Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00005890

Standard Name

Anqa6

Aliases

PreTt11600 | 1.m00648

Description

Tesmin/TSO1-like CXC domain containing protein. Homolog of Lin54. Tetrahymena contains at least 14 Lin54-like genes (Anqa1-14) (Nabeel-Shah et al. 2021).

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Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF05033 ) Pre-SET motif
  • ( PF03638 ) Tesmin/TSO1-like CXC domain
  • ( PF08512 ) Histone chaperone Rttp106-like

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 11.5%

TetraMine Data

TTHERM_00005890

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_17104.19.997093137033517e-262hypothetical protein (713 aa)
OxytrichaContig21081.0.g248.998549051015915e-36Tesmin/TSO1-like CXC domain
WormBaseWBGene000030371.9993007828132465e-27locus:lin-54 Protein lin-54
status:Partially_confirmed
UniProt:Q95QD7 protein_id:C
AB05229.1
DictyBaseDDB_G02815195.00179831534194e-27lin54 on chromosome: 3 positio
n 4464773 to 4467683
Stentor CoeruleusSteCoe_119950.000000000000004658886145103398

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:34086947: Nabeel-Shah S, Garg J, Saettone A, Ashraf K, Lee H, Wahab S, Ahmed N, Fine J, Derynck J, Pu S, Ponce M, Marcon E, Zhang Z, Greenblatt JF, Pearlman RE, Lambert JP, Fillingham J (2021) Functional characterization of RebL1 highlights the evolutionary conservation of oncogenic activities of the RBBP4/7 orthologue in Tetrahymena thermophila. Nucleic acids research ( ):

Sequences

>TTHERM_00005890(coding)
ATGGACAATAGTCAAATGACACCAGTAAAGTAGCAGCCAAAAATGCAATAATAGGATGAC
AATATCAATTCCTTTCAAACTTAAAGCAATGCTTTGGGGAACAACTTATTTAATGGTATG
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TCATCATCTAACAATTCGAATAATGAAGAAGAGGAAGAGGAAGAAGAAAATTAAGAATTA
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AACCATGAGCATCAAATTGATTAGGAAGATCATAGTGCTATTAAAACTTAAACACAATTT
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>TTHERM_00005890(protein)
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AYSNLNKVNENQSSDTMFYPINDPIFQPTPSPNVYMEYKAGNNNNPYLNSSFKTNGMLAS
TKKPYNNNLFLTPIKEDDRRKPAYINSILKDSPYFNGNNICRKLNFEDDVDDFSGNCFNP
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NSFSNQNNQKKLQTIQQNGNSHIQANASSTNNQANSNNTIAPQASVFSSNQKKQKTCNCK
KTKCLKLYCDCFAAGELCGGECNCFGCFNTSNSEKRAGAIVSIMDRQPDAFGPKVQQNTH
KKGCNCTRSGCLKKYCECYTLGVNCGEYCKCTQCKNVDLNHSERLALSMNGSNGIGNSVD
LPKKSSSDKRQQQLDEIETKASTKKKIFSNQENSKFASNNSSSNNSNNEEEEEEEENQEL
DEELEIKQNSRMNKNMKEREDDIDDENEQEEEEEEEQEEEINQDRQRQINEQISPSQKMY
TTPLKQPIKQDSRSLTTADTAKKNQCQENDSEIKNRIVKLKISESQSTKKQQPNKSENQN
NHEHQIDQEDHSAIKTQTQFSTIKNKSQIAKTTKIS


>TTHERM_00005890(gene)
ATGGACAATAGTCAAATGACACCAGTAAAGTAGCAGCCAAAAATGCAATAATAGGATGAC
AATATCAATTCCTTTCAAACTTAAAGCAATGCTTTGGGGAACAACTTATTTAATGGTATG
GCTACCTCATCCATTTTTTTAGCTAATTCATAAGCTAATTTGAACCCTTTAACTACAAAA
GCTTACAGTAACTTAAATAAAGTGAATGAAAACTAATCATCTGACACTATGTTTTACCCA
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TTCAAAACAGTTTTTTCTTTATTGGAATAGCCATTATACCAAAGAAGAGCGTTTTTACTG
CAGTAAATTTTTGAATATGTAAGAGCAATTTTGATTTTTCATCATTAATAGAGTGCTTGC
TTGATTGCTCTTTAATTATAGTTTGAATAGTAAAGAAAAAGTGTATTTATTGATAAAAAT
TGCGCTAAAAGATTAATTATTATTAATAACAAAAAAGTGATGGGAAATCAAATAGTCAAA
AATCAATCTTTATTTATTAGTTGATTTTAAGAATTTAGGATTTGATTAAAACAAATAGGC
AAGCAAAAAATAAATAAATAAACAAACAAACAAATAAAAGGAAAGAGAGAAGGAAAGAAT
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GTGTAAAAATGTTGATTTAAATCATTCAGAAAGATTAGCACTATCAATGAATGGCAGCAA
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AAAGAACAGAATAGTTAAATTAAAGATTAGTGAGAGCCAGTCTACTAAGAAATAGCAACC
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