Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00138370Standard Name
ATG7 (AuTophaGy 7)Aliases
PreTt24464 | 10.m00513 | 3698.m00230Description
ATG7 ubiquitin-like modifier-activating enzyme; Autophagy protein; involved in programmed nuclear degradation (autophagy)Genome Browser (Macronucleus)
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Genome Browser (Micronucleus)
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Gene Ontology Annotations
Biological Process
- autophagy (ISS) | GO:0006914 | Ref:22366125
Domains
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 14.7%
TetraMine Data
TTHERM_00138370
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_05898.1 9.997093137033517e-262 ThiF family protein (671 aa)
Oxytricha Contig15667.0.g98 3.000678663157884e-145 ThiF family
DictyBase DDB_G0271096 2.9995941501461703e-129 atg7 on chromosome: 2 position
20345 to 22738
WormBase WBGene00010882 1.9991070409258158e-114 locus:atg-7 status:Confirmed
UniProt:G5EBK4 protein_id
:CAA92753.1
SGD YHR171W 1.0002646133906571e-103 ATG7 Autophagy-related protein
and dual specificity member o
f the E1 family of ubiquitin-a
ctivating enzymes; mediates th
e conjugation of Atg12p with A
tg5p and Atg8p with phosphatid
ylethanolamine, required steps
in autophagosome formation
Stentor Coeruleus SteCoe_8257 5.814040485895939e-62
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
- Ref:22366125: Liu ML, Yao MC (2012) Role of ATG8 and autophagy in programmed nuclear degradation in Tetrahymena thermophila. Eukaryotic cell 11(4):494-506
Sequences
>TTHERM_00138370(coding)
ATGGACAAAAAATTTGAAATTATTCCATTTTCTCCTATGGCGGACATAGGATTTTGGAGT
ACATTAGCAAAGAAAAAGCTCGAAGAATGGAAATTAAATTCAGATCCTTAAGATATTTTT
GTTAAATTTAAGATTAGCAATTTCACAAGCAAAAAGGCATTTTTAAATCTAGATGTTTAC
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TTAAAAAATTACAATACAATTGAAGAGTTCAAATAAATAAACTACCATGACTTGTTTAAG
GACCTAACATAAAAGTAGATTTCTGCAATTGATAACTTTTTAAGTGGCAAAGACGAAAAT
TTAAATGCATTCATAATGAAATTAGTTACATTTGCAGATCTAAAAAAACATAATTATTCA
TACAAGCTATGTTCTCCCTCAATTAAAGTGGATGATTTTAATTTACTTGAAAAGAGCTCG
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TTTTTAAAAAGCGGAAAGATTTCACCTTTCTTCTACTGTAAAGAAGTTGACGGGGGAAAA
TTTGTTTTTGGTACATTAAGAGAATATCTTAGCGAATTAGAAACAGGAAAAACAAATGAT
TTATATGGAGTATTTTTTGATCCATATAACTAAAATACAGGAACACACGCATACTTCACC
AATTTACTTGCATTAGTACTTAAGTTAGCAGAATAAAAAGGGATTAAAAATATTCTATCA
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ATGAAAAATTCTTTGGTTGTGTCTGTTGACTTGACTAATGCTAAAATTGATGCTGAATCA
TACACAGGCTGCGACCCAAACTAAATACCCCCAAGTATAGACTTAAAAAGCTCTCTAGAT
GAAGCTACCTTAGCCACAGATGCTGTAGATTTAAATATTAAGCTAATGAAATGGAGGGTC
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GTTGACTATGGCAAGATATCTTATTCTAACCCTGTGCGTTAATCTCTTTATGAATTTGAA
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GCAAGTGTTGAGCATGCTATTGAAACACTAAAAGACGTAGATCTTCTAGAAGAACTTGTT
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ATATTAGCAAACAAATACAATAAGATTTGTATTACTGTTGGCCTTGGATTTGACTCTTTT
GTTATTGTTCGTCATGGTCTATCACCTAAAGTGCATAACCCCGAAATAAATGGTGAAAGA
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AATGATCCTGATTATTTGCAGTAAGTAACTAAATTGTCTGAGCTTCTTAGGGATTTAGAT
GGTACTGATGCTTTTATAGAAGTAGATGATTGA>TTHERM_00138370(protein)
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LNAFIMKLVTFADLKKHNYSYKLCSPSIKVDDFNLLEKSSFKTAFNDEQKQKAFDESLKQ
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TLGCQLSRNLIGWGIKHITFVDYGKISYSNPVRQSLYEFEDTINGGKPKAETAAEKLKKI
FPDIVSKGYQIKIPMPGHYLASVEHAIETLKDVDLLEELVKEHDVLYLMTDSRESRWLPT
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LDQQCTVTRPGLSFVSSAYASELLISLLHHPLKNGAPAADEIEKLPQTDLGILPQHIRGT
MGEFETRVMYGRAFEHCVACSEFVLDEYLKDRDNFLQRVINDPDYLQQVTKLSELLRDLD
GTDAFIEVDD>TTHERM_00138370(gene)
ATGGACAAAAAATTTGAAATTATTCCATTTTCTCCTATGGCGGACATAGGATTTTGGAGT
ACATTAGCAAAGGTAAAATGAGAAATGTAATCAATTCACTCACACGTTTCTTATTATATA
GAAAAAGCTCGAAGAATGGAAATTAAATTCAGATCCTTAAGATATTTTTGTTAAATTTAA
GATTAGCAATTTCACAAGCAAAAAGGCATTTTTAAATCTAGATGTTTACAGCTTTCAACA
ATGGGAGCTACAGTTATAGGGACCTGTAGAAATTGTCATTTAAACTTAGTTAAAAAATTA
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TAGAATAAACTTTAAACAAAGCTTTTTAAGTGAGTATAAATAAATTAATAAATATTTTAT
ATTTAAAGAGGACCTAACATAAAAGTAGATTTCTGCAATTGATAACTTTTTAAGTGGCAA
AGACGAAAATTTAAATGCATTCATAATGAAATTAGTTACATTTGCAGATCTAAAAAAACA
TAATTATTCATACAAGCTATGTTCTCCCTCAATTAAAGTGGATGATTTTAATTTACTTGA
AAAGAGCTCGTTTAAAACTGCTTTTAACGATGAATAAAAAGTATTACTTTTCTTTTTTTT
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TTGAACATTTAAAGCAAAAAGCATTTGATGAGTCTTTGAAGCAATTTTTAAAAAGCGGAA
AGATTTCACCTTTCTTCTACTGTAAAGAAGTTGACGGGGGAAAATTTGTTTTTGGTACAT
TAAGAGAATATCTTAGCGAATTAGAAACAGGAAAAACAAATGATTTATATGGAGTATTTT
TTGATCCATATAACTAAAATACAGGAACACACGCATACTTCACCAATTTACTTGCATTAG
TACTTAAGTTAGCAGAATAAAAAGGGATTAAAAATATTCTATCAAACCTAAAATTTATCT
TGCTTAAAGATTCCCTCATATACAATTTTGCTAATAAATATGATATGAAAAATTCTTTGG
TTGTGTCTGTTGACTTGACTAATGCTAAAATTGATGCTGAATCATACACAGGCTGCGACC
CAAACTAAATACCCCCAAGTATAGACTTAAAAAGCTCTCTAGATGAAGCTACCTTAGCCA
CAGATGCTGTAGATTTAAATATTAAGCTAATGAAATGGAGGGTCTTGCCTACCCTTGATC
TCGAACTGTTGAAGAGCACAAAGGTATCACTTATGAAATAAAATACTATTTACTGATGAA
TTAAAAATGGAGTTTAATGAATCAAAATGTTTAAAGAAATTTATTAATTTATTAAAAATA
GTCAATAACTTAATTTTTGTATATTCCCTAAGAAAAATGGCTTGATTTAAAATATATTTC
AATGACTTTACCATATTTTTGAAGGCTAATTTTTTTATTTATTTACAAAAGGTATTGATG
TTAGGTGCAGGTACTTTAGGATGCTAGTTAAGTCGTAATTTGATCGGTTGGGGTATTAAG
CATATCACTTTTGTTGACTATGGCAAGATATCTTATTCTAACCCTGTGCGTTAATCTCTT
TATGAATTTGAAGATACTATCAATGGAGGTAAGCCTAAGGTAAAAATTTAAAAAACCCTT
CTCTTTATTCTAGAAAATGTTATAGACAGTTTGAAAAGATAGGATGATAGTATTAGAATT
ATTTGAGCTAATACAAACTGTTGAATAGTAAGTAAAAAGAGAGGAGGAAAATCTTGAAGC
AAGTTTTCAAAAGTTCCCCAACCAAAAAAAGGAAAACTTTTATATCAATTCAACTTTCTT
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AAAAAATATTTCCAGATATTGTTAGCAAGGGCTATTAAATTAAGATTCCAATGCCTGGCC
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TCAAATTGATTTTATTGCAATTTGCATTAAAAAATTATCCACTAAATTAAATACGTTCAA
TTATTTAAGCTATTTTAATTTTTTTTTTTTATAGGCTATTGAAACACTAAAAGACGTAGA
TCTTCTAGAAGAACTTGTTAAAGAGCATGATGTTCTTTACTTAATGACTGACTCTCGTGA
ATCTCGTTGGCTACCTACCATATTAGCAAACAAATACAATAAGGTAATCTTTCCTAGAAA
TATAAATATTTATTCCATGTTTAATAAACTCCTCCCCATTTTACAATGAAATTAAGCAGG
AGAAAAGACAAACAATAAAAATAATTGATTTCATTTAGTGTTTCAGAGCTTGAATCTCTC
TCTGCATATTCAAATTAATTTACTTTAATTTTATCACTTTTAAATTTTGAAATATCAATA
GATTTGTATTACTGTTGGCCTTGGATTTGACTCTTTTGTTATTGTTCGTCATGGTCTATC
ACCTAAAGTGCATAACCCCGGTAAATTTAATTTAAAAAATGTGTATCTCCATTGATAGTT
TTTTTATTTTGAAATCAGTTCAAGTTAGTTTTTTTCATCTCTTTTTGAAATGATTTTATA
GATTTTTGTTTATTTTTATTAAATTAAAATAATTTTATTAAAATGTTTGATTAAAAAATT
AGAAATAAATGGTGAAAGATTGAGTTGCTATTTCTGCAACGATGTTATTTCTCCTGGAAA
TACTATGAAGGATAGAACTCTTGATTAACAATGCACAGTTACTCGTCCTGGTTTATCTTT
TGTAAGCTCAGCCTATGCAAGTGAATTATTGATTTCTTTACTGCACCACCCACTGAAAAA
TGGAGCTCCTGCAGCTGATGAAATCGAAAAACTACCTCAAACTGATCTAGGTAAATTAAA
ATAGTTTTGATTTTATAGGTTAAAGGCTATATTGATGAGTGATAGATAATACAATCTATT
ATATAATGCTTTCATGAAAACAAATAATTTTTCATACTTCATTAAAAAGGATGAAGATAA
AGTATTAACGTAGTAAAAGAATTTGAAATAGCTATTCAACCATTTAATGAAATTTACAAT
CTAATCTGACATATATTAATTAAAATTTTGTGTCTACAAATGTAATAAGGTATTCTTCCC
TAGCATATCAGAGGAACTATGGGTGAATTTGAGACAAGAGTGATGTATGGCAGAGCATTT
GAACAGTAAAAAACTTGTTTATATTTTATCATATAGAGATTTATTTTCATATATTTATTG
AGAGAGAAGGGTGGGGAAATTAATTTTATAGTATTAGATATATTTCATATTATTTATGAT
TTATTGATAGATTGCTTTAATGAATGAATTTATTTATTTATTTACTTATTTTTATCGTTG
CATATAAAAAGCTGTGTAGCCTGCAGTGAATTTGTTTTAGATGAATATCTAAAAGACCGT
GACAATTTCTTATAGAGAGTTATTAATGATCCTGATTATTTGCAGGTGAGTTTTTTATTT
TCTTTAAAAAATTTAATTTAAAAAAGGGGTTGGCATTTATTTTAATCTAGAATAGATCAC
AATCATCCTCATATTAAATTTACATATAATAAACCAATGTTTTAAAAATTCTAATTTTTA
AACATATTTAAAATAGTAAGTAACTAAATTGTCTGAGCTTCTTAGGGATTTAGATGGTAC
TGATGCTTTTATAGAAGTAGATGATTGA