Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00287890

Standard Name

APG11 (Adaptor Protein 1 complex Gamma chain 11)

Aliases

PreTt25920 | 26.m00272 | 3688.m00066

Description

Adaptin N terminal region family protein; gamma subunit of AP-1 complex

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• clathrin adaptor complex (IEA) | GO:0030131
• membrane coat (IEA) | GO:0030117

Molecular Function

• protein binding (IEA) | GO:0005515

Biological Process

• vesicle-mediated transport (IEA) | GO:0016192
• intracellular protein transport (IEA) | GO:0006886

Domains

• ( PF02985 ) HEAT repeat
• ( PF01602 ) Adaptin N terminal region
• ( PF02883 ) Adaptin C-terminal domain
• ( PF01814 ) Hemerythrin HHE cation binding domain
• ( TIGR02549 ) CRISPR-associated DxTHG motif protein

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.2%

TetraMine Data

TTHERM_00287890

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_09298.1	9.997093137033517e-262	adaptin N-terminal region fami ly protein (895 aa)
DictyBase	DDB_G0281957	5.001257666360868e-155	ap1g1 on chromosome: 3 positio n 5194623 to 5197502
Oxytricha	Contig11604.0.g35	1.0001043265246556e-154	Adaptin N terminal region
WormBase	WBGene00000158	9.997962730346853e-122	locus:apg-1 status:Partially _confirmed UniProt:Q8WQB3 protein_id:CAD21660.1
Stentor Coeruleus	SteCoe_18173	1.4411565509640892e-64
SGD	YPR029C	1.9990871925214856e-61	APL4 Gamma-adaptin, large subu nit of the clathrin-associated protein (AP-1) complex; binds clathrin; involved in vesicle mediated transport

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00287890(coding)
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AAAAGCATAGCTATGAAGGTCCGTCTTCAATATAATATAAATGGAAAGCCAGTAGCACTA
GACAGTCTTGTATAAGATTTCCCCAAGGGATGGTGA

>TTHERM_00287890(protein)
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PEATSDIVQQIDSLMEDKHHGVLLSTVSLMKSLVVLNEENKNYFYKHITPLKKILKALIS
NMSAEFDVNGVNDPFLQISILEFFRMMAQGKQHVADEISGILGEVASNTNGDKNSGSAVL
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IIQCLKEEDISIKQLALDLIFMVSSSENVESIIKELLNHMMDPEQLIFLPELVLKTCMII
DSHAPNRRWQIDTIIKVLSLAGSYAKEDTTNNLINLISVSPSLQQYAVQKLYFALKQKID
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MKLFYKFTSLTLENYVNILNPLTTSTTPEVQKRACEYLHIIQNEWKNQVHYIFQTNPEYS
KATQQFSKKPVDEQSQKKQTNLLEDDEIPQTPVSQAQTAQQNILDDLIGGTSTANNVPTT
SSIQGEQNGIDLLNDIIGGTSYTPSAQNDNKIQKNLITDLLDDLPSQSQNQQISQSNTQA
QKEKNNEQQQSKNLIDLLGGDEEITTTPISNQKITSNNNFDDFGEMQVSQPVLPKHIFTA
IEDATIKIVFKCTKQSADTVEITIEYGNKTPFIINELQFQVAVQKHNKLTMNPISSTQIP
PNSSSETVQVMSVVNTMAGQKSIAMKVRLQYNINGKPVALDSLVQDFPKGW

>TTHERM_00287890(gene)
ATGAGTATTAGCAAGCCAGGAGAGGGAGCTACTAAATAACACCCTTTACATGAGTTTAAA
GATATTATAAAGCAAGTGAGGGAATGTAAAACAGCTGCATAGGAAAGAGAGTTAATCAAT
AAGGAAAAAGCTCTAATTAGAGAAAGATTCCTGGTATGATTACAATCATATTAAATTTAA
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AGTTGATTCCAGATCTTATGAAGCAATTCTAAGTTGGATCAACTTTTATTAAAAAGAAAG
TAGCATTATGTTGTATTAAAATGGTTAAAAAGTTACCTGAAGCAACTTCCGATATAGTAT
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TATTGATTTCAAATTAAAATTTGTAGCATTTTTTTAAAGCATTCACAAATAAGTTGAAAA
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TCTTTACCAAATTTGATTAAAAATACAATCAAATTTATCAGCTTTGACTTATCCATTTAC
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ATTTTTATTTTTTAGATTACTAAAATATTAAAATAATAATTTAAAGGTAGCACTAGACAG
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