Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00444320

Standard Name

APG2 (The gamma subunit of the AP-2 adaptin complex)

Aliases

PreTt03800 | 51.m00166 | 3704.m00021

Description

Adaptin AP-2 gamma subunit

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• Golgi-associated vesicle (IEA) | GO:0005798
• membrane coat (IEA) | GO:0030117

Molecular Function

• protein binding (IEA) | GO:0005515
• structural molecule activity (IEA) | GO:0005198

Biological Process

• intracellular protein transport (IEA) | GO:0006886
• vesicle-mediated transport (IEA) | GO:0016192

Domains

• ( PF02985 ) HEAT repeat
• ( PF04899 ) MbeD/MobD like
• ( PF01602 ) Adaptin N terminal region
• ( PF03130 ) PBS lyase HEAT-like repeat
• ( PF00514 ) Armadillo/beta-catenin-like repeat
• ( PF08752 ) Coatomer gamma subunit appendage domain

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.7%

TetraMine Data

TTHERM_00444320

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_10925.1	9.997093137033517e-262	adaptin N-terminal region fami ly protein (925 aa)
Oxytricha	Contig3797.0.g32	7.001585505934824e-125	Adaptin N terminal region
DictyBase	DDB_G0289371	2.000277046697593e-115	copG on chromosome: 5 position 2724036 to 2727148
WormBase	WBGene00011775	3.9998808708412595e-103	Probable coatomer subunit gamm a status:Confirmed UniProt :Q22498 protein_id:CAA93095. 1
SGD	YNL287W	3.999329394025902e-72	SEC21 Gamma subunit of coatome r, a heptameric protein comple x that together with Arf1p for ms the COPI coat; involved in ER to Golgi transport of selec tive cargo
Stentor Coeruleus	SteCoe_486	5.5210822770285325e-42

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00444320(coding)
ATGGCTCACCTCATTAAATAAGTGTCAGAAAAATTCTAAAAGCTTCAAAATGATTTTAGG
AGAAATACCATAGAAGTAGATGCTTTTAGTAAGATTAGCAAATCATAGGTCCTTTAAGAT
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TTAATCTATCTTATCAACTAAGGAAATAAGTTCAGTGATTAAGAGTAGTCAACTTTATTT
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TTCTTACAAATGAATGTTAAGAGCGCAGACGAAGAATTAAACTAAGATCTTATAAATACT
TTCAATAACTGA

>TTHERM_00444320(protein)
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LIYLINQGNKFSDQEQSTLFFQVTRLFQSNNKELRRMVYLMIKEFKDEKMVYVVTQSLMK
DITSTVDLYKMNALRIIPVVLDPSNLIQVERYIKNAILDKNTAVASAAILAAIQLFPQHS
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SSKNTASLKMIRLINNRIHLEDSEVRAAAVGTISKFASKQQSVREQVIQLLKHALSDPDE
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AQQFASSAIFQGYGPLRHISNGGDLTDKNASYLVSYVKYFFDDYVVLEFLVKNKAQDQIL
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IGANGKVISEYADEYQLDDVQVTISDHLTNWEIGKGKYETELNYLEGEVATQKFKLSYKS
IDFAIQEIIKHFSVSVCDGTNHIPQVQTEKFHTLKLAGKYLDKEKFLLSCMIAMDAKQGC
FLQMNVKSADEELNQDLINTFNN

>TTHERM_00444320(gene)
CTCATCTATAATTTTTTATTAGGAATTATATTGGTTATCAATAAATAAGTAAACAAATAA
AAAGCACGTATTTAGCAAAAGTTTAATCTGTTAAAGAAATGGCTCACCTCATTAAATAAG
TGTCAGAAAAATTCTAAAAGCTTCAAAATGATTTTAGGAGAAATACCATAGGTACCAACA
AACAAACAAATTAACTTCAATAACATTTAGAAAAATATTATTTTCAAATTCATTATTTTA
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TTTTGAATTGGTTAATATGGAAAATGTTAAAATAAGAATTGTTTTTGTTAAATATAATAG
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TTTGAGAATTATTCCAGTTGTTTTAGATCCTTCTAATCTTATTTAAGTTGAACGCTACAT
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TAATAAAAATATAATAATCTTTTT