Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01205350

Standard Name

AXE2 (Ankyrin/histone H3 methyl transferase and EXosome 3-5 exoribonuclease 2)

Aliases

PreTt02725 | 273.m00030

Description

AXE2 3-prime-5-prime exonuclease; 3'-5' exonuclease family protein; identified by homology with AXE1

Genome Browser (Macronucleus)

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Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

Biological Process

  • nucleobase-containing compound metabolic process (IEA) | GO:0006139

Domains

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 11.2%

TetraMine Data

TTHERM_01205350

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_20551.19.997093137033517e-2623-5 exonuclease (1106 aa)
OxytrichaContig6366.0.g391.0004249259458435e-52Ankyrin repeats (3 copies)
SGDYOR001W6.996829646809514e-23RRP6 Nuclear exosome exonuclea
se component; has 3-5 exonucle
ase activity; involved in RNA
processing, maturation, survei
llance, degradation, tethering
, and export; has similarity t
o E. coli RNase D and to human
PM-Sc1 100 (EXOSC10); mutant
displays reduced transcription
elongation in the G-less-base
d run-on (GLRO) assay
DictyBaseDDB_G02715722.0002795641672355e-21exosc10 on chromosome: 2 posit
ion 601251 to 605014
Stentor CoeruleusSteCoe_363991.0530617357553812e-20
WormBaseWBGene000007968.002082816694397e-20locus:crn-3 status:Confirmed
UniProt:G5EBX6 protein_id
:CAA90108.1

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_01205350(coding)
ATGGATTAAAGTATTAACTAGTAAAACTGGGAATCTCTTCTTGTTTAAGAGCTTTTCAAC
AATGAAATCCTTGATTTTATAGATAATGGATTGAATACAAAACCTTAATAGCTTCTTTAC
CTACTTTTCAAGTTAATGTAGGGTTTAAAACTAAATAAATAACATCAAAATAGTAACTCA
TCAGAATCTAATTCTGGTTTCAAATTATTACATGTAGAAGATGAAAATGATGATTAAAAG
CTAGAATATTTTTTGAAAAATACAATAACTACTTATGATTAGAATATTTAAACTATTGTA
AATTGCTAAGAATTAGTTAAAGCAAAAGAGGAATAATATAAATATTTAGTTAGATTAGAT
GATTAAATAAAATAAAATTGTTTGAAGCTTGAATTTAGCTAACAGAGTTAGCTATATGAT
TTTCATTAATAATGTGTGAATGGCTAATGGAAAAATTACAATCTTATTTCATTTTATCTA
TTTATCTCTCTGGGAAAAAGTAAGATATGGCCCAGACTATTCAAAGATATAAAATCTGGT
AAAAAAGTTGAGCGTCAATGGCAAATACATTAATTTTTCGATTAATTTAGAAATGACTTT
AGTAGCATTGTTAAATAAGGCTTTAATTCATCTGTCATATCAAAGAAGCATCAAAAGGAA
ATTGACAAACAAACAATCATTCAAAAAAGCAATAACTCCTTTATATAAGCTGTTAGGGAT
AATCAATTTGAAAAAGTCTAGTAAATGCTAGTAGATGGTACAAACATAGAAGCAATTGAT
ACAGTAGAATAATTTACAGCAGCACATATTGCTTGTGATGTGGGTAATATGGAAATGATA
AGATTACTTGATTCTTACAATTGTAATTGGGAAGCCCTAGACCATGAATAAATGACACCG
TTATATTATGCTATAAGAGGAGAAAATTTACCTACTGTCAAATTTTTAGTTGAAGAAAAA
AAGGTTAATATAGAACATAAAGAATTCATGCATAGAACTCCTTTTTACTGGGCTTGCTGC
CTAGGAAACCTTAGGATCATAAGATTTTTAACAGAAGCAGGAGCAGACATCAATGCAAAG
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GAAAGTATTCCTCTTTTAATTGCATATGGCGCAGATGTAAATAAACAAAATAAGTTTGGT
GATACAGCCTTGCATTTTGCTTCTCGTTTCGGACATATTAAAACAGTTATTATGCTCATA
GAATAGTTTAATGCTCTAGTTTTAGAAGACTGTAAAGGATTTACAGGATTAGACAACGCT
CTTATTGGTAATCATCTTGACATTTATACATATTTAATTGAAAAAATAGCGAAAGAATTC
ATTTAAACGCCAGATTAAAAATATCGACATCTTAAGAATTTAATAAAGTAGCATGAGAAT
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TTTGATATGCTTTCTTAAAAATTCAAACCATTTTTTGTTGAAGAAGATTAAATTATAAAT
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TTTATAGATGTCTTTTAGAAATTTGAATTTAATAATGTAAATGAAATTTTACACAACATC
CTAGAGTATAATGACAGAGAAATAGTTTAAATAGCATTTACTTTAAACTTAAATATCTTT
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GACATTTATAATCTTTTGGAGTAATTTTGTGTCAAAAATCTTAACTTTGATAAACAGCTC
GTTGAATTTTAAATTCCTGAGTATGATATCGTAGGAATCGAAGATTATTTAAAATCATTA
AAAGATAAAGTTTCAGAAAATGTTTACATGCAGGAAAAATAACACTATTGCTATCTAATA
GAACCTGAAATGAAATTTAATCTTAACAGACCTTTATTAGAATAAATTATTTAGGAGGTA
GATGAATCAAAAAAAGTAGAAATTTATGAGTTACACAATCAAAATGACTCTTAGTTCTAT
TAAGAAATAAATAGTATTTCTTTTGATAAAAAACCATTACATATAAAAAATAAAATGAAT
TCTTTACCTTCCATATTTGTAGATAAAGAAGAGTAACTTATAGAAAAAGTTATTCCAGAT
CTTTTATAGCATTAAATCATAGGTATAGATCTAGAATATTGGACAGATAATAAAGATTAG
AAATTATCTTTCATATGCACTCTATAATTGTCTACTTTATCATCAAATTTTGTTATCGAT
ATTCTTAATCTCAGTAAATCAGTATCTGTACATCTAAAGAGCATATTTGAATCTCCTAAA
TTTGTTAAAGTATTTCATGGTGGTGAAACAGATTTAAAACTACTAAAAAAAGATTTAAAC
TTTAATTTAGTAAATATATTTGATACTGCAAAAGCTTATCTTAAACAAAATAAAGGAGCT
GGATCAGTTTCTTTAAGTTCTCTTAGTTAGTAGTATTTAAATTATAATGTTGATAAATAG
TACTAAACTTCTGATTGGAGGATAAGACCTCTCCCAAAGCCGATGCTTAATTATGCAATG
TATGATTCTTTTATAACTTTGATATTATTTTTTGTTATGAAATCTACAATATCCTAAGAA
GATTTAAGCATAATAGCAATAAGTTGTAACAAAATGTGTATTAAATAGCTAGAAAAATCT
TCGTTTGATTTTAATAAACTATTTTTAATTAAAGATAACTAAAATATATAATGA


>TTHERM_01205350(protein)
MDQSINQQNWESLLVQELFNNEILDFIDNGLNTKPQQLLYLLFKLMQGLKLNKQHQNSNS
SESNSGFKLLHVEDENDDQKLEYFLKNTITTYDQNIQTIVNCQELVKAKEEQYKYLVRLD
DQIKQNCLKLEFSQQSQLYDFHQQCVNGQWKNYNLISFYLFISLGKSKIWPRLFKDIKSG
KKVERQWQIHQFFDQFRNDFSSIVKQGFNSSVISKKHQKEIDKQTIIQKSNNSFIQAVRD
NQFEKVQQMLVDGTNIEAIDTVEQFTAAHIACDVGNMEMIRLLDSYNCNWEALDHEQMTP
LYYAIRGENLPTVKFLVEEKKVNIEHKEFMHRTPFYWACCLGNLRIIRFLTEAGADINAK
TKLMRTALNKACFLGRADVGTFGKDCPEAALLLLEKGVNVDAEDVDQSTPLHIACSSEAL
ESIPLLIAYGADVNKQNKFGDTALHFASRFGHIKTVIMLIEQFNALVLEDCKGFTGLDNA
LIGNHLDIYTYLIEKIAKEFIQTPDQKYRHLKNLIKQHENKTQKLYLQLFLNNVVTIDDY
QYFFSNEIIEMLPLLRDVDMFDMLSQKFKPFFVEEDQIINLLLIVIKSRKIEFFNKLFES
FIDVFQKFEFNNVNEILHNILEYNDREIVQIAFTLNLNIFDYRNQNQTNNSFLHDLVQRR
KTGVIINFIKVINNKYPQSQLKNKFLIEKQGDLDFMKKFVLMKNDVNMNCIEQAVILKFF
DIYNLLEQFCVKNLNFDKQLVEFQIPEYDIVGIEDYLKSLKDKVSENVYMQEKQHYCYLI
EPEMKFNLNRPLLEQIIQEVDESKKVEIYELHNQNDSQFYQEINSISFDKKPLHIKNKMN
SLPSIFVDKEEQLIEKVIPDLLQHQIIGIDLEYWTDNKDQKLSFICTLQLSTLSSNFVID
ILNLSKSVSVHLKSIFESPKFVKVFHGGETDLKLLKKDLNFNLVNIFDTAKAYLKQNKGA
GSVSLSSLSQQYLNYNVDKQYQTSDWRIRPLPKPMLNYAMYDSFITLILFFVMKSTISQE
DLSIIAISCNKMCIKQLEKSSFDFNKLFLIKDNQNIQ


>TTHERM_01205350(gene)
ATGGATTAAAGTATTAACTAGTAAAACTGGGAATCTCTTCTTGTTTAAGAGCTTTTCAAC
AATGAAATCCTTGATTTTATAGATAATGGATTGAATACAAAACCTTAATAGCTTCTTTAC
CTACTTTTCAAGTTAATGTAGGGTTTAAAACTAAATAAATAACATCAAAATAGTAACTCA
TCAGAATCTAATTCTGGTTTCAAATTATTACATGTAGAAGATGAAAATGATGATTAAAAG
CTAGAATATTTTTTGAAAAATACAATAACTACTTATGATTAGAATATTTAAACTATTGTA
AATTGCTAAGAATTAGTTAAAGCAAAAGAGGAATAATATAAATATTTAGTTAGATTAGAT
GATTAAATAAAATAAAATTGTTTGAAGCTTGAATTTAGCTAACAGAGTTAGCTATATGAT
TTTCATTAATAATGTGTGAATGGCTAATGGAAAAATTACAATCTTATTTCATTTTATCTA
TTTATCTCTCTGGGAAAAAGTAAGATATGGCCCAGACTATTCAAAGATATAAAATCTGGT
AAAAAAGTTGAGCGTCAATGGCAAATACATTAATTTTTCGATTAATTTAGGTAATTTTAA
GATATTGTCATTTTTAAAGTTTAAAAGTTTGTAATTTAATTGTTAAACTATTAATTCTTA
ATAGAAATGACTTTAGTAGCATTGTTAAATAAGGCTTTAATTCATCTGTCATATCAAAGA
AGCATCAAAAGGAAATTGACAAACAAACAATCATTCAAAAAAGCAATAACTCCTTTATAT
AAGCTGTTAGGGATAATCAATTTGAAAAAGTCTAGTAAATGCTAGTAGATGGTACAAACA
TAGAAGCAGTAACAAAAACAACTTTTTTCTAATCCCTAATTTACAATTTATTTTTTGGAT
AACTAAATAAAATAGATTGATACAGTAGAATAATTTACAGCAGCACATATTGCTTGTGAT
GTGGGTAATATGGAAATGATAAGATTACTTGATTCTTACAATTGTAATTGGGAAGCCCTA
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AAATTTTTAGTTGAAGAAAAAAAGGTTAATATAGAACATAAAGAATTCATGCATAGAACT
CCTTTTTACTGGGCTTGCTGCCTAGGAAAGTAATTATTCAAACAAAAAATTAAATTACAT
AGACACTTTAATTAAGTCTAGACGCTATTAACAAACCTTAAATCAAATTATTTTAAAAGC
CTTAGGATCATAAGATTTTTAACAGAAGCAGGAGCAGACATCAATGCAAAGACTAAACTA
ATGAGAACAGCACTTAATAAAGCTTGCTTTCTTGGAAGAGCAGATGTAGTTTCCTACCTC
TTATCTCAGCCTTAAATAGATTTTGAATGGGGAGATACTAAAGGAAGAAATCCACTTCAT
AACGCTATTTTTGGTCCTCGAGGTGGCAGGGAAGGAAAAAAGTAGTTCCAAAAGGACTTA
ATTTACAAGTCTAAATAATTAAAATATTTTTTGAATTTGCCTTAATTTGGTTTAATTCAA
ATAATAAAGTAAAAACTTTAAAAAAATAATTCTTTATTAATTAAATATAGGTGGGAACTT
TTGGAAAGGATTGCCCTGAAGCTGCTCTTCTACTTTTAGAGAAAGGGGTAAATGTTGATG
CTGAAGATGTTGATTAATCTACTCCTTTACATATAGCCTGTAGCTCTGAAGCATTGGAAA
GTATTCCTCTTTTAATTGCATATGGCGCAGATGTAAATAAACAAAATAAGGTATTTTATA
AAAATTAAATAAATTTTAGAAAATTTAAAACTTTAATAAATCTAAGTTTGGTGATACAGC
CTTGCATTTTGCTTCTCGTTTCGGACATATTAAAACAGTTATTATGCTCATAGAATAGTT
TAATGCTCTAGTTTTAGAAGACTGTAAAGGGTAATTAATAACATCAAAAACTAAAAATTT
TTAATTTTAAATATTAAACAAACAGATTTACAGGATTAGACAACGCTCTTATTGGTAATC
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ATTAAAAATATCGACATCTTAAGAATTTAATAAAGTAGCATGAGAATAAAACTCAAAAAC
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CTTAAAAATTCAAACCATTTTTTGTTGAAGAAGATTAAATTATAAATTTGCTGCTGATTG
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TTTAGAAATTTGAATTTAATGTAAACAATTTGATCATTCATTTTATTTATCTATTCATTC
ATTTTTTAATTTATTTATTTATTTTAATGCTAGAATGTAAATGAAATTTTACACAACATC
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GATTACAGGAATTAAAACTAAACAAATAATTCCTTTTTACATGATTTGGTACAAAGAAGA
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ATTGAGAAACAAGGAGATTTGGACTTTATGAAAAAATTTGTTTTAATGAAAAATGATGTT
AATATGAATTGTATAGAATAAGCTGTTATTTTAAAGTTTTTTGACATTTATAATCTTTTG
GAGTAATTTTGTGTCAAAAATCTTAACTTTGATAAACAGCTCGTTGAATTTTAAATTCCT
GAGTATGATATCGTAGGAATCGAAGATTATTTAAAATCATTAAAAGATAAAGTTTCAGAA
AATGTTTACATGCAGGAAAAATAACACTATTGCTATCTAATAGAACCTGAAATGAAATTT
AATCTTAACAGACCTTTATTAGAATAAATTATTTAGGTAAATTAATGATATATAATGTTT
AATAAAATAACTATATTAAAAATAGGAGGTAGATGAATCAAAAAAAGTAGAAATTTATGA
GTTACACAATCAAAATGACTCTTAGTTCTATTAAGAAATAAATAGTATTTCTTTTGATAA
AAAACCATTACATATAAAAAATAAAATGAATTCTTTACCTTCCATATTTGTAGATAAAGA
AGAGTAACTTATAGAAAAAGTTATTCCAGATCTTTTATAGCATTAAATCATAGGTATAGA
TCTAGAATATTGGACAGATAATAAAGATTAGAAATTATCTTTCATATGCACTCTATAATT
GTCTACTTTATCATCAAATTTTGTTATCGATATTCTTAATCTCAGTAAATCAGTATCTGT
ACATCTAAAGAGCATATTTGAATCTCCTAAATTTGTTAAAGTAAATTACTATTTTTATTT
TTAAAAAATGATAATAATATCTATTATTTAATAATTGCTGAATAAAGTTAATCCCTTATC
GAATTATTTATATTTTAAATAAATTATATTTTTTAATAGGTATTTCATGGTGGTGAAACA
GATTTAAAACTACTAAAAAAAGATTTAAACTTTAATTTAGTAAATATATTTGATACTGCA
AAAGCTTATCTTAAACAAAATAAAGGAGCTGGATCAGTTTCTTTAAGTTCTCTTAGTTAG
TAGTATTTAAATTATAATGTTGATAAATAGTACTAAACTTCTGATTGGAGGATAAGACCT
CTCCCAAAGCCGATGCTTAATTATGCAATGTATGATTCTTTTATAACTTTGATATTATTT
TTTGTTATGAAATCTACAATATCCTAAGAAGATTTAAGCATAATAGCAATAAGTTGTAAC
AAAATGTGTATTAAATAGCTAGAAAAATCTTCGTTTGATTTTAATAAACTATTTTTAATT
AAAGATAACTAAAATATATAATGA