATAAGTGTAAAATGGAATCAGCTAATACCCTCAA
TCGTAAAATTACTACAATGCTTAATATCAATCAAACCCAAGCTAGTATTAGTAACATTTA
CAATAAATGAATGTAAATCCACAGTACAGCAGTAATAGTAATTAAGCTTAGTAATATAAC
GGTCATATTTAAAATTAGAATAACAGTGAGTAAAGTTCTGAAGCAATGCTCTCTGAAAGT
GAGGAAGAGTGA>TTHERM_00499530(protein)
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MNQPLSANSNGNHNRNIVPNQQIQYGANTQVQNGISQYPQSQNYYNAQYQSNPSQYQQHL
QQMNVNPQYSSNSNQAQQYNGHIQNQNNSEQSSEAMLSESEEE>TTHERM_00499530(gene)
ATGAGTGATGTAATATCTTAAATAACTTCCTAAACAGAAGAGCAATCATTTATACTCAAT
TATTTGTGAATTAACTATCATTTTATTCTCTAAATTTTTTGAATTTCAGCAAACCTAATC
TTTGTGTATGATTTTAAAATTAGTAAGTATAAGAAATATTTTTGACATAAGAGTAATCAA
AGTACATCAATAGTATGCTACCTAGAGGATACTCACTGTAATTCTCATCTTCTCACACTA
GACGTGTTCAAATGAATCCAAATGCTACAAAGTTAAATGTAATTTACTTAAAATTTTTTA
GACCAAACTTTTGAGCTTTGTTTACAATTTTTGATGTTACATTAAAGATCATAATTTTAA
ACTTGGAAGAAAACTCTTAAGTATTAAGATAAATAACGATATGAAGGCATTCATATACTC
TTCACCCAAATACAATGCATAGGAAATAAATAAAATGAAATAGAATTTATAATATATTAG
TATAGCAAAATATGTTGCATAGAAAGATATGAAAAATAAAGTTCCTAAATTTTAGATTGA
TTTATTTAAATATCAAACAAAAGCAATATGAGCAAACACTGATCTAAGAGAGGTTAAAGT
AAACTAGATCCAAGATGAATCAGGCAGCAAATGCTTAAAATGCCGCATCATTAGCAGCCC
AACAAAATAAAAATGATAAAGATAAAAAGTTGTAATCCAAAAAAGAAAATATACCTGAAA
AAGAATAAATAGCCGATTCTCCAGAAAGCGGAAATACAAAGAAAAGAAAGTAGTAGGAAA
AAATTTTAGAAAAGTAAGCAGCAAAAAGCTTAAAACAGCAAAATTAAGTTTTATAGTAAG
TAATTAGTGTTGACACACAATAGAAAGGAACAATTCCTGTTTCTGAAGACATAAGGGTGT
GCTTTTCGATATTGTAATAACTAAAGAAAAGCGAAAATGCAGGTCCATTTTTATAAAAAG
TTGATGCCTTAGCACAATAATGCCCTGACTACTATAAAATAATAAGAGATCCAATGGATT
TATCGAAAGTGGAGTCAAATTTAAAACAGGGCTATTATTAAACTACTTTACAATTCGCAG
ATGATGTTAGAAAGATATGGAATAACTCCTTTACATATAACTAAAAAGGAAGCTAAATCT
ATAAAATGACAGAAGAAATGAGCAGGTTATTTGAAAAAATTTTTACTCAGGTAAAAAGTT
AATCACTTCCTAACCCTATGGAGTATCAGTAATAATTTTTTATTTAAATTATAAATGTAA
ATTCATTCAGAATGCTGAAAAATATGAATTTTTGTTAACTTAAACGAAGTAAAACACAAA
AGAAAGGTGGAAAAAATAATTTTATTTTCACATACAAAAAATACAGCAGTAAAAGTTATT
GGTTTTGAGTTGATTCATTTAAAAAATATAATTTTTGAACGAAATCCTCTATTTATTCAA
TAAAATTTCCTCAAAATTGTTGCACTTAATCTTCATTAGTTAATTAAGTGAAAATAAAAA
AATAATTCCATTCAAATTAAAAAAAATTGATTGATTGATTAATTAATTATTTGAACGAAC
ATCTTTTTATAAAATTTTTCAAATTTCTTTAGTGGATAAAAAAATTCCAAATAGGAGCAA
TAACAAAAAATTTCAAATAAAAAGCAATAGGTTGATGGTTGTAGCATTTAAATACATTTT
TAATTAAAATTTACACATTTACTTATATATCTTTTTGATCAAAAAATAAACAACATCAAG
ATCCTTTGCTTTCACTTACTTACATATATTAGGATATATAAATATAATTTTTTAATTTTA
GTTTACCAAAGTCGTAGAACTTAATAAATAAAAAATTAAATATCCTTCATTAATTAATTA
TCAATTTGTATTTTCATTCTCATAATTTTTTGCATACAAAATTAGAGATTCAATAGACGC
TTCTTCCAACTCTATCAACAATAATACCGCTTCGTCATTAAAGAAGAGAGCTAATAAATA
AGCATAAAATGTTACTTAATAATAGAATTAGATTTAATAGCTATCTTCTGCTTCAGTGCC
AATAACTTAAAATTCAGCTATACCAGCAAATCCTCCAAAACCTGAAAAATAAAAAAAGAC
TAAATAAACTGCTAACTAACCTGATACAACTGCATAATAAGCCAAAGCTAAAGATAAATA
TTAAACCAAATTAAGTTAAGATGAAATCAACTAACTTTATTAAAATATCGGATCGCTTAC
AGAAGACGATACAAAATAATTATACGAGTTAATAAAGGATTACTGTGAAACAAATAACGA
ATAGATTGAATTAAATATAGATAATCTCCCTATTAAAACTGCAAGAGAAGTACAAGAATT
CGTTCTTTTCAAAAGACGTTTACCATCTTAGCAATAAGTCAATCAATAACAATAATAATA
ATAATAGTTGTAGTAATAATAATAGTTGTAATAATAATAATAATTACAGCAGCAATAAAT
CCAATAATAGAAATAGCAATAGTCATAAGAGTAATTAATTCTATTTAATTTTTTACTTCA
CCATTAATTTTTGCTAAATAACCTTCAACTCAACCATAAATCTTAAATTTTTTCCAACTG
CTGAACTAAAATAAATTAATTGGTTAATGAAAAAAATATTTTGAATTATAAAAAGAAATT
TATATTGAAAATTATCGCAAAATAATTTATTTAAATTTTACATTAATATTATCATTTTAA
TTAACAAAAGTGAATAGTAAGACAATAAAAAGAAGAAGAAGATTGGAAAATTGGAAAAGA
AAGACATCCCATTAACTATCAGTGAAAAGAAGCAACTAGGAATAAATATACGTAGACTTC
CTCCAGAAGATTTAAATGGAATTTGGAGTATAGTATAAGATAGCTAATAAAATAGTGAAG
TGATAGAATTTGATATTGATACATTGCCAGTAAGAAAAGCTAGAGAATTAGAAGCATATG
TCAAGTAAAGAGCTGCATTTCAACAAAAAAAACAACGTGTTTAGAAAAATTAACCAAATA
ACCTTTTATCAGACAGCTAACAATAAGCTAAAGCTTAGTTACCATACTCTACGCCTACAA
CAACTACAACTGCAAGTACTACAGTAAATACTAATTAAACTCCAATTGATGCTGCAGTAA
ACAACTTCCCACAATAAACTAGCTTTACTGCTGCTTAGTAATATCCTGCCACAGCTTACG
CTAGTAATCCAGGTTATACATAAGCAAATTAACTTATTCAAAATAATGGTTCTGCTTAAA
ATGCTGCAAGTGCAAAAGTCAACAACAGCTAAATGATATAGTAGGGATAGTATGTTCAAG
CTAATCCAGTAGCTTAGTAATAACTACCCATTGCTTAAGCAACTACATAATAAAACATGG
CTTCTATATAAGGATACAATCATTTAAATTAATAATAGTATGCTTAGCAATCGACATACT
AAAATTAAATGATGATGAATTAATATCCTTCTGCTTTTCCTATTTAGTAACCTATGGTAC
TTTCTTGTTCACTTTTTTAAAACTTTTTAAAAATTTTATCAAATATAAAAGCAAAGCGCT
GTCATCGGTGGTTATCAGAACAGACCCAGCTAATAGTATGATGCAGGTTAATAAGGCATG
GCAATACCAAGCATGATTAATTAAACTTAGCAACCTTATTCAGGATAGCAGTATAATCAA
TAGGGATAAGCATAATATTAAGGATATGGAAATAACATGCAAAATATGTATATGAATTAG
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CAATATGGAGCTAATACATAAGTGTAAAATGGAATCAGCTAATACCCTCAATCGTAAAAT
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AATGTAAATCCACAGTACAGCAGTAATAGTAATTAAGCTTAGTAATATAACGGTCATATT
TAAAATTAGAATAACAGTGAGTAAAGTTCTGAAGCAATGCTCTCTGGTAATTTTAAAAAA
CATTAAAATATTTAATAAAATTATTTAAATTGATTTATTTCTTAAAAATAATTAGAAAGT
GAGGAAGAGTGA