Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00320020

Standard Name

ABCC10 (ABCC family gene 10)

Aliases

PreTt15921 | 32.m00165

Description

ABC transporter family protein

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF05662 ) hemagglutinin
  • ( PF02141 ) DENN (AEX-3) domain
  • ( PF07782 ) DC-STAMP-like protein
  • ( TIGR01978 ) FeS assembly ATPase SufC
  • ( TIGR00955 ) pigment precursor permease
  • ( TIGR01194 ) cyclic peptide transporter
  • ( PF02463 ) RecF/RecN/SMC N terminal domain
  • ( TIGR00958 ) antigen peptide transporter 2
  • ( TIGR01842 ) type I secretion system ATPase
  • ( TIGR01846 ) type I secretion system ATPase
  • ( TIGR03375 ) type I secretion system ATPase
  • ( TIGR01288 ) nodulation ABC transporter NodI
  • ( TIGR01193 ) ABC-type bacteriocin transporter
  • ( PF00005 ) ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( PF00664 ) ABC transporter transmembrane region
  • ( PF06341 ) Protein of unknown function (DUF1056)
  • ( TIGR01192 ) glucan exporter ATP-binding protein
  • ( PF05316 ) Mitochondrial ribosomal protein (VAR1)
  • ( TIGR02673 ) cell division ATP-binding protein FtsE
  • ( TIGR02769 ) nickel import ATP-binding protein NikE
  • ( TIGR02770 ) nickel import ATP-binding protein NikD
  • ( TIGR02323 ) phosphonate C-P lyase system protein
  • ( TIGR02324 ) phosphonate C-P lyase system protein
  • ( TIGR02857 ) thiol reductant ABC exporter, CydD
  • ( TIGR02868 ) thiol reductant ABC exporter, CydC
  • ( TIGR02872 ) sporulation integral membrane protein YtvI
  • ( TIGR01166 ) cobalt ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR01189 ) heme ABC exporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR00968 ) sulfate ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR00954 ) Peroxysomal long chain fatty acyl
  • ( TIGR01277 ) thiamine ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR02204 ) ABC transporter, permease/ATP-binding protein
  • ( TIGR02633 ) D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR02982 ) ABC exporter ATP-binding subunit, DevA
  • ( TIGR00957 ) multi drug resistance-associated protein (MRP)
  • ( TIGR00972 ) phosphate ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR01187 ) polyamine ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR03410 ) urea ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR03411 ) urea ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR02203 ) lipid A export permease/ATP-binding protein
  • ( TIGR02315 ) phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR03269 ) methyl coenzyme M reductase system,
  • ( TIGR02211 ) lipoprotein releasing system, ATP-binding protein
  • ( TIGR02314 ) D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR01184 ) nitrate ABC transporter, ATP-binding proteins
  • ( TIGR01186 ) glycine betaine/L-proline transport ATP binding
  • ( TIGR01271 ) cystic fibrosis transmembrane conductor regulator
  • ( TIGR00960 ) Type II (General) Secretory Pathway
  • ( TIGR01188 ) daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding
  • ( TIGR03005 ) ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.8%

TetraMine Data

TTHERM_00320020

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_19041.19.997093137033517e-262ABC transporter (5234 aa)
DictyBaseDDB_G02876915.997858334163121e-134abcC3 on chromosome: 5 positio
n 792495 to 797051
SGDYLL015W1.0003814179949055e-122BPT1 ABC type transmembrane tr
ansporter of MRP/CFTR family,
found in vacuolar membrane, in
volved in the transport of unc
onjugated bilirubin and in hea
vy metal detoxification via gl
utathione conjugates, along wi
th Ycf1p
WormBaseWBGene000034133.000551941601253e-121locus:mrp-7 status:Partially
_confirmed UniProt:Q9U2G5
protein_id:CAA21622.4
OxytrichaContig841.0.g974.001540793770557e-102ABC transporter transmembrane
region
Stentor CoeruleusSteCoe_165342.2856936767186716e-49

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:22184018: Lu XY, Xiong J, Yuan DX, Miao W (2011) [Alternative splicing of an ATP-binding cassette transporter ABCC10 in Tetrahymena thermophila]. Dong wu xue yan jiu = Zoological research 32(6):605-10

Sequences

>TTHERM_00320020(coding)
ATGGAGTTAAAACAATCTCTTTTAGAATCAACTTCAAGGGAAGATGCCAATAAAAAATAT
TTTAAGACTCACAACATTTTATTTACAAAAATAACTTAGTTTGTTAAAAGCCTTAAAACA
TAATCAAAAGATCAACAGCTCAATAATAAATAAATAGATCCTTTTATAGCCTAAAGTACT
AGTGTAGATGTTTAATTAGAAAAACTAGAAAAATACATTTAGGAAAACCAATAACATTTC
TAATCTACCAATTTTAACTTATTCAAAATTTACAAACAAATGACAGGCCTTACTCTTTTA
AAAGGCTTCTTCTTATCTGTTTCAAATGAACTTTTATCAGCATCAGGTATTTTTATGCTG
GACTTTGTCACTGATCAAATGAAAGATTTCACAGGATTGTCTAGTTAAAAGGCTTTAATT
TCAATAATATTCCTAGGGATAGTGATAAACTATACTATAAAAAACTTTGTGTGGACGAAT
TATCAATGGATGAATTACAGATGGTAGGCTTTGTGTAAAACTACACTCTAATATATCATT
TATAAAAAATCCTTAAAAGTTAAGAATTATTCAAAATAGAATAATAGTGTTGAGCCAAAA
ATTTAAAAATTAGAAAACTAAGCTGAAGGACAAGGAGATGAAAAGTTAGACATAACTTCT
TTTTAAAAAGTTAATCCCGATATAAATAACTTATTAACTGTAGATGTAGAAGAATCGATG
CAGTTATTTTGGGGAATAAACTAATTAGTTGCTAGCTTAGCTGTAATAATAATCACGTTT
GCTATCATTTATTATAAAATCGGTAAGTCGATTGTAAATGGACTTTATTTAATGGCAGGA
GCAATGGCAGTAAGTTTTCTTTCTGGATTTTTCATGAATATCTTTTATGACAGAATATAC
AGCCATAAAGATAGCAGAATTTCTCTTTGCAAAGATGTGATAGAAGGGATGAAGAGTATA
AAATACTTAGGATGGGAAAATATATTTTCTAATAAAATCAAAGACTTGAGACAAAAAGAA
TTTTTTAATGTAGCTGCTATGAGGTCAATTGATGGAATCTTTAGTACTTTTATAGTATGT
TCAAATTATTTTCTCTTGTATTGCTTTATTGTATCATATATAAACGATGGAAACGAGCTG
ATCAATTCTAATGTCTTTACTATTATAGCCCTTTTTGGTAATTTAGCTTTTCCAATTGGA
ATGATACCCTTTTCTCTTAAGTGCATGACAAAAGCAAGAATTTCTTTCTTTAGAATCAAA
AGCTTCTTAAACATTGATGAAATTGATGAATCTCAAATTATTTAGACAAGTGAAAATCAA
TCCTAAGTAGCTGTTCAAATTCAAAATTAATATTTCTCTTGGCCTAACAAAGAATTAAAT
GAAGAATAAAATATAAAATAGAGACAGTAAAAGCAAGATATTTCAGATTCAGAAAGCCAA
TTTGAAGACTAAGAAAATAGCGTTTCTAAAAATAGCTCAGAATTTAATTTGTTTATTGAT
AACATTTAAATCTAAAAAAATTCTCTGAATTTTGTAATCGGAAAAGTTGGATGTGGAAAA
ACATTATTTTTACTCTCAATCATGAATGAGATGGAAAAAAGGTCTTAAAATTTTGACCAA
TCTATTATTAAAGATGACCTTAAATAAGTAAATACCTTAAAAATGACAAATTATGAAAAT
AAAATCATAGTGAATGGTAATGTGGCATATGTCAGTTAGAATCATTGGCTTTAATCAAAA
ACAATCAAAGAAAATATACTTTTAGGAAAAAAATATGATCAAGACCTTTATTTGAAATGT
CTTGAAATAAGCTAGCTAAAGACTGATTTATCTCAATTCTCAAAGGGAGATTAAAAAATT
ATTTCTTCAGATGGAAATAATTTAAGTGGAGGTCAGAGATAAAGAATTTCATTGTGTAGA
GCACTCTACTAAGATAAAGAAATCTACTTATTAGATGATATATTTAGTTCGCTAGATGCT
CATGTGGCAGAATACATTTATAAGAATGCTATATTAGATTACTTAATCAAATAAAAAAAT
AAAACAGTTATTTTAGTAACTAGTAATTATGAGTTTTTAAGCAATGAGAGTATTCAAAAT
ATAATTTATTTGAGAAATGGGAGGATTATTAATGACTAAGAAGAAATATAAAGCTATATC
TTAAATTGCAAATAAAAATAAAAAAAGAATGATTTCTTCTTTGAAAGCGATTACTTTTAA
AACTCAAGTAATCTAAACAATAAATATAATAAGAATTCAGATGAAGAGATCGATTAATTA
AATATAACTTAAAAATAAATTAAACTAAAACCAGAAAATTAAAAAAATATAGGATTTAAC
CAAACAAATGAGCAGAATGAAGTATAAAATAATAATGAGATAAGCTCAGAAGAAGGAGAA
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AAAAGTTAAGGCATAGTTTACTTATTTTTTTTTATAGTATTTTTTGCTTTAGTAGAAGTG
GCTAGCTTATTGATTGACTTTTGGCTTAGAGATAAGCTGATAAATTAAAATGAGGAAGAT
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ACAATGCTTTAGCTATCTTTAATGCTTATTGGGGCTTTCTTTTATGTTGTCATATCGTTA
TTAAGTTGTTACAGACTTTATAATAAGTTAAATAACTCTATAATGTCTAGTAAAATGGTT
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ATTGATGATGATCTACCTTTGAATTTTGAAACTGCATCTGAACAAGTTGTTCTTGCAATT
GGTTATCCAGTTGGTATCTCTATTTAGTTTCCTTGGATGAGTGCTTTTTTTGTAGTTGCT
ATAGTAATTACATATTTTATTTCAAATATGTATAGAAGTTCAAACAGAGAAGTCAAAAGG
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GTAACAATTAGGTCTTTTTAAAAATAAGCTTACATGACAAAATAATATATTTTAAGATTA
ACGAATAATATAAACACATTTTTACTTTCTTTATCTTTGTAGATGTGGTTGTTTGTAAGG
CTACTTTTAATTTCTAATGGAATCTAGCTAGTTCTTTCAATAACAGCAATTATCATAATA
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TTTAGCGGTTAAATTCTTGATGTTGTTTATTTCGTTTGTTTAACTGAATAAGAATTAATC
AGTGTTGAGAGAATAAGACAGTATTTTGATAACCCCTAAGAAAATGTTTATACCATTCAA
AACTCTAACAAATATATACAATCAGCATATGCTTTAAGTCCTTCTGATATAAATCAGAAT
TTTTCCATAATCTTCTAAGATCTAAGCATCACTTATGATGAATTGAATGAATAAAATTCT
GATCTTGTATAGTATGCTCTAAAAGACTTTAATCTTCAAATCAAAAAAGGAGAGAAAATT
GCATTTTGTGGAAGAACAGGTTCTGGTAAAACCTCGATCCTTAATTGTTTGTTTAGATTA
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AAGGAGTTAAGAAATAAAATGGCTATCATTCCTTAATTTGGATTTTTATATAATGCAACT
CTTAGAGATAACATAGATCCAATCAATGAAATACCTGATGAAAATATTTAAAGATGCATT
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AGAGTGGCTCTGAGGTAGACAGAAATAATTTGCTTGGATGAAGCTACTTCTAACATGGAT
CCAAAAACAGACGAATTGATTCACAAAAAGTTATTTGAATTAAGTGAAGGAAAAACACTT
CTAGTGATAACTCACAGATTAGAAAATATACATAAATTTGATAGGATAGTAGTGTTAGAT
TCTGGAAAAATTGTCGAAGAAGGAAATTATGAGTAACTAAGATATACAAATATAATAATT
AACATAATTAAAGTATCTATATTAAATAAATTATAAATGGATATAAAGTAACCACTTCTT
GTAGAGTAATCTTCAGATCAAAGTAGTTAGTATACTTTCAAGGCTCATAACATTTTCTTT
ACAAGATTAACTTCATTTATAAAGTAAATTAAGTTTTTAAATGATGGTCAATACATATCT
AATCAGTAAACCTAGCCATTTATAGCCCAAAGCACCAGCGTAGATGTTTAAATCAATAAA
TTAGAAAAATTCATGAGTGATAATTAATAGCACTTTTAACCAAACAATTTTAATTTATAT
AAAATTTACGTTTAAATGACTGGATTTACACTAGGTAAAGGTATTTTCCTTTCAGTTATG
AATGAAGTTTTATCTGCCTCAGGCATATTTTTACTTGATTATGTTACTGATAAACTCAAG
TAGTTTAATGGAGAGTCCAATGAAAAGCTTATCATATCGTTTATTCTTATTGGAATAGTT
GTGAACTATACTGTCAAAAATATTATTTAGGGGAAATATTATTGGTTGGATTACAAATGG
CAAGCTTTGTGTAAAACAACTCTTTAATATTTAATTTATAAAAAATCACTAAAAGTCAAA
AACTACTCTAAGTAGAGCAACTTAGTGGCTGAACAAAAAAAGGAGGATAATCAAAAATAA
GAGAATGATGAAACAGAAGGAGAAGAGGAAATTACATCTTTTTAAAAAAGAAATCCTGAT
ATAAACAACTTATTGACTGTTGATATTGAAGAATCGATGCAGCTTTTTTGGGGTATTACT
TAACTAGTTGACAGTATAGCTGTTATAATTATTACTCTAATTTTCCTCTTCTATAAAATT
GGAAAGTCCATGTTTAACGGATTATATTTAATGGCTGGAGCTATGTTAATAGGTTTCCTC
TCAGGCTACATAATGAATATCTTCTATGATAAAATTTATGGATGTAAAGACAATAGAATC
TCACTAAGTAAGGATGTTATTGAAGGAATGAAGAGCATTAAATATTTAGGATGGGAAACT
ATATTTTCAAATAAAATAAAAGATTTGAGAAGAAAAGAGTTTTTCTAAATATCTGTTATG
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ATTTTTATTGTTTCATATGTTAATGATGGAAATGACCTATAAGATTCAAATGTATTCACA
ATAATTGCTCTTTTTGGTAATTTAGCTTTCCCAATAGGCATGATTCCTTTCACTACTAAA
TGTATCTCCAAAGCTAGAATCTCTTTCTTAAGAATTAAAGGCTTTTTGAATATTGAAGAA
ATAAATGAATCAGATGTCATAAAGGTAGATAATGATGAAATTAATTAAGATGTATAAAAC
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AATGAAGAGAGAGTTTCTGAAAAATCAAATAATATAAAGTCTTCAGGATAGCTTAATTAA
CTAGATGATTAAAGTATCTAAGATTCTAAAATTAGCTCTGAATTTACTTTATATATTGAT
GAAATGATAATATAGAAAGGCACCTTGAATTTTGTTATTGGTAAAATAGGTTGTGGAAAA
ACTGCTTTTTTGCTTTCGATTTTGAATGAGATGGAAAAAAAATAACACCAATCTGATCCA
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AAAATAGTTGTAAATGGGAGTATAGGATATGTAAGCTAAAATCATTGGCTATAAACCAAG
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CTGGATTTATGCTAATTGAAGATTGATTTATCTCATTTTTATAAGGGTGATTAAAAGGTT
ATATCTTCAGACGGTAATAATCTGAGTGGAGGTTAGAGATAAAGAATTTCTTTGTGCAGA
GCACTGTACTAAGATAATGATATTTATTTATTAGATGATATATTTAGCTCTTTGGATGCT
CATGTTGCTGAGCATATCTATAAAAATGCCATTTTAGATTATTTAATTAAATAAAAAAAT
AAAACAGTCATTCTAGTTACAAGTCACTATGGATTTATAACAAATGATAATATTTCTAAT
ATCATTTACTTAAAGAACGGAGAAATTATTCATGACTAAAAATAAATTTATAGTTATATT
CAGAATTCTTAATAAGATTCTAAAACTAAAGATTTTAATTTCTTAAATGAATAAGAAGAT
GATTTATAAGATCAAGAAGTAGAAGAAAATAAGGTTGAAAACTCTGAGACTAACTAATAA
TTAATCTAAAGAAAAGTAGATAGTGAATAAGACCACTTGATGCTTTAAAAGAAAAATTCT
ACAAGTAGCGAAACTAAATTAGCATTGAGAAAAGAAAACTCTAAAAAGTAGAATTTTAAG
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TTTTCCAGCTTTAAAGATACATTCCTTTTTTTGACTATGCTTTAATTGTTTTTAATGATT
TTAAGCTCTGTTTTTTATGTTCTGGTTTCATTATTAAGTTGCTACAGACTTTTTAATAAA
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CTTTATATGAGTTAGTTATATGTCGAAAGATTAAAAAACAATGTTAATACATTTTTACTA
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CTTTTGGTTGTAATAACAGCTATTATGATCATTACAATTGAATTTTCTGTAGATATTAAT
GTTATCGTTTTATGCTTATCATATGGAATCTTATTTAGTGGATCGATATGTGATGTCATG
TACTTTATATGCTTAACTGAGTAAGAGTTAATCAGTGTTGAGAGAGTAAGACAGTACTTT
GACAATCCACAAGAGAATCTTGATAACGTTGATAATTCTACTTAAAAATTACAATCTGTT
GAATAGACCTTAAGTCCTTCTGATATTAATCAGAATTTCTCTATAATCTTCAAAGATTTG
TCTATTACATACGATGAACTGAACGAGCATAATACTGATCATGTACAATATGCTCTCAAA
AACTTTAATCTTAAAATTAGAAAAGGAGAGAAAGTTGCTTTCTGTGGAAGAACAGGCTCT
GGTAAAACCTCTATCCTTAATTGTTTGTTTAGATTATATGATTACCAAAAAGGGTAAATC
TTCATAGATAATACTGATATTCTAAGCATGAGTTTGAAGGAGCTTAGAAAAAAAATGGCT
ATCATTCCTTAGTTTGGCTTTTTATACAATGCCACTCTTAGAGATAATATAGATCCTGTA
AATGAAATATCTGAAGAAGAAATTCAAAGATGTATACAATCAATTCAAGAAGAGGGTCAA
TTAAATTCAAATGACTGCTTCTAAGAGTTAGATTTCGAAATCTAAGAAGGTGGAAAGAAT
TTATCAAATGGATAAAAGTAAATAATTAATTTTATTAGAGTGGCTTTGAGGTAGACAGAA
ATAATTTGCTTGGATGAAGCCACTTCTAATATGGATCCAAAAACAGACGAATTAATTCAT
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AATATTCATAAATTTGATAGAATCGTTGTGCTTGATTCTGGGAGAATTGTAGAAGTGGGT
AACTATGATTAACTAAGATAAATAGAAGGAGGATTTTTTAATAGATTAATCACATAAAAA
TGA


>TTHERM_00320020(protein)
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>TTHERM_00320020(gene)
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CTTTTAGGAAAAAAATATGATCAAGACCTTTATTTGAAATGTCTTGAAATAAGCTAGCTA
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