Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00138370

Standard Name

ATG7 (AuTophaGy 7)

Aliases

PreTt24464 | 10.m00513 | 3698.m00230

Description

Autophagy protein; involved in programmed nuclear degradation (autophagy)

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Biological Process

• autophagy (ISS) | GO:0006914 | Ref:22366125

Domains

• ( PF00899 ) ThiF family
• ( TIGR02354 ) thiamine biosynthesis protein ThiF
• ( TIGR02355 ) molybdopterin synthase sulfurylase MoeB
• ( TIGR01381 ) E1-like protein-activating enzyme Gsa7p/Apg7p
• ( TIGR02356 ) thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 14.7%

TetraMine Data

TTHERM_00138370

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_05898.1	9.997093137033517e-262	ThiF family protein (671 aa)
Oxytricha	Contig15667.0.g98	3.000678663157884e-145	ThiF family
DictyBase	DDB_G0271096	2.9995941501461703e-129	atg7 on chromosome: 2 position 20345 to 22738
WormBase	WBGene00010882	1.9991070409258158e-114	locus:atg-7 status:Confirmed UniProt:G5EBK4 protein_id :CAA92753.1
SGD	YHR171W	1.0002646133906571e-103	ATG7 Autophagy-related protein and dual specificity member o f the E1 family of ubiquitin-a ctivating enzymes; mediates th e conjugation of Atg12p with A tg5p and Atg8p with phosphatid ylethanolamine, required steps in autophagosome formation
Stentor Coeruleus	SteCoe_8257	5.814040485895939e-62

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:22366125: Liu ML, Yao MC (2012) Role of ATG8 and autophagy in programmed nuclear degradation in Tetrahymena thermophila. Eukaryotic cell 11(4):494-506

Sequences

>TTHERM_00138370(coding)
ATGGACAAAAAATTTGAAATTATTCCATTTTCTCCTATGGCGGACATAGGATTTTGGAGT
ACATTAGCAAAGAAAAAGCTCGAAGAATGGAAATTAAATTCAGATCCTTAAGATATTTTT
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AATGATCCTGATTATTTGCAGTAAGTAACTAAATTGTCTGAGCTTCTTAGGGATTTAGAT
GGTACTGATGCTTTTATAGAAGTAGATGATTGA

>TTHERM_00138370(protein)
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FLKSGKISPFFYCKEVDGGKFVFGTLREYLSELETGKTNDLYGVFFDPYNQNTGTHAYFT
NLLALVLKLAEQKGIKNILSNLKFILLKDSLIYNFANKYDMKNSLVVSVDLTNAKIDAES
YTGCDPNQIPPSIDLKSSLDEATLATDAVDLNIKLMKWRVLPTLDLELLKSTKVLMLGAG
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GTDAFIEVDD

>TTHERM_00138370(gene)
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ACATTAGCAAAGGTAAAATGAGAAATGTAATCAATTCACTCACACGTTTCTTATTATATA
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AAAGAGCTCGTTTAAAACTGCTTTTAACGATGAATAAAAAGTATTACTTTTCTTTTTTTT
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TTGAACATTTAAAGCAAAAAGCATTTGATGAGTCTTTGAAGCAATTTTTAAAAAGCGGAA
AGATTTCACCTTTCTTCTACTGTAAAGAAGTTGACGGGGGAAAATTTGTTTTTGGTACAT
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TTGATCCATATAACTAAAATACAGGAACACACGCATACTTCACCAATTTACTTGCATTAG
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TGCTTAAAGATTCCCTCATATACAATTTTGCTAATAAATATGATATGAAAAATTCTTTGG
TTGTGTCTGTTGACTTGACTAATGCTAAAATTGATGCTGAATCATACACAGGCTGCGACC
CAAACTAAATACCCCCAAGTATAGACTTAAAAAGCTCTCTAGATGAAGCTACCTTAGCCA
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TTAAAAATGGAGTTTAATGAATCAAAATGTTTAAAGAAATTTATTAATTTATTAAAAATA
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TCAAATTGATTTTATTGCAATTTGCATTAAAAAATTATCCACTAAATTAAATACGTTCAA
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TGTAAGCTCAGCCTATGCAAGTGAATTATTGATTTCTTTACTGCACCACCCACTGAAAAA
TGGAGCTCCTGCAGCTGATGAAATCGAAAAACTACCTCAAACTGATCTAGGTAAATTAAA
ATAGTTTTGATTTTATAGGTTAAAGGCTATATTGATGAGTGATAGATAATACAATCTATT
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GAACAGTAAAAAACTTGTTTATATTTTATCATATAGAGATTTATTTTCATATATTTATTG
AGAGAGAAGGGTGGGGAAATTAATTTTATAGTATTAGATATATTTCATATTATTTATGAT
TTATTGATAGATTGCTTTAATGAATGAATTTATTTATTTATTTACTTATTTTTATCGTTG
CATATAAAAAGCTGTGTAGCCTGCAGTGAATTTGTTTTAGATGAATATCTAAAAGACCGT
GACAATTTCTTATAGAGAGTTATTAATGATCCTGATTATTTGCAGGTGAGTTTTTTATTT
TCTTTAAAAAATTTAATTTAAAAAAGGGGTTGGCATTTATTTTAATCTAGAATAGATCAC
AATCATCCTCATATTAAATTTACATATAATAAACCAATGTTTTAAAAATTCTAATTTTTA
AACATATTTAAAATAGTAAGTAACTAAATTGTCTGAGCTTCTTAGGGATTTAGATGGTAC
TGATGCTTTTATAGAAGTAGATGATTGA