Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00647130

Standard Name

ALT1 (Alpha-Like Tubulin )

Aliases

PreTt15819 | 93.m00115 | 3727.m00035

Description

Alpha-like tubulin protein

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF00091 ) Tubulin/FtsZ family, GTPase domain
  • ( PF03953 ) tubulin/FtsZ family, C-terminal domain

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.9%

TetraMine Data

TTHERM_00647130

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_19119.19.998596099208102e-158tubulin/FtsZ family, GTPase do
main-containing protein (448 a
a)
OxytrichaContig22199.0.g1196.000220702367707e-121Tubulin/FtsZ family, GTPase do
main
WormBaseWBGene000065303.998986577109865e-118locus:tba-4 status:Confirmed
UniProt:G5EDD4 protein_id
:CAA85463.1
DictyBaseDDB_G02876899.002752962930884e-112tubA on chromosome: 5 position
707217 to 708704
SGDYML085C7.0000984021781654e-99TUB1 Alpha-tubulin; associates
with beta-tubulin (Tub2p) to
form tubulin dimer, which poly
merizes to form microtubules
Stentor CoeruleusSteCoe_381022.820770088460135e-53

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:16933976: Eisen JA, Coyne RS, Wu M, Wu D, Thiagarajan M, Wortman JR, Badger JH, Ren Q, Amedeo P, Jones KM, Tallon LJ, Delcher AL, Salzberg SL, Silva JC, Haas BJ, Majoros WH, Farzad M, Carlton JM, Smith RK, Garg J, Pearlman RE, Karrer KM, Sun L, Manning G, Elde NC, Turkewitz AP, Asai DJ, Wilkes DE, Wang Y, Cai H, Collins K, Stewart BA, Lee SR, Wilamowska K, Weinberg Z, Ruzzo WL, Wloga D, Gaertig J, Frankel J, Tsao CC, Gorovsky MA, Keeling PJ, Waller RF, Patron NJ, Cherry JM, Stover NA,

Sequences

>TTHERM_00647130(coding)
ATGGGAGAAATAATAAACGTTTTCGTTGGATAATACGGAGTACAATCAGGATAGGAATAT
TGGAAATAAATTTGTTTAGAACACAATATTAATTCTTATGGATAAAAATTAACTTAGTAA
TAAGATGATAATGAAAATGTAACTTGCTTTTTTAGTGAATCAGAGAAATAAAAATATGTT
CCTCGATGTGTGTTTTTGGATTTAGATGCAACTCCTATTGATGAAATAAGGAAAAAAAGT
AGCAGCTTTTTTAGAAAAGATTGCTTAATATCTGGTAAAGAAGATTGTGGAAGCAATTGT
GTTAGAGGGAAATATACACTCGGAAAAGAAATATGCGATATTGCTCTTGACTAGATAAGA
TTAGAGGCAAATAAATGCGAAAATTTATAAGGTTTTATAATTCACAGATCTCTTAATGGA
GGGACTGGTAATGGTGTTGGTAACTTAATTTGTGATAGGCTCTCAAGAGATTATAATAAA
AAAGTTAAAATAAATTCATTGCTCTTTCCATCTAATAATATTGCAAATGAAGTTGTTGAA
CCCTTTAATTTTGTCCTTGGCATGTATGATATTTTAGAACACTAAGAGATGAGCTTATCA
TTTTAAAATGAACAAATTTACAAATTTGCAGATAATTATTTAGATATTGAGTAACTCGAT
TACTAAAATATTAACTAATTAACCAGCATTATAAACTCTTCACTTACACATTCAATGCGT
TTTAAAGGCGACTTAAACTATAATATGGCAAATTTAGTAACTAATTTAGTTTGTTATCCA
AGAATTAATAACACCATACCCTCTTATTGTTCTTCTAATTTTAATTTCATCAAAGAAAAA
TGTGGTTAACCTACAGTAAATATGTTATGTTCTAGTTTATTTAACAAATAAAACTTTTTT
GTTGATTGTAATCCATAACAAGGTAAGTATTTATCTTGTTGTTTAACTGCAAGAGGAGAT
ATATATCCTAGATAAATTAGTGAATCTATAAAAATAATCAAATCTAAACAATCAATTGAT
TTTGTTGATTTCATTCCTACTGGTATTAAAGTTGGAGTATGCTAAAAGTAGCCTAAAAAT
TTACTACATAAAGAATATGAATCTAAATTTCAAAGGGATGCTATTTTATTAGCCAATAAT
ACTTCAATTAATTCTATATTTTAAATTATGGCTTAAAAATTTAATAAAATGTATGATAAA
AGAGCATTTGTTCATTGGTATGTGGGTGAAGGAATGGAATCAGATGAATTTGCATGCGCG
AGAGAGAATTTATTGGCTATAATTAAGGATTATGAAGAAGTCTCTACTGAAACGAATGAA
AATTTCCTAGAAGAGGATGATGATATTATAGAAATATGA


>TTHERM_00647130(protein)
MGEIINVFVGQYGVQSGQEYWKQICLEHNINSYGQKLTQQQDDNENVTCFFSESEKQKYV
PRCVFLDLDATPIDEIRKKSSSFFRKDCLISGKEDCGSNCVRGKYTLGKEICDIALDQIR
LEANKCENLQGFIIHRSLNGGTGNGVGNLICDRLSRDYNKKVKINSLLFPSNNIANEVVE
PFNFVLGMYDILEHQEMSLSFQNEQIYKFADNYLDIEQLDYQNINQLTSIINSSLTHSMR
FKGDLNYNMANLVTNLVCYPRINNTIPSYCSSNFNFIKEKCGQPTVNMLCSSLFNKQNFF
VDCNPQQGKYLSCCLTARGDIYPRQISESIKIIKSKQSIDFVDFIPTGIKVGVCQKQPKN
LLHKEYESKFQRDAILLANNTSINSIFQIMAQKFNKMYDKRAFVHWYVGEGMESDEFACA
RENLLAIIKDYEEVSTETNENFLEEDDDIIEI


>TTHERM_00647130(gene)
ATGGGAGAAATAATAAACGTTTTCGTTGGATAATACGGAGTACAATCAGGATAGGAATAT
TGGAAATAAATTTGTTTAGAACACAATATTAATTCTTATGGATAAAAATTAACTTAGTAA
TAAGATGATAATGAAAATGTAACTTGCTTTTTTAGTGAATCAGAGAAATAAAAATATGTT
CCTCGATGTGTGTTTTTGGATTTAGATGCAACTCCTATTGATGAAATAAGGAAAAAAAGT
AGCAGCTTTTTTAGAAAAGATTGCTTAATATCTGGTAAAGAAGATTGTGGAAGCAATTGT
GTTAGAGGGAAATATACACTCGGAAAAGAAATATGCGATATTGCTCTTGACTAGATAAGA
TTAGAGGCAAATAAATGCGAAAATTTATAAGGTTTTATAATTCACAGATCTCTTAATGGA
GGGACTGGTAATGGTGTTGGTAACTTAATTTGTGATAGGCTCTCAAGAGATTATAATAAA
AAAGTTAAAATAAATTCATTGCTCTTTCCATCTAATAATATTGCAAATGAAGTTGTTGAA
CCCTTTAATTTTGTCCTTGGCATGTATGATATTTTAGAACACTAAGAGATGAGCTTATCA
TTTTAAAATGAACAAATTTACAAATTTGCAGATAATTATTTAGATATTGAGTAACTCGAT
TACTAAAATATTAACTAATTAACCAGCATTATAAACTCTTCACTTACACATTCAATGCGT
TTTAAAGGCGACTTAAACTATAATATGGCAAATTTAGTAACTAATTTAGTTTGTTATCCA
AGAATTAATAACACCATACCCTCTTATTGTTCTTCTAATTTTAATTTCATCAAAGAAAAA
TGTGGTTAACCTACAGTAAATATGTTATGTTCTAGTTTATTTAACAAATAAAACTTTTTT
GTTGATTGTAATCCATAACAAGGTAAGTATTTATCTTGTTGTTTAACTGCAAGAGGAGAT
ATATATCCTAGATAAATTAGTGAATCTATAAAAATAATCAAATCTAAACAATCAATTGAT
TTTGTTGATTTCATTCCTACTGGTATTAAAGTTGGAGTATGCTAAAAGTAGCCTAAAAAT
TTACTACATAAAGAATATGAATCTAAATTTCAAAGGGATGCTATTTTATTAGCCAATAAT
ACTTCAATTAATTCTATATTTTAAATTATGGCTTAAAAATTTAATAAAATGTATGATAAA
AGAGCATTTGTTCATTGGTATGTGGGTGAAGGAATGGAATCAGATGAATTTGCATGCGCG
AGAGAGAATTTATTGGCTATAATTAAGGATTATGAAGAAGTCTCTACTGAAACGAATGAA
AATTTCCTAGAAGAGGATGATGATATTATAGAAATATGA