Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00138370

Standard Name

ATG7 (AuTophaGy 7)

Aliases

PreTt24464 | 10.m00513 | 3698.m00230

Description

ATG7 ubiquitin-like modifier-activating enzyme; Autophagy protein; involved in programmed nuclear degradation (autophagy)

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Biological Process

• autophagy (ISS) | GO:0006914 | Ref:22366125

Domains

• ( PF00899 ) ThiF family
• ( TIGR02354 ) thiamine biosynthesis protein ThiF
• ( TIGR02355 ) molybdopterin synthase sulfurylase MoeB
• ( TIGR01381 ) E1-like protein-activating enzyme Gsa7p/Apg7p
• ( TIGR02356 ) thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 14.7%

TetraMine Data

TTHERM_00138370

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_05898.1	9.997093137033517e-262	ThiF family protein (671 aa)
Oxytricha	Contig15667.0.g98	3.000678663157884e-145	ThiF family
DictyBase	DDB_G0271096	2.9995941501461703e-129	atg7 on chromosome: 2 position 20345 to 22738
WormBase	WBGene00010882	1.9991070409258158e-114	locus:atg-7 status:Confirmed UniProt:G5EBK4 protein_id :CAA92753.1
SGD	YHR171W	1.0002646133906571e-103	ATG7 Autophagy-related protein and dual specificity member o f the E1 family of ubiquitin-a ctivating enzymes; mediates th e conjugation of Atg12p with A tg5p and Atg8p with phosphatid ylethanolamine, required steps in autophagosome formation
Stentor Coeruleus	SteCoe_8257	5.814040485895939e-62

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:22366125: Liu ML, Yao MC (2012) Role of ATG8 and autophagy in programmed nuclear degradation in Tetrahymena thermophila. Eukaryotic cell 11(4):494-506

Sequences

>TTHERM_00138370(coding)
ATGGACAAAAAATTTGAAATTATTCCATTTTCTCCTATGGCGGACATAGGATTTTGGAGT
ACATTAGCAAAGAAAAAGCTCGAAGAATGGAAATTAAATTCAGATCCTTAAGATATTTTT
GTTAAATTTAAGATTAGCAATTTCACAAGCAAAAAGGCATTTTTAAATCTAGATGTTTAC
AGCTTTCAACAATGGGAGCTACAGTTATAGGGACCTGTAGAAATTGTCATTTAAACTTAG
TTAAAAAATTACAATACAATTGAAGAGTTCAAATAAATAAACTACCATGACTTGTTTAAG
GACCTAACATAAAAGTAGATTTCTGCAATTGATAACTTTTTAAGTGGCAAAGACGAAAAT
TTAAATGCATTCATAATGAAATTAGTTACATTTGCAGATCTAAAAAAACATAATTATTCA
TACAAGCTATGTTCTCCCTCAATTAAAGTGGATGATTTTAATTTACTTGAAAAGAGCTCG
TTTAAAACTGCTTTTAACGATGAATAAAAACAAAAAGCATTTGATGAGTCTTTGAAGCAA
TTTTTAAAAAGCGGAAAGATTTCACCTTTCTTCTACTGTAAAGAAGTTGACGGGGGAAAA
TTTGTTTTTGGTACATTAAGAGAATATCTTAGCGAATTAGAAACAGGAAAAACAAATGAT
TTATATGGAGTATTTTTTGATCCATATAACTAAAATACAGGAACACACGCATACTTCACC
AATTTACTTGCATTAGTACTTAAGTTAGCAGAATAAAAAGGGATTAAAAATATTCTATCA
AACCTAAAATTTATCTTGCTTAAAGATTCCCTCATATACAATTTTGCTAATAAATATGAT
ATGAAAAATTCTTTGGTTGTGTCTGTTGACTTGACTAATGCTAAAATTGATGCTGAATCA
TACACAGGCTGCGACCCAAACTAAATACCCCCAAGTATAGACTTAAAAAGCTCTCTAGAT
GAAGCTACCTTAGCCACAGATGCTGTAGATTTAAATATTAAGCTAATGAAATGGAGGGTC
TTGCCTACCCTTGATCTCGAACTGTTGAAGAGCACAAAGGTATTGATGTTAGGTGCAGGT
ACTTTAGGATGCTAGTTAAGTCGTAATTTGATCGGTTGGGGTATTAAGCATATCACTTTT
GTTGACTATGGCAAGATATCTTATTCTAACCCTGTGCGTTAATCTCTTTATGAATTTGAA
GATACTATCAATGGAGGTAAGCCTAAGGCTGAGACCGCTGCTGAGAAATTAAAAAAAATA
TTTCCAGATATTGTTAGCAAGGGCTATTAAATTAAGATTCCAATGCCTGGCCACTATCTA
GCAAGTGTTGAGCATGCTATTGAAACACTAAAAGACGTAGATCTTCTAGAAGAACTTGTT
AAAGAGCATGATGTTCTTTACTTAATGACTGACTCTCGTGAATCTCGTTGGCTACCTACC
ATATTAGCAAACAAATACAATAAGATTTGTATTACTGTTGGCCTTGGATTTGACTCTTTT
GTTATTGTTCGTCATGGTCTATCACCTAAAGTGCATAACCCCGAAATAAATGGTGAAAGA
TTGAGTTGCTATTTCTGCAACGATGTTATTTCTCCTGGAAATACTATGAAGGATAGAACT
CTTGATTAACAATGCACAGTTACTCGTCCTGGTTTATCTTTTGTAAGCTCAGCCTATGCA
AGTGAATTATTGATTTCTTTACTGCACCACCCACTGAAAAATGGAGCTCCTGCAGCTGAT
GAAATCGAAAAACTACCTCAAACTGATCTAGGTATTCTTCCCTAGCATATCAGAGGAACT
ATGGGTGAATTTGAGACAAGAGTGATGTATGGCAGAGCATTTGAACACTGTGTAGCCTGC
AGTGAATTTGTTTTAGATGAATATCTAAAAGACCGTGACAATTTCTTATAGAGAGTTATT
AATGATCCTGATTATTTGCAGTAAGTAACTAAATTGTCTGAGCTTCTTAGGGATTTAGAT
GGTACTGATGCTTTTATAGAAGTAGATGATTGA

>TTHERM_00138370(protein)
MDKKFEIIPFSPMADIGFWSTLAKKKLEEWKLNSDPQDIFVKFKISNFTSKKAFLNLDVY
SFQQWELQLQGPVEIVIQTQLKNYNTIEEFKQINYHDLFKDLTQKQISAIDNFLSGKDEN
LNAFIMKLVTFADLKKHNYSYKLCSPSIKVDDFNLLEKSSFKTAFNDEQKQKAFDESLKQ
FLKSGKISPFFYCKEVDGGKFVFGTLREYLSELETGKTNDLYGVFFDPYNQNTGTHAYFT
NLLALVLKLAEQKGIKNILSNLKFILLKDSLIYNFANKYDMKNSLVVSVDLTNAKIDAES
YTGCDPNQIPPSIDLKSSLDEATLATDAVDLNIKLMKWRVLPTLDLELLKSTKVLMLGAG
TLGCQLSRNLIGWGIKHITFVDYGKISYSNPVRQSLYEFEDTINGGKPKAETAAEKLKKI
FPDIVSKGYQIKIPMPGHYLASVEHAIETLKDVDLLEELVKEHDVLYLMTDSRESRWLPT
ILANKYNKICITVGLGFDSFVIVRHGLSPKVHNPEINGERLSCYFCNDVISPGNTMKDRT
LDQQCTVTRPGLSFVSSAYASELLISLLHHPLKNGAPAADEIEKLPQTDLGILPQHIRGT
MGEFETRVMYGRAFEHCVACSEFVLDEYLKDRDNFLQRVINDPDYLQQVTKLSELLRDLD
GTDAFIEVDD

>TTHERM_00138370(gene)
ATGGACAAAAAATTTGAAATTATTCCATTTTCTCCTATGGCGGACATAGGATTTTGGAGT
ACATTAGCAAAGGTAAAATGAGAAATGTAATCAATTCACTCACACGTTTCTTATTATATA
GAAAAAGCTCGAAGAATGGAAATTAAATTCAGATCCTTAAGATATTTTTGTTAAATTTAA
GATTAGCAATTTCACAAGCAAAAAGGCATTTTTAAATCTAGATGTTTACAGCTTTCAACA
ATGGGAGCTACAGTTATAGGGACCTGTAGAAATTGTCATTTAAACTTAGTTAAAAAATTA
CAATACAATTGAAGAGTTCAAATAAATAAACTACCATGACTTGTTTAGTAAGAATTAATC
TTGTTTTTCAAAATAATTAAAAATGCATTTAATGATTTTTCAATTTAAAATATTTTGTTT
TAGAATAAACTTTAAACAAAGCTTTTTAAGTGAGTATAAATAAATTAATAAATATTTTAT
ATTTAAAGAGGACCTAACATAAAAGTAGATTTCTGCAATTGATAACTTTTTAAGTGGCAA
AGACGAAAATTTAAATGCATTCATAATGAAATTAGTTACATTTGCAGATCTAAAAAAACA
TAATTATTCATACAAGCTATGTTCTCCCTCAATTAAAGTGGATGATTTTAATTTACTTGA
AAAGAGCTCGTTTAAAACTGCTTTTAACGATGAATAAAAAGTATTACTTTTCTTTTTTTT
GTTAAGTATATACATATGTATTTAATACAAAATGTTAATAAAATGCTCACTAATTAATAT
TTGAACATTTAAAGCAAAAAGCATTTGATGAGTCTTTGAAGCAATTTTTAAAAAGCGGAA
AGATTTCACCTTTCTTCTACTGTAAAGAAGTTGACGGGGGAAAATTTGTTTTTGGTACAT
TAAGAGAATATCTTAGCGAATTAGAAACAGGAAAAACAAATGATTTATATGGAGTATTTT
TTGATCCATATAACTAAAATACAGGAACACACGCATACTTCACCAATTTACTTGCATTAG
TACTTAAGTTAGCAGAATAAAAAGGGATTAAAAATATTCTATCAAACCTAAAATTTATCT
TGCTTAAAGATTCCCTCATATACAATTTTGCTAATAAATATGATATGAAAAATTCTTTGG
TTGTGTCTGTTGACTTGACTAATGCTAAAATTGATGCTGAATCATACACAGGCTGCGACC
CAAACTAAATACCCCCAAGTATAGACTTAAAAAGCTCTCTAGATGAAGCTACCTTAGCCA
CAGATGCTGTAGATTTAAATATTAAGCTAATGAAATGGAGGGTCTTGCCTACCCTTGATC
TCGAACTGTTGAAGAGCACAAAGGTATCACTTATGAAATAAAATACTATTTACTGATGAA
TTAAAAATGGAGTTTAATGAATCAAAATGTTTAAAGAAATTTATTAATTTATTAAAAATA
GTCAATAACTTAATTTTTGTATATTCCCTAAGAAAAATGGCTTGATTTAAAATATATTTC
AATGACTTTACCATATTTTTGAAGGCTAATTTTTTTATTTATTTACAAAAGGTATTGATG
TTAGGTGCAGGTACTTTAGGATGCTAGTTAAGTCGTAATTTGATCGGTTGGGGTATTAAG
CATATCACTTTTGTTGACTATGGCAAGATATCTTATTCTAACCCTGTGCGTTAATCTCTT
TATGAATTTGAAGATACTATCAATGGAGGTAAGCCTAAGGTAAAAATTTAAAAAACCCTT
CTCTTTATTCTAGAAAATGTTATAGACAGTTTGAAAAGATAGGATGATAGTATTAGAATT
ATTTGAGCTAATACAAACTGTTGAATAGTAAGTAAAAAGAGAGGAGGAAAATCTTGAAGC
AAGTTTTCAAAAGTTCCCCAACCAAAAAAAGGAAAACTTTTATATCAATTCAACTTTCTT
CCTTTTCTGAATTACCTACAATAATTTTGTTTGTCTGTTTATCACACAGTTCTAAATAAT
TAACAAATCATGATTTTAAAATTGTATAATAATAGGCTGAGACCGCTGCTGAGAAATTAA
AAAAAATATTTCCAGATATTGTTAGCAAGGGCTATTAAATTAAGATTCCAATGCCTGGCC
ACTATCTAGCAAGTGTTGAGCATGTAAAAAATTTCTCTCATCACATCAATTCAAATTTTT
TCAAATTGATTTTATTGCAATTTGCATTAAAAAATTATCCACTAAATTAAATACGTTCAA
TTATTTAAGCTATTTTAATTTTTTTTTTTTATAGGCTATTGAAACACTAAAAGACGTAGA
TCTTCTAGAAGAACTTGTTAAAGAGCATGATGTTCTTTACTTAATGACTGACTCTCGTGA
ATCTCGTTGGCTACCTACCATATTAGCAAACAAATACAATAAGGTAATCTTTCCTAGAAA
TATAAATATTTATTCCATGTTTAATAAACTCCTCCCCATTTTACAATGAAATTAAGCAGG
AGAAAAGACAAACAATAAAAATAATTGATTTCATTTAGTGTTTCAGAGCTTGAATCTCTC
TCTGCATATTCAAATTAATTTACTTTAATTTTATCACTTTTAAATTTTGAAATATCAATA
GATTTGTATTACTGTTGGCCTTGGATTTGACTCTTTTGTTATTGTTCGTCATGGTCTATC
ACCTAAAGTGCATAACCCCGGTAAATTTAATTTAAAAAATGTGTATCTCCATTGATAGTT
TTTTTATTTTGAAATCAGTTCAAGTTAGTTTTTTTCATCTCTTTTTGAAATGATTTTATA
GATTTTTGTTTATTTTTATTAAATTAAAATAATTTTATTAAAATGTTTGATTAAAAAATT
AGAAATAAATGGTGAAAGATTGAGTTGCTATTTCTGCAACGATGTTATTTCTCCTGGAAA
TACTATGAAGGATAGAACTCTTGATTAACAATGCACAGTTACTCGTCCTGGTTTATCTTT
TGTAAGCTCAGCCTATGCAAGTGAATTATTGATTTCTTTACTGCACCACCCACTGAAAAA
TGGAGCTCCTGCAGCTGATGAAATCGAAAAACTACCTCAAACTGATCTAGGTAAATTAAA
ATAGTTTTGATTTTATAGGTTAAAGGCTATATTGATGAGTGATAGATAATACAATCTATT
ATATAATGCTTTCATGAAAACAAATAATTTTTCATACTTCATTAAAAAGGATGAAGATAA
AGTATTAACGTAGTAAAAGAATTTGAAATAGCTATTCAACCATTTAATGAAATTTACAAT
CTAATCTGACATATATTAATTAAAATTTTGTGTCTACAAATGTAATAAGGTATTCTTCCC
TAGCATATCAGAGGAACTATGGGTGAATTTGAGACAAGAGTGATGTATGGCAGAGCATTT
GAACAGTAAAAAACTTGTTTATATTTTATCATATAGAGATTTATTTTCATATATTTATTG
AGAGAGAAGGGTGGGGAAATTAATTTTATAGTATTAGATATATTTCATATTATTTATGAT
TTATTGATAGATTGCTTTAATGAATGAATTTATTTATTTATTTACTTATTTTTATCGTTG
CATATAAAAAGCTGTGTAGCCTGCAGTGAATTTGTTTTAGATGAATATCTAAAAGACCGT
GACAATTTCTTATAGAGAGTTATTAATGATCCTGATTATTTGCAGGTGAGTTTTTTATTT
TCTTTAAAAAATTTAATTTAAAAAAGGGGTTGGCATTTATTTTAATCTAGAATAGATCAC
AATCATCCTCATATTAAATTTACATATAATAAACCAATGTTTTAAAAATTCTAATTTTTA
AACATATTTAAAATAGTAAGTAACTAAATTGTCTGAGCTTCTTAGGGATTTAGATGGTAC
TGATGCTTTTATAGAAGTAGATGATTGA