Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00466120

Standard Name

Anqa5

Aliases

PreTt18616 | 55.m00171 | 3710.m00021

Description

Tesmin/TSO1-like CXC domain containing protein. Homolog of Lin54. Tetrahymena contains at least 14 Lin54-like genes (Anqa1-14) (Nabeel-Shah et al. 2021).

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Domains

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.4%

TetraMine Data

TTHERM_00466120

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_14761.19.997093137033517e-262tesmin/TSO1-like CXC domain-co
ntaining protein (856 aa)
OxytrichaContig21081.0.g242.9993743585281133e-40Tesmin/TSO1-like CXC domain
WormBaseWBGene000030373.0013534825799953e-36locus:lin-54 Protein lin-54
status:Partially_confirmed
UniProt:Q95QD7 protein_id:C
AB05229.1
DictyBaseDDB_G02815197.999528511121947e-28lin54 on chromosome: 3 positio
n 4464773 to 4467683
Stentor CoeruleusSteCoe_126723.1391327920480296e-17

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:34086947: Nabeel-Shah S, Garg J, Saettone A, Ashraf K, Lee H, Wahab S, Ahmed N, Fine J, Derynck J, Pu S, Ponce M, Marcon E, Zhang Z, Greenblatt JF, Pearlman RE, Lambert JP, Fillingham J (2021) Functional characterization of RebL1 highlights the evolutionary conservation of oncogenic activities of the RBBP4/7 orthologue in Tetrahymena thermophila. Nucleic acids research ( ):

Sequences

>TTHERM_00466120(coding)
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GAAGAAATACTGATTCACAACAAAGGATGCAATTGTAAAAAATCTGGATGTGAAAAGAAA
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AGCTAAAAATCAGAGAACCAAGTATTTGAGCTACAACTTACTGATGGATAGGTTAAAAAT
ATAATAACGAAAAAGGAATGA


>TTHERM_00466120(protein)
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YHNRNTLDSLCNSQIEVEDENQLFSKKENKGRNSRQNYRQPISKKADLKVEANLDNNNNQ
DETKENHLITFSQERDSTYQNNMDPSHNNERNYKNQVDFAQDGDSDYNLKNIRLQRINFE
YSESEDTGDSNSQNIKKANKSRTLTFQRISKKNQIGSIKDELDGQSQSFQSGSLLIQVCQ
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TECSNTENNKAERESAIKQLQERNPDAFKPKIQTKEIKDDEEILIHNKGCNCKKSGCEKK
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NNEELYQHNSQSMLHHNSNLIGNSLLRQSQEDSIPNYSQSMKRFNMGEYNPNIPARLGSI
GIDSQNMFNSQNKFYFSQDDNLPIRFSQNSQNNINPLKHFQSSIAGFSSSQYRGGMFDDN
SQKSENQVFELQLTDGQVKNIITKKE


>TTHERM_00466120(gene)
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GCTACTAGTCGTTAAGATATTAAGTAAAGGATGGGGCCTGATAACAAAAAGAGAGTTCAC
GGTACTCGCGGAGCTACTAAAGCAGGCAGCGCAAACAAGAATGGTGCTGATGAACAACAA
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GTTTTTTTTTTCTTCTTCTTTGCAATTCTTCTGATAATCATTTTCTTTATTGATTTTTCA
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CAGAACTCATAAAACAACATAAATCCCTTGAAACACTTCCAAAGCAGCATAGCAGGCTTC
TCATCTTCATAATACAGAGGAGGAATGTTTGATGACAATAGCTAAAAATCAGAGAACCAA
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