Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01005190

Standard Name

ARP6 (Actin-related protein 6)

Aliases

PreTt27636 | 192.m00074 | 3757.m00322

Description

Actin family protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

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Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 12%

TetraMine Data

TTHERM_01005190

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_19894.1	9.997093137033517e-262	actin family protein (401 aa)
Oxytricha	Contig9419.0.g21	1.9999590304423412e-72	Actin
WormBase	WBGene00007434	7.001890014428386e-55	locus:arp-6 Actin-like prote in C08B11.6 status:Confirmed UniProt:Q09443 protein_id :CAA86667.3
SGD	YFL039C	4.997755005759707e-41	ACT1 Actin, structural protein involved in cell polarization , endocytosis, and other cytos keletal functions
DictyBase	DDB_G0274131	7.003455847728069e-40	act17 on chromosome: 2 positio n 4723516 to 4724640
Stentor Coeruleus	SteCoe_22192	2.1151310375910805e-19

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_01005190(coding)
ATGAGCGATTGGAAGACAAATTTAAATAAAAGATTAATAGTGGATAATGGTTCTTGGGAA
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AAAGAAATTATTACATGCAGATATATTCAGCTAAAAAACGAAATTAGAATGGTTTCTCAA
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GGCTCTCATACCAAGTATTTTATTTTACCTGATTACGAGACAGGTAAAAAAGGTTTTGCT
GTAGATTTCTATGATAGATCTTCTTATAGTGATAAGCTAACTTTAGACAAAGAGAGATTC
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TAAGGCGCAAGCAGTGTTATTAAGGAAATACATCCTGATATTAAAGAATACTTCTATGAG
AATATCATTTTATGTGGTGGATCATCAAATTTTGTGGGCTTAAAAGAAAGACTATTAAAT
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TGA

>TTHERM_01005190(protein)
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ANLIYVKPQVRGVVVDWDHEVHLWEKMLDAQTEFESKQNELQSYSISILHNPCVPDKVRQ
RMIEVCFEYFGFDAIYPALSQQMSQIHALDKYNKKISDTFQLVIEIGHSATYFVPFFDGQ
PINYAIKRLDVGGKLLTNHLKEIITCRYIQLKNEIRMVSQIKEDMCFVSQNFQKDIKLRK
GSHTKYFILPDYETGKKGFAVDFYDRSSYSDKLTLDKERFTLPEILFNPSDIGLDQCGIS
QGASSVIKEIHPDIKEYFYENIILCGGSSNFVGLKERLLNEVTQNTPDYLDNKLVHLKDT
SSAYQGCQRVTSGDNFEMLAMNRNDYKEYGFEQLNALYFI

>TTHERM_01005190(gene)
ATGAGCGATTGGAAGACAAATTTAAATAAAAGATTAATAGTGGATAATGGTTCTTGGGAA
ATAAGATTAGGATCTGCTTTAAATGAAGTACCTAATTTAACTTACTATAATTTATTAGGT
AAATTTAAATGAGAGAAAGTTTGATCAGTTTTTTAGCTTATAATATTTGTTAGGTATTGA
CAGAAAAAATGGTAATTTGTTATGCGGAGAGAATTTAAATAACTACATAGATGAAGCTAA
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TTATAGAAATAGGGCACTCTGCTACTTACTTTGTGCCTTTCTTTGATGGATAACCTATAA
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ATATTTTTTATAGGTGGTAAATTACTTACAAACCATTTGAAAGAAATTATTACATGCAGA
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GTGTCACAAAATTTTTAAAAAGATATCAAATTGCGGTAATAATAATTTATTATTAATTCT
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ATTTGTTAACTATTACCATTTAAAACTCCTTTTCTTAGCAAAAATGATTAGTGATTTTAC
ATTTGAAAATCCCAAAATTAATTGCAAAAATAGAAAGTGTAAATTGTAATTTAAATGGTA
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TGAGTAGATATAAATAATTCTCTTAACTGTTTTAAATAGGTTTAGATTAATGTGGTATCT
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AGAATATCATTTTATGTGGTGGATCATCAAATTTTGTGGGCTTAAAAGAAAGACTGTAAG
ATATATTAATTAATTAGTTATATTAATTGATTACATTTATTTTACTAAAATTAGATTAAA
TGAAGTCACTTAGAATACTCCTGATTATTTAGATAATAAATTAGTTCATCTCAAAGACAC
TTCATCAGCTTATTAGGGATGTTAAAGGGTAACTTCAGGAGATAATTTTGAAATGCTAGC
TATGAATAGAAATGATTATAAAGAATATGGATTTGAACAACTAAATGCTCTGTATTTTAT
TTGA