Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_01620840
Standard Name
BLT5 (Beta-Like Tubulin 5)
Aliases
PreTt24577 | 513.m00004
Description
BLT5 tubulin; Beta-tubulin-like protein
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
Cellular Component Molecular Function Biological Process
Domains
( PF00091 ) Tubulin/FtsZ family, GTPase domain
( PF03953 ) tubulin/FtsZ family, C-terminal domain
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.3%
TetraMine Data
TTHERM_01620840
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Stentor Coeruleus SteCoe_24853 0
WormBase WBGene00006538 9.997093137033517e-262 locus:tbb-4 Tubulin beta-4 c
hain status:Partially_confir
med UniProt:P41937 protein
_id:CAA86310.1
Tetrahymena borealis EI9_19570.1 9.997093137033517e-262 tubulin/FtsZ family, GTPase do
main-containing protein (444 a
a)
Oxytricha Contig8449.0.g1 9.997093137033517e-262 Tubulin/FtsZ family, GTPase do
main
DictyBase DDB_G0269196 8.999778555070543e-161 tubB on chromosome: 1 position
3261649 to 3263130
SGD YFL037W 9.997639769646959e-151 TUB2 Beta-tubulin; associates
with alpha-tubulin (Tub1p and
Tub3p) to form tubulin dimer,
which polymerizes to form micr
otubules
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
Ref:16933976 : Eisen JA, Coyne RS, Wu M, Wu D, Thiagarajan M, Wortman JR, Badger JH, Ren Q, Amedeo P, Jones KM, Tallon LJ, Delcher AL, Salzberg SL, Silva JC, Haas BJ, Majoros WH, Farzad M, Carlton JM, Smith RK, Garg J, Pearlman RE, Karrer KM, Sun L, Manning G, Elde NC, Turkewitz AP, Asai DJ, Wilkes DE, Wang Y, Cai H, Collins K, Stewart BA, Lee SR, Wilamowska K, Weinberg Z, Ruzzo WL, Wloga D, Gaertig J, Frankel J, Tsao CC, Gorovsky MA, Keeling PJ, Waller RF, Patron NJ, Cherry JM, Stover NA,
Sequences
>TTHERM_01620840(coding)ATG AGA GAA ATT CTT AAT ATT CAA ATA GGT TAG GCA GGG AAT TAA ATT GGT ACA GCC TAT TGG GAA GAA ATC TCT AAA GAG CAT GGT ATT TAA CCT ACT GGT GTT CAT AAA GGT GAT TCT GAT TTG TAA TTA GAG AAA ATA GAT GTG TAT TAT AAC CAA ACA AAA GCA GAT AAA TAT GTT CCT AGA GCT ATT TTG ATC GAT TTA GAT CCA GCA TTG TTA AAT TCT ATT AAT ACA AGT TAA ATT GGG CAA CTT TTC AAG CCT GAA AAC TTA ATA ATT GGT TAA GAC CCA GCA GAA AAT AAT TGG GCT ATT GGT CAT TAC ATT TTA GGT CCA TAA TAT ATT GAT TAA GTT ATG GAG ACT GTC AGA AAA GAG GCT GAA ATT TGT GAT TGT CTT TAG GGT TTT TAA ATG ATC CAT TCA ATA GGT GGT GGT ACT GGT TCG GGA ATG GGT ACT CTC CTT CTT TAG AAA TTA AAA GAA GAA TAT CCT GAT AGA ATT ACT GAA ACA TTC TCA ATT TTC CCT TCA ACT AAG ATT TCA GAT AAA ATA ATA GAA CCC TAC AAT GCT TTG CTT TCT ATT AAT TAA TTA ATC GAA TAT GCT GAT TAA ACT ATG GTA ATT GAT AAT GAA GCT CTT TAT GAT ATT TGT TTT AGA GTT GCT AAA CTT TAC AAC CCT AAT TTA AAG GAT CTT AAC TAT TAT ATT TCT TCT GCA ATA TCT TCT ATT ACT TGT ACT CTA AGA TTT CCT GGA TTA TTT AAT TCA GAC CTT AGA AAA ATT GCT CTT AAC TTG ATT CCT TTT CCT CGA CTC CAT TTT TTA ATG AGT GCT ATT GCT CCT AGT TAT TCA AGA GGC TCT ACT TAG TGC TAT CCA CCT AAA TTT CCT GAA ATA AAA AAT TTG GTT TAC AAT CCT AGA ACT ATG CTT TGC TCT ACT GAT TGG AGA TAT GGT AGA TTT TTA GCT GCC TCT GCT ATT TTC AGA GGA AGG ATA CCA TAT AAA GAT TTC TTT GAA TAG GTT GTA AAT TCT TCA AAT GAA TAT AAC TCT TAT TTT GTA TAA TAA ATT CCT AAC AAT TTG AAA TAT TCT AAA TGT GAT ATT CCT CTT AAT TCA GTA AGA TTA TCT GGT GTC CTT ATT GGA AAT TCT ACA GCC ATA AAA GAC GTA TTT AAT AGG ATT TCA AAT TAA TTT ACT GCT TTA TTT TAA AAT AAA ACT TTT TTG TCG CAG TAT ACA AAT AAA GGA ATG GAA GAA ATA GAA TTC AAA GAA GCT CAT TCA AAT GTG ATG GAT TTG ATT TCA GAA TAT TAA TAG TGT GAA AAT CTT TTT GAT GAA GAA GCA GAA TTT GAT GAA TTC GAT GAA GAA ATG CCA ATT GAA GAA AAT AAA GAA ATT GGA GAA GAG AAA GAT AAA AAT TGA >TTHERM_01620840(protein)M R E I L N I Q I G Q A G N Q I G T A Y W E E I S K E H G I Q P T G V H K G D S D L Q L E K I D V Y Y N Q T K A D K Y V P R A I L I D L D P A L L N S I N T S Q I G Q L F K P E N L I I G Q D P A E N N W A I G H Y I L G P Q Y I D Q V M E T V R K E A E I C D C L Q G F Q M I H S I G G G T G S G M G T L L L Q K L K E E Y P D R I T E T F S I F P S T K I S D K I I E P Y N A L L S I N Q L I E Y A D Q T M V I D N E A L Y D I C F R V A K L Y N P N L K D L N Y Y I S S A I S S I T C T L R F P G L F N S D L R K I A L N L I P F P R L H F L M S A I A P S Y S R G S T Q C Y P P K F P E I K N L V Y N P R T M L C S T D W R Y G R F L A A S A I F R G R I P Y K D F F E Q V V N S S N E Y N S Y F V Q Q I P N N L K Y S K C D I P L N S V R L S G V L I G N S T A I K D V F N R I S N Q F T A L F Q N K T F L S Q Y T N K G M E E I E F K E A H S N V M D L I S E Y Q Q C E N L F D E E A E F D E F D E E M P I E E N K E I G E E K D K N >TTHERM_01620840(gene)ATG AGA GAA ATT CTT AAT ATT CAA ATA GGT TAG GCA GGG AAT TAA ATT GGT ACA GCC TAT TGG GAA GAA ATC TCT AAA GAG CAT GGT ATT TAA CCT ACT GGT GTT CAT AAA GGT GAT TCT GAT TTG TAA TTA GAG AAA ATA GAT GTG TAT TAT AAC CAA ACA AAA GCA GAT AAA TAT GTT CCT AGA GCT ATT TTG ATC GAT TTA GAT CCA GCA TTG TTA AAT TCT ATT AAT ACA AGT TAA ATT GGG CAA CTT TTC AAG CCT GAA AAC TTA ATA ATT GGT TAA GAC CCA GCA GAA AAT AAT TGG GCT ATT GGT CAT TAC ATT TTA GGT CCA TAA TAT ATT GAT TAA GTT ATG GAG ACT GTC AGA AAA GAG GCT GAA ATT TGT GAT TGT CTT TAG GGT TTT TAA ATG ATC CAT TCA ATA GGT GGT GGT ACT GGT TCG GGA ATG GGT ACT CTC CTT CTT TAG AAA TTA AAA GAA GAA TAT CCT GAT AGA ATT ACT GAA ACA TTC TCA ATT TTC CCT TCA ACT AAG ATT TCA GAT AAA ATA ATA GAA CCC TAC AAT GCT TTG CTT TCT ATT AAT TAA TTA ATC GAA TAT GCT GAT TAA ACT ATG GTA ATT GAT AAT GAA GCT CTT TAT GAT ATT TGT TTT AGA GTT GCT AAA CTT TAC AAC CCT AAT TTA AAG GAT CTT AAC TAT TAT ATT TCT TCT GCA ATA TCT TCT ATT ACT TGT ACT CTA AGA TTT CCT GGA TTA TTT AAT TCA GAC CTT AGA AAA ATT GCT CTT AAC TTG ATT CCT TTT CCT CGA CTC CAT TTT TTA ATG AGT GCT ATT GCT CCT AGT TAT TCA AGA GGC TCT ACT TAG TGC TAT CCA CCT AAA TTT CCT GAA ATA AAA AAT TTG GTT TAC AAT CCT AGA ACT ATG CTT TGC TCT ACT GAT TGG AGA TAT GGT AGA TTT TTA GCT GCC TCT GCT ATT TTC AGA GGA AGG ATA CCA TAT AAA GAT TTC TTT GAA TAG GTT GTA AAT TCT TCA AAT GAA TAT AAC TCT TAT TTT GTA TAA TAA ATT CCT AAC AAT TTG AAA TAT TCT AAA TGT GAT ATT CCT CTT AAT TCA GTA AGA TTA TCT GGT GTC CTT ATT GGA AAT TCT ACA GCC ATA AAA GAC GTA TTT AAT AGG ATT TCA AAT TAA TTT ACT GCT TTA TTT TAA AAT AAA ACT TTT TTG TCG CAG TAT ACA AAT AAA GGA ATG GAA GAA ATA GAA TTC AAA GAA GCT CAT TCA AAT GTG ATG GAT TTG ATT TCA GAA TAT TAA TAG TGT GAA AAT CTT TTT GAT GAA GAA GCA GAA TTT GAT GAA TTC GAT GAA GAA ATG CCA ATT GAA GAA AAT AAA GAA ATT GGA GAA GAG AAA GAT AAA AAT TGA