Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00378580

Standard Name

ARP4 (Actin-Related Protein 4)

Aliases

PreTt10312 | 40.m00197 | Arp

Description

Actin-related protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF00022 ) Actin

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.9%

TetraMine Data

TTHERM_00378580

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_00115.1	9.997093137033517e-262	actin family protein (399 aa)
Oxytricha	Contig14403.0.g67	9.997329401607134e-86	Actin
WormBase	WBGene00000067	4.998071612500574e-77	locus:act-5 status:Confirmed UniProt:O45815 protein_id :CAB05817.1
SGD	YFL039C	8.998448382613942e-77	ACT1 Actin, structural protein involved in cell polarization , endocytosis, and other cytos keletal functions
DictyBase	DDB_G0289487	1.0004671766404936e-76	act3 on chromosome: 5 position 2884652 to 2885782
Stentor Coeruleus	SteCoe_9575	4.906094730649281e-35

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:16732560: Kuribara S, Kato M, Kato-Minoura T, Numata O (2006) Identification of a novel actin-related protein in Tetrahymena cilia. Cell motility and the cytoskeleton 63(7):437-46

Sequences

>TTHERM_00378580(coding)
ATGGATAAACAAAAGGAAAATAAAAGGGCTAAAATGGAAAGTGAGTTTGATGTAAAAGAC
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GAATATGAAGAAAATCCTGAGTCTAAGATGTCAATAATACATAAAAAAACATTTTGA

>TTHERM_00378580(protein)
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TNQKPQCLFGQQLQQAKIEKKFELEEKFPIQNGKIVDFDAIRDLYTYALEKLLQVNEISS
CNLLIIDSPLNPKNYKHKLAEILFDDMKVNSVLFQNSSSLSLFSTGETTGLVVESGHSLT
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VDVNGPTLLSLEEKSYELPDGSILEINNSQRYKPTEIIFNPSIIGDDSMSIPEMMIDTLH
RCDVEFQEELYRNIVLCGGSSLFKGFLPRIEKELLNEVTNTINRKDINFVQNTHRRYSAW
IGGSMLGSLSTFQNLAITKNEYEENPESKMSIIHKKTF

>TTHERM_00378580(gene)
TTTTCATTATCAAAGTTTGAATTTGCATAAAGATATTTAATTTAATAGTTTTTTTTGTTA
GAACACCTACTCATAAATGGATAAACAAAAGGAAAATAAAAGGGCTAAAATGGAAAGTGA
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AATGTGTTTAAGGATATCAAGGAAAGAATGTGCTATGTGGCTAGAGATTACTACGTTGAT
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ATTTTTTGTATTTGTAGACTTTTTAGAATAGCCAGATTAAAACTTTTCCATAAGAGAAAA
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GATTGATTAAATAACTTAAAAATGAATTTTCCTTTATTAGTCCTTCAATCATAGGAGACG
ACAGTATGAGCATACCAGAGATGATGATTGATACTCTTCATAGATGTGATGTAGAATTTT
AAGAAGAACTGTATAGAAACATAGTATTATGCGGAGGGTCTTCATTATTTAAGGGTTTTT
TACCCCGTATAGAGAAGGAGCTATTAAATGAGGTGACCAATACGATAAATAGAAAAGATA
TTAATTTTGTTTAAAACACTCATAGAAGGTATTCAGCTTGGATTGGTAATATTGTCTATA
AAGCATTTATTTAAATGATTAGCATTATCCGGGGCTTTTCTTTCCAACTTAATATTTTCC
TACTTAACTTCTTTTAACTGCATAAAAATGGTTAGTAATGATGATTAATAATTAAATTTT
CAAATAATAGGAGGATCTATGCTAGGCAGCTTAAGCACTTTCTAGAATTTAGCAATTACT
AAAAATGAATATGAAGAAAATCCTGAGTCTAAGATGTCAATAATACATAAAAAAACATTT
TGAACTCTTGAAAATATAAAACATTTAATTAAATTTGTATTTATTTTAAAGCTATTTACA
GAAATCAATGTAAGAAAAATAGAAAGAGAAATATAAGAAAAACCATCAGTAAAAGAAAAA
TAAATAAATAAATAAAAAATTAGATACTTGTTTGTTAATTTATTTTTGTATTTTTTGTTT
ATTTGTTTGTTTGAGAGCTTTATTTATTTTAAGTTGTAAATAAATCATGTAAG