Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00647130
Standard Name
ALT1 (Alpha-Like Tubulin 1)
Aliases
PreTt15819 | 93.m00115 | 3727.m00035
Description
ALT1 tubulin/FtsZ family GTPase domain protein; Alpha-like tubulin protein
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
Cellular Component Molecular Function Biological Process
Domains
( PF00091 ) Tubulin/FtsZ family, GTPase domain
( PF03953 ) tubulin/FtsZ family, C-terminal domain
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.9%
TetraMine Data
TTHERM_00647130
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_19119.1 9.998596099208102e-158 tubulin/FtsZ family, GTPase do
main-containing protein (448 a
a)
Oxytricha Contig22199.0.g119 6.000220702367707e-121 Tubulin/FtsZ family, GTPase do
main
WormBase WBGene00006530 3.998986577109865e-118 locus:tba-4 status:Confirmed
UniProt:G5EDD4 protein_id
:CAA85463.1
DictyBase DDB_G0287689 9.002752962930884e-112 tubA on chromosome: 5 position
707217 to 708704
SGD YML085C 7.0000984021781654e-99 TUB1 Alpha-tubulin; associates
with beta-tubulin (Tub2p) to
form tubulin dimer, which poly
merizes to form microtubules
Stentor Coeruleus SteCoe_38102 2.820770088460135e-53
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
Ref:16933976 : Eisen JA, Coyne RS, Wu M, Wu D, Thiagarajan M, Wortman JR, Badger JH, Ren Q, Amedeo P, Jones KM, Tallon LJ, Delcher AL, Salzberg SL, Silva JC, Haas BJ, Majoros WH, Farzad M, Carlton JM, Smith RK, Garg J, Pearlman RE, Karrer KM, Sun L, Manning G, Elde NC, Turkewitz AP, Asai DJ, Wilkes DE, Wang Y, Cai H, Collins K, Stewart BA, Lee SR, Wilamowska K, Weinberg Z, Ruzzo WL, Wloga D, Gaertig J, Frankel J, Tsao CC, Gorovsky MA, Keeling PJ, Waller RF, Patron NJ, Cherry JM, Stover NA,
Sequences
>TTHERM_00647130(coding)ATG GGA GAA ATA ATA AAC GTT TTC GTT GGA TAA TAC GGA GTA CAA TCA GGA TAG GAA TAT TGG AAA TAA ATT TGT TTA GAA CAC AAT ATT AAT TCT TAT GGA TAA AAA TTA ACT TAG TAA TAA GAT GAT AAT GAA AAT GTA ACT TGC TTT TTT AGT GAA TCA GAG AAA TAA AAA TAT GTT CCT CGA TGT GTG TTT TTG GAT TTA GAT GCA ACT CCT ATT GAT GAA ATA AGG AAA AAA AGT AGC AGC TTT TTT AGA AAA GAT TGC TTA ATA TCT GGT AAA GAA GAT TGT GGA AGC AAT TGT GTT AGA GGG AAA TAT ACA CTC GGA AAA GAA ATA TGC GAT ATT GCT CTT GAC TAG ATA AGA TTA GAG GCA AAT AAA TGC GAA AAT TTA TAA GGT TTT ATA ATT CAC AGA TCT CTT AAT GGA GGG ACT GGT AAT GGT GTT GGT AAC TTA ATT TGT GAT AGG CTC TCA AGA GAT TAT AAT AAA AAA GTT AAA ATA AAT TCA TTG CTC TTT CCA TCT AAT AAT ATT GCA AAT GAA GTT GTT GAA CCC TTT AAT TTT GTC CTT GGC ATG TAT GAT ATT TTA GAA CAC TAA GAG ATG AGC TTA TCA TTT TAA AAT GAA CAA ATT TAC AAA TTT GCA GAT AAT TAT TTA GAT ATT GAG TAA CTC GAT TAC TAA AAT ATT AAC TAA TTA ACC AGC ATT ATA AAC TCT TCA CTT ACA CAT TCA ATG CGT TTT AAA GGC GAC TTA AAC TAT AAT ATG GCA AAT TTA GTA ACT AAT TTA GTT TGT TAT CCA AGA ATT AAT AAC ACC ATA CCC TCT TAT TGT TCT TCT AAT TTT AAT TTC ATC AAA GAA AAA TGT GGT TAA CCT ACA GTA AAT ATG TTA TGT TCT AGT TTA TTT AAC AAA TAA AAC TTT TTT GTT GAT TGT AAT CCA TAA CAA GGT AAG TAT TTA TCT TGT TGT TTA ACT GCA AGA GGA GAT ATA TAT CCT AGA TAA ATT AGT GAA TCT ATA AAA ATA ATC AAA TCT AAA CAA TCA ATT GAT TTT GTT GAT TTC ATT CCT ACT GGT ATT AAA GTT GGA GTA TGC TAA AAG TAG CCT AAA AAT TTA CTA CAT AAA GAA TAT GAA TCT AAA TTT CAA AGG GAT GCT ATT TTA TTA GCC AAT AAT ACT TCA ATT AAT TCT ATA TTT TAA ATT ATG GCT TAA AAA TTT AAT AAA ATG TAT GAT AAA AGA GCA TTT GTT CAT TGG TAT GTG GGT GAA GGA ATG GAA TCA GAT GAA TTT GCA TGC GCG AGA GAG AAT TTA TTG GCT ATA ATT AAG GAT TAT GAA GAA GTC TCT ACT GAA ACG AAT GAA AAT TTC CTA GAA GAG GAT GAT GAT ATT ATA GAA ATA TGA >TTHERM_00647130(protein)M G E I I N V F V G Q Y G V Q S G Q E Y W K Q I C L E H N I N S Y G Q K L T Q Q Q D D N E N V T C F F S E S E K Q K Y V P R C V F L D L D A T P I D E I R K K S S S F F R K D C L I S G K E D C G S N C V R G K Y T L G K E I C D I A L D Q I R L E A N K C E N L Q G F I I H R S L N G G T G N G V G N L I C D R L S R D Y N K K V K I N S L L F P S N N I A N E V V E P F N F V L G M Y D I L E H Q E M S L S F Q N E Q I Y K F A D N Y L D I E Q L D Y Q N I N Q L T S I I N S S L T H S M R F K G D L N Y N M A N L V T N L V C Y P R I N N T I P S Y C S S N F N F I K E K C G Q P T V N M L C S S L F N K Q N F F V D C N P Q Q G K Y L S C C L T A R G D I Y P R Q I S E S I K I I K S K Q S I D F V D F I P T G I K V G V C Q K Q P K N L L H K E Y E S K F Q R D A I L L A N N T S I N S I F Q I M A Q K F N K M Y D K R A F V H W Y V G E G M E S D E F A C A R E N L L A I I K D Y E E V S T E T N E N F L E E D D D I I E I >TTHERM_00647130(gene)ATG GGA GAA ATA ATA AAC GTT TTC GTT GGA TAA TAC GGA GTA CAA TCA GGA TAG GAA TAT TGG AAA TAA ATT TGT TTA GAA CAC AAT ATT AAT TCT TAT GGA TAA AAA TTA ACT TAG TAA TAA GAT GAT AAT GAA AAT GTA ACT TGC TTT TTT AGT GAA TCA GAG AAA TAA AAA TAT GTT CCT CGA TGT GTG TTT TTG GAT TTA GAT GCA ACT CCT ATT GAT GAA ATA AGG AAA AAA AGT AGC AGC TTT TTT AGA AAA GAT TGC TTA ATA TCT GGT AAA GAA GAT TGT GGA AGC AAT TGT GTT AGA GGG AAA TAT ACA CTC GGA AAA GAA ATA TGC GAT ATT GCT CTT GAC TAG ATA AGA TTA GAG GCA AAT AAA TGC GAA AAT TTA TAA GGT TTT ATA ATT CAC AGA TCT CTT AAT GGA GGG ACT GGT AAT GGT GTT GGT AAC TTA ATT TGT GAT AGG CTC TCA AGA GAT TAT AAT AAA AAA GTT AAA ATA AAT TCA TTG CTC TTT CCA TCT AAT AAT ATT GCA AAT GAA GTT GTT GAA CCC TTT AAT TTT GTC CTT GGC ATG TAT GAT ATT TTA GAA CAC TAA GAG ATG AGC TTA TCA TTT TAA AAT GAA CAA ATT TAC AAA TTT GCA GAT AAT TAT TTA GAT ATT GAG TAA CTC GAT TAC TAA AAT ATT AAC TAA TTA ACC AGC ATT ATA AAC TCT TCA CTT ACA CAT TCA ATG CGT TTT AAA GGC GAC TTA AAC TAT AAT ATG GCA AAT TTA GTA ACT AAT TTA GTT TGT TAT CCA AGA ATT AAT AAC ACC ATA CCC TCT TAT TGT TCT TCT AAT TTT AAT TTC ATC AAA GAA AAA TGT GGT TAA CCT ACA GTA AAT ATG TTA TGT TCT AGT TTA TTT AAC AAA TAA AAC TTT TTT GTT GAT TGT AAT CCA TAA CAA GGT AAG TAT TTA TCT TGT TGT TTA ACT GCA AGA GGA GAT ATA TAT CCT AGA TAA ATT AGT GAA TCT ATA AAA ATA ATC AAA TCT AAA CAA TCA ATT GAT TTT GTT GAT TTC ATT CCT ACT GGT ATT AAA GTT GGA GTA TGC TAA AAG TAG CCT AAA AAT TTA CTA CAT AAA GAA TAT GAA TCT AAA TTT CAA AGG GAT GCT ATT TTA TTA GCC AAT AAT ACT TCA ATT AAT TCT ATA TTT TAA ATT ATG GCT TAA AAA TTT AAT AAA ATG TAT GAT AAA AGA GCA TTT GTT CAT TGG TAT GTG GGT GAA GGA ATG GAA TCA GAT GAA TTT GCA TGC GCG AGA GAG AAT TTA TTG GCT ATA ATT AAG GAT TAT GAA GAA GTC TCT ACT GAA ACG AAT GAA AAT TTC CTA GAA GAG GAT GAT GAT ATT ATA GAA ATA TGA