Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00313140

Standard Name

AAP2 (Ada2-associated protein 2)

Aliases

PreTt03501 | 30.m00310 | 3810.m01922 | A2A2

Description

Member of the SAGA complex. PHD finger-containing protein.

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

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Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 11.3%

TetraMine Data

TTHERM_00313140

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_03335.19.997093137033517e-262PHD-finger family protein (813
aa)
OxytrichaContig3237.0.g250.000000000000004001928599951003PHD-finger
WormBaseWBGene000030340.000000000003001226732525078locus:lin-49 Protein lin-49
status:Confirmed UniProt:Q
20318 protein_id:CCD67656.1
SGDYPR031W0.000000009996807949091551NTO1 Subunit of the NuA3 histo
ne acetyltransferase complex t
hat acetylates histone H3; con
tains PHD finger domain that i
nteracts with methylated histo
ne H3

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:29523178: Saettone A, Garg J, Lambert JP, Nabeel-Shah S, Ponce M, Burtch A, Thuppu Mudalige C, Gingras AC, Pearlman RE, Fillingham J (2018) The bromodomain-containing protein Ibd1 links multiple chromatin-related protein complexes to highly expressed genes in Tetrahymena thermophila. Epigenetics & chromatin 11(1):10

Sequences

>TTHERM_00313140(coding)
ATGAATCCAGATAAATGCTAGATTTGTTCTTCTAATTATGCTAAGCATCTCTCTGTGATT
CCATATATTCACTCTGCATAGTAAAAAGGTGATCAAAATTAAGATAATAAATGTCATTTG
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TATAGTTAGCTTCTATGTTAAGATTGCAATGAAATCGATACAGAAACATACATTAAATGC
ATTGATGAAGATTGCAATAATTACTTTCATATTTCTTGCATTATCAAGAATCAAATCAAA
ATATCTCTTGGTAGATGGTCAGAAATAGATCGTAAAGCTTATTTACTTGAGCCTATTTGT
AGCGAACACATCAATAATAAAAAATATGTAGAGAAGTCAATTTCATGGTAAAATATTGAT
AAATAGCTGAAGCAAAAAATATTTGAAATGAATGGCCTAGATATCCAGTTGTTATCTGAT
GATGAAAGTGCAAGGGATTTAAAAAATATTTAGTTACAAGCAGGGAGAAAAGAGAGTCAT
TCTTAAAGTTAAGAGGACTCTTAATTAACTAAATTAGAAAGCAAGTCTGAAAGGAAATCT
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TTAGATATAGTTGTTAAAAATGAGCTATAAAATTACATGTGTGCAATTTGCTAGAAAAGA
TAAGGTTATAAAATAAAGTGCAATCATTGTGATTGCAATTTAGCATTTCATACTCACTGT
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AATTCTATAGACGATAATTTTAACAAAATCTAAACATCTATTTACTGCCCAAGTCATCAA
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TATTAAACAGCAGTTGAATACAAAGATTATAACTCTTTCATCGCTGATCATGAAAATATT
TAAAAAGAATCAAAATAAAAAATAGAAGAAATTAGATCTAAAATTCAATAAGAAAATTAA
GTGAGCTATGAAAGTACAAGTGGAATATTTAAGCTTTTAAATGACTGTACAAGTAATTAA
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AACCATGTTGAAACACAAAATAGTAATTCAAATTAAATCAAAAATATTGAAAAAAGTATC
TCCAACAACAAATAATAAAATACTAAAAATGACAATTGTTCAAAATCAAATATCAAGATT
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AGTAGTTAAATATCATCTAATCAATTATAAGAATAATAAATTGATGCTAGCAAATTGATT
TCTGAAATATTTTCAGACTGA


>TTHERM_00313140(protein)
MNPDKCQICSSNYAKHLSVIPYIHSAQQKGDQNQDNKCHLVCASFIKDVEINIRNKPKNK
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AAESAESSDVGTHLSSIQYSSDQIKSNLKSTLKQKKAKLQTKQIEEKVNKGEQKSRGRKI
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QNKCLQQINNNKKQSTQNNNYQNTSSISQFQNKNNSNSQKSSQISSNQLQEQQIDASKLI
SEIFSD


>TTHERM_00313140(gene)
ATGAATCCAGATAAATGCTAGATTTGTTCTTCTAATTATGCTAAGCATCTCTCTGTGATT
CCATATATTCACTCTGCATAGTAAAAAGGTGATCAAAATTAAGATAATAAATGTCATTTG
GTTTGCGCATCTTTCATTAAAGATGTAGAAATTAATATTAGAAATAAGCCAAAAAATAAA
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GAAAACACAACAATATCTAATTCTGCAGCTGAATCAGCAGAGAGTTCTGATGTTGGAACA
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TAGGACTGTACAAGTAATTAAGAAATAGATATTACTGATATTTTTGGTGATTTAAATGAG
AATAGTATAAACCAAAATAATAACCATGTTGAAACACAAAATAGTAATTCAAATTAAATC
AAAAATATTGAAAAAAGTATCTCCAACAACAAATAATAAAATACTAAAAATGACAATTGT
TCAAAATCAAATATCAAGATTGATTAAATGAATTCTCTTTTGAAGGCATAATCAAAAGAA
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TAATAAAAGTAGAACAATTCTTAGAATAAATGTTTATAATAAATTAACAATAATAAAAAA
TAAAGCACTTAGAATAATAATTATCAAAATACTTCTTCTATTTCTTAGTTTCAAAACAAA
AATAATTCCAACTCCTAAAAAAGTAGTTAAATATCATCTAATCAATTATAAGAATAATAA
ATTGATGCTAGCAAATTGATTTCTGAAATATTTTCAGACTGA