Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00502120

Standard Name

AAP3 (Ada2-associated protein 3)

Aliases

PreTt08051 | 63.m00229 | 3716.m00081 | A2A3

Description

Member of the SAGA complex. PHD finger-containing protein.

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.4%

TetraMine Data

TTHERM_00502120

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_09618.29.997093137033517e-262PHD-finger family protein (154
5 aa)
OxytrichaContig307.0.0.g609.99723014177113e-33PHD-finger
Stentor CoeruleusSteCoe_342892.8625185805493937e-20
SGDYPR031W2.000769134519826e-18NTO1 Subunit of the NuA3 histo
ne acetyltransferase complex t
hat acetylates histone H3; con
tains PHD finger domain that i
nteracts with methylated histo
ne H3
WormBaseWBGene000030340.0000000000000030004923591262316locus:lin-49 Protein lin-49
status:Confirmed UniProt:Q
20318 protein_id:CCD67656.1

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:29523178: Saettone A, Garg J, Lambert JP, Nabeel-Shah S, Ponce M, Burtch A, Thuppu Mudalige C, Gingras AC, Pearlman RE, Fillingham J (2018) The bromodomain-containing protein Ibd1 links multiple chromatin-related protein complexes to highly expressed genes in Tetrahymena thermophila. Epigenetics & chromatin 11(1):10

Sequences

>TTHERM_00502120(coding)
ATGTCCAGCTAGGATCTTGATCAGAATAACGATAGCACTTGCAAGACTAATGATTGCGAT
CGTAGCCAAAAGCTGATAGATGAAACAGATCTTGATGACGATAAAAATAAAAATGAGAAA
AAATATTAAGATTTAGTTAAATCCATAAACTACTTAAAGAAGTTTGATTGGTTTGATACA
AACAACCCTTAGCTAAAAACGCCTCCAATAAAGCTTTTAACTCCAGCTGCATTTTGGTTT
ATGGTATGCGCAGAATACTTTCCAAGGTCTCTAACTATAGGTACTAATGATCCCGCTTAG
ACACTAACAGAATTACTTCAAAAAATAGAGAGATAATAGATATTTTAAGTCATTAGAGTT
AAAGATAAGTCTTATTAGAATCTAAAGGGAGAACCAACAGATGAGCAGTGCCAGGAATAT
ATTTAAAAAATAAAATAAGCTATTAAAAAATTAAAATATGATAAGCCATAAGCAAATATT
AGGAATAGTGCAGAATTGAAAGAAGATTACACTTTCGAAGACGATTTATATATTTAAAGT
GTCCGTAATGATTTACTGGATCTTTATTCCTTTTACATTAATTAGGAATTGCAATAAACA
AATCAGCAAAGTTGCTCATCTTCTGAATCTACTACAGTTGAGGAAGATTCTAGGCATTTA
TATATCACTAAAGATGAGATAAATGTTAATGTATCATGCAACGAAAAACAAAATTCTGAA
AATGCAGTTATGATTGTAAAAGAAATAGATGAAAATAATATTTCTGAAGAAAGCTAGCTT
AAATAAAAAAATGAAGAACCTTCACAATCATAAGATGAAATTGATGAAAAGGAAAAAAAA
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GAATAAGAATACCTTAATTTCTTAGAGAATAAACAGCAATTTATTGATTTTGAGAGTGAA
AGATAAAATTAAAACTAAAATCAGAAGAAGCAACACACAAAGTAGCATGAAAAAATAGTT
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GTATTTTGCTCTAAATGCAATATTTCTGTACATCAAAGATGTTATGGTATTCCCAAAATC
CCTAATGATGACTGGATTTGTGAACTGTGCTTAAGTTTTGGTCCAGAAGGTAAATACTTA
CGCTGTGCTTTATGCACAAAGAGAGGTGGTGCTATGAAGCCTAGCAAAATCCCAATTACT
TCTAATATCTTTTAGCATACAAATACACAATATTACGAATTTTAAAAAACTTGTAAGGCA
GGTCCACCTAATAAAAAATAAAGATATGAGGATCCTAATGAGAAACAAAATAAGGTTGGG
AGTGCTTCTAAGCATACTTCTCCAGAAAACGAAGAAGTTGAAGAAGAAAGTAATAGCTAA
TATTATGACTTCCATTACTTGAAAGAATTTACTGAGGAAGAGCTTAAGAATGAACCTAAG
CCATACTTTGTGTGGTGCCATATTACATGCACTTTATGGACTCCTGAATGCTTTTTTGAT
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TTGGAATGCAGTATCTGTAAGTAGAAGAAAGCAGGATCTTGTGTTTAATGTGCAAAGACT
AAATGTATGGAGGCATTCCATCCTGAGTGTGCTCGTAGAGAAAATATTTATATGGAAATT
AGGAACACAGATAAGTTAGCATATTTAATTTACTGTGAAAGACATACCCCACTAAAGTTA
AGAAGACTCCTTGAATAAAAAGAAAAAAAATATAAAGAAGAAATTATAAAATTTTGTAGA
AGTATCGAAAGATCTAGGGAATTTAGAAAGAAGGAAAGAAACACAAAGAAAGAGCGTGAT
AGATAACTAGAAAAAGAATAAAAGAAGGCTCCTGCGAAAAAGAAAGTTTTAATTAGTGCT
AAAAAGATAAGACAACAAATTACCAAAAATGAGGAAGAGACAAATAAAGAGGAATAAGAA
TTTTAGTAAATGCTCATTCACAAAATGATAGAATATATTGACACCTTAACTCCAGAGGAC
TTGAATAGGATTAACTCTGAGTTTAATTCAAAAAAATAAAATGAAGAAGGTCAAAATATT
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TCCGTAAAAAAAATAAATTTATGGAAAAATAGAGTTTTCATAAGAAAGGAAGAGCCCTTT
TGGAAGGATATTTAGTATAAATCTCTATCTACACTTTAAATTTACAAGAGATACAAAAGA
ATTCAAAGAGATAAAAATAAGAAGAAAGAATTCAAGTAGTTGTACCTTAAAACAGTAAGT
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AAAATTGAAAAATAATAAAAAAGATAGCAAAAAATAGCTGAAATATTCATAAAAACATAA
GAAAGATAAAAAAAGAAATTAGAAATTCAGGAAAGGAAAGAGCAAAAAGAAGTTTAGAAG
AAATAAAAATCTCAGACGGGTTTTGAACTTGCTAAGCATGCTATCAGAAGGACTAATAAA
AAGAGAGATAAATCTAATGATAAGAAACAATAAAAAAATTTAAAACAATAAGAACTCATT
ATTGAGCAAGTTGTTCCTCATAATTATGAGCCTGTTGATGAAACTTCTGAATAAGTTTAC
TGTGTTTGCAGAAGAAAGTATCAAGAGGGAGATTAGATGATGGAGTGTGAAAAATGTTAA
GAATGGTATCATTTTGAGTGCATAGGGTTCAAAGGTACAATTGATGAAGCTGATTAATTA
AACTTTGTGTGTAAGTTTTGTGATCTAAAGGATGATGAAAATCAAAGGTAAAAGCGTAGA
TAGATTTACAAAGACTACTTTATAAATATAGACACTCCTAATTATGATGATTTCAAAGAT
GCTTTCAATAAAAAGTAAAATTAAGAGTAGTAGTAATAATAAGAAGAAGTCTAATTAGAA
ACCAAAGAAAAAGAAAATGATTCTTCAAGAATGAAGAGTGATTCAAAATCCTCTAAAAAA
TAATAAAAAAAATAAACTTAAAATAAAAAGAGATCTTCAAGCACTAAGTTATAAGATATA
GAAGAATAAACTACAACTTCTAAGAAGACTAAAAAATCTAAAGATAGTAAAACAAATAGC
TCTTCATCTAAGATTTCTGAAGTTAAGGCTAAGTTAGATTATGCTAACTACAGTGATGCC
AAAGAAGAAATATTTGAAGAAGATGAAGATGACAATGAATAAAAAGAAGAAATTTAACAT
CAAGAAGATCATATGCACTTAGAAGAACTTTCAAAATAAGATGAATAGGAAAATAATATT
AATAATCTAAAATCTAAATAACTTGACTGTAATTAAATAGAAAAAACTTTAAATGAATAA
ATCAAGTTTGAAACTTTACAAGAAAGCTAATGTATTGATAAACTAATTGAAAATAAAAAT
TAAGATAAATGCGAGATTGAATAAAATTAGAAGTAATAAATTTAAACAAAAACAGAGCAT
ACTGATACCTAAATGTTTGATAACTAAGATATGAGTGATAATTCAGCTTTAATTGATAAA
AAAATAACAAAAAGTAATGATTAATCACACATGAAAATTGAAAAAGAAGAAACAGAAACA
AAAAATGATGAAATTAAAACAGAAAATTAGGAAGAAAATGAATCAGTAAAATAATAAGAT
ATTAAAAAAGAAAAGTAAGAAGATATAAAAAATGAACAAAATGAAATTATAAATACAGAA
GAAAAATAGGAGGAGGAAGATGGATAAACCAAAATTAATTTATTGCAAGAATATCAATAC
AACAAAAAATCTGATAGTTTAAAAATAGAATCATAGTAGAGTAATAATTCATAAAATTAA
GTAAATGAAAATTGTTTAAGTAAATAAAGCTCAAATTAAAACCAATAAAATGTGTGCAAT
ATAGCAAATTTAGACTAGTTTAAGTTTAAGCAAAAAAGCATAAAAGATTTTTTCAAAAAG
AAGTGA


>TTHERM_00502120(protein)
MSSQDLDQNNDSTCKTNDCDRSQKLIDETDLDDDKNKNEKKYQDLVKSINYLKKFDWFDT
NNPQLKTPPIKLLTPAAFWFMVCAEYFPRSLTIGTNDPAQTLTELLQKIERQQIFQVIRV
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ERQKKKLEIQERKEQKEVQKKQKSQTGFELAKHAIRRTNKKRDKSNDKKQQKNLKQQELI
IEQVVPHNYEPVDETSEQVYCVCRRKYQEGDQMMECEKCQEWYHFECIGFKGTIDEADQL
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TKEKENDSSRMKSDSKSSKKQQKKQTQNKKRSSSTKLQDIEEQTTTSKKTKKSKDSKTNS
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IKKEKQEDIKNEQNEIINTEEKQEEEDGQTKINLLQEYQYNKKSDSLKIESQQSNNSQNQ
VNENCLSKQSSNQNQQNVCNIANLDQFKFKQKSIKDFFKKK


>TTHERM_00502120(gene)
AATCCTATCTATATATCTATATACTTAATTGCTTGTTAACTCTTTTAGAAATCAAGAAAG
CTCTAAAGTAACAATTAAAAATAAAATCAAACAAACTACAACTATTTGCAAGAAAGAAAA
AGGAATAGGAGCAGAGAAAGCAAAAACACAAAGTACAAAACAGCAAGTTTAAGAAAATAA
ATCCTTTTATTTAAGATCAATCCCTAACAAAAAGAAGTTATTTTAAAAATAAACAACATG
TCCAGCTAGGATCTTGATCAGAATAACGATAGCACTTGCAAGACTAATGTAAAAGTATTG
ATTAAAATTGAAATTTTACCATTTAATCATAAAGTTTACCAAGTTTGTAATACAAAATAT
TAGAAAATGATATTTAAATAGGAATAATAGTTATAAATGGCAATAATAATTCATATTAAT
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TTTTGGTTTATGGTATGCGCAGAATACTTTCCAAGGTCTCTAACTATAGGTACTAATGAT
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AAGCTTTAGATAGATGAAAAAATAACATCACTTACATATTAATTTAAATGCAATTCAAAT
ATTATTTTAATACCATAATATCTAAACTATTATTTTAAGTTTTTATTCATTTTTCTGTTT
GAAATAAATTTTTATAATGTAAATGTAATCTTTTATTAACAATTACTTTTAATAAATAAG
TCTTATTAGAATCTAAAGGGAGAACCAACAGATGAGCAGTGCCAGGAATATATTTAAAAA
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TCTATTAAATTGTTTCAATAATTAAATTGATCCTATTTTAAAATTAATAGAAATGCAATA
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ATACACAATATTACGAATTTTAAAAAACTTGTAAGGCAGGTCCACCTAATAAAAAATAAA
GATATGGTAAAAATAAATATTATTTTTTGTTTATTTACAATTTTTATTTTTATAAAAAAA
GAGGATCCTAATGAGAAACAAAATAAGGTTGGGAGTGCTTCTAAGCATACTTCTCCAGAA
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CTGCGAAAAAGAAAGTTTTAATTAGTGCTAAAAAGATAAGACAACAAATTACCAAAAATG
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AAGGATGATAATAAGCTAAATGCTAATGATCCTAAATCCGTAAAAAAAATAAATTTATGG
AAAAATAGAGTTTTCATAAGAAAGGAAGAGCCCTTTTGGAAGGATATTTAGTATAAATCT
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AATTATTATCTAATAGAAACTTCTGAATAAGTTTACTGTGTTTGCAGAAGAAAGTATCAA
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GGATGATGAAAATCAAAGGTAAAAGCGTAGATAGATTTACAAAGACTACTTTATAAATAT
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AATGAAGAGTGATTCAAAATCCTCTAAAAAATAATAAAAAAAATAAACTTAAAATAAAAA
GAGATCTTCAAGCACTAAGTTATAAGATATAGAAGAATAAACTACAACTTCTAAGAAGAC
TAAAAAATCTAAAGATAGTAAAACAAATAGCTCTTCATCTAAGATTTCTGAAGTTAAGGC
TAAGTTAGATTATGCTAACTACAGTGATGCCAAAGAAGAAATATTTGAAGAAGATGAAGA
TGACAATGAATAAAAAGAAGAAATTTAACATCAAGAAGATCATATGCACTTAGAAGAACT
TTCAAAATAAGATGAATAGGAAAATAATATTAATAATCTAAAATCTAAATAACTTGACTG
TAATTAAATAGAAAAAACTTTAAATGAATAAATCAAGTTTGAAACTTTACAAGAAAGCTA
ATGTATTGATAAACTAATTGAAAATAAAAATTAAGATAAATGCGAGATTGAATAAAATTA
GAAGTAATAAATTTAAACAAAAACAGAGCATACTGATACCTAAATGTTTGATAACTAAGA
TATGAGTGATAATTCAGCTTTAATTGATAAAAAAATAACAAAAAGTAATGATTAATCACA
CATGAAAATTGAAAAAGAAGAAACAGAAACAAAAAATGATGAAATTAAAACAGAAAATTA
GGAAGAAAATGAATCAGTAAAATAATAAGATATTAAAAAAGAAAAGTAAGAAGATATAAA
AAATGAACAAAATGAAATTATAAATACAGAAGAAAAATAGGAGGAGGAAGATGGATAAAC
CAAAATTAATTTATTGCAAGAATATCAATACAACAAAAAATCTGATAGTTTAAAAATAGA
ATCATAGTAGAGTAATAATTCATAAAATTAAGTAAATGAAAATTGTTTAAGTAAATAAAG
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GCAAAAAAGCATAAAAGATTTTTTCAAAAAGAAGTGA